![]()
Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | NEURODEVELOPMENTAL DISORDER WITH MICROCEPHALY, SEIZURES, AND BRAIN ATROPHY | | ISO | RGD:1343470 | 7240710 | | OMIM | | |
|
![]()
Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | NEURODEVELOPMENTAL DISORDER WITH MICROCEPHALY, SEIZURES, AND BRAIN ATROPHY | | ISO | RGD:1343470 | 7240710 | | OMIM | | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | Rat ISS GO annotations from GOA human gene data--August 2006 | GOA data from the GO Consortium |
3. | Subunit structure of the mammalian exocyst complex. | Kee Y, etal., Proc Natl Acad Sci U S A 1997 Dec 23;94(26):14438-43. |
4. | Electronic Transfer of LocusLink and RefSeq Data | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
5. | SH3BP1, an exocyst-associated RhoGAP, inactivates Rac1 at the front to drive cell motility. | Parrini MC, etal., Mol Cell. 2011 Jun 10;42(5):650-61. doi: 10.1016/j.molcel.2011.03.032. |
6. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
7. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
8. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
9. | An aPKC-exocyst complex controls paxillin phosphorylation and migration through localised JNK1 activation. | Rosse C, etal., PLoS Biol. 2009 Nov;7(11):e1000235. Epub 2009 Nov 3. |
PMID:12954101 | PMID:14525976 | PMID:15920473 | PMID:19946888 | PMID:24056301 | PMID:24344185 | PMID:26582389 | PMID:30053369 |
Exoc8 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EXOC8 (Homo sapiens - human) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exoc8 (Mus musculus - house mouse) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exoc8 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EXOC8 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EXOC8 (Canis lupus familiaris - dog) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exoc8 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EXOC8 (Sus scrofa - pig) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EXOC8 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exoc8 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
|
The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 2 | 6 | 16 | 19 | 70 | 26 | 21 | 11 | |||||
Low | 1 | 37 | 41 | 41 | 41 | 8 | 11 | 4 | 9 | 20 | 8 | ||
Below cutoff |
RefSeq Transcripts | NM_139043 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
GenBank Nucleotide | AC105521 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
AF032669 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
CH474054 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JACYVU010000314 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000026757 ⟹ ENSRNOP00000026757 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_139043 ⟹ NP_620612 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
Protein RefSeqs | NP_620612 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
GenBank Protein | AAC01581 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
EDL96746 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
O54924 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_620612 ⟸ NM_139043 |
- UniProtKB: | O54924 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000026757 ⟸ ENSRNOT00000026757 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-O54924-F1-model_v2 | AlphaFold | O54924 | 1-716 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13701244 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R11766 | ||||||||
Type: | multiple initiation site | ||||||||
Name: | Exoc8_1 | ||||||||
Description: | exocyst complex component 8 | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
|
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:620245 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-5227 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000019766 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000026757 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000026757 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
Gene3D-CATH | 1.20.58.1210 | UniProtKB/Swiss-Prot |
1.20.58.1220 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
2.30.29.30 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
InterPro | Cullin_repeat-like_dom_sf | UniProtKB/Swiss-Prot |
Exo84 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Exo84_C | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Exo84_C_1 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Exo84_C_2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
PH-like_dom_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
PH_domain | UniProtKB/Swiss-Prot | |
KEGG Report | rno:245709 | UniProtKB/Swiss-Prot |
NCBI Gene | 245709 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR21426 | UniProtKB/Swiss-Prot |
Pfam | Exo84_C | UniProtKB/Swiss-Prot |
PhenoGen | Exoc8 | PhenoGen |
PROSITE | PH_DOMAIN | UniProtKB/Swiss-Prot |
SMART | SM00233 | UniProtKB/Swiss-Prot |
Superfamily-SCOP | SSF74788 | UniProtKB/Swiss-Prot |
UniProt | EXOC8_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2004-12-06 | Exoc8 | exocyst complex component 8 | Exo84 | exocyst complex 84-kDa subunit | Symbol and Name updated | 1299863 | APPROVED |
2002-08-07 | Exo84 | exocyst complex 84-kDa subunit | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |
Note Type | Note | Reference |
---|---|---|
gene_expression | broadly expressed | 69988 |
gene_protein | 84 kDa | 69988 |