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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | hereditary spastic paraplegia 86 | | ISO | RGD:1351609 | 7240710 | | OMIM | | |
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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | hereditary spastic paraplegia 86 | | ISO | RGD:1351609 | 7240710 | | OMIM | | |
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# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | MHC-linked diabetogenic gene of the NOD mouse: molecular mapping of the 3' boundary of the diabetogenic region. | Ikegami H, etal., Biochem Biophys Res Commun 1993 Apr 30;192(2):677-82. |
3. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
Abhd16a (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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ABHD16A (Homo sapiens - human) |
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Abhd16a (Mus musculus - house mouse) |
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Abhd16a (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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ABHD16A (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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ABHD16A (Canis lupus familiaris - dog) |
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Abhd16a (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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ABHD16A (Sus scrofa - pig) |
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ABHD16A (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Abhd16a (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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D20Yum51 |
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AI326074 |
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RH138896 |
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RH133704 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 3 | 43 | 47 | 31 | 19 | 31 | 8 | 11 | 74 | 35 | 41 | 11 | 8 |
Low | 10 | 10 | 10 | ||||||||||
Below cutoff |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000077082 ⟹ ENSRNOP00000071617 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000078576 ⟹ ENSRNOP00000071276 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000079886 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000081760 ⟹ ENSRNOP00000070241 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000083284 ⟹ ENSRNOP00000073114 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000083411 ⟹ ENSRNOP00000068595 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
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RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000086950 ⟹ ENSRNOP00000072329 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
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RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_212531 ⟹ NP_997696 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
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Sequence: |
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039098804 ⟹ XP_038954732 | ||||||||
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Status: | |||||||||
Type: | NON-CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | NP_997696 ⟸ NM_212531 |
- UniProtKB: | Q6MG55 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
- Sequence: |
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RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000071276 ⟸ ENSRNOT00000078576 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000068595 ⟸ ENSRNOT00000083411 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000073114 ⟸ ENSRNOT00000083284 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000072329 ⟸ ENSRNOT00000086950 |
RefSeq Acc Id: | XP_038954730 ⟸ XM_039098802 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
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- Peptide Label: | isoform X2 |
RefSeq Acc Id: | XP_038954732 ⟸ XM_039098804 |
- Peptide Label: | isoform X3 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-Q6MG55-F1-model_v2 | AlphaFold | Q6MG55 | 1-558 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13701395 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R11913 | ||||||||
Type: | initiation region | ||||||||
Name: | Abhd16a_1 | ||||||||
Description: | abhydrolase domain containing 16A | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1303164 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-4643 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000056637 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000071617 | ENTREZGENE |
ENSRNOP00000071617.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOP00000073114 | ENTREZGENE | |
ENSRNOP00000073114.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000077082 | ENTREZGENE |
ENSRNOT00000077082.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOT00000083284 | ENTREZGENE | |
ENSRNOT00000083284.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
Gene3D-CATH | 3.40.50.1820 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
IMAGE_CLONE | IMAGE:7317323 | IMAGE-MGC_LOAD |
InterPro | AB_hydrolase | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
AB_hydrolase_1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
ABHD16A | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:361796 | UniProtKB/Swiss-Prot |
MGC_CLONE | MGC:108968 | IMAGE-MGC_LOAD |
NCBI Gene | 361796 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR12277:SF54 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | Abhydrolase_1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Abhd16a | PhenoGen |
Superfamily-SCOP | SSF53474 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
UniProt | A0A0G2K0X5_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
A0A0G2K4N8_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
ABHGA_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
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2020-02-13 | Abhd16a | abhydrolase domain containing 16A, phospholipase | Abhd16a | abhydrolase domain containing 16A | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2011-07-28 | Abhd16a | abhydrolase domain containing 16A | Bat5 | HLA-B associated transcript 5 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2005-11-17 | Bat5 | HLA-B associated transcript 5 | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED | ||
2005-07-14 | Bat5 | HLA-B associated transcript 5 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |