RGD DISEASE ONTOLOGY - ANNOTATIONS
RGD uses the Human Disease Ontology (DO, https://disease-ontology.org/) for disease curation across species. RGD automatically downloads each new release of the ontology on a monthly basis. Some additional terms which are required for RGD's curation purposes but are not currently covered in the official version of DO have been added. As corresponding terms are added to DO, these custom terms are retired and the DO terms substituted in existing annotations and subsequently used for curation.
Term: Leber congenital amaurosis 7
Accession: DOID:0110333
browse the term
Definition: A Leber congenital amaurosis that has_material_basis_in mutation in the CRX gene on chromosome 19q13. (DO)
Synonyms: exact_synonym: LCA7
primary_id: OMIM:613829
Please select species to view GViewer data.
G
N
Crx
cone-rod homeobox
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
OMIM ClinVar
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 More...
NCBI chrNW_004624832:6,103,530...6,108,129
Ensembl chrNW_004624832:6,104,229...6,108,146
G
G
CRX
cone-rod homeobox
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
OMIM ClinVar
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 More...
NCBI chr 6:41,125,912...41,133,478
Ensembl chr 6:41,126,125...41,132,951
G
P
CRX
cone-rod homeobox
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
OMIM ClinVar
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 More...
NCBI chr 6:53,506,410...53,509,858
Ensembl chr 6:53,506,410...53,512,190
G
D
CRX
cone-rod homeobox
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
OMIM ClinVar
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 More...
NCBI chr 1:108,249,911...108,261,015
Ensembl chr 1:108,249,911...108,261,010
G
B
CRX
cone-rod homeobox
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
OMIM ClinVar
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 More...
NCBI chr19:44,828,119...44,856,284
G
C
Crx
cone-rod homeobox
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
OMIM ClinVar
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 More...
NCBI chrNW_004955574:1,544,917...1,548,912
Ensembl chrNW_004955574:1,544,917...1,548,912
G
R
Crx
cone-rod homeobox
ISO ISS
DNA:deletions:cds (human) ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7 OMIM:613829 CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar MouseDO CTD OMIM RGD
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 PMID:9537410 More...
RGD:734827
NCBI chr 1:76,539,812...76,553,694
Ensembl chr 1:76,540,141...76,545,818
G
M
Crx
cone-rod homeobox
ISO IAGP
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7 CTD Direct Evidence: marker/mechanism OMIM:613829 DNA:deletions:cds (human)
OMIM ClinVar CTD MouseDO RGD
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 PMID:9537410 More...
RGD:734827
NCBI chr 7:15,599,872...15,613,880
Ensembl chr 7:15,599,872...15,613,893
G
H
CRX
cone-rod homeobox
IAGP ISS EXP
DNA:deletions:cds (human) ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7 OMIM:613829 CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar MouseDO CTD OMIM RGD
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 PMID:9537410 More...
RGD:734827
NCBI chr19:47,821,937...47,843,324
Ensembl chr19:47,819,779...47,843,330
G
S
LOC101960714
cone-rod homeobox protein
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
OMIM ClinVar
PMID:9390563 PMID:9427255 PMID:9536098 PMID:9537410 PMID:9792858 PMID:9931337 PMID:10766140 PMID:10874321 PMID:10916183 PMID:11139241 PMID:11748859 PMID:11910559 PMID:11971869 PMID:12208271 PMID:12359607 PMID:12843339 PMID:15531334 PMID:15994872 PMID:16123401 PMID:16199547 PMID:17576681 PMID:17964524 PMID:18682808 PMID:20301475 PMID:20513135 PMID:21602930 PMID:22960069 PMID:22968130 PMID:23049240 PMID:23806086 PMID:24088041 PMID:24154662 PMID:24265693 PMID:24516401 PMID:25259927 PMID:25270190 PMID:25326637 PMID:25356976 PMID:25741868 PMID:26161267 PMID:26355662 PMID:26667666 PMID:26682157 PMID:26992781 PMID:27032803 PMID:27208204 PMID:27624628 PMID:28041643 PMID:28492532 PMID:28945142 PMID:28966547 PMID:29068479 PMID:29555955 PMID:29568065 PMID:29641573 PMID:29785639 PMID:29847639 PMID:30029497 PMID:30460480 PMID:30543658 PMID:30557390 PMID:30718709 PMID:30945053 PMID:31047384 PMID:31054281 PMID:31215831 PMID:31626798 PMID:31630094 PMID:31743059 PMID:32165824 PMID:32531858 PMID:32533067 PMID:32581362 PMID:32689858 PMID:32865313 PMID:32927963 PMID:33090715 PMID:33546218 PMID:33691693 PMID:35260635 PMID:35934205 PMID:36464167 PMID:36909829 More...
NCBI chrNW_004936664:1,408,618...1,419,096
Ensembl chrNW_004936664:1,409,229...1,419,234
G
M
Rhox2a
reproductive homeobox 2A
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
NCBI chr X:36,508,645...36,513,343
Ensembl chr X:36,508,629...36,513,339
G
G
SULT2A1
sulfotransferase family 2A member 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr 6:41,160,707...41,175,382
Ensembl chr 6:41,159,978...41,175,300
G
P
SULT2A1
sulfotransferase family 2A member 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr 6:53,525,496...53,536,723
Ensembl chr 6:53,524,787...53,536,718
G
B
SULT2A1
sulfotransferase family 2A member 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr19:44,864,747...44,880,688
Ensembl chr19:53,517,248...53,532,573
G
R
Sult2a1
sulfotransferase family 2A member 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr 1:75,451,178...75,508,113
Ensembl chr 1:74,911,100...75,508,134
G
M
Sult2a1
sulfotransferase family 2A, dehydroepiandrosterone (DHEA)-preferring, member 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr 7:13,530,171...13,571,335
Ensembl chr 7:13,530,171...13,571,334
G
H
SULT2A1
sulfotransferase family 2A member 1
IAGP
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr19:47,870,467...47,886,315
Ensembl chr19:47,870,467...47,886,315
G
G
TPRX1
tetrapeptide repeat homeobox 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr 6:41,099,988...41,102,217
G
D
TPRX1
tetrapeptide repeat homeobox 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr 1:108,269,117...108,271,438
G
B
TPRX1
tetrapeptide repeat homeobox 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr19:44,795,775...44,813,621
G
H
TPRX1
tetrapeptide repeat homeobox 1
IAGP
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
PMID:28492532 PMID:30557390
NCBI chr19:47,801,232...47,819,051
Ensembl chr19:47,801,232...47,819,051
G
B
TPRX2
tetrapeptide repeat homeobox 2
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
G
H
TPRX2
tetrapeptide repeat homeobox 2
IAGP
ClinVar Annotator: match by term: Leber congenital amaurosis 7
ClinVar
NCBI chr19:47,859,235...47,861,721
Ensembl chr19:47,859,235...47,861,721
Term paths to the root one shortest all shortest one longest all longest one shortest and longest all