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Imported Disease Annotations - MGITerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | hydrocephalus | | ISS | RGD:1332480 | 13592920 | OMIM:123155 more ... | MouseDO | | |
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Imported Disease Annotations - MGITerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | hydrocephalus | | ISS | RGD:1332480 | 13592920 | OMIM:123155 more ... | MouseDO | | |
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# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
3. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
4. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
5. | Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. | Strausberg RL, etal., Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Dec 24;99(26):16899-903. Epub 2002 Dec 11. |
PMID:10215863 | PMID:21080915 | PMID:21746835 | PMID:23416111 | PMID:24740601 |
Ak8 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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AK8 (Homo sapiens - human) |
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Ak8 (Mus musculus - house mouse) |
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Ak8 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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AK8 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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AK8 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Ak8 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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AK8 (Sus scrofa - pig) |
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AK8 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Ak8 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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BE118976 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 7 | ||||||||||||
Low | 1 | 1 | 58 | 8 | 13 | 11 | 1 | ||||||
Below cutoff | 2 | 14 | 34 | 18 | 19 | 18 | 1 | 3 | 16 | 15 | 20 | 1 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000017029 ⟹ ENSRNOP00000017029 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001004266 ⟹ NP_001004266 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_006233794 ⟹ XP_006233856 | ||||||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017591825 ⟹ XP_017447314 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017591826 ⟹ XP_017447315 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017591827 ⟹ XP_017447316 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_039105221 ⟹ XP_038961149 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039105222 ⟹ XP_038961150 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NP_001004266 ⟸ NM_001004266 |
- UniProtKB: | Q68FP8 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_006233856 ⟸ XM_006233794 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_017447316 ⟸ XM_017591827 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_017447315 ⟸ XM_017591826 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_017447314 ⟸ XM_017591825 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000017029 ⟸ ENSRNOT00000017029 |
RefSeq Acc Id: | XP_038961149 ⟸ XM_039105221 |
- Peptide Label: | isoform X2 |
RefSeq Acc Id: | XP_038961150 ⟸ XM_039105222 |
- Peptide Label: | isoform X3 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-Q68FP8-F1-model_v2 | AlphaFold | Q68FP8 | 1-479 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13691937 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R2462 | ||||||||
Type: | multiple initiation site | ||||||||
Name: | Ak8_1 | ||||||||
Description: | adenylate kinase 8 | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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Chromosome | Start Pos | End Pos | Reference Nucleotide | Variant Nucleotide | Variant Type | Strain |
3 | 7320472 | 7320473 | C | G | snv | COP/CrCrl (MCW & UW) |
Chromosome | Start Pos | End Pos | Reference Nucleotide | Variant Nucleotide | Variant Type | Strain |
3 | 12671203 | 12671204 | C | G | snv | COP/CrCrl (MCW & UW) |
Chromosome | Start Pos | End Pos | Reference Nucleotide | Variant Nucleotide | Variant Type | Strain |
3 | 7731830 | 7731831 | C | G | snv | COP/CrCrl (MCW & UW) |
Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1303144 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-50271 | BioCyc |
BioCyc Pathway | PWY-7219 [adenosine ribonucleotides de novo biosynthesis] | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000012761 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000017029 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000017029 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
Gene3D-CATH | 3.40.50.300 | UniProtKB/Swiss-Prot |
IMAGE_CLONE | IMAGE:7115585 | IMAGE-MGC_LOAD |
InterPro | Adenylat/UMP-CMP_kin | UniProtKB/Swiss-Prot |
ADK_active_lid_dom_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
P-loop_NTPase | UniProtKB/Swiss-Prot | |
KEGG Report | rno:311833 | UniProtKB/Swiss-Prot |
MGC_CLONE | MGC:94995 | IMAGE-MGC_LOAD |
NCBI Gene | 311833 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR23359 | UniProtKB/Swiss-Prot |
PhenoGen | Ak8 | PhenoGen |
PRINTS | ADENYLTKNASE | UniProtKB/Swiss-Prot |
Superfamily-SCOP | SSF52540 | UniProtKB/Swiss-Prot |
SSF57774 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
UniProt | KAD8_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
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2011-08-02 | Ak8 | adenylate kinase 8 | RGD1303144 | HypB, AroK, ADK and rho factor domain containing protein RGD1303144 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2005-11-17 | RGD1303144 | HypB, AroK, ADK and rho factor domain containing protein RGD1303144 | MGC94995 | similar to hypothetical protein FLJ32704 | Symbol and Name updated | 1299863 | APPROVED |
2005-09-30 | MGC94995 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |