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InterViewer (Protein-Protein Interactions) |
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Gene Annotator (Annotation Comparison) |
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 MOET (Multi-Ontology Enrichement) unavailable |
 GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) unavailable |
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MOET (Multi-Ontology Enrichement) |
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) |
Imported Annotations - CTD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Breast Neoplasms | ISO | RGD:1313091 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:19066611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| invasive ductal carcinoma | ISO | RGD:1313091 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:19066611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction AnnotationsGene Ontology AnnotationsMolecular Pathway AnnotationsDisease Annotations
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Gene-Chemical Interaction Annotations
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Gene Ontology Annotations
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Molecular Pathway AnnotationsReferences - curated| 1. | GOA data from the GO Consortium |
| 2. | Hayashi T, etal., Brain Res. 2000 Jan 10;852(2):496-500. |
| 3. | Maki HE, etal., J Pathol. 2007 Aug;212(4):395-401. |
| 4. | MGD data from the GO Consortium |
| 5. | Moriyama T, etal., Gynecol Oncol. 2004 Aug;94(2):289-95. |
| 6. | Nadler Y, etal., Breast Cancer Res. 2008 Apr 22;10(2):R35. |
| 7. | Orr AL, etal., J Biol Chem. 2008 Jun 6;283(23):16027-36. doi: 10.1074/jbc.M710606200. Epub 2008 Apr 8. |
| 8. | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
| 9. | RGD automated data pipeline |
| 10. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 11. | RGD comprehensive gene curation |
| 12. | Sawitzki B, etal., Hum Gene Ther. 2002 Aug 10;13(12):1495-504. |
| 13. | Silva R, etal., Neuroscience. 2008 Mar 27;152(3):656-69. Epub 2007 Dec 23. |
| 14. | Turner BC, etal., J Clin Oncol. 2001 Feb 15;19(4):992-1000. |
| 15. | Weaver CV and Liu SP, Exp Toxicol Pathol. 2008 Mar;59(5):265-72. Epub 2008 Feb 21. |
| 16. | Wu H, etal., J Mol Neurosci. 2013 Mar;49(3):512-22. doi: 10.1007/s12031-012-9910-6. Epub 2012 Oct 30. |
| 17. | Xilouri M and Stefanis L, Mol Cell Neurosci. 2015 May;66(Pt A):29-36. doi: 10.1016/j.mcn.2015.01.003. Epub 2015 Feb 25. |
| 18. | Yamada K, etal., J Neural Transm. 2005 May;112(5):633-9. Epub 2005 Mar 23. |
| 19. | Yang L, etal., J Cell Biochem. 2007 Oct 15;102(3):786-800. |
| 20. | Yang X, etal., Exp Cell Res. 1999 Feb 25;247(1):200-7. |
| 21. | Zhou R, etal., J Neurosci. 2005 May 4;25(18):4493-502. |
References - uncurated| PubMed | 7834747 8889548 9396724 9679980 11965493 12477932 12853476 14978028 16116448 16207813 17046197 18242589 18793351 20516211 21630459 21808025 22526508 22647578 24318877 |
Comparative Map Data| Bag1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| BAG1 (Homo sapiens - human) |
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| Bag1 (Mus musculus - house mouse) |
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| Bag1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| BAG1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| BAG1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Bag1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| BAG1 (Sus scrofa - pig) |
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| BAG1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Bag1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
No map positions available. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position Markers| Bag1 |
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QTLs in Region (Rnor_6.0)| The following QTLs overlap with this region. |  | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer | | Gviewer |
miRNA Target Status
| The detailed report is available here: | | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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RNA-SEQ Expression| testis | heart | brain | ovary | uterus | skeletal muscle tissue | colon | gastrocnemius | forebrain | hindbrain | lung | spleen | liver | kidney | adrenal gland | thymus | |
| High | 1 | |||||||||||||||
| Medium | 21 | 43 | 23 | 15 | 4 | 3 | 3 | 8 | 26 | 25 | 11 | 11 | 41 | 35 | 8 | 8 |
| Low | ||||||||||||||||
| Below cutoff |
Nucleotide Sequences| RefSeq Transcripts | NM_001106647 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| NM_001256084 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AAHX01036317 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| AC121205 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC159418 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BF523560 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BI280304 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473962 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| DY309876 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ215132 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ224976 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000011455 ⟹ ENSRNOP00000011455 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001106647 ⟹ NP_001100117 | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | REVIEWED | ||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
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| Sequence: |
TGCAAGACTGCGCGCCCCGTTGCCTCCGCTGCTCCGTGAACAAACGCGGGCCTGGCGGATCGCGhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | NM_001256084 ⟹ NP_001243013 | |||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | REVIEWED | |||||||||||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||||||||||||
| Position: |
|
|||||||||||||||||||
| Sequence: |
TGCAAGACTGCGCGCCCCGTTGCCTCCGCTGCTCCGTGAACAAACGCGGGCCTGGCGGATCGCGhide sequence |
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_001100117 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| NP_001243013 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAI59419 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| B0K019 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL98648 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL98649 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL98650 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_001100117 ⟸ NM_001106647 |
| - Peptide Label: | isoform 1L |
| - UniProtKB: | B0K019 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MADRGGARRPRGDQEPLGPRLRAPRSARETRQSESRAERGLPPSQRSSVRSAASGHDRSTRGAAhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | NP_001243013 ⟸ NM_001256084 |
| - Peptide Label: | isoform 1S |
| - UniProtKB: | B0K019 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MAQTEEMVQTEEMEPPTLSVVVTHSNERYDLLVTPQQGNSEPIVQDLAQLVEEATGVPLPFQKLhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000011455 ⟸ ENSRNOT00000011455 |
TranscriptomePromoters| RGD ID: | 13693639 | |||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R4163 | |||||||||
| Type: | initiation region | |||||||||
| Name: | Bag1_1 | |||||||||
| Description: | Bcl2 associated athanogene 1 | |||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | |||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | |||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | |||||||||
| Position: |
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Strain Sequence Variants (Rnor 6.0)
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External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1305203 | AgrOrtholog |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000008277 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000011455 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000011455 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Gene3D-CATH | 1.20.58.120 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:8370352 | IMAGE-MGC_LOAD |
| InterPro | BAG-1 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| BAG_chaperone_regulator | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| BAG_dom_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| BAG_domain | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Ubiquitin-like_domsf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Ubiquitin_dom | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | rno:297994 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| MGC_CLONE | MGC:188704 | IMAGE-MGC_LOAD |
| NCBI Gene | 297994 | ENTREZGENE |
| PANTHER | PTHR12329 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PTHR12329:SF16 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | BAG | UniProtKB/Swiss-Prot |
| ubiquitin | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| PhenoGen | Bag1 | PhenoGen |
| PROSITE | BAG | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UBIQUITIN_2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| SMART | BAG | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UBQ | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Superfamily-SCOP | SSF54236 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| SSF63491 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| UniGene | Rn.16320 | ENTREZGENE |
| UniProt | B0K019 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| F1LRM5_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2019-11-11 | Bag1 | BAG cochaperone 1 | Bag1 | Bcl2 associated athanogene 1 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2015-11-25 | Bag1 | Bcl2 associated athanogene 1 | Bag1 | BCL2-associated athanogene | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-09-25 | Bag1 | BCL2-associated athanogene | Bag1 | Bcl2-associated athanogene 1 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-04-30 | Bag1 | Bcl2-associated athanogene 1 | Bag1_predicted | Bcl2-associated athanogene 1 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2005-01-12 | Bag1_predicted | Bcl2-associated athanogene 1 (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |
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| More on Bag1 | |
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Alliance Gene |
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NCBI Gene |
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Ensembl Gene |
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JBrowse: rn5 rn6 |
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NCBI Genome Data Viewer |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 1305203 |
| Created: | 2005-01-12 |
| Species: | Rattus norvegicus |
| Last Modified: | 2019-11-27 |
| Status: | ACTIVE |
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RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.
