.
N-acylphytosphingosine - Ontology Report - Rat Genome Database

Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
Advanced Search (OLGA)

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.
Term:N-acylphytosphingosine
go back to main search page
Accession:CHEBI:31998 term browser browse the term
Definition:A ceramide that is phytosphingosine having a fatty acyl group attached to the nitrogen.
Synonyms:exact_synonym: N-[(2S,3S,4R)-1,3,4-trihydroxyoctadecan-2-yl]alkanamide
 related_synonym: Ceramide II;   Formula=C19H38NO4R;   N-acyl-4-hydroxysphinganine;   N-acylphytosphingosines;   Phytoceramide;   SMILES=CCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)NC([*])=O;   an N-acyl-(4R)-4-hydroxysphinganine;   phytoceramides
 alt_id: CHEBI:50933
 xref: KEGG:C12145;   LIPID_MAPS_instance:LMSP01030000

 Loading Annotations... 
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
X

show annotations for term's descendants           Sort by:
1-O-(alpha-D-galactosyl)-N-hexacosanoylphytosphingosine term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Cxcl10 C-X-C motif chemokine ligand 10 increases expression ISO KRN 7000 results in increased expression of CXCL10 protein CTD PMID:15867097 NCBI chr14:15,704,772...15,706,969
Ensembl chr14:15,704,758...15,706,975 		JBrowse link
G Il12b interleukin 12B increases expression ISO KRN 7000 results in increased expression of IL12B protein CTD PMID:15867097 NCBI chr10:29,390,300...29,405,194
Ensembl chr10:28,893,008...28,902,903 		JBrowse link
Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 20856
    chemical entity 20854
      atom 20854
        nonmetal atom 20762
          carbon atom 20704
            organic molecular entity 20704
              beta-galactosylceramide 15
                N-acyl-beta-D-galactosylphytosphingosine 15
                  N-acylphytosphingosine 2
                    (2S, 3S, 4R)-2-[(2'R)-2'-hydroxydocosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                    (2S, 3S, 4R)-2-[(2'R)-2'-hydroxyhexacosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                    (2S, 3S, 4R)-2-[(2'R)-2'-hydroxypentacosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                    (2S, 3S, 4R)-2-[(2'R)-2'-hydroxytricosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                    (2S, 3S, 4R)-2-[(2R)-2-hydroxytetracosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                    (2S,3S,4R,20R)-2-(20-hydroxydocosanoylamino)eicosane-1,3,4-triol 0
                    (2S,3S,4R,9E)-1,3,4-trihydroxyl-2-[(2'R)-2'-hydroxytetracosanoylamino]-9-octadecene 0
                    (4R)-N-(2,3-dihydroxytetracosanoyl)-4-hydroxysphinganine + 0
                    (E,2S,3R,4R,5S)-2-Acetamido-3,4,5,14-tetrahydroxyicos-6-enoic acid 0
                    2-Hydroxy-N-(1,3,4-trihydroxy-2-octadecanyl)docosanamide 0
                    Man-alpha-1->6-Ins-1-P-Cer(t18:0)(1-) 0
                    N-(1,2-saturated acyl)phytosphingosine 0
                    N-(13Z-docosenoyl)-phytosphingosine 0
                    N-(2'hydroxynonacosanoyl)-o-erythro-1,3,4-trihydroxy-2-amino-octadecane 0
                    N-(2,3-dihydroxyhexacosanoyl)-(4R)-hydroxysphinganine + 0
                    N-(2-hydroxydocosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxyeicosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxyhexacosanoyl)phytosphingosine + 0
                    N-(2-hydroxyhexadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxyoctacosanoyl)phytosphingosine 0
                    N-(2-hydroxyoctadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxytetracosanoyl)phytosphingosine + 0
                    N-(2-hydroxytetradecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxytricontanoyl)phytosphingosine 0
                    N-(2R-Hydroxyhexacosanoyl)-2S-amino-1,3S,4R-octadecanetriol 0
                    N-[(R)-2-hydroxyacyl]phytosphingosine 0
                    N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine + 0
                    N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine zwitterion + 0
                    N-arachidonoylphytosphingosine 0
                    N-docosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-dodecanoylphytosphingosine 0
                    N-eicosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-hexacosanoylphytosphingosine + 0
                    N-hexadecanoylphytosphingosine + 0
                    N-icosenoylphytosphingosine + 0
                    N-octacosanoylphytosphingosine 0
                    N-octadecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-octanoylphytosphingosine 0
                    N-oleoylphytosphingosine 0
                    N-tetracosanoylphytosphingosine + 0
                    N-tetradecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-triacontanoyphytosphingosine 0
                    Paxillamide 0
                    Sphingofungin D 0
                    benjaminamide 0
                    glycophytoceramide + 2
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 20856
    subatomic particle 20854
      composite particle 20854
        hadron 20854
          baryon 20854
            nucleon 20854
              atomic nucleus 20854
                atom 20854
                  main group element atom 20777
                    p-block element atom 20777
                      carbon group element atom 20710
                        carbon atom 20704
                          organic molecular entity 20704
                            heteroorganic entity 20215
                              organochalcogen compound 19902
                                organooxygen compound 19804
                                  carbon oxoacid 19150
                                    carboxylic acid 19147
                                      carboacyl group 18082
                                        univalent carboacyl group 18082
                                          carbamoyl group 17918
                                            carboxamide 17918
                                              ceramide 128
                                                cerebroside 26
                                                  galactosylceramide 26
                                                    beta-galactosylceramide 15
                                                      N-acyl-beta-D-galactosylphytosphingosine 15
                                                        phytosphingosine 15
                                                          N-acylphytosphingosine 2
                                                            (2S, 3S, 4R)-2-[(2'R)-2'-hydroxydocosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                                                            (2S, 3S, 4R)-2-[(2'R)-2'-hydroxyhexacosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                                                            (2S, 3S, 4R)-2-[(2'R)-2'-hydroxypentacosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                                                            (2S, 3S, 4R)-2-[(2'R)-2'-hydroxytricosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                                                            (2S, 3S, 4R)-2-[(2R)-2-hydroxytetracosanoylamino]-1, 3, 4-octadecanetriol 0
                                                            (2S,3S,4R,20R)-2-(20-hydroxydocosanoylamino)eicosane-1,3,4-triol 0
                                                            (2S,3S,4R,9E)-1,3,4-trihydroxyl-2-[(2'R)-2'-hydroxytetracosanoylamino]-9-octadecene 0
                                                            (4R)-N-(2,3-dihydroxytetracosanoyl)-4-hydroxysphinganine + 0
                                                            (E,2S,3R,4R,5S)-2-Acetamido-3,4,5,14-tetrahydroxyicos-6-enoic acid 0
                                                            2-Hydroxy-N-(1,3,4-trihydroxy-2-octadecanyl)docosanamide 0
                                                            Man-alpha-1->6-Ins-1-P-Cer(t18:0)(1-) 0
                                                            N-(1,2-saturated acyl)phytosphingosine 0
                                                            N-(13Z-docosenoyl)-phytosphingosine 0
                                                            N-(2'hydroxynonacosanoyl)-o-erythro-1,3,4-trihydroxy-2-amino-octadecane 0
                                                            N-(2,3-dihydroxyhexacosanoyl)-(4R)-hydroxysphinganine + 0
                                                            N-(2-hydroxydocosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                            N-(2-hydroxyeicosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                            N-(2-hydroxyhexacosanoyl)phytosphingosine + 0
                                                            N-(2-hydroxyhexadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                            N-(2-hydroxyoctacosanoyl)phytosphingosine 0
                                                            N-(2-hydroxyoctadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                            N-(2-hydroxytetracosanoyl)phytosphingosine + 0
                                                            N-(2-hydroxytetradecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                            N-(2-hydroxytricontanoyl)phytosphingosine 0
                                                            N-(2R-Hydroxyhexacosanoyl)-2S-amino-1,3S,4R-octadecanetriol 0
                                                            N-[(R)-2-hydroxyacyl]phytosphingosine 0
                                                            N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine + 0
                                                            N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine zwitterion + 0
                                                            N-arachidonoylphytosphingosine 0
                                                            N-docosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                            N-dodecanoylphytosphingosine 0
                                                            N-eicosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                            N-hexacosanoylphytosphingosine + 0
                                                            N-hexadecanoylphytosphingosine + 0
                                                            N-icosenoylphytosphingosine + 0
                                                            N-octacosanoylphytosphingosine 0
                                                            N-octadecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                            N-octanoylphytosphingosine 0
                                                            N-oleoylphytosphingosine 0
                                                            N-tetracosanoylphytosphingosine + 0
                                                            N-tetradecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                            N-triacontanoyphytosphingosine 0
                                                            Paxillamide 0
                                                            Sphingofungin D 0
                                                            benjaminamide 0
                                                            glycophytoceramide + 2
paths to the root