Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.
Term:estrane
go back to main search page
Accession:CHEBI:23966 term browser browse the term
Definition:A steroid fundamental parent that has formula C18H30.
Synonyms:related_synonym: Formula=C18H30;   InChI=1S/C18H30/c1-18-11-4-7-17(18)16-9-8-13-5-2-3-6-14(13)15(16)10-12-18/h13-17H,2-12H2,1H3/t13?,14-,15+,16+,17-,18-/m0/s1;   InChIKey=GRXPVLPQNMUNNX-MHJRRCNVSA-N;   Oestran;   SMILES=[H][C@]12CCCCC1CC[C@]1([H])[C@]2([H])CC[C@]2(C)CCC[C@@]12[H];   oestrane
 xref: Beilstein:3125721;   LIPID_MAPS_instance:LMST02010000


show annotations for term's descendants           Sort by:
17beta-estradiol term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G ABCC2 ATP binding cassette subfamily C member 2 affects transport EXP ABCC2 protein affects the transport of Estradiol CTD PMID:15507541 NCBI chr28:12,670,885...12,740,124
Ensembl chr28:12,670,885...12,740,740 		JBrowse link
G ESR1 estrogen receptor 1 affects expression EXP Estradiol affects the expression of ESR1 protein CTD PMID:16483645 NCBI chr 1:42,081,952...42,368,544
Ensembl chr 1:42,081,969...42,368,544 		JBrowse link
17beta-estradiol 17-glucosiduronic acid term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G SLCO1B2 solute carrier organic anion transporter family member 1B2 increases transport EXP SLCO1B3 protein results in increased transport of estradiol-17 beta-glucuronide CTD PMID:20079461 NCBI chr27:26,411,008...26,496,174
Ensembl chr27:26,411,010...26,470,989 		JBrowse link
estrone term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G ALPI alkaline phosphatase, intestinal increases chemical synthesis EXP ALPI protein results in increased chemical synthesis of Estrone CTD PMID:1495895 NCBI chr25:44,107,418...44,110,947 JBrowse link
estrone 3-sulfate term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G SLCO1B2 solute carrier organic anion transporter family member 1B2 increases transport EXP SLCO1B3 protein results in increased transport of estrone sulfate CTD PMID:20079461 NCBI chr27:26,411,008...26,496,174
Ensembl chr27:26,411,010...26,470,989 		JBrowse link
Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 501
    chemical entity 501
      atom 501
        nonmetal atom 494
          carbon atom 482
            organic molecular entity 482
              lipid 113
                steroid 40
                  steroid fundamental parent 20
                    estrane 4
                      (13S,17R)-17-ethynyl-3-methoxy-13-methyl-7,8,9,11,12,14,15,16-octahydro-6H-cyclopenta[a]phenanthren-17-ol 0
                      (16R)-3-methoxy-13-methyl-6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-decahydrocyclopenta[a]phenanthrene-16,17-diol 0
                      (8R,9S,13S,14R,17R)-17-ethynyl-3-methoxy-13-methyl-7,8,9,11,12,14,15,16-octahydro-6H-cyclopenta[a]phenanthren-17-ol 0
                      (8S,9S,13R,14S,16S)-3-Methoxy-13,16-dimethyl-6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-decahydrocyclopenta[a]phenanthrene 0
                      1'H-5alpha-Androst-2-eno[3,2-b]indol-17beta-ol 0
                      1-methylestra-1,3,5(10),6-tetraene-3,17beta-diol 0
                      15alpha-hydroxyestradiol 0
                      15alpha-hydroxyestrone 0
                      16-Butyl-3-methoxy-estra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                      16-Propyl-3-methoxy-estra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                      16beta-Hydroxystanozolol 0
                      16beta-hydroxyestradiol + 0
                      16beta-hydroxyestrone 0
                      17-Methyl-2'H-5alpha-androst-2-eno[3,2-c]pyrazol-17beta-ol 0
                      17-Methylandrosta-2,4-dieno[2,3-d]isoxazol-17beta-ol 0
                      17-epiestriol + 0
                      17beta-Hydroxy-3-methoxyestra-1,3,5(10)-trien-16-one 0
                      17beta-Hydroxy-3-methoxyestra-1,3,5(10)-triene-17-carbonitrile 0
                      17beta-Hydroxy-androstano[3,2-c]isoxazole 0
                      17beta-hydroxy-17-methylestra-4,9,11-trien-3-one 0
                      17beta-hydroxy-2alpha,17-dimethylestr-4-en-3-one 0
                      17beta-hydroxy-2alpha-methylestr-4-en-3-one 0
                      17beta-hydroxyestr-5(10)-en-3-one 0
                      19-norandrosterone 0
                      2-Hydroxy-3-methoxyestrone 0
                      2-Hydroxydesogestrel 0
                      3'-Hydroxystanozolol 0
                      3,6-Dimethoxyestra-1,3,5(10),6,8-pentaene-17beta-carboxylic acid methyl ester 0
                      3-(2-allyloxy)estra-1,3,5(10)-triene-16,17-dione 16-oxime 0
                      3-(Allyloxy)estra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                      3-(allyloxy)estra-1,3,5(10)-triene-16alpha,17beta-diol 0
                      3-Deoxyestradiol 0
                      3-Deoxyestrone 0
                      3-Methoxy-16-ethylestra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                      3-Methoxy-16-octylestra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                      3-Methoxyestra-1,3,5(10),16-tetraene 0
                      3-Methoxyestra-1,3,5(10)-triene-16,17-dione 16-oxime 0
                      3-Methoxyestriol 0
                      3-methoxyestra-1,3,5(10)-trien-16beta-ol 0
                      4beta,5-Epoxy-17beta-hydroxy-5beta-androstan-3-one 0
                      5alpha-estrane 0
                      5beta-estrane + 0
                      6-ketoestriol 0
                      6beta-hydroxyestrone 0
                      7alpha-hydroxyestradiol 0
                      Allylestrenol 0
                      C18-steroid + 0
                      ESTRIOL BENZYL ETHER 0
                      Epimestrol 0
                      Estra-1,3,5(10),16-tetraen-3-ol benzoate 0
                      Estra-1,3,5(10)-triene-2,17beta-diol 0
                      Estra-1,3,5(10)-triene-3,17beta-diol 3-phosphate 0
                      Estra-1,3,5-(10)-trien-17-one-3-oxyacetic acid 0
                      Furazabol 0
                      Hydroxystenozole 0
                      LSM-1379 0
                      LSM-5126 0
                      LSM-5853 0
                      LSM-6384 0
                      LSM-6713 0
                      Lynestrenol 0
                      Zanoterone 0
                      androisoxazole 0
                      benzoic acid (17-hydroxy-13-methyl-6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-decahydrocyclopenta[a]phenanthren-3-yl) ester 0
                      benzoic acid [(13S)-13-methyl-17-oxo-7,8,9,11,12,14,15,16-octahydro-6H-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl] ester 0
                      bolandiol + 0
                      dienogest 0
                      equilin + 0
                      estetrol 0
                      estra-1,3,5(10)-trien-3-ol 0
                      estra-1,3,5(10)-triene-3,16beta-diol 0
                      estradiol + 3
                      estrane derivative + 0
                      estriol + 0
                      estriol 3-O-(beta-D-glucuronide) 0
                      estrone + 2
                      estrone 3-sulfate 1
                      ethinylestradiol sulfonate 0
                      fulvestrant 0
                      mibolerone 0
                      mifepristone 0
                      mytatrienediol 0
                      nandrolone + 0
                      nivazol 0
                      norelgestromin 0
                      norethisterone + 0
                      promegestone 0
                      promestriene 0
                      quinestradol 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 501
    subatomic particle 501
      composite particle 501
        hadron 501
          baryon 501
            nucleon 495
              atomic nucleus 501
                atom 501
                  main group element atom 494
                    p-block element atom 494
                      carbon group element atom 483
                        carbon atom 482
                          organic molecular entity 482
                            organic molecule 471
                              organic cyclic compound 454
                                organic polycyclic compound 65
                                  steroid 40
                                    steroid fundamental parent 20
                                      estrane 4
                                        (13S,17R)-17-ethynyl-3-methoxy-13-methyl-7,8,9,11,12,14,15,16-octahydro-6H-cyclopenta[a]phenanthren-17-ol 0
                                        (16R)-3-methoxy-13-methyl-6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-decahydrocyclopenta[a]phenanthrene-16,17-diol 0
                                        (8R,9S,13S,14R,17R)-17-ethynyl-3-methoxy-13-methyl-7,8,9,11,12,14,15,16-octahydro-6H-cyclopenta[a]phenanthren-17-ol 0
                                        (8S,9S,13R,14S,16S)-3-Methoxy-13,16-dimethyl-6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-decahydrocyclopenta[a]phenanthrene 0
                                        1'H-5alpha-Androst-2-eno[3,2-b]indol-17beta-ol 0
                                        1-methylestra-1,3,5(10),6-tetraene-3,17beta-diol 0
                                        15alpha-hydroxyestradiol 0
                                        15alpha-hydroxyestrone 0
                                        16-Butyl-3-methoxy-estra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                                        16-Propyl-3-methoxy-estra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                                        16beta-Hydroxystanozolol 0
                                        16beta-hydroxyestradiol + 0
                                        16beta-hydroxyestrone 0
                                        17-Methyl-2'H-5alpha-androst-2-eno[3,2-c]pyrazol-17beta-ol 0
                                        17-Methylandrosta-2,4-dieno[2,3-d]isoxazol-17beta-ol 0
                                        17-epiestriol + 0
                                        17beta-Hydroxy-3-methoxyestra-1,3,5(10)-trien-16-one 0
                                        17beta-Hydroxy-3-methoxyestra-1,3,5(10)-triene-17-carbonitrile 0
                                        17beta-Hydroxy-androstano[3,2-c]isoxazole 0
                                        17beta-hydroxy-17-methylestra-4,9,11-trien-3-one 0
                                        17beta-hydroxy-2alpha,17-dimethylestr-4-en-3-one 0
                                        17beta-hydroxy-2alpha-methylestr-4-en-3-one 0
                                        17beta-hydroxyestr-5(10)-en-3-one 0
                                        19-norandrosterone 0
                                        2-Hydroxy-3-methoxyestrone 0
                                        2-Hydroxydesogestrel 0
                                        3'-Hydroxystanozolol 0
                                        3,6-Dimethoxyestra-1,3,5(10),6,8-pentaene-17beta-carboxylic acid methyl ester 0
                                        3-(2-allyloxy)estra-1,3,5(10)-triene-16,17-dione 16-oxime 0
                                        3-(Allyloxy)estra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                                        3-(allyloxy)estra-1,3,5(10)-triene-16alpha,17beta-diol 0
                                        3-Deoxyestradiol 0
                                        3-Deoxyestrone 0
                                        3-Methoxy-16-ethylestra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                                        3-Methoxy-16-octylestra-1,3,5(10)-triene-16beta,17beta-diol 0
                                        3-Methoxyestra-1,3,5(10),16-tetraene 0
                                        3-Methoxyestra-1,3,5(10)-triene-16,17-dione 16-oxime 0
                                        3-Methoxyestriol 0
                                        3-methoxyestra-1,3,5(10)-trien-16beta-ol 0
                                        4beta,5-Epoxy-17beta-hydroxy-5beta-androstan-3-one 0
                                        5alpha-estrane 0
                                        5beta-estrane + 0
                                        6-ketoestriol 0
                                        6beta-hydroxyestrone 0
                                        7alpha-hydroxyestradiol 0
                                        Allylestrenol 0
                                        C18-steroid + 0
                                        ESTRIOL BENZYL ETHER 0
                                        Epimestrol 0
                                        Estra-1,3,5(10),16-tetraen-3-ol benzoate 0
                                        Estra-1,3,5(10)-triene-2,17beta-diol 0
                                        Estra-1,3,5(10)-triene-3,17beta-diol 3-phosphate 0
                                        Estra-1,3,5-(10)-trien-17-one-3-oxyacetic acid 0
                                        Furazabol 0
                                        Hydroxystenozole 0
                                        LSM-1379 0
                                        LSM-5126 0
                                        LSM-5853 0
                                        LSM-6384 0
                                        LSM-6713 0
                                        Lynestrenol 0
                                        Zanoterone 0
                                        androisoxazole 0
                                        benzoic acid (17-hydroxy-13-methyl-6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-decahydrocyclopenta[a]phenanthren-3-yl) ester 0
                                        benzoic acid [(13S)-13-methyl-17-oxo-7,8,9,11,12,14,15,16-octahydro-6H-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl] ester 0
                                        bolandiol + 0
                                        dienogest 0
                                        equilin + 0
                                        estetrol 0
                                        estra-1,3,5(10)-trien-3-ol 0
                                        estra-1,3,5(10)-triene-3,16beta-diol 0
                                        estradiol + 3
                                        estrane derivative + 0
                                        estriol + 0
                                        estriol 3-O-(beta-D-glucuronide) 0
                                        estrone + 2
                                        estrone 3-sulfate 1
                                        ethinylestradiol sulfonate 0
                                        fulvestrant 0
                                        mibolerone 0
                                        mifepristone 0
                                        mytatrienediol 0
                                        nandrolone + 0
                                        nivazol 0
                                        norelgestromin 0
                                        norethisterone + 0
                                        promegestone 0
                                        promestriene 0
                                        quinestradol 0
paths to the root