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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | pneumoconiosis | | ISO | RGD:1312815 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:25445010 | |
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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | pneumoconiosis | | ISO | RGD:1312815 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:25445010 | |
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1. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | Holscher C, etal., J Immunol. 2005 Mar 15;174(6):3534-44. |
3. | MGD data from the GO Consortium |
4. | Miyazaki Y, etal., J Immunol. 2005 Aug 15;175(4):2401-7. |
5. | Pipeline to import Pathway Interaction Database annotations from NCI into RGD |
6. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
7. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
8. | RGD comprehensive gene curation |
9. | Shimanoe Y, etal., Ann Allergy Asthma Immunol. 2009 Mar;102(3):223-32. |
10. | Yoshizaki A, etal., Ann Rheum Dis. 2011 Jan;70(1):194-200. Epub 2010 Aug 12. |
Il27ra (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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IL27RA (Homo sapiens - human) |
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Il27ra (Mus musculus - house mouse) |
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Il27ra (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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IL27RA (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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IL27RA (Canis lupus familiaris - dog) |
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Il27ra (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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IL27RA (Sus scrofa - pig) |
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IL27RA (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Il27ra (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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D19Mgh1 |
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D19Mgh1 |
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D19Mgh1 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 2 | ||||||||||||
Low | 2 | 31 | 14 | 6 | 17 | 6 | 6 | 22 | 27 | 11 | |||
Below cutoff | 1 | 12 | 41 | 34 | 34 | 4 | 5 | 63 | 13 | 14 | 4 |
RefSeq Transcripts | NM_001105943 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
NM_001395124 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_006255227 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_006255228 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017601191 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097529 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | CH473972 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
JACYVU010000313 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000007726 ⟹ ENSRNOP00000007726 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000085630 ⟹ ENSRNOP00000069777 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001105943 ⟹ NP_001099413 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_006255227 ⟹ XP_006255289 | ||||||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_039097529 ⟹ XP_038953457 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
Protein RefSeqs | NP_001099413 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
NP_001382053 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_006255289 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038953457 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | EDL92242 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001099413 ⟸ NM_001105943 |
- Peptide Label: | precursor |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_006255289 ⟸ XM_006255227 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- UniProtKB: | A0A0G2JW79 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000069777 ⟸ ENSRNOT00000085630 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000007726 ⟸ ENSRNOT00000007726 |
RefSeq Acc Id: | XP_038953457 ⟸ XM_039097529 |
- Peptide Label: | isoform X2 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-A0A0G2JW79-F1-model_v2 | AlphaFold | A0A0G2JW79 | 1-631 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13701011 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R11534 | ||||||||
Type: | initiation region | ||||||||
Name: | Il27ra_1 | ||||||||
Description: | interleukin 27 receptor subunit alpha | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1305029 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-6050 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000005747 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000007726 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOP00000069777 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000007726 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOT00000085630 | UniProtKB/TrEMBL | |
Gene3D-CATH | 2.60.40.10 | UniProtKB/TrEMBL |
InterPro | FN3_sf | UniProtKB/TrEMBL |
FN_III | UniProtKB/TrEMBL | |
Ig-like_fold | UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:288905 | UniProtKB/TrEMBL |
NCBI Gene | 288905 | ENTREZGENE |
Pfam | fn3 | UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Il27ra | PhenoGen |
PROSITE | FN3 | UniProtKB/TrEMBL |
SMART | FN3 | UniProtKB/TrEMBL |
Superfamily-SCOP | FN_III-like | UniProtKB/TrEMBL |
UniProt | A0A0G2JW79 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
D4A6K5_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2015-12-16 | Il27ra | interleukin 27 receptor subunit alpha | Il27ra | interleukin 27 receptor, alpha | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-04-30 | Il27ra | interleukin 27 receptor, alpha | Il27ra_predicted | interleukin 27 receptor, alpha (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
2005-01-12 | Il27ra_predicted | interleukin 27 receptor, alpha (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |