RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) Pan paniscus
Analyze
Symbol: RPE65
Name: retinoid isomerohydrolase RPE65
RGD ID: 11784520
Description: ENCODES a protein that exhibits all-trans-retinyl-ester hydrolase, 11-cis retinol forming activity (ortholog); INVOLVED IN camera-type eye development (ortholog); circadian rhythm (ortholog); neural retina development (ortholog); PARTICIPATES IN altered retinoid cycle metabolic pathway; retinitis pigmentosa pathway; retinoid cycle metabolic pathway; ASSOCIATED WITH adrenocorticotropic hormone deficiency (ortholog); autistic disorder (ortholog); basal cell carcinoma (ortholog); FOUND IN cell body (ortholog)
Type: protein-coding
RefSeq Status: MODEL
Previously known as: retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa; retinoid isomerohydrolase; RPE65, retinoid isomerohydrolase
RGD Orthologs
Human
Mouse
Rat
Chinchilla
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Orthologs
More Info more info ...
Latest Assembly: Mhudiblu_PPA_v0 - Bonobo Mhudiblu_PPA_v0 Assembly
Position:
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
NHGRI_mPanPan1-v21158,421,347 - 158,442,454 (+)NCBINHGRI_mPanPan1-v2
NHGRI_mPanPan11157,581,121 - 157,602,228 (+)NCBINHGRI_mPanPan1
Mhudiblu_PPA_v0167,666,784 - 67,687,891 (-)NCBIMhudiblu_PPA_v0Mhudiblu_PPA_v0panPan3
PanPan1.1169,623,775 - 69,644,894 (-)NCBIpanpan1.1PanPan1.1panPan2
PanPan1.1 Ensembl169,623,775 - 69,644,904 (-)Ensemblpanpan1.1panPan2
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model



  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
RPE65Bonobobasal cell carcinoma  ISORGD:7324169068941mRNA:increased expression:skin (human)RGDPMID:16181461|REF_RGD_ID:9495923
RPE65BonoboExperimental Autoimmune Uveitis  ISORGD:7324169068941human peptides in a rat modelRGDPMID:16109648|REF_RGD_ID:9585652
RPE65BonoboExperimental Diabetes Mellitus  ISORGD:6213969068941mRNA:decreased expression:retina (rat)RGDPMID:21862641|REF_RGD_ID:9585653
RPE65BonoboLeber congenital amaurosis 2 treatmentISORGD:7324169068941human gene in mouse modelRGDPMID:16505056|REF_RGD_ID:9495919
RPE65Bonoboretinitis pigmentosa treatmentISORGD:7324179068941 RGDPMID:20164818|REF_RGD_ID:9585645
RPE65Bonobosquamous cell carcinoma  ISORGD:7324169068941mRNA:decreased expression:skin (human)RGDPMID:16181461|REF_RGD_ID:9495923
1 to 20 of 25 rows
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
RPE65Bonoboadrenocorticotropic hormone deficiency  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: ACTH deficiencyClinVarPMID:18632300|PMID:25741868|PMID:28492532|PMID:30576320|PMID:31273949|PMID:31630094|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9843205
RPE65Bonoboautistic disorder  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Autistic disorderClinVarPMID:32581362
RPE65Bonobocone-rod dystrophy  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Cone-rod degeneration | ClinVar Annotator: match by term: Rod-cone dystrophyClinVarPMID:32581362
RPE65Bonobocone-rod dystrophy 15  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Cone-rod dystrophy 15ClinVarPMID:25741868|PMID:28492532
RPE65BonoboDevelopmental Disabilities  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Global developmental delayClinVarPMID:32581362
RPE65BonoboEye Abnormalities  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Abnormality of the eyeClinVarPMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11095629|PMID:16518657|PMID:16754667|PMID:17525851|PMID:17933883|PMID:18682808|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19854499|PMID:21153841|PMID:25257057|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:26427430|PMID:26626312|PMID:27874104|PMID:28492532|PMID:30268864|PMID:30718709|PMID:31054281|PMID:31273949|PMID:31816670|PMID:31925606|PMID:31964843|PMID:32579692|PMID:34374989|PMID:34830511|PMID:36460718|PMID:9501220
RPE65Bonobofundus dystrophy  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Retinal dystrophyClinVarPMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11035546|PMID:11095629|PMID:11462243|PMID:11786058|PMID:12960219|PMID:13616783|PMID:14962443|PMID:15024725|PMID:15512997|PMID:15557452|PMID:16096063|PMID:16123401|PMID:16150724|PMID:16199547|PMID:16205573|PMID:16518657|PMID:16754667|PMID:17197551|PMID:17525851|PMID:17576681|PMID:17724218|PMID:17933883|PMID:17964524|PMID:18539930|PMID:18599565|PMID:18632300|PMID:18682808|PMID:18722466|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19753312|PMID:19854499|PMID:19959640|PMID:20043869|PMID:20079931|PMID:20604683|PMID:20683928|PMID:21151602|PMID:21153841|PMID:21211845|PMID:21654732|PMID:21911650|PMID:2233437|PMID:23661369|PMID:23878505|PMID:24066033|PMID:24265693|PMID:24849605|PMID:24997176|PMID:25257057|PMID:25324289|PMID:25333069|PMID:25356976|PMID:25495949|PMID:25525159|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:25972377|PMID:26024124|PMID:26047050|PMID:26355662|PMID:26364624|PMID:26427430|PMID:26427455|PMID:26626312|PMID:26656277|PMID:26906952|PMID:27208204|PMID:27307694|PMID:27535533|PMID:27874104|PMID:28041643|PMID:28041994|PMID:28224992|PMID:28492532|PMID:28559085|PMID:28945494|PMID:29033008|PMID:29074561|PMID:29178642|PMID:29332120|PMID:29659842|PMID:29681726|PMID:29785639|PMID:29947567|PMID:30025081|PMID:30268864|PMID:30576320|PMID:30628748|PMID:30718709|PMID:30996589|PMID:31054281|PMID:31174678|PMID:31213501|PMID:31273949|PMID:31379919|PMID:31456290|PMID:31589614|PMID:31630094|PMID:31736247|PMID:31816670|PMID:31925606|PMID:3196484|PMID:31964843|PMID:32036094|PMID:32037395|PMID:32165824|PMID:32367544|PMID:32483926|PMID:32531858|PMID:32579692|PMID:32581362|PMID:32865313|PMID:33308271|PMID:33472769|PMID:33494148|PMID:33576794|PMID:33629268|PMID:33749171|PMID:33952291|PMID:34157943|PMID:34374989|PMID:34440443|PMID:34492281|PMID:34830511|PMID:34906171|PMID:34906470|PMID:35001204|PMID:35101781|PMID:35129589|PMID:35402056|PMID:35456422|PMID:35835501|PMID:35836572|PMID:36284460|PMID:36429068|PMID:36460718|PMID:36819107|PMID:36909829|PMID:38002999|PMID:9326927|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9536098|PMID:9843205
RPE65Bonobogenetic disease  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Inborn genetic diseasesClinVarPMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11095629|PMID:11462243|PMID:11786058|PMID:12960219|PMID:16123401|PMID:16150724|PMID:16205573|PMID:16754667|PMID:17197551|PMID:17525851|PMID:17576681|PMID:18539930|PMID:18632300|PMID:18682808|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19854499|PMID:20043869|PMID:20079931|PMID:20683928|PMID:21211845|PMID:24849605|PMID:25257057|PMID:25356976|PMID:25525159|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:26427455|PMID:26626312|PMID:26656277|PMID:28041643|PMID:28224992|PMID:28492532|PMID:28559085|PMID:28945494|PMID:29332120|PMID:30025081|PMID:30268864|PMID:30996589|PMID:31054281|PMID:31174678|PMID:31213501|PMID:31630094|PMID:31736247|PMID:31964843|PMID:32531858|PMID:32581362|PMID:32865313|PMID:33576794|PMID:34492281|PMID:34830511|PMID:34906171|PMID:35001204|PMID:35101781|PMID:35129589|PMID:35835501|PMID:35836572|PMID:36429068|PMID:36460718|PMID:36819107|PMID:38002999|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9536098|PMID:9843205
RPE65Bonobointellectual disability  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Intellectual disability, severeClinVarPMID:25741868
RPE65BonoboJoubert syndrome 9  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Joubert syndrome 9ClinVarPMID:10766140|PMID:16123440|PMID:19431183|PMID:24265693|PMID:25741868|PMID:28492532
RPE65BonoboLeber congenital amaurosis  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Congenital retinal blindness | ClinVar Annotator: match by term: Leber more ...ClinVarPMID:10090910|PMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11035546|PMID:11095629|PMID:11264131|PMID:11462243|PMID:11786058|PMID:12960219|PMID:13616783|PMID:14962443|PMID:15024725|PMID:15512997|PMID:15557452|PMID:15837919|PMID:16123401|PMID:16123440|PMID:16150724|PMID:16199547|PMID:16205573|PMID:16754667|PMID:16828753|PMID:17197551|PMID:17576681|PMID:17724218|PMID:17964524|PMID:18055820|PMID:18441371|PMID:18539930|PMID:18599565|PMID:18632300|PMID:18682808|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19753312|PMID:19854499|PMID:19920137|PMID:19959640|PMID:20079931|PMID:20604683|PMID:20683928|PMID:20801516|PMID:20811047|PMID:21151602|PMID:21153841|PMID:21211845|PMID:21602930|PMID:21911650|PMID:22334370|PMID:23591405|PMID:23661369|PMID:24066033|PMID:24265693|PMID:24849605|PMID:24997176|PMID:25097241|PMID:25257057|PMID:25324289|PMID:25356976|PMID:25495949|PMID:25525159|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:25972377|PMID:26024124|PMID:26047050|PMID:26355662|PMID:26364624|PMID:26427455|PMID:26605849|PMID:26626312|PMID:26656277|PMID:26906952|PMID:27102010|PMID:27535533|PMID:27874104|PMID:28041643|PMID:28130426|PMID:28181551|PMID:28224992|PMID:28492532|PMID:28714225|PMID:29033008|PMID:29186038|PMID:29332120|PMID:29681726|PMID:29785639|PMID:30025081|PMID:30268864|PMID:30653986|PMID:30718709|PMID:30870047|PMID:30924848|PMID:30996589|PMID:31273949|PMID:31456290|PMID:31736247|PMID:31878136|PMID:31964843|PMID:32037395|PMID:32165824|PMID:32347917|PMID:32581362|PMID:32865313|PMID:33308271|PMID:33472769|PMID:33494148|PMID:33629268|PMID:33749171|PMID:34492281|PMID:34830511|PMID:34906458|PMID:34906470|PMID:35129589|PMID:35836572|PMID:36909829|PMID:4492281|PMID:9326927|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9536098|PMID:9801879|PMID:9843205
RPE65BonoboLeber congenital amaurosis  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Congenital retinal blindness | ClinVar Annotator: match by term: Leber more ...ClinVarPMID:10090910|PMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11035546|PMID:11095629|PMID:11264131|PMID:11462243|PMID:11786058|PMID:12960219|PMID:13616783|PMID:14962443|PMID:15024725|PMID:15512997|PMID:15557452|PMID:15837919|PMID:16096063|PMID:16123401|PMID:16123440|PMID:16150724|PMID:16198348|PMID:16199547|PMID:16205573|PMID:16518657|PMID:16754667|PMID:16828753|PMID:17197551|PMID:17525851|PMID:17576681|PMID:17724218|PMID:17933883|PMID:17964524|PMID:18055820|PMID:18441371|PMID:18539930|PMID:18599565|PMID:18632300|PMID:18682808|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19753312|PMID:19854499|PMID:19920137|PMID:19959640|PMID:20043869|PMID:20079931|PMID:20604683|PMID:20683928|PMID:20801516|PMID:20811047|PMID:21151602|PMID:21153841|PMID:21211845|PMID:21602930|PMID:21911650|PMID:22334370|PMID:23591405|PMID:23661369|PMID:24066033|PMID:24265693|PMID:24849605|PMID:24997176|PMID:25097241|PMID:25257057|PMID:25324289|PMID:25333069|PMID:25356976|PMID:25495949|PMID:25525159|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:25972377|PMID:26024124|PMID:26047050|PMID:26355662|PMID:26364624|PMID:26427430|PMID:26427455|PMID:26605849|PMID:26626312|PMID:26656277|PMID:26906952|PMID:27102010|PMID:27535533|PMID:27874104|PMID:28041643|PMID:28130426|PMID:28181551|PMID:28224992|PMID:28492532|PMID:28559085|PMID:28714225|PMID:28945494|PMID:29033008|PMID:29074561|PMID:29178642|PMID:29186038|PMID:29332120|PMID:29681726|PMID:29785639|PMID:30025081|PMID:30268864|PMID:30653986|PMID:30718709|PMID:30870047|PMID:30924848|PMID:30996589|PMID:31054281|PMID:31174678|PMID:31213501|PMID:31273949|PMID:31429209|PMID:31456290|PMID:31580392|PMID:31589614|PMID:31630094|PMID:31736247|PMID:31816670|PMID:31878136|PMID:31925606|PMID:3196484|PMID:31964843|PMID:32036094|PMID:32037395|PMID:32165824|PMID:32347917|PMID:32531858|PMID:32579692|PMID:32581362|PMID:32865313|PMID:33308271|PMID:33472769|PMID:33494148|PMID:33576794|PMID:33629268|PMID:33749171|PMID:34157943|PMID:34374989|PMID:34492281|PMID:34830511|PMID:34906171|PMID:34906458|PMID:34906470|PMID:35101781|PMID:35129589|PMID:35402056|PMID:35456422|PMID:35835501|PMID:35836572|PMID:36271235|PMID:36284460|PMID:36429068|PMID:36460718|PMID:36819107|PMID:36909829|PMID:37704110|PMID:4492281|PMID:9326927|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9536098|PMID:9801879|PMID:9843205
RPE65BonoboLeber congenital amaurosis  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Congenital retinal blindness | ClinVar Annotator: match by term: Leber more ...ClinVarPMID:10090910|PMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11035546|PMID:11095629|PMID:11264131|PMID:11462243|PMID:11786058|PMID:12960219|PMID:13616783|PMID:14962443|PMID:15024725|PMID:15512997|PMID:15557452|PMID:15837919|PMID:16123401|PMID:16123440|PMID:16150724|PMID:16198348|PMID:16199547|PMID:16205573|PMID:16754667|PMID:16828753|PMID:17197551|PMID:17576681|PMID:17724218|PMID:17964524|PMID:18055820|PMID:18441371|PMID:18539930|PMID:18599565|PMID:18632300|PMID:18682808|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19753312|PMID:19854499|PMID:19920137|PMID:19959640|PMID:20079931|PMID:20604683|PMID:20683928|PMID:20801516|PMID:20811047|PMID:21151602|PMID:21153841|PMID:21211845|PMID:21602930|PMID:21911650|PMID:22334370|PMID:23591405|PMID:23661369|PMID:24066033|PMID:24265693|PMID:24849605|PMID:24997176|PMID:25097241|PMID:25257057|PMID:25324289|PMID:25356976|PMID:25495949|PMID:25525159|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:25972377|PMID:26024124|PMID:26047050|PMID:26355662|PMID:26364624|PMID:26427455|PMID:26605849|PMID:26626312|PMID:26656277|PMID:26906952|PMID:27102010|PMID:27535533|PMID:27874104|PMID:28041643|PMID:28130426|PMID:28181551|PMID:28224992|PMID:28492532|PMID:28714225|PMID:29033008|PMID:29186038|PMID:29332120|PMID:29681726|PMID:29785639|PMID:30025081|PMID:30268864|PMID:30653986|PMID:30718709|PMID:30870047|PMID:30924848|PMID:30996589|PMID:31273949|PMID:31429209|PMID:31456290|PMID:31580392|PMID:31736247|PMID:31878136|PMID:31964843|PMID:32037395|PMID:32165824|PMID:32347917|PMID:32531858|PMID:32581362|PMID:32865313|PMID:33308271|PMID:33472769|PMID:33494148|PMID:33629268|PMID:33749171|PMID:34492281|PMID:34830511|PMID:34906458|PMID:34906470|PMID:35129589|PMID:35836572|PMID:36271235|PMID:36460718|PMID:36909829|PMID:37704110|PMID:4492281|PMID:9326927|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9536098|PMID:9801879|PMID:9843205
RPE65BonoboLeber congenital amaurosis  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis | ClinVar Annotator: match by term: Leber's more ...ClinVarPMID:10090910|PMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11035546|PMID:11095629|PMID:11264131|PMID:11462243|PMID:11786058|PMID:12960219|PMID:13616783|PMID:14962443|PMID:15024725|PMID:15512997|PMID:15557452|PMID:15837919|PMID:16096063|PMID:16123401|PMID:16123440|PMID:16150724|PMID:16198348|PMID:16199547|PMID:16205573|PMID:16518657|PMID:16754667|PMID:16828753|PMID:17197551|PMID:17525851|PMID:17576681|PMID:17724218|PMID:17933883|PMID:17964524|PMID:18055820|PMID:18441371|PMID:18539930|PMID:18599565|PMID:18632300|PMID:18682808|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19753312|PMID:19854499|PMID:19920137|PMID:19959640|PMID:20043869|PMID:20079931|PMID:20604683|PMID:20683928|PMID:20801516|PMID:20811047|PMID:21151602|PMID:21153841|PMID:21211845|PMID:21602930|PMID:21911650|PMID:22334370|PMID:23591405|PMID:23661369|PMID:23878505|PMID:24066033|PMID:24265693|PMID:24849605|PMID:24997176|PMID:25097241|PMID:25257057|PMID:25324289|PMID:25333069|PMID:25356976|PMID:25495949|PMID:25525159|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:25972377|PMID:26024124|PMID:26047050|PMID:26355662|PMID:26364624|PMID:26427430|PMID:26427455|PMID:26605849|PMID:26626312|PMID:26656277|PMID:26667666|PMID:26906952|PMID:27102010|PMID:27535533|PMID:27874104|PMID:28041643|PMID:28130426|PMID:28181551|PMID:28224992|PMID:28492532|PMID:28559085|PMID:28714225|PMID:28945494|PMID:29033008|PMID:29074561|PMID:29178642|PMID:29186038|PMID:29332120|PMID:29681726|PMID:29785639|PMID:30025081|PMID:30268864|PMID:30653986|PMID:30718709|PMID:30870047|PMID:30924848|PMID:30996589|PMID:31054281|PMID:31174678|PMID:31213501|PMID:31273949|PMID:31429209|PMID:31456290|PMID:31580392|PMID:31589614|PMID:31630094|PMID:31736247|PMID:31816670|PMID:31878136|PMID:31925606|PMID:3196484|PMID:31964843|PMID:32036094|PMID:32037395|PMID:32165824|PMID:32347917|PMID:32531858|PMID:32579692|PMID:32581362|PMID:32865313|PMID:33090715|PMID:33308271|PMID:33472769|PMID:33494148|PMID:33576794|PMID:33629268|PMID:33749171|PMID:33952291|PMID:34157943|PMID:34374989|PMID:34492281|PMID:34830511|PMID:34906171|PMID:34906458|PMID:34906470|PMID:35001204|PMID:35101781|PMID:35129589|PMID:35402056|PMID:35456422|PMID:35835501|PMID:35836572|PMID:36225124|PMID:36271235|PMID:36284460|PMID:36429068|PMID:36460718|PMID:36819107|PMID:36909829|PMID:37217489|PMID:37704110|PMID:37901629|PMID:38002999|PMID:38219857|PMID:4492281|PMID:9326927|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9536098|PMID:9801879|PMID:9843205
RPE65BonoboLeber congenital amaurosis  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Congenital retinal blindness | ClinVar Annotator: match by term: Leber more ...ClinVarPMID:10090910|PMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11035546|PMID:11095629|PMID:11264131|PMID:11462243|PMID:11786058|PMID:12960219|PMID:13616783|PMID:14962443|PMID:15024725|PMID:15512997|PMID:15557452|PMID:15837919|PMID:16123401|PMID:16123440|PMID:16150724|PMID:16199547|PMID:16205573|PMID:16754667|PMID:16828753|PMID:17197551|PMID:17576681|PMID:17724218|PMID:17964524|PMID:18055820|PMID:18441371|PMID:18539930|PMID:18599565|PMID:18632300|PMID:18682808|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19753312|PMID:19854499|PMID:19920137|PMID:19959640|PMID:20079931|PMID:20604683|PMID:20683928|PMID:20801516|PMID:20811047|PMID:21151602|PMID:21153841|PMID:21211845|PMID:21602930|PMID:21911650|PMID:22334370|PMID:23591405|PMID:23661369|PMID:24066033|PMID:24265693|PMID:24849605|PMID:24997176|PMID:25097241|PMID:25257057|PMID:25324289|PMID:25356976|PMID:25495949|PMID:25525159|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:25972377|PMID:26024124|PMID:26047050|PMID:26355662|PMID:26364624|PMID:26427455|PMID:26605849|PMID:26626312|PMID:26656277|PMID:26906952|PMID:27102010|PMID:27535533|PMID:27874104|PMID:28041643|PMID:28130426|PMID:28181551|PMID:28224992|PMID:28492532|PMID:28714225|PMID:29033008|PMID:29186038|PMID:29332120|PMID:29681726|PMID:29785639|PMID:30025081|PMID:30268864|PMID:30653986|PMID:30718709|PMID:30870047|PMID:30924848|PMID:30996589|PMID:31273949|PMID:31429209|PMID:31456290|PMID:31736247|PMID:31878136|PMID:31964843|PMID:32037395|PMID:32165824|PMID:32347917|PMID:32531858|PMID:32581362|PMID:32865313|PMID:33308271|PMID:33472769|PMID:33494148|PMID:33629268|PMID:33749171|PMID:34492281|PMID:34830511|PMID:34906458|PMID:34906470|PMID:35129589|PMID:35836572|PMID:36271235|PMID:36460718|PMID:36909829|PMID:37704110|PMID:4492281|PMID:9326927|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9536098|PMID:9801879|PMID:9843205
RPE65BonoboLeber congenital amaurosis 2  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: AMAUROSIS CONGENITA OF LEBER II | ClinVar Annotator: match by more ...ClinVarPMID:10090910|PMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11035546|PMID:11095629|PMID:11264131|PMID:11295838|PMID:11462243|PMID:11786058|PMID:12960219|PMID:13616783|PMID:14962443|PMID:14971589|PMID:15024725|PMID:15512997|PMID:15557452|PMID:15837919|PMID:16096063|PMID:16123401|PMID:16123440|PMID:16150724|PMID:16199547|PMID:16205573|PMID:16505055|PMID:16518657|PMID:16754667|PMID:16828753|PMID:17197551|PMID:17525851|PMID:17576681|PMID:17724218|PMID:17964524|PMID:18055820|PMID:18441371|PMID:18484312|PMID:18539930|PMID:18599565|PMID:18632300|PMID:18682808|PMID:18722466|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19753312|PMID:19854499|PMID:19920137|PMID:19959640|PMID:20043869|PMID:20079931|PMID:20604683|PMID:20683928|PMID:20801516|PMID:20811047|PMID:21151602|PMID:21153841|PMID:21211845|PMID:21602930|PMID:21654732|PMID:21911650|PMID:22164218|PMID:22334370|PMID:22509104|PMID:23591405|PMID:23661368|PMID:23661369|PMID:23878505|PMID:24066033|PMID:24265693|PMID:24849605|PMID:24997176|PMID:25097241|PMID:25257057|PMID:25324289|PMID:25356976|PMID:25383945|PMID:25495949|PMID:25525159|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:25972377|PMID:26024124|PMID:26047050|PMID:26147992|PMID:26306921|PMID:26355662|PMID:26364624|PMID:26427455|PMID:26605849|PMID:26626312|PMID:26656277|PMID:26667666|PMID:26906952|PMID:27102010|PMID:27208204|PMID:27307694|PMID:27535533|PMID:27874104|PMID:28041643|PMID:28041994|PMID:28130426|PMID:28181551|PMID:28224992|PMID:28393863|PMID:28418496|PMID:28492532|PMID:28559085|PMID:28714225|PMID:28838317|PMID:28945494|PMID:29033008|PMID:29068479|PMID:29178642|PMID:29186038|PMID:29332120|PMID:29641573|PMID:29659842|PMID:29681726|PMID:29785639|PMID:29947567|PMID:30025081|PMID:30268864|PMID:30576320|PMID:30628748|PMID:30653986|PMID:30718709|PMID:30870047|PMID:30924848|PMID:30996589|PMID:31054281|PMID:31174678|PMID:31273949|PMID:31379919|PMID:31429209|PMID:31456290|PMID:31580392|PMID:31630094|PMID:31725702|PMID:31736247|PMID:31878136|PMID:31957135|PMID:31960602|PMID:31964843|PMID:32037395|PMID:32165824|PMID:32347917|PMID:32367544|PMID:32531858|PMID:32581362|PMID:32865313|PMID:33090715|PMID:33308271|PMID:33472769|PMID:33494148|PMID:33576794|PMID:33629268|PMID:33749171|PMID:33952291|PMID:34492281|PMID:34830511|PMID:34906458|PMID:34906470|PMID:35129589|PMID:35836572|PMID:36271235|PMID:36460718|PMID:36909829|PMID:37704110|PMID:4492281|PMID:9326927|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9536098|PMID:9801879|PMID:9843205
RPE65BonoboLeber congenital amaurosis 2  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: AMAUROSIS CONGENITA OF LEBER II | ClinVar Annotator: match by more ...ClinVarPMID:10090910|PMID:10766140|PMID:10937591|PMID:11035546|PMID:11095629|PMID:11264131|PMID:11295838|PMID:11462243|PMID:11786058|PMID:12960219|PMID:13616783|PMID:14962443|PMID:14971589|PMID:15024725|PMID:15512997|PMID:15557452|PMID:15837919|PMID:16096063|PMID:16123401|PMID:16123440|PMID:16150724|PMID:16198348|PMID:16199547|PMID:16205573|PMID:16505055|PMID:16518657|PMID:16754667|PMID:16828753|PMID:17197551|PMID:17525851|PMID:17576681|PMID:17724218|PMID:17933883|PMID:17964524|PMID:18055820|PMID:18441371|PMID:18484312|PMID:18539930|PMID:18599565|PMID:18632300|PMID:18682808|PMID:18722466|PMID:19117922|PMID:19431183|PMID:19753312|PMID:19854499|PMID:19920137|PMID:19959640|PMID:20043869|PMID:20079931|PMID:20604683|PMID:20683928|PMID:20801516|PMID:20811047|PMID:21151602|PMID:21153841|PMID:21211845|PMID:21602930|PMID:21654732|PMID:21911650|PMID:22164218|PMID:2233437|PMID:22334370|PMID:22509104|PMID:23591405|PMID:23661368|PMID:23661369|PMID:23878505|PMID:24066033|PMID:24265693|PMID:24849605|PMID:24997176|PMID:25097241|PMID:25257057|PMID:25324289|PMID:25333069|PMID:25356976|PMID:25383945|PMID:25495949|PMID:25525159|PMID:25741868|PMID:25752820|PMID:25972377|PMID:26024124|PMID:26047050|PMID:26147992|PMID:26306921|PMID:26355662|PMID:26364624|PMID:26427430|PMID:26427455|PMID:26605849|PMID:26626312|PMID:26656277|PMID:26667666|PMID:26906952|PMID:27102010|PMID:27208204|PMID:27307694|PMID:27535533|PMID:27874104|PMID:28041643|PMID:28041994|PMID:28130426|PMID:28181551|PMID:28224992|PMID:28393863|PMID:28418496|PMID:28492532|PMID:28559085|PMID:28714225|PMID:28838317|PMID:28945494|PMID:29033008|PMID:29068479|PMID:29074561|PMID:29178642|PMID:29186038|PMID:29332120|PMID:29641573|PMID:29659842|PMID:29681726|PMID:29785639|PMID:29947567|PMID:30025081|PMID:30268864|PMID:30576320|PMID:30628748|PMID:30653986|PMID:30718709|PMID:30870047|PMID:30924848|PMID:30996589|PMID:31054281|PMID:31174678|PMID:31213501|PMID:31273949|PMID:31379919|PMID:31429209|PMID:31456290|PMID:31580392|PMID:31589614|PMID:31630094|PMID:31725702|PMID:31736247|PMID:31816670|PMID:31878136|PMID:31925606|PMID:31957135|PMID:31960602|PMID:3196484|PMID:31964843|PMID:32036094|PMID:32037395|PMID:32165824|PMID:32347917|PMID:32367544|PMID:32483926|PMID:32531858|PMID:32579692|PMID:32581362|PMID:32865313|PMID:33090715|PMID:33308271|PMID:33472769|PMID:33494148|PMID:33576794|PMID:33629268|PMID:33749171|PMID:33952291|PMID:34157943|PMID:34374989|PMID:34440443|PMID:34492281|PMID:34830511|PMID:34906171|PMID:34906458|PMID:34906470|PMID:35001204|PMID:35101781|PMID:35129589|PMID:35402056|PMID:35456422|PMID:35835501|PMID:35836572|PMID:36225124|PMID:36271235|PMID:36284460|PMID:36429068|PMID:36460718|PMID:36819107|PMID:36909829|PMID:37217489|PMID:37704110|PMID:37734845|PMID:38002999|PMID:4492281|PMID:9326927|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9536098|PMID:9801879|PMID:9843205
RPE65BonoboNeurodevelopmental Disorders  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Neurodevelopmental disorderClinVarPMID:21654732|PMID:25741868|PMID:27307694|PMID:28041994|PMID:28492532|PMID:29659842|PMID:29947567|PMID:30628748|PMID:31379919
RPE65Bonobopathologic nystagmus  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: NystagmusClinVarPMID:32581362
RPE65Bonoboretinal degeneration  ISORGD:7324168554872ClinVar Annotator: match by term: Retinal degenerationClinVarPMID:16199547|PMID:18632300|PMID:25741868|PMID:28492532|PMID:32367544|PMID:9326941|PMID:9501220|PMID:9843205
1 to 20 of 25 rows
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
RPE65Bonoboblindness  ISORGD:7324169068941CTD Direct Evidence: marker/mechanism|therapeuticCTDPMID:16150724|PMID:16226919
RPE65Bonobocongenital nystagmus  ISORGD:7324169068941CTD Direct Evidence: marker/mechanismCTDPMID:32971638
RPE65BonoboHereditary Eye Diseases  ISORGD:7324169068941CTD Direct Evidence: therapeuticCTDPMID:16968212
RPE65BonoboLeber hereditary optic neuropathy  ISORGD:7324169068941CTD Direct Evidence: marker/mechanismCTDPMID:16828753|PMID:17011878
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
RPE65BonoboLeber congenital amaurosis 2  ISORGD:7324167240710 OMIM 
RPE65Bonoboretinitis pigmentosa 20  ISORGD:7324167240710 OMIM 
RPE65Bonoboretinitis pigmentosa 87  ISORGD:7324167240710 OMIM 


Biological Process
1 to 14 of 14 rows

  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
RPE65Bonobocamera-type eye development  ISORGD:6213969068941 RGDPMID:9512345|REF_RGD_ID:633787
RPE65Bonobocircadian rhythm  ISORGD:6213969068941 RGDPMID:12742352|REF_RGD_ID:9585648
RPE65Bonobodetection of light stimulus involved in visual perception involved_inIEAUniProtKB:Q16518|ensembl:ENSP00000262340150520179 EnsemblGO_REF:0000107
RPE65Bonoboneural retina development  ISORGD:6213969068941 RGDPMID:2631392|REF_RGD_ID:9585660
RPE65Bonoboresponse to light stimulus  ISORGD:6213969068941 RGDPMID:17389522|REF_RGD_ID:9585654
RPE65Bonoboretina homeostasis involved_inIEAUniProtKB:Q16518|ensembl:ENSP00000262340150520179 EnsemblGO_REF:0000107
RPE65Bonoboretinal metabolic process  ISORGD:6213969068941 RGDPMID:21785167|REF_RGD_ID:6893661
RPE65Bonoboretinal metabolic process involved_inIEAPANTHER:PTN000057233150520179 TreeGrafterGO_REF:0000118
RPE65Bonoboretinoid metabolic process involved_inIEAUniProtKB:Q16518|ensembl:ENSP00000262340150520179 EnsemblGO_REF:0000107
RPE65Bonoboretinol metabolic process involved_inIEAGO:0052884|GO:0052885150520179 GOCGO_REF:0000108
RPE65Bonoboretinol metabolic process  ISORGD:6213969068941 RGDPMID:3603006|REF_RGD_ID:9585656
RPE65Bonobovisual perception involved_inIEAUniProtKB-KW:KW-0844150520179 UniProtGO_REF:0000043
RPE65Bonobozeaxanthin biosynthetic process involved_inIEAPANTHER:PTN000057233150520179 TreeGrafterGO_REF:0000118
RPE65Bonobozeaxanthin biosynthetic process involved_inIEAUniProtKB:Q16518|ensembl:ENSP00000262340150520179 EnsemblGO_REF:0000107
1 to 14 of 14 rows

Cellular Component

  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
RPE65Bonobocell body  ISORGD:6213969068941 RGDPMID:19180257|REF_RGD_ID:6893662
RPE65Bonobocytoplasm located_inIEAUniProtKB:Q91ZQ5|ensembl:ENSMUSP00000143654150520179 EnsemblGO_REF:0000107
RPE65Bonoboendoplasmic reticulum membrane located_inIEAUniProtKB:Q16518|ensembl:ENSP00000262340150520179 EnsemblGO_REF:0000107
RPE65Bonobomembrane located_inIEAUniProtKB-KW:KW-0472150520179 UniProtGO_REF:0000043
RPE65Bonobonucleus located_inIEAUniProtKB:Q91ZQ5|ensembl:ENSMUSP00000143654150520179 EnsemblGO_REF:0000107
RPE65Bonoboplasma membrane located_inIEAUniProtKB:Q91ZQ5|ensembl:ENSMUSP00000143654150520179 EnsemblGO_REF:0000107
RPE65Bonoboplasma membrane located_inIEAUniProtKB-KW:KW-1003150520179 UniProtGO_REF:0000043
RPE65Bonoboplasma membrane located_inIEAUniProtKB-SubCell:SL-0039150520179 UniProtGO_REF:0000044

Molecular Function
1 to 11 of 11 rows

  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
RPE65Bonoboall-trans-retinyl-ester hydrolase, 11-cis retinol forming activity  ISORGD:6213969068941 RGDPMID:21785167|REF_RGD_ID:6893661
RPE65Bonoboall-trans-retinyl-ester hydrolase, 11-cis retinol forming activity enablesIEAPANTHER:PTN000057233150520179 TreeGrafterGO_REF:0000118
RPE65Bonoboall-trans-retinyl-palmitate hydrolase, 11-cis retinol forming activity enablesIEAUniProtKB:Q16518|ensembl:ENSP00000262340150520179 EnsemblGO_REF:0000107
RPE65Bonobobeta-carotene 15,15'-dioxygenase activity enablesIEAPANTHER:PTN000057233150520179 TreeGrafterGO_REF:0000118
RPE65Bonoboisomerase activity enablesIEAUniProtKB:Q16518|ensembl:ENSP00000262340150520179 EnsemblGO_REF:0000107
RPE65Bonoboisomerase activity enablesIEAUniProtKB-KW:KW-0413150520179 UniProtGO_REF:0000043
RPE65Bonobometal ion binding enablesIEAUniProtKB-KW:KW-0479150520179 UniProtGO_REF:0000043
RPE65Bonobooxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen enablesIEAInterPro:IPR004294150520179 InterProGO_REF:0000002
RPE65Bonoboprotein binding enablesISOUniProtKB:P974799068941 PMID:21493626IntActPMID:21493626
RPE65Bonoboprotein binding enablesISOUniProtKB:Q925269068941 PMID:28514442, PMID:33961781IntActPMID:28514442|PMID:33961781
RPE65Bonoboretinol isomerase activity enablesIEAPANTHER:PTN000057233150520179 TreeGrafterGO_REF:0000118
1 to 11 of 11 rows

RGD Manual Annotations


  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
RPE65Bonoboaltered retinoid cycle metabolic pathway   ISORGD:7324169068941 RGDPMID:20212494|REF_RGD_ID:8547536
RPE65Bonoboretinitis pigmentosa pathway   ISORGD:7324169068941 RGDPMID:23701314|REF_RGD_ID:8547535
RPE65Bonoboretinoid cycle metabolic pathway   ISORGD:6213969068941 RGDPMID:21785167|REF_RGD_ID:6893661
RPE65Bonoboretinoid cycle metabolic pathway   ISORGD:7324169068941 RGDPMID:21447403|REF_RGD_ID:6893650

Imported Annotations - SMPDB

Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
RPE65Bonoboretinol metabolic pathway   ISORGD:7324169068941 SMPDBSMP:00074
RPE65Bonobovitamin A deficiency pathway  ISORGD:7324169068941 SMPDBSMP:00336
PMID:30032202  



RPE65
(Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee)
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
NHGRI_mPanPan1-v21158,421,347 - 158,442,454 (+)NCBINHGRI_mPanPan1-v2
NHGRI_mPanPan11157,581,121 - 157,602,228 (+)NCBINHGRI_mPanPan1
Mhudiblu_PPA_v0167,666,784 - 67,687,891 (-)NCBIMhudiblu_PPA_v0Mhudiblu_PPA_v0panPan3
PanPan1.1169,623,775 - 69,644,894 (-)NCBIpanpan1.1PanPan1.1panPan2
PanPan1.1 Ensembl169,623,775 - 69,644,904 (-)Ensemblpanpan1.1panPan2
RPE65
(Homo sapiens - human)
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCh38168,428,822 - 68,449,954 (-)NCBIGRCh38GRCh38hg38GRCh38
GRCh38.p14 Ensembl168,428,822 - 68,451,103 (-)EnsemblGRCh38hg38GRCh38
GRCh37168,894,505 - 68,915,637 (-)NCBIGRCh37GRCh37hg19GRCh37
Build 36168,667,095 - 68,688,230 (-)NCBINCBI36Build 36hg18NCBI36
Build 34168,606,465 - 68,627,663NCBI
Celera167,184,748 - 67,205,854 (-)NCBICelera
Cytogenetic Map1p31.3NCBI
HuRef167,004,313 - 67,025,452 (-)NCBIHuRef
CHM1_1169,009,866 - 69,031,001 (-)NCBICHM1_1
T2T-CHM13v2.0168,306,207 - 68,327,339 (-)NCBIT2T-CHM13v2.0
Rpe65
(Mus musculus - house mouse)
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm393159,304,712 - 159,330,944 (+)NCBIGRCm39GRCm39mm39
GRCm39 Ensembl3159,304,812 - 159,330,958 (+)EnsemblGRCm39 Ensembl
GRCm383159,599,075 - 159,625,307 (+)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl3159,599,175 - 159,625,321 (+)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv373159,262,145 - 159,288,271 (+)NCBIGRCm37MGSCv37mm9NCBIm37
MGSCv363159,534,526 - 159,560,092 (+)NCBIMGSCv36mm8
Celera3166,038,618 - 166,064,587 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map3H4NCBI
cM Map382.52NCBI
Rpe65
(Rattus norvegicus - Norway rat)
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCr82251,425,228 - 251,457,209 (+)NCBIGRCr8
mRatBN7.22248,766,497 - 248,798,403 (+)NCBImRatBN7.2mRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl2248,766,612 - 248,798,403 (+)EnsemblmRatBN7.2 Ensembl
UTH_Rnor_SHR_Utx2256,482,408 - 256,514,178 (+)NCBIRnor_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.02254,375,936 - 254,407,703 (+)NCBIRnor_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.02249,342,889 - 249,374,020 (+)NCBIRnor_WKYUTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0
Rnor_6.02266,141,581 - 266,169,197 (+)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl2266,141,581 - 266,169,197 (+)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.02284,774,159 - 284,804,254 (+)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.12257,860,998 - 257,893,921 (+)NCBI
Celera2240,512,281 - 240,537,640 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map2q45NCBI
Rpe65
(Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla)
Chinchilla AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChiLan1.0 EnsemblNW_00495542323,183,937 - 23,208,282 (+)EnsemblChiLan1.0
ChiLan1.0NW_00495542323,184,326 - 23,208,206 (+)NCBIChiLan1.0ChiLan1.0
RPE65
(Canis lupus familiaris - dog)
Dog AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
CanFam3.1676,887,399 - 76,911,133 (+)NCBICanFam3.1CanFam3.1canFam3CanFam3.1
CanFam3.1 Ensembl676,887,399 - 76,911,131 (+)EnsemblCanFam3.1canFam3CanFam3.1
Dog10K_Boxer_Tasha679,498,666 - 79,521,615 (+)NCBIDog10K_Boxer_Tasha
ROS_Cfam_1.0677,481,101 - 77,504,927 (+)NCBIROS_Cfam_1.0
ROS_Cfam_1.0 Ensembl677,481,101 - 77,504,925 (+)EnsemblROS_Cfam_1.0 Ensembl
UMICH_Zoey_3.1677,031,835 - 77,055,739 (+)NCBIUMICH_Zoey_3.1
UNSW_CanFamBas_1.0676,935,191 - 76,959,205 (+)NCBIUNSW_CanFamBas_1.0
UU_Cfam_GSD_1.0677,422,281 - 77,446,314 (+)NCBIUU_Cfam_GSD_1.0
Rpe65
(Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel)
Squirrel AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HiC_Itri_2NW_02440505881,055,133 - 81,142,276 (-)NCBIHiC_Itri_2
SpeTri2.0 EnsemblNW_0049365913,347,272 - 3,368,015 (+)EnsemblSpeTri2.0SpeTri2.0 Ensembl
SpeTri2.0NW_0049365913,347,346 - 3,368,062 (+)NCBISpeTri2.0SpeTri2.0SpeTri2.0
RPE65
(Sus scrofa - pig)
Pig AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
Sscrofa11.1 Ensembl6144,206,078 - 144,229,467 (+)EnsemblSscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa11.16144,206,078 - 144,229,471 (+)NCBISscrofa11.1Sscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa10.26133,491,901 - 133,514,217 (+)NCBISscrofa10.2Sscrofa10.2susScr3
RPE65
(Chlorocebus sabaeus - green monkey)
Green Monkey AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChlSab1.12064,662,777 - 64,684,178 (+)NCBIChlSab1.1ChlSab1.1chlSab2
ChlSab1.1 Ensembl2064,664,358 - 64,683,211 (+)EnsemblChlSab1.1ChlSab1.1 EnsemblchlSab2
Vero_WHO_p1.0NW_02366603352,929,980 - 52,950,761 (-)NCBIVero_WHO_p1.0Vero_WHO_p1.0
Rpe65
(Heterocephalus glaber - naked mole-rat)
Naked Mole-Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HetGla_female_1.0 EnsemblNW_00462474227,302,453 - 27,319,203 (+)EnsemblHetGla_female_1.0HetGla_female_1.0 EnsemblhetGla2
HetGla 1.0NW_00462474227,302,222 - 27,319,549 (+)NCBIHetGla_female_1.0HetGla 1.0hetGla2

.

1 to 10 of 113 rows
Name
Type
Condition(s)
Position(s)
Clinical significance
GRCh38/hg38 20p13(chr20:89939-1360110)x1 copy number loss See cases [RCV000050841] Chr20:89939..1360110 [GRCh38]
Chr20:70580..1340754 [GRCh37]
Chr20:18580..1288754 [NCBI36]
Chr20:20p13
pathogenic
GRCh38/hg38 20p13(chr20:89939-1028206)x3 copy number gain See cases [RCV000050986] Chr20:89939..1028206 [GRCh38]
Chr20:70580..1008849 [GRCh37]
Chr20:18580..956849 [NCBI36]
Chr20:20p13
pathogenic
GRCh38/hg38 20p13(chr20:89939-1852477)x1 copy number loss See cases [RCV000050373] Chr20:89939..1852477 [GRCh38]
Chr20:70580..1833123 [GRCh37]
Chr20:18580..1781123 [NCBI36]
Chr20:20p13
pathogenic
GRCh38/hg38 20p13-11.21(chr20:89939-25697564)x3 copy number gain See cases [RCV000051227] Chr20:89939..25697564 [GRCh38]
Chr20:70580..25678200 [GRCh37]
Chr20:18580..25626200 [NCBI36]
Chr20:20p13-11.21
pathogenic
GRCh38/hg38 20p13-11.23(chr20:89939-19146279)x3 copy number gain See cases [RCV000051041] Chr20:89939..19146279 [GRCh38]
Chr20:70580..19126923 [GRCh37]
Chr20:18580..19074923 [NCBI36]
Chr20:20p13-11.23
pathogenic
GRCh38/hg38 20p13(chr20:89939-975656)x1 copy number loss See cases [RCV000052733] Chr20:89939..975656 [GRCh38]
Chr20:70580..956299 [GRCh37]
Chr20:18580..904299 [NCBI36]
Chr20:20p13
pathogenic
GRCh38/hg38 20p13(chr20:89939-1939218)x1 copy number loss See cases [RCV000052735] Chr20:89939..1939218 [GRCh38]
Chr20:70580..1919864 [GRCh37]
Chr20:18580..1867864 [NCBI36]
Chr20:20p13
pathogenic
GRCh38/hg38 20p13(chr20:89939-1770567)x1 copy number loss See cases [RCV000052736] Chr20:89939..1770567 [GRCh38]
Chr20:70580..1751213 [GRCh37]
Chr20:18580..1699213 [NCBI36]
Chr20:20p13
pathogenic
GRCh38/hg38 20p13(chr20:89939-1668795)x1 copy number loss Developmental Delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000052737]|Developmental delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000052737]|See cases [RCV000052737] Chr20:89939..1668795 [GRCh38]
Chr20:70580..1649441 [GRCh37]
Chr20:18580..1597441 [NCBI36]
Chr20:20p13
pathogenic
GRCh38/hg38 20p13(chr20:121781-2290194)x1 copy number loss See cases [RCV000052738] Chr20:121781..2290194 [GRCh38]
Chr20:102422..2270840 [GRCh37]
Chr20:50422..2218840 [NCBI36]
Chr20:20p13
pathogenic
1 to 10 of 113 rows






Ensembl Acc Id: ENSPPAT00000062852   ⟹   ENSPPAP00000039939
Type: CODING
Position:
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)Source
PanPan1.1 Ensembl169,623,775 - 69,644,904 (-)Ensembl
Ensembl Acc Id: ENSPPAT00000062856   ⟹   ENSPPAP00000039944
Type: CODING
Position:
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)Source
PanPan1.1 Ensembl169,623,868 - 69,644,904 (-)Ensembl
RefSeq Acc Id: XM_003807877   ⟹   XP_003807925
Type: CODING
Position:
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)Source
NHGRI_mPanPan1-v21158,421,347 - 158,442,454 (+)NCBI
NHGRI_mPanPan11157,581,121 - 157,602,228 (+)NCBI
Mhudiblu_PPA_v0167,666,784 - 67,687,891 (-)NCBI
PanPan1.1169,623,775 - 69,644,894 (-)NCBI
Sequence:
RefSeq Acc Id: XM_034967277   ⟹   XP_034823168
Type: CODING
Position:
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)Source
NHGRI_mPanPan1-v21158,421,347 - 158,442,454 (+)NCBI
NHGRI_mPanPan11157,581,121 - 157,602,228 (+)NCBI
Mhudiblu_PPA_v0167,666,784 - 67,687,891 (-)NCBI
Protein RefSeqs XP_003807925 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer  
  XP_034823168 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer  
Ensembl Protein ENSPPAP00000039939.1
  ENSPPAP00000039944.1
RefSeq Acc Id: XP_003807925   ⟸   XM_003807877
- Peptide Label: isoform X1
- UniProtKB: A0A2R9CDI3 (UniProtKB/TrEMBL)
- Sequence:
RefSeq Acc Id: XP_034823168   ⟸   XM_034967277
- Peptide Label: isoform X2
- UniProtKB: A0A2R9CDI9 (UniProtKB/TrEMBL)
Ensembl Acc Id: ENSPPAP00000039944   ⟸   ENSPPAT00000062856
Ensembl Acc Id: ENSPPAP00000039939   ⟸   ENSPPAT00000062852



1 to 11 of 11 rows
Database
Acc Id
Source(s)
Ensembl Genes ENSPPAG00000042629 Ensembl, UniProtKB/TrEMBL
Ensembl Transcript ENSPPAT00000062852.1 UniProtKB/TrEMBL
  ENSPPAT00000062856.1 UniProtKB/TrEMBL
InterPro Carotenoid_Oase UniProtKB/TrEMBL
KEGG Report pps:100994777 UniProtKB/TrEMBL
NCBI Gene RPE65 ENTREZGENE
PANTHER PTHR10543 UniProtKB/TrEMBL
  RETINOID ISOMEROHYDROLASE UniProtKB/TrEMBL
Pfam RPE65 UniProtKB/TrEMBL
UniProt A0A2R9CDI3 ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL
  A0A2R9CDI9 ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL
1 to 11 of 11 rows


Date Current Symbol Current Name Previous Symbol Previous Name Description Reference Status
2019-01-29 RPE65  retinoid isomerohydrolase RPE65    RPE65, retinoid isomerohydrolase  Symbol and/or name change 5135510 APPROVED