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Gene Annotator (Functional Annotation) |
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InterViewer (Protein-Protein Interactions) |
GViewer (Genome Viewer) |
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 OLGA (Gene List Generator) unavailable |
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Gene Annotator (Annotation Comparison) |
OLGA (Gene List Generator) |
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 MOET (Multi-Ontology Enrichement) unavailable |
 GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) unavailable |
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MOET (Multi-Ontology Enrichement) |
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) |
Imported Annotations - CTD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mammary Neoplasms, Experimental | ISO | RGD:733030 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:16619500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction AnnotationsGene Ontology AnnotationsMolecular Pathway AnnotationsPhenotype AnnotationsDisease Annotations
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Gene-Chemical Interaction Annotations
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Gene Ontology Annotations
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Molecular Pathway AnnotationsPhenotype Annotations
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References - curated| 1. | Balogh A, etal., J Cell Sci. 1998 Jan;111 ( Pt 2):161-9. |
| 2. | Cadel S, etal., Proc Natl Acad Sci U S A 1997 Apr 1;94(7):2963-8. |
| 3. | Carrera MP, etal., Cancer Invest. 2006 Mar;24(2):149-53. |
| 4. | Flister MJ, etal., Hypertension. 2013 Apr;61(4):850-6. doi: 10.1161/HYPERTENSIONAHA.111.01008. Epub 2013 Mar 4. |
| 5. | Fontes G, etal., Endocrinology. 2005 Feb;146(2):702-12. Epub 2004 Nov 11. |
| 6. | Fukasawa KM, etal., Biochem J 1999 May 1;339 ( Pt 3):497-502. |
| 7. | Fukasawa KM, etal., J Biol Chem 1996 Nov 29;271(48):30731-5. |
| 8. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 9. | GOA data from the GO Consortium |
| 10. | Hirose J, etal., Biol Pharm Bull. 2006 Dec;29(12):2378-82. |
| 11. | MGD data from the GO Consortium |
| 12. | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
| 13. | Piesse C, etal., Exp Eye Res. 2004 Nov;79(5):639-48. |
| 14. | Pilar Carrera M, etal., Anticancer Res. 2006 Mar-Apr;26(2A):1011-4. |
| 15. | Prieto I, etal., Horm Metab Res. 1998 May;30(5):246-8. |
| 16. | Ramirez M, etal., Experientia. 1993 Apr 15;49(4):300-3. |
| 17. | Ramirez M, etal., Rev Esp Fisiol. 1990 Dec;46(4):393-7. |
| 18. | RGD automated data pipeline |
| 19. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 20. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 21. | Strausberg RL, etal., Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Dec 24;99(26):16899-903. Epub 2002 Dec 11. |
| 22. | Wright JW, etal., Neurosci Lett. 1985 Nov 11;61(3):351-6. |
References - uncuratedCandidate Gene StatusComparative Map Data| Rnpep (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| RNPEP (Homo sapiens - human) |
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| Rnpep (Mus musculus - house mouse) |
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| Rnpep (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| RNPEP (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| RNPEP (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Rnpep (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| RNPEP (Sus scrofa - pig) |
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| RNPEP (Chlorocebus sabaeus - African green monkey) |
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| Rnpep (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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Position Markers| D13Hmgc24 |
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| BF400237 |
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| BF386633 |
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QTLs in Region (Rnor_6.0)| The following QTLs overlap with this region. |  | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer | | Gviewer |
miRNA Target Status
| The detailed report is available here: | | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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RNA-SEQ Expression| alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
| High | |||||||||||||
| Medium | 3 | 40 | 43 | 31 | 19 | 31 | 2 | 4 | 74 | 35 | 41 | 11 | 2 |
| Low | 3 | 14 | 10 | 10 | 6 | 7 | 6 | ||||||
| Below cutoff |
Nucleotide Sequences| RefSeq Transcripts | NM_031097 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_017598940 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017598941 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AAHX01075205 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| AC096239 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AJ414402 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AY724503 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC061718 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473958 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| D87515 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| U61696 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000009198 ⟹ ENSRNOP00000009198 | ||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_031097 ⟹ NP_112359 | ||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||
| Sequence: |
CTCTAAGAGCCATGGAGAGCAGCGGACCCAGCAGCTGCCACAGCGCGGCCCGGCGGCCACTTCAhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_017598940 ⟹ XP_017454429 | ||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
||||||||
| Sequence: |
GCTCTCAACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTAATAAACCCAATTCTAAATGAGAATAATTCCThide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_017598941 ⟹ XP_017454430 | ||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
||||||||
| Sequence: |
GCTCTCAACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTAATAAACCCAATTCTAAATGAGAATAATTCCThide sequence |
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_112359 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_017454429 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_017454430 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAB52971 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| AAH61718 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| BAA13413 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM09701 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| O09175 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_112359 ⟸ NM_031097 |
| - UniProtKB: | O09175 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MESSGPSSCHSAARRPLHSAQAVDVASASSFRAFEILHLHLDLRAELPPGPGPGSRGLNGKATLhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_017454430 ⟸ XM_017598941 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | G3V6V1 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
MESSGPSSCHSAARRPLHSAQAVDVASASSFRAFEILHLHLDLRAEFGPPGPGPGSRGLNGKAThide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_017454429 ⟸ XM_017598940 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | G3V6V1 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
MESSGPSSCHSAARRPLHSAQAVDVASASSFRAFEILHLHLDLRAEFGPPGPGPGSRGLNGKAThide sequence |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000009198 ⟸ ENSRNOT00000009198 |
TranscriptomePromoters| RGD ID: | 13698841 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R9365 | ||||||||
| Type: | initiation region | ||||||||
| Name: | Rnpep_1 | ||||||||
| Description: | arginyl aminopeptidase | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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Strain Sequence Variants (Rnor 6.0)
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External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:621137 | AgrOrtholog |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000006720 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000009198 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000009198 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Gene3D-CATH | 1.10.390.10 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| 1.25.40.320 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| 2.60.40.1730 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:5598331 | IMAGE-MGC_LOAD |
| InterPro | Aminopeptidase_N-like_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| ARM-type_fold | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| M1_LTA-4_hydro/amino_C_sf | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| M1_LTA4H | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Pept_M1_aminopeptidase-B | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Peptidase_M1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Peptidase_M1_C | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Peptidase_M1_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Peptidase_M4/M1_CTD_sf | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:81761 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| MGC_CLONE | MGC:72412 | IMAGE-MGC_LOAD |
| NCBI Gene | 81761 | ENTREZGENE |
| PANTHER | PTHR45726 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| PTHR45726:SF1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | Leuk-A4-hydro_C | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| Peptidase_M1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| PhenoGen | Rnpep | PhenoGen |
| PRINTS | ALADIPTASE | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| PROSITE | ZINC_PROTEASE | UniProtKB/Swiss-Prot |
| SMART | Leuk-A4-hydro_C | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| Superfamily-SCOP | SSF48371 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| SSF63737 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| UniGene | Rn.10979 | ENTREZGENE |
| UniProt | AMPB_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot |
| G3V6V1 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| O09175 | ENTREZGENE | |
| Q6P7D2_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| UniProt Secondary | P97530 | UniProtKB/Swiss-Prot |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2016-02-03 | Rnpep | arginyl aminopeptidase | Rnpep | arginyl aminopeptidase (aminopeptidase B) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2004-09-10 | Rnpep | arginyl aminopeptidase (aminopeptidase B) | aminopeptidase B | Name updated | 1299863 | APPROVED | |
| 2002-08-07 | Rnpep | aminopeptidase B | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |
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| More on Rnpep | |
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Alliance Gene |
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NCBI Gene |
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Ensembl Gene |
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JBrowse: rn5 rn6 |
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NCBI Genome Data Viewer |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 621137 |
| Created: | 2002-08-06 |
| Species: | Rattus norvegicus |
| Last Modified: | 2020-11-24 |
| Status: | ACTIVE |
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RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.
