RGD DISEASE ONTOLOGY - ANNOTATIONS
RGD uses the Human Disease Ontology (DO, https://disease-ontology.org/) for disease curation across species. RGD automatically downloads each new release of the ontology on a monthly basis. Some additional terms which are required for RGD's curation purposes but are not currently covered in the official version of DO have been added. As corresponding terms are added to DO, these custom terms are retired and the DO terms substituted in existing annotations and subsequently used for curation.
Term: familial combined hyperlipidemia
Accession: DOID:13809
browse the term
Definition: A type of familial lipid metabolism disorder characterized by a variable pattern of elevated plasma CHOLESTEROL and/or TRIGLYCERIDES. Multiple genes on different chromosomes may be involved, such as the major late transcription factor (UPSTREAM STIMULATORY FACTORS) on CHROMOSOME 1.
Synonyms: exact_synonym: FCHL; familial combined hyperlipidemias; familial multiple lipoprotein-type hyperlipidemia; hyperbetalipoproteinemia with prebetalipoproteinemia; mixed hyperlipidaemia; multiple lipoprotein-type hyperlipidemia; multiple lipoprotein-type hyperlipidemias; type IIb hyperlipoproteinemia
related_synonym: HYPERLIPIDEMIA, FAMILIAL COMBINED, SUSCEPTIBILITY TO
primary_id: MESH:D006950
alt_id: OMIM:144250
xref: EFO:0000492 ; ICD10CM:E78.49 ; NCI:C35637
For additional species annotation, visit the
Alliance of Genome Resources .
G
Add1
adducin 1
ISO
DNA:polymorphism: :p.Gly460Trp (human)
RGD
PMID:11775124
RGD:1559299
NCBI chr14:76,108,643...76,167,267
Ensembl chr14:76,108,654...76,167,182
G
Alpl
alkaline phosphatase, biomineralization associated
ISO
RGD
PMID:16336518
RGD:1601173
NCBI chr 5:149,951,397...150,006,424
Ensembl chr 5:149,951,409...150,006,446
G
Ampd1
adenosine monophosphate deaminase 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipoproteinemia Type IIb
ClinVar
PMID:25741868 PMID:28492532
NCBI chr 2:190,598,707...190,619,938
Ensembl chr 2:190,598,700...190,619,938
G
Apoa2
apolipoprotein A2
ISO
protein:increased expression:plasma:
RGD
PMID:12738753
RGD:1300287
NCBI chr13:83,644,460...83,646,358
Ensembl chr13:83,644,470...83,646,355
G
Apob
apolipoprotein B
ISO
protein:increased expression:plasma ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipidemia, familial combined | ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipidemia, familial combined, susceptibility to | ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipoproteinemia Type IIb ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipidemia, familial combined | ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipoproteinemia Type IIb
ClinVar RGD
PMID:174884 PMID:221546 PMID:1360085 PMID:1424233 PMID:1431583 PMID:1454832 PMID:1466657 PMID:1493642 PMID:1600334 PMID:1770316 PMID:1793440 PMID:1977310 PMID:2280177 PMID:2375782 PMID:2563166 PMID:2725600 PMID:2843815 PMID:2903181 PMID:3399894 PMID:3473077 PMID:3477815 PMID:3771801 PMID:7627691 PMID:7670940 PMID:7882518 PMID:7883971 PMID:8141833 PMID:8254047 PMID:8318509 PMID:8318993 PMID:8371062 PMID:8468533 PMID:8478017 PMID:8723684 PMID:8831935 PMID:8889592 PMID:8931699 PMID:8960785 PMID:9081691 PMID:9104431 PMID:9105560 PMID:9191540 PMID:9254062 PMID:9259199 PMID:9339363 PMID:9486979 PMID:9490296 PMID:9536098 PMID:9568749 PMID:9603795 PMID:9654205 PMID:9702952 PMID:9925662 PMID:10208479 PMID:10388479 PMID:10529757 PMID:10735632 PMID:10952765 PMID:11031227 PMID:11115503 PMID:11137107 PMID:11238294 PMID:11494965 PMID:11781700 PMID:11810272 PMID:11833852 PMID:11940084 PMID:11941481 PMID:12124991 PMID:12655413 PMID:12872264 PMID:14508510 PMID:14732481 PMID:15135245 PMID:15514099 PMID:15797858 PMID:15805152 PMID:15984016 PMID:16199547 PMID:16250003 PMID:17043676 PMID:17046772 PMID:17087781 PMID:17142622 PMID:17160438 PMID:17539906 PMID:17570373 PMID:17576681 PMID:17588943 PMID:17595251 PMID:17765246 PMID:17964958 PMID:17968143 PMID:18022922 PMID:18028451 PMID:18096825 PMID:18160469 PMID:18222178 PMID:18258526 PMID:18279815 PMID:18325181 PMID:18355452 PMID:18492086 PMID:18700895 PMID:18710658 PMID:19602640 PMID:20032471 PMID:20145306 PMID:20167924 PMID:20236128 PMID:20506408 PMID:20538126 PMID:20592474 PMID:20657596 PMID:20736250 PMID:20809525 PMID:20828696 PMID:20981092 PMID:21033204 PMID:21059979 PMID:21270786 PMID:21303902 PMID:21310417 PMID:21376320 PMID:21382890 PMID:21408211 PMID:21513517 PMID:21520333 PMID:21657943 PMID:21722902 PMID:21862702 PMID:21868016 PMID:21919778 PMID:22095935 PMID:22244043 PMID:22256951 PMID:22294733 PMID:22353362 PMID:22408029 PMID:22534770 PMID:22544856 PMID:22698793 PMID:22855658 PMID:22863191 PMID:22883975 PMID:22923420 PMID:23054246 PMID:23064986 PMID:23130880 PMID:23375686 PMID:23593297 PMID:23680767 PMID:23685560 PMID:23775634 PMID:23833242 PMID:23936638 PMID:24033266 PMID:24106285 PMID:24234650 PMID:24404629 PMID:24498611 PMID:24503134 PMID:24507774 PMID:24507775 PMID:24607922 PMID:24627126 PMID:24784157 PMID:24892279 PMID:24956927 PMID:24987033 PMID:25430706 PMID:25461735 PMID:25647241 PMID:25712136 PMID:25741868 PMID:25974703 PMID:26020417 PMID:26036859 PMID:26064709 PMID:26332594 PMID:26415676 PMID:26467025 PMID:26516186 PMID:26546829 PMID:26612772 PMID:26636822 PMID:26643808 PMID:26666465 PMID:26688439 PMID:26690388 PMID:26802169 PMID:26892515 PMID:27153395 PMID:27206935 PMID:27206948 PMID:27365461 PMID:27497240 PMID:27516387 PMID:27578127 PMID:27654142 PMID:27765764 PMID:27783906 PMID:27784735 PMID:27824480 PMID:27831900 PMID:27872105 PMID:27884173 PMID:27919364 PMID:27932355 PMID:28008009 PMID:28104544 PMID:28166811 PMID:28405938 PMID:28428224 PMID:28431867 PMID:28475941 PMID:28492532 PMID:28518168 PMID:28733173 PMID:28895539 PMID:28953935 PMID:28958330 PMID:28965616 PMID:29036232 PMID:29083407 PMID:29192238 PMID:29233637 PMID:29261184 PMID:29284604 PMID:29290422 PMID:29353225 PMID:29386597 PMID:29459468 PMID:29540175 PMID:29555771 PMID:29572815 PMID:29590070 PMID:29598884 PMID:29870584 PMID:30030251 PMID:30056620 PMID:30122538 PMID:30206226 PMID:30217213 PMID:30270084 PMID:30270359 PMID:30291343 PMID:30333156 PMID:30337457 PMID:30348779 PMID:30420299 PMID:30526649 PMID:30586733 PMID:30592178 PMID:30681615 PMID:30694319 PMID:30710474 PMID:30782561 PMID:30842500 PMID:30971288 PMID:31028937 PMID:31106297 PMID:31135820 PMID:31150472 PMID:31153816 PMID:31345425 PMID:31371270 PMID:31447099 PMID:31570899 PMID:31589614 PMID:31624253 PMID:31893465 PMID:31980526 PMID:32009526 PMID:32044282 PMID:32101375 PMID:32115487 PMID:32355288 PMID:32461654 PMID:32591292 PMID:32625235 PMID:32702746 PMID:32706999 PMID:32719484 PMID:32770674 PMID:33006316 PMID:33020668 PMID:33059327 PMID:33111339 PMID:33207932 PMID:33269076 PMID:33303402 PMID:33418990 PMID:33454241 PMID:33489595 PMID:33508743 PMID:33519890 PMID:33740630 PMID:33875564 PMID:34037665 PMID:34297352 PMID:34426522 PMID:34428338 PMID:34445196 PMID:34456049 PMID:34573395 PMID:34650182 PMID:34875256 PMID:35047021 PMID:35052492 PMID:35276540 PMID:35339733 PMID:35741760 PMID:35761384 PMID:35910211 PMID:35913489 PMID:35979295 PMID:36071769 PMID:36105085 PMID:36190978 PMID:36196022 PMID:36413997 PMID:36499307 PMID:36555767 PMID:36973604 PMID:37108800 PMID:37593691 PMID:37675602 PMID:16797745 More...
RGD:1601200
NCBI chr 6:30,844,386...30,883,983
Ensembl chr 6:30,844,368...30,892,497
G
Apoc3
apolipoprotein C3
no_association
ISO
DNA:haplotype, snp:3' utr:g.3175G>C (human)
RGD
PMID:15863838 PMID:9062353 PMID:9812922
RGD:1601225 , RGD:5685674 , RGD:5685676
NCBI chr 8:46,531,478...46,533,658
Ensembl chr 8:46,531,478...46,533,583
G
Apoe
apolipoprotein E
ISO
DNA:missense mutations, haplotype:cds:p.C112R, p.R158C (human)
RGD
PMID:17127808 PMID:12915220
RGD:1601231 , RGD:1578481
NCBI chr 1:79,353,924...79,357,852
Ensembl chr 1:79,353,916...79,357,932
G
Faslg
Fas ligand
ISO
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
CTD
PMID:15063428
NCBI chr13:74,151,519...74,172,760
Ensembl chr13:74,154,954...74,162,215
G
Hnf4a
hepatocyte nuclear factor 4, alpha
ISO
DNA:haplotype: :rs6031558,rs745975, rs3212198(human)
RGD
PMID:18340007
RGD:12904697
NCBI chr 3:152,186,787...152,248,320
Ensembl chr 3:152,186,787...152,248,320
G
Ldlr
low density lipoprotein receptor
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipoproteinemia Type IIb
ClinVar
PMID:7616128 PMID:7709162 PMID:9039985 PMID:9259195 PMID:9654205 PMID:10090484 PMID:10208490 PMID:11857755 PMID:15256764 PMID:16389549 PMID:17142622 PMID:17765246 PMID:18263977 PMID:19318025 PMID:20145306 PMID:20538126 PMID:20809525 PMID:21310417 PMID:21382890 PMID:22390909 PMID:22698793 PMID:23375686 PMID:25461735 PMID:25487149 PMID:25525159 PMID:25741868 PMID:25846081 PMID:26415676 PMID:26467025 PMID:26927322 PMID:27680772 PMID:28235710 PMID:28492532 PMID:28645073 PMID:29261184 PMID:30592178 PMID:31345425 PMID:31727422 PMID:32331935 PMID:32522009 PMID:32719484 PMID:32770674 PMID:33087929 PMID:33269076 PMID:33418990 PMID:33740630 PMID:34037665 More...
NCBI chr 8:20,270,020...20,292,981
Ensembl chr 8:20,270,041...20,294,580
G
Lipc
lipase C, hepatic type
ISO
RGD
PMID:16338252
RGD:1580512
NCBI chr 8:71,509,633...71,635,663
Ensembl chr 8:71,509,635...71,635,464
G
Lpl
lipoprotein lipase
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipidemia, familial combined | ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipidemia, familial combined, susceptibility to | ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipoproteinemia Type IIb CTD Direct Evidence: marker/mechanism
OMIM ClinVar CTD
PMID:1351946 PMID:1371284 PMID:1400331 PMID:1479292 PMID:1505655 PMID:1511985 PMID:1512512 PMID:1598907 PMID:1619366 PMID:1639392 PMID:1674945 PMID:1702428 PMID:1730727 PMID:1731801 PMID:1752947 PMID:1872917 PMID:1907278 PMID:1969408 PMID:1975597 PMID:2038366 PMID:2394828 PMID:2914262 PMID:6645961 PMID:7607318 PMID:7647785 PMID:7753827 PMID:7906986 PMID:8077845 PMID:8096693 PMID:8099055 PMID:8199176 PMID:8541837 PMID:8732773 PMID:8808493 PMID:8872057 PMID:8956048 PMID:8973094 PMID:9401010 PMID:9550358 PMID:9811888 PMID:10359734 PMID:10364086 PMID:10517255 PMID:10560236 PMID:10619999 PMID:11260209 PMID:11334614 PMID:11893776 PMID:12204001 PMID:12655575 PMID:12839295 PMID:12905705 PMID:15185149 PMID:15877202 PMID:16199547 PMID:16278884 PMID:16972177 PMID:17476032 PMID:17560523 PMID:17717288 PMID:18068174 PMID:18350203 PMID:18922999 PMID:19034041 PMID:19335919 PMID:20650961 PMID:21146168 PMID:21159338 PMID:22095987 PMID:22239554 PMID:22691586 PMID:23212406 PMID:23357145 PMID:23484243 PMID:24033266 PMID:24291057 PMID:24366202 PMID:24503134 PMID:24507774 PMID:24591733 PMID:24627108 PMID:24646025 PMID:24747307 PMID:24793350 PMID:25741868 PMID:25966443 PMID:26079787 PMID:26156051 PMID:26337181 PMID:26342331 PMID:26892137 PMID:26975783 PMID:27055971 PMID:27097985 PMID:27142713 PMID:27150867 PMID:27206937 PMID:27573733 PMID:28008009 PMID:28267856 PMID:28438574 PMID:28492532 PMID:28502509 PMID:28606150 PMID:28951076 PMID:29054425 PMID:29153744 PMID:29288010 PMID:29431110 PMID:29748148 PMID:29921298 PMID:30150141 PMID:30210108 PMID:30352774 PMID:30389453 PMID:30420299 PMID:30559189 PMID:31153847 PMID:31352695 PMID:31589614 PMID:31619059 PMID:31669931 PMID:31901151 PMID:32041611 PMID:32472350 PMID:33217533 PMID:33303402 PMID:33588820 PMID:34363016 PMID:34635320 PMID:35309119 PMID:35368694 PMID:35837325 PMID:36555767 PMID:38025240 More...
NCBI chr16:20,830,055...20,853,855
Ensembl chr16:20,829,465...20,855,249
G
Serpine1
serpin family E member 1
ISO
protein:increased expression:plasma:
RGD
PMID:18417194
RGD:13207412
NCBI chr12:19,601,272...19,611,657
Ensembl chr12:19,601,272...19,611,657
G
Thbd
thrombomodulin
ISO
RGD
PMID:15262191
RGD:1601645
NCBI chr 3:135,863,366...135,867,018
Ensembl chr 3:135,862,835...135,867,193
G
Usf1
upstream transcription factor 1
ISO
CTD Direct Evidence: marker/mechanism ClinVar Annotator: match by term: Hyperlipidemia, familial combined, susceptibility to
CTD ClinVar
PMID:14991056 PMID:16076849
NCBI chr13:83,845,230...83,854,875
Ensembl chr13:83,822,035...83,854,885
G
Vwf
von Willebrand factor
ISO
protein:increased expression:plasma:
RGD
PMID:18417194
RGD:13207412
NCBI chr 4:158,360,152...158,491,539
Ensembl chr 4:158,360,152...158,491,539
G
Usf1
upstream transcription factor 1
susceptibility
ISO
OMIM
NCBI chr13:83,845,230...83,854,875
Ensembl chr13:83,822,035...83,854,885
Term paths to the root one shortest all shortest one longest all longest one shortest and longest all
Path 1
disease
18969
Nutritional and Metabolic Diseases
8247
disease of metabolism
8247
lipid metabolism disorder
1741
familial combined hyperlipidemia
16
Hyperlipidemia, Combined, 1
1
Hyperlipidemia, Combined, 2
0
Path 2
disease
18969
Developmental Disease
14400
Congenital, Hereditary, and Neonatal Diseases and Abnormalities
13417
genetic disease
13036
inherited metabolic disorder
6257
lipid metabolism disorder
1741
Dyslipidemias
396
familial hyperlipidemia
363
familial combined hyperlipidemia
16
Hyperlipidemia, Combined, 1
1
Hyperlipidemia, Combined, 2
0