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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Experimental Liver Cirrhosis | | ISO | RGD:1352041 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:25380136 | |
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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Experimental Liver Cirrhosis | | ISO | RGD:1352041 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:25380136 | |
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# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | Mammalian Golgi-associated Bicaudal-D2 functions in the dynein-dynactin pathway by interacting with these complexes. | Hoogenraad CC, etal., EMBO J 2001 Aug 1;20(15):4041-54. |
3. | OMIM Disease Annotation Pipeline | OMIM Disease Annotation Pipeline |
4. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
5. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
PMID:12447383 | PMID:12477932 | PMID:17139249 | PMID:19825938 | PMID:20386726 | PMID:22956769 | PMID:23664116 | PMID:24614806 | PMID:25272277 | PMID:25962623 |
Bicd2 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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BICD2 (Homo sapiens - human) |
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Bicd2 (Mus musculus - house mouse) |
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Bicd2 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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BICD2 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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BICD2 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Bicd2 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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BICD2 (Sus scrofa - pig) |
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BICD2 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Bicd2 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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D17Rat70 |
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RH91165 |
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RH131216 |
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AA891724 |
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G06234 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 2 | 43 | 24 | 8 | 19 | 8 | 8 | 10 | 74 | 35 | 41 | 11 | 8 |
Low | 1 | 33 | 33 | 33 | 1 | ||||||||
Below cutoff |
RefSeq Transcripts | NM_001033674 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
NM_198765 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | AC111847 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
AJ250312 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
AJ250313 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
BC100660 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
CH473977 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
FQ232573 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JACYVU010000288 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000048653 ⟹ ENSRNOP00000047890 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000090647 ⟹ ENSRNOP00000069365 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001033674 ⟹ NP_001028846 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | REVIEWED | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | NM_198765 ⟹ NP_942060 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | REVIEWED | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
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Sequence: |
Protein RefSeqs | NP_001028846 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
NP_942060 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | AAI00661 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
CAC13968 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
CAC13969 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
EDL98116 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
EDL98117 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001028846 ⟸ NM_001033674 |
- Peptide Label: | isoform 1 |
- UniProtKB: | Q496Z1 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | NP_942060 ⟸ NM_198765 |
- Peptide Label: | isoform 2 |
- UniProtKB: | Q712J3 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000047890 ⟸ ENSRNOT00000048653 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000069365 ⟸ ENSRNOT00000090647 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-Q496Z1-F1-model_v2 | AlphaFold | Q496Z1 | 1-851 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13700354 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R10877 | ||||||||
Type: | initiation region | ||||||||
Name: | Bicd2_1 | ||||||||
Description: | BICD cargo adaptor 2 | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:735093 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-9993 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000016031 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000047890.5 | UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOP00000069365 | ENTREZGENE | |
ENSRNOP00000069365.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000048653.5 | UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOT00000090647 | ENTREZGENE | |
ENSRNOT00000090647.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
IMAGE_CLONE | IMAGE:7935996 | IMAGE-MGC_LOAD |
InterPro | Bicaudal-D_microtubule-assoc | UniProtKB/TrEMBL |
KEGG Report | rno:306809 | UniProtKB/TrEMBL |
MGC_CLONE | MGC:124540 | IMAGE-MGC_LOAD |
NCBI Gene | 306809 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR31233 | UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | BicD | UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Bicd2 | PhenoGen |
UniProt | A0A8J8Y893_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Q496Z1 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
Q712J2_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
Q712J3 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
UniProt Secondary | F7FC29 | UniProtKB/TrEMBL |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
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2016-04-05 | Bicd2 | BICD cargo adaptor 2 | Bicd2 | bicaudal D homolog 2 (Drosophila) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2005-11-17 | Bicd2 | bicaudal D homolog 2 (Drosophila) | Symbol updated | 1299863 | APPROVED | ||
2004-09-10 | BicD2 | bicaudal D homolog 2 (Drosophila) | bicaudal D protein | Name updated | 1299863 | APPROVED |