Isl1 (ISL1 transcription factor, LIM/homeodomain) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: Isl1 (ISL1 transcription factor, LIM/homeodomain) Mus musculus
Analyze
Symbol: Isl1
Name: ISL1 transcription factor, LIM/homeodomain
RGD ID: 62250
MGI Page MGI
Description: Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; promoter-specific chromatin binding activity; and sequence-specific DNA binding activity. Involved in several processes, including heart development; nervous system development; and positive regulation of cytokine production. Acts upstream of or within several processes, including heart development; neuron differentiation; and positive regulation of nitrogen compound metabolic process. Located in nucleus. Is expressed in several structures, including alimentary system; branchial arch; central nervous system; genitourinary system; and heart and pericardium. Human ortholog(s) of this gene implicated in type 1 diabetes mellitus and type 2 diabetes mellitus. Orthologous to human ISL1 (ISL LIM homeobox 1).
Type: protein-coding
RefSeq Status: VALIDATED
Previously known as: insulin gene enhancer protein ISL-1; insulin related protein; Islet 1; islet-1; Lim-homeodomain protein Islet1
RGD Orthologs
Human
Rat
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Genes
More Info more info ...
Latest Assembly: GRCm39 - Mouse Genome Assembly GRCm39
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm3913116,434,806 - 116,446,224 (-)NCBIGRCm39mm39
GRCm39 Ensembl13116,434,817 - 116,446,225 (-)Ensembl
GRCm3813116,298,270 - 116,309,688 (-)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl13116,298,281 - 116,309,689 (-)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv3713117,088,478 - 117,099,896 (-)NCBIGRCm37mm9NCBIm37
MGSCv3613117,418,963 - 117,430,370 (-)NCBImm8
Celera13120,696,034 - 120,707,388 (-)NCBICelera
Cytogenetic Map13D2.2NCBI
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


Gene Ontology Annotations     Click to see Annotation Detail View

Biological Process
atrial septum morphogenesis  (IGI)
axon regeneration  (ISO)
axonogenesis  (IBA)
canonical Wnt signaling pathway  (IGI)
cardiac cell fate determination  (IMP,ISO)
cardiac muscle cell myoblast differentiation  (IMP)
cardiac right ventricle morphogenesis  (IGI)
cell differentiation  (IEA)
cell population proliferation  (IDA)
cellular response to glucocorticoid stimulus  (ISO)
endocardial cushion morphogenesis  (IGI)
heart development  (IMP)
heart morphogenesis  (IGI)
innervation  (IMP)
mesenchymal cell differentiation  (IMP)
negative regulation of canonical Wnt signaling pathway  (IGI)
negative regulation of epithelial cell proliferation  (ISO)
negative regulation of inflammatory response  (IMP)
negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway  (ISO)
negative regulation of neuron apoptotic process  (IMP)
negative regulation of neuron differentiation  (IGI)
negative regulation of protein-containing complex assembly  (ISO)
negative regulation of transcription by RNA polymerase II  (IMP)
neural crest cell migration  (IGI)
neuron differentiation  (IGI,IMP)
neuron fate commitment  (IGI)
neuron fate specification  (IBA,IMP)
outflow tract morphogenesis  (IGI)
outflow tract septum morphogenesis  (IGI)
pancreas development  (IMP)
peripheral nervous system neuron axonogenesis  (IMP)
peripheral nervous system neuron development  (IGI)
pharyngeal system development  (IGI)
pituitary gland development  (IMP)
positive regulation of angiogenesis  (IMP)
positive regulation of cell differentiation  (IMP)
positive regulation of cell population proliferation  (IDA)
positive regulation of DNA binding  (IDA)
positive regulation of epithelial to mesenchymal transition  (ISO)
positive regulation of granulocyte colony-stimulating factor production  (IDA)
positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production  (IDA)
positive regulation of histone acetylation  (IMP)
positive regulation of insulin secretion  (ISO)
positive regulation of interleukin-1 alpha production  (IDA)
positive regulation of interleukin-1 beta production  (IDA)
positive regulation of interleukin-12 production  (IDA)
positive regulation of interleukin-6 production  (IDA)
positive regulation of macrophage colony-stimulating factor production  (IDA)
positive regulation of transcription by RNA polymerase II  (IBA,IDA,IGI,IMP,ISO)
positive regulation of tumor necrosis factor production  (IDA)
positive regulation of type II interferon production  (IDA)
positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein  (IDA)
positive regulation of vascular endothelial growth factor production  (IDA)
regulation of DNA-templated transcription  (ISO)
regulation of gene expression  (IMP)
regulation of heart rate by cardiac conduction  (IMP)
regulation of secondary heart field cardioblast proliferation  (IMP)
regulation of transcription by RNA polymerase II  (IBA)
retinal ganglion cell axon guidance  (IMP)
secondary heart field specification  (ISO)
sensory system development  (IMP)
sinoatrial node cell development  (IMP)
spinal cord motor neuron cell fate specification  (IGI)
spinal cord motor neuron differentiation  (IMP)
stem cell differentiation  (IMP)
transcription by RNA polymerase II  (IDA)
trigeminal nerve development  (IMP)
ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis  (IGI)
visceral motor neuron differentiation  (IGI)

Cellular Component
nucleoplasm  (TAS)
nucleus  (IBA,IDA,ISO)

Phenotype Annotations     Click to see Annotation Detail View

Mammalian Phenotype
aberrant origin of the right subclavian artery  (IAGP)
abnormal abducens nerve morphology  (IAGP)
abnormal aortic arch morphology  (IAGP)
abnormal auditory bulla morphology  (IAGP)
abnormal axon extension  (IAGP)
abnormal axon morphology  (IAGP)
abnormal blood circulation  (IAGP)
abnormal brain development  (IAGP)
abnormal cardiac epithelial to mesenchymal transition  (IAGP)
abnormal cardiac neural crest cell migration  (IAGP)
abnormal cardiac outflow tract development  (IAGP)
abnormal cardiomyocyte apoptosis  (IAGP)
abnormal cerebral cortex morphology  (IAGP)
abnormal coat/ hair morphology  (IAGP)
abnormal common carotid artery morphology  (IAGP)
abnormal conotruncal ridge morphology  (IAGP)
abnormal dorsal aorta morphology  (IAGP)
abnormal dorsal root ganglion morphology  (IAGP)
abnormal embryonic cloaca development  (IAGP)
abnormal external female genitalia morphology  (IAGP)
abnormal fetal cardiomyocyte proliferation  (IAGP)
abnormal fibula morphology  (IAGP)
abnormal heart atrium morphology  (IAGP)
abnormal heart development  (IAGP)
abnormal heart right ventricle morphology  (IAGP)
abnormal heart shape  (IAGP)
abnormal hindlimb bud morphology  (IAGP)
abnormal hindlimb morphology  (IAGP)
abnormal hindlimb zeugopod morphology  (IAGP)
abnormal hyoid bone greater horn morphology  (IAGP)
abnormal hyoid bone lesser horn morphology  (IAGP)
abnormal hyoid bone morphology  (IAGP)
abnormal inferior horn of thyroid cartilage morphology  (IAGP)
abnormal innervation  (IAGP)
abnormal interatrial septum morphology  (IAGP)
abnormal ischium morphology  (IAGP)
abnormal limb development  (IAGP)
abnormal malleus morphology  (IAGP)
abnormal Meissner's corpuscle morphology  (IAGP)
abnormal motor neuron innervation pattern  (IAGP)
abnormal motor neuron morphology  (IAGP)
abnormal muscle spindle morphology  (IAGP)
abnormal myocardial trabeculae morphology  (IAGP)
abnormal nervous system electrophysiology  (IAGP)
abnormal neuron differentiation  (IAGP)
abnormal neuron physiology  (IAGP)
abnormal optic nerve innervation  (IAGP)
abnormal optic nerve morphology  (IAGP)
abnormal optic tract morphology  (IAGP)
abnormal pacinian corpuscle morphology  (IAGP)
abnormal pancreas mesenchyme morphology  (IAGP)
abnormal pancreas morphology  (IAGP)
abnormal pancreatic acinar cell morphology  (IAGP)
abnormal pancreatic islet morphology  (IAGP)
abnormal pharyngeal arch morphology  (IAGP)
abnormal proprioceptive neuron morphology  (IAGP)
abnormal pterygopalatine ganglion morphology  (IAGP)
abnormal Rathke's pouch development  (IAGP)
abnormal renal/urinary system morphology  (IAGP)
abnormal retina bipolar cell morphology  (IAGP)
abnormal retina ganglion cell morphology  (IAGP)
abnormal retina outer plexiform layer morphology  (IAGP)
abnormal sensory neuron innervation pattern  (IAGP)
abnormal sensory neuron morphology  (IAGP)
abnormal sixth pharyngeal arch artery morphology  (IAGP)
abnormal spinal cord interneuron morphology  (IAGP)
abnormal splanchnic mesoderm morphology  (IAGP)
abnormal superior horn of thyroid cartilage morphology  (IAGP)
abnormal trigeminal ganglion morphology  (IAGP)
abnormal truncus arteriosus septation  (IAGP)
abnormal tympanic membrane morphology  (IAGP)
abnormal vascular endothelial cell morphology  (IAGP)
absent cardiac outflow tract  (IAGP)
absent gastric milk in neonates  (IAGP)
absent heart right ventricle  (IAGP)
absent hindlimb  (IAGP)
absent pancreatic alpha cells  (IAGP)
absent petrosal ganglion  (IAGP)
absent pinna reflex  (IAGP)
absent pubis  (IAGP)
absent urinary bladder  (IAGP)
anal stenosis  (IAGP)
atrial septal defect  (IAGP)
atrioventricular septal defect  (IAGP)
axon degeneration  (IAGP)
blood vessel atresia  (IAGP)
blood vessel congestion  (IAGP)
bradykinesia  (IAGP)
craniofacial phenotype  (IAGP)
cyanosis  (IAGP)
decreased amacrine cell number  (IAGP)
decreased body size  (IAGP)
decreased body weight  (IAGP)
decreased cell proliferation  (IAGP)
decreased chemical nociceptive threshold  (IAGP)
decreased embryo size  (IAGP)
decreased embryonic neuroepithelium thickness  (IAGP)
decreased heart right ventricle size  (IAGP)
decreased mitotic index  (IAGP)
decreased motor neuron number  (IAGP)
decreased muscle spindle number  (IAGP)
decreased nerve conduction velocity  (IAGP)
decreased pacinian corpuscle number  (IAGP)
decreased retina ganglion cell number  (IAGP)
decreased retina inner nuclear layer thickness  (IAGP)
decreased Schwann cell number  (IAGP)
dorsal root ganglion hypoplasia  (IAGP)
double outlet right ventricle  (IAGP)
ectopic thymus  (IAGP)
embryo tissue necrosis  (IAGP)
embryonic growth arrest  (IAGP)
embryonic lethality during organogenesis, complete penetrance  (IAGP)
embryonic lethality during organogenesis, incomplete penetrance  (IAGP)
embryonic lethality, complete penetrance  (IAGP)
excessive cerumen  (IAGP)
external male genitalia hypoplasia  (IAGP)
failure of heart looping  (IAGP)
fusion of middle ear ossicles  (IAGP)
heart right ventricle hypoplasia  (IAGP)
impaired coordination  (IAGP)
impaired hearing  (IAGP)
increased apoptosis  (IAGP)
increased gastrointestinal tumor incidence  (IAGP)
increased or absent threshold for auditory brainstem response  (IAGP)
increased retina apoptosis  (IAGP)
increased susceptibility to otitis media  (IAGP)
interrupted aortic arch  (IAGP)
lethality throughout fetal growth and development, complete penetrance  (IAGP)
microphthalmia  (IAGP)
middle ear effusion  (IAGP)
neonatal lethality, complete penetrance  (IAGP)
neonatal lethality, incomplete penetrance  (IAGP)
no abnormal phenotype detected  (IAGP)
oligodactyly  (IAGP)
optic nerve degeneration  (IAGP)
optic nerve hypoplasia  (IAGP)
pericardial edema  (IAGP)
perinatal lethality  (IAGP)
perinatal lethality, complete penetrance  (IAGP)
persistent truncus arteriosis  (IAGP)
postnatal lethality, complete penetrance  (IAGP)
preaxial polydactyly  (IAGP)
premature death  (IAGP)
preweaning lethality, complete penetrance  (IAGP)
renal hypoplasia  (IAGP)
retina ganglion cell degeneration  (IAGP)
right aortic arch  (IAGP)
sirenomelia  (IAGP)
small pacinian corpuscles  (IAGP)
small pharyngeal arch  (IAGP)
small Rathke's pouch  (IAGP)
thin cerebral cortex  (IAGP)
thin myocardium  (IAGP)
thin retina inner plexiform layer  (IAGP)
thymus hypoplasia  (IAGP)
transposition of great arteries  (IAGP)
ventricular septal defect  (IAGP)
References

References - curated
# Reference Title Reference Citation
1. Positional candidate gene analysis of Lim domain homeobox gene (Isl-1) on chromosome 5q11-q13 in a French morbidly obese population suggests indication for association with type 2 diabetes. Barat-Houari M, etal., Diabetes. 2002 May;51(5):1640-3.
2. Interaction and association analysis of a type 1 diabetes susceptibility locus on chromosome 5q11-q13 and the 7q32 chromosomal region in Scandinavian families. Holm P, etal., Diabetes. 2004 Jun;53(6):1584-91.
3. Insulin gene enhancer binding protein Isl-1 is a member of a novel class of proteins containing both a homeo- and a Cys-His domain. Karlsson O, etal., Nature 1990 Apr 26;344(6269):879-82.
4. Electronic Transfer of Homolog Data MGD and Homologene mouse data transfer
5. MGDs mouse GO annotations MGD data from the GO Consortium
6. MGD IEA MGD IEA
7. Mouse MP Annotation Import Pipeline RGD automated import pipeline
8. Data Import for Chemical-Gene Interactions RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions
Additional References at PubMed
PMID:1764243   PMID:7720556   PMID:8050356   PMID:8069910   PMID:8221886   PMID:8224007   PMID:8543157   PMID:8555108   PMID:8565076   PMID:8744440   PMID:8756299   PMID:8812059  
PMID:8817562   PMID:8837770   PMID:8876198   PMID:8889548   PMID:8903354   PMID:8922421   PMID:8951074   PMID:8951795   PMID:8955272   PMID:8967950   PMID:8978605   PMID:9000074  
PMID:9100133   PMID:9102308   PMID:9118797   PMID:9192866   PMID:9230312   PMID:9242412   PMID:9272948   PMID:9315901   PMID:9353119   PMID:9374403   PMID:9389446   PMID:9463347  
PMID:9486801   PMID:9490412   PMID:9507132   PMID:9584121   PMID:9585504   PMID:9603426   PMID:9620855   PMID:9636069   PMID:9655799   PMID:9664688   PMID:9767163   PMID:9806916  
PMID:9806931   PMID:9828088   PMID:9851981   PMID:9865699   PMID:9895316   PMID:9915576   PMID:9988216   PMID:10049363   PMID:10075844   PMID:10079519   PMID:10217145   PMID:10349636  
PMID:10357893   PMID:10367888   PMID:10395791   PMID:10419687   PMID:10419695   PMID:10431247   PMID:10471501   PMID:10476967   PMID:10477289   PMID:10482234   PMID:10482235   PMID:10499586  
PMID:10529422   PMID:10536059   PMID:10585298   PMID:10588713   PMID:10615124   PMID:10625551   PMID:10640277   PMID:10642437   PMID:10677261   PMID:10677506   PMID:10693795   PMID:10704382  
PMID:10707974   PMID:10712625   PMID:10725236   PMID:10725250   PMID:10825208   PMID:10850491   PMID:10862153   PMID:10864955   PMID:10864957   PMID:10864958   PMID:10868931   PMID:10887087  
PMID:10903178   PMID:10906467   PMID:10921901   PMID:10932192   PMID:10934027   PMID:11003836   PMID:11042159   PMID:11066097   PMID:11071781   PMID:11076752   PMID:11076756   PMID:11076772  
PMID:11076861   PMID:11152636   PMID:11156606   PMID:11161479   PMID:11165475   PMID:11180952   PMID:11217851   PMID:11222142   PMID:11239429   PMID:11239430   PMID:11299042   PMID:11306624  
PMID:11312598   PMID:11390667   PMID:11395002   PMID:11395003   PMID:11449277   PMID:11466434   PMID:11472850   PMID:11493524   PMID:11500980   PMID:11502253   PMID:11502254   PMID:11511541  
PMID:11566099   PMID:11567614   PMID:11684651   PMID:11731238   PMID:11731257   PMID:11731457   PMID:11748146   PMID:11748151   PMID:11749040   PMID:11784004   PMID:11784021   PMID:11784044  
PMID:11784060   PMID:11825874   PMID:11877374   PMID:11880356   PMID:11886853   PMID:11912494   PMID:11944941   PMID:11955448   PMID:11960711   PMID:11988168   PMID:12019323   PMID:12023301  
PMID:12040030   PMID:12062038   PMID:12062039   PMID:12112475   PMID:12118260   PMID:12135932   PMID:12139922   PMID:12183375   PMID:12186854   PMID:12189445   PMID:12209838   PMID:12351199  
PMID:12354395   PMID:12361967   PMID:12372284   PMID:12404118   PMID:12410312   PMID:12412008   PMID:12421714   PMID:12421716   PMID:12435629   PMID:12466851   PMID:12477932   PMID:12485625  
PMID:12490199   PMID:12495620   PMID:12514213   PMID:12559489   PMID:12571103   PMID:12571110   PMID:12575949   PMID:12619134   PMID:12624426   PMID:12651891   PMID:12666204   PMID:12681500  
PMID:12687699   PMID:12730604   PMID:12741988   PMID:12787506   PMID:12797958   PMID:12799141   PMID:12805300   PMID:12812795   PMID:12842915   PMID:12855770   PMID:12874134   PMID:12900460  
PMID:12917290   PMID:12921747   PMID:12933680   PMID:12948444   PMID:12954718   PMID:12971893   PMID:12971989   PMID:13678579   PMID:14499653   PMID:14517283   PMID:14517990   PMID:14522873  
PMID:14534138   PMID:14551230   PMID:14623245   PMID:14627641   PMID:14627719   PMID:14643678   PMID:14643685   PMID:14664703   PMID:14667410   PMID:14681479   PMID:14702043   PMID:14723851  
PMID:14729487   PMID:14736744   PMID:14766174   PMID:14960494   PMID:15031110   PMID:15037319   PMID:15071095   PMID:15075292   PMID:15105370   PMID:15148302   PMID:15150159   PMID:15163631  
PMID:15198977   PMID:15215207   PMID:15229603   PMID:15240886   PMID:15326611   PMID:15329346   PMID:15329890   PMID:15339983   PMID:15363409   PMID:15459098   PMID:15469980   PMID:15509772  
PMID:15525990   PMID:15528197   PMID:15541311   PMID:15545635   PMID:15548576   PMID:15576400   PMID:15590934   PMID:15604100   PMID:15618518   PMID:15653467   PMID:15659653   PMID:15668393  
PMID:15673567   PMID:15689381   PMID:15691760   PMID:15703280   PMID:15703750   PMID:15728558   PMID:15729571   PMID:15733084   PMID:15733660   PMID:15739225   PMID:15753214   PMID:15769945  
PMID:15788454   PMID:15804564   PMID:15817220   PMID:15820692   PMID:15834955   PMID:15836427   PMID:15843409   PMID:15843414   PMID:15870291   PMID:15880651   PMID:15901662   PMID:15901664  
PMID:15922675   PMID:15930101   PMID:15936012   PMID:15944193   PMID:15976074   PMID:16020526   PMID:16026391   PMID:16026781   PMID:16038893   PMID:16055717   PMID:16099729   PMID:16116448  
PMID:16129397   PMID:16141072   PMID:16141073   PMID:16145668   PMID:16182275   PMID:16183241   PMID:16186384   PMID:16193506   PMID:16198599   PMID:16221724   PMID:16230531   PMID:16234809  
PMID:16236524   PMID:16284245   PMID:16291784   PMID:16311594   PMID:16319924   PMID:16322559   PMID:16326147   PMID:16354937   PMID:16357211   PMID:16360650   PMID:16364899   PMID:16386727  
PMID:16396906   PMID:16399505   PMID:16406324   PMID:16407399   PMID:16407563   PMID:16438966   PMID:16446142   PMID:16452096   PMID:16458083   PMID:16459298   PMID:16495162   PMID:16556915  
PMID:16556916   PMID:16571630   PMID:16600854   PMID:16602821   PMID:16615895   PMID:16625209   PMID:16651659   PMID:16672344   PMID:16687132   PMID:16709898   PMID:16720879   PMID:16738228  
PMID:16741123   PMID:16781703   PMID:16790475   PMID:16815098   PMID:16829956   PMID:16836994   PMID:16839542   PMID:16854970   PMID:16859901   PMID:16873717   PMID:16885222   PMID:16899237  
PMID:16912273   PMID:16919269   PMID:16938278   PMID:16949349   PMID:16950124   PMID:16951258   PMID:16957084   PMID:16964608   PMID:16968817   PMID:17026983   PMID:17027958   PMID:17032746  
PMID:17035289   PMID:17049510   PMID:17050624   PMID:17065330   PMID:17074316   PMID:17086203   PMID:17092954   PMID:17116257   PMID:17119020   PMID:17122055   PMID:17150206   PMID:17150208  
PMID:17151600   PMID:17166926   PMID:17185046   PMID:17208219   PMID:17234970   PMID:17238155   PMID:17258700   PMID:17267606   PMID:17286298   PMID:17309606   PMID:17332510   PMID:17344230  
PMID:17350578   PMID:17359964   PMID:17360442   PMID:17367776   PMID:17396120   PMID:17399698   PMID:17418794   PMID:17436285   PMID:17448459   PMID:17468181   PMID:17468498   PMID:17480014  
PMID:17488627   PMID:17492640   PMID:17493606   PMID:17504941   PMID:17507410   PMID:17519332   PMID:17519333   PMID:17537793   PMID:17576928   PMID:17596284   PMID:17601530   PMID:17605791  
PMID:17609113   PMID:17626887   PMID:17635645   PMID:17654714   PMID:17687036   PMID:17721516   PMID:17724084   PMID:17823370   PMID:17825816   PMID:17898204   PMID:17919533   PMID:17922007  
PMID:17928203   PMID:17928865   PMID:17936263   PMID:17947796   PMID:17948256   PMID:17972876   PMID:17996499   PMID:18000065   PMID:18003851   PMID:18023262   PMID:18031722   PMID:18037398  
PMID:18058910   PMID:18061569   PMID:18065432   PMID:18084289   PMID:18086710   PMID:18094249   PMID:18164701   PMID:18184728   PMID:18198335   PMID:18213584   PMID:18214994   PMID:18215620  
PMID:18216204   PMID:18223201   PMID:18239644   PMID:18272695   PMID:18282814   PMID:18287559   PMID:18302773   PMID:18328475   PMID:18329011   PMID:18351662   PMID:18356247   PMID:18367596  
PMID:18371348   PMID:18385258   PMID:18400164   PMID:18400219   PMID:18429041   PMID:18430798   PMID:18434416   PMID:18434421   PMID:18452912   PMID:18459960   PMID:18460603   PMID:18462699  
PMID:18480159   PMID:18480752   PMID:18487195   PMID:18498088   PMID:18506029   PMID:18507827   PMID:18534921   PMID:18547144   PMID:18554416   PMID:18568026   PMID:18572160   PMID:18577233  
PMID:18583962   PMID:18590716   PMID:18599523   PMID:18606147   PMID:18662545   PMID:18665267   PMID:18700968   PMID:18719084   PMID:18722343   PMID:18723011   PMID:18723448   PMID:18775691  
PMID:18787067   PMID:18804103   PMID:18816853   PMID:18830404   PMID:18832390   PMID:18832392   PMID:18832393   PMID:18842897   PMID:18849985   PMID:18854178   PMID:18927156   PMID:18940586  
PMID:18942141   PMID:18953410   PMID:18985716   PMID:18996108   PMID:19000668   PMID:19000842   PMID:19004860   PMID:19008950   PMID:19020035   PMID:19026994   PMID:19029045   PMID:19030180  
PMID:19035347   PMID:19048639   PMID:19088086   PMID:19109910   PMID:19135992   PMID:19141476   PMID:19149881   PMID:19210786   PMID:19211681   PMID:19223390   PMID:19223466   PMID:19225519  
PMID:19236857   PMID:19251731   PMID:19285468   PMID:19287388   PMID:19298856   PMID:19300477   PMID:19304889   PMID:19306865   PMID:19325129   PMID:19332558   PMID:19339595   PMID:19386638  
PMID:19386662   PMID:19389377   PMID:19398581   PMID:19403835   PMID:19416500   PMID:19433083   PMID:19483677   PMID:19500363   PMID:19502415   PMID:19509466   PMID:19521500   PMID:19524524  
PMID:19531353   PMID:19542360   PMID:19563797   PMID:19578358   PMID:19578380   PMID:19580802   PMID:19587446   PMID:19591819   PMID:19592574   PMID:19598113   PMID:19607821   PMID:19616129  
PMID:19620969   PMID:19621436   PMID:19623272   PMID:19632216   PMID:19642194   PMID:19661150   PMID:19666503   PMID:19666821   PMID:19684112   PMID:19692620   PMID:19705442   PMID:19705444  
PMID:19706423   PMID:19709628   PMID:19745164   PMID:19766572   PMID:19774071   PMID:19782674   PMID:19796621   PMID:19797899   PMID:19800948   PMID:19805360   PMID:19806666   PMID:19828801  
PMID:19837037   PMID:19850029   PMID:19850157   PMID:19850875   PMID:19855026   PMID:19855129   PMID:19877275   PMID:19887680   PMID:19890917   PMID:19900438   PMID:19906864   PMID:19910576  
PMID:19913004   PMID:19940179   PMID:19955426   PMID:20003319   PMID:20017954   PMID:20018625   PMID:20035084   PMID:20053920   PMID:20059953   PMID:20064392   PMID:20067783   PMID:20079728  
PMID:20081190   PMID:20081193   PMID:20096094   PMID:20096780   PMID:20107170   PMID:20110338   PMID:20133851   PMID:20150232   PMID:20159597   PMID:20162674   PMID:20171203   PMID:20181579  
PMID:20185795   PMID:20211142   PMID:20213756   PMID:20215350   PMID:20230754   PMID:20231872   PMID:20235227   PMID:20345923   PMID:20346763   PMID:20357111   PMID:20417598   PMID:20436479  
PMID:20463215   PMID:20484636   PMID:20519544   PMID:20533404   PMID:20534675   PMID:20554876   PMID:20562861   PMID:20626560   PMID:20627934   PMID:20631168   PMID:20631175   PMID:20648636  
PMID:20680010   PMID:20691899   PMID:20692345   PMID:20699298   PMID:20702576   PMID:20711475   PMID:20727874   PMID:20733081   PMID:20736290   PMID:20806357   PMID:20807571   PMID:20826310  
PMID:20826655   PMID:20844123   PMID:20857084   PMID:20875817   PMID:20929948   PMID:20932939   PMID:20934421   PMID:20942609   PMID:20943929   PMID:20950489   PMID:20960561   PMID:20969844  
PMID:20970343   PMID:21040847   PMID:21048141   PMID:21062862   PMID:21068056   PMID:21068058   PMID:21084609   PMID:21087508   PMID:21093585   PMID:21099304   PMID:21124801   PMID:21138975  
PMID:21145505   PMID:21150899   PMID:21157040   PMID:21167960   PMID:21185281   PMID:21205786   PMID:21215373   PMID:21220053   PMID:21220101   PMID:21246648   PMID:21246650   PMID:21248112  
PMID:21273415   PMID:21273545   PMID:21281624   PMID:21305474   PMID:21311046   PMID:21316586   PMID:21320481   PMID:21337666   PMID:21338882   PMID:21339182   PMID:21343540   PMID:21347250  
PMID:21364285   PMID:21364975   PMID:21368052   PMID:21377456   PMID:21382375   PMID:21385575   PMID:21388963   PMID:21435555   PMID:21451048   PMID:21451052   PMID:21471366   PMID:21478884  
PMID:21490060   PMID:21510873   PMID:21511879   PMID:21512031   PMID:21525287   PMID:21529712   PMID:21533046   PMID:21543603   PMID:21565611   PMID:21569850   PMID:21576457   PMID:21648018  
PMID:21651972   PMID:21658586   PMID:21658587   PMID:21664901   PMID:21674568   PMID:21674689   PMID:21677750   PMID:21698205   PMID:21708977   PMID:21731673   PMID:21734270   PMID:21750036  
PMID:21752929   PMID:21757651   PMID:21761479   PMID:21761482   PMID:21763481   PMID:21775418   PMID:21786021   PMID:21791286   PMID:21800302   PMID:21830221   PMID:21831920   PMID:21841793  
PMID:21873635   PMID:21880902   PMID:21896628   PMID:21898690   PMID:21900566   PMID:21912524   PMID:21912643   PMID:21925604   PMID:21929743   PMID:21931855   PMID:21936904   PMID:21937598  
PMID:21943603   PMID:21945624   PMID:21945863   PMID:21989917   PMID:22007132   PMID:22013016   PMID:22021915   PMID:22025611   PMID:22028026   PMID:22036570   PMID:22040872   PMID:22075149  
PMID:22087235   PMID:22096531   PMID:22102297   PMID:22102600   PMID:22103411   PMID:22110056   PMID:22116619   PMID:22116936   PMID:22128334   PMID:22158708   PMID:22159578   PMID:22173944  
PMID:22182519   PMID:22182523   PMID:22186137   PMID:22192413   PMID:22219353   PMID:22228100   PMID:22238077   PMID:22252499   PMID:22258620   PMID:22272337   PMID:22275227   PMID:22278924  
PMID:22300732   PMID:22304922   PMID:22307612   PMID:22315402   PMID:22318233   PMID:22326227   PMID:22343712   PMID:22345400   PMID:22351125   PMID:22363567   PMID:22387004   PMID:22394517  
PMID:22396765   PMID:22399681   PMID:22407321   PMID:22411555   PMID:22411557   PMID:22419569   PMID:22427341   PMID:22438573   PMID:22465342   PMID:22508726   PMID:22514301   PMID:22534286  
PMID:22542185   PMID:22549777   PMID:22569553   PMID:22586713   PMID:22595886   PMID:22609550   PMID:22613570   PMID:22621927   PMID:22629237   PMID:22649409   PMID:22711842   PMID:22718343  
PMID:22723712   PMID:22727192   PMID:22745311   PMID:22790009   PMID:22792072   PMID:22815831   PMID:22821687   PMID:22826212   PMID:22833130   PMID:22836272   PMID:22841628   PMID:22863011  
PMID:22880002   PMID:22889265   PMID:22903063   PMID:22955731   PMID:22958821   PMID:22972626   PMID:22988430   PMID:22992950   PMID:23006325   PMID:23028418   PMID:23028455   PMID:23028704  
PMID:23042297   PMID:23054727   PMID:23056209   PMID:23077629   PMID:23093675   PMID:23093780   PMID:23103965   PMID:23112163   PMID:23129807   PMID:23141541   PMID:23142317   PMID:23193182  
PMID:23213408   PMID:23227180   PMID:23238718   PMID:23284619   PMID:23288605   PMID:23293286   PMID:23307821   PMID:23319656   PMID:23342162   PMID:23351706   PMID:23359544   PMID:23361844  
PMID:23393595   PMID:23395374   PMID:23408898   PMID:23418536   PMID:23420014   PMID:23437302   PMID:23455426   PMID:23482494   PMID:23494735   PMID:23504315   PMID:23515312   PMID:23548689  
PMID:23562155   PMID:23583114   PMID:23584254   PMID:23591430   PMID:23601687   PMID:23610061   PMID:23610558   PMID:23614009   PMID:23618354   PMID:23623500   PMID:23637192   PMID:23637775  
PMID:23641053   PMID:23648511   PMID:23666531   PMID:23673330   PMID:23684982   PMID:23720040   PMID:23743334   PMID:23750000   PMID:23763947   PMID:23790753   PMID:23791818   PMID:23792428  
PMID:23797856   PMID:23798382   PMID:23817127   PMID:23823474   PMID:23826407   PMID:23866336   PMID:23873040   PMID:23900540   PMID:23906961   PMID:23926259   PMID:23932931   PMID:23974038  
PMID:23988635   PMID:24007338   PMID:24009262   PMID:24010020   PMID:24048839   PMID:24073291   PMID:24082127   PMID:24115909   PMID:24116103   PMID:24123507   PMID:24141719   PMID:24146773  
PMID:24147056   PMID:24159046   PMID:24167636   PMID:24173031   PMID:24186978   PMID:24198358   PMID:24214099   PMID:24257627   PMID:24258027   PMID:24267650   PMID:24307303   PMID:24333658  
PMID:24335256   PMID:24335282   PMID:24347548   PMID:24348261   PMID:24351932   PMID:24381269   PMID:24395778   PMID:24424161   PMID:24449844   PMID:24453327   PMID:24485459   PMID:24496616  
PMID:24591256   PMID:24591570   PMID:24610003   PMID:24643061   PMID:24656932   PMID:24674670   PMID:24680892   PMID:24709358   PMID:24715462   PMID:24755910   PMID:24760871   PMID:24763339  
PMID:24776795   PMID:24797473   PMID:24803655   PMID:24811913   PMID:24821700   PMID:24843018   PMID:24885223   PMID:24885435   PMID:24887312   PMID:24925912   PMID:24930700   PMID:24948600  
PMID:24952961   PMID:24956377   PMID:24979729   PMID:24995796   PMID:24996922   PMID:24998526   PMID:25002511   PMID:25015099   PMID:25028525   PMID:25047837   PMID:25053427   PMID:25053429  
PMID:25100604   PMID:25100946   PMID:25108913   PMID:25113559   PMID:25139745   PMID:25152336   PMID:25174608   PMID:25176648   PMID:25179941   PMID:25190705   PMID:25199831   PMID:25214396  
PMID:25228773   PMID:25258086   PMID:25271623   PMID:25296024   PMID:25313862   PMID:25331329   PMID:25336743   PMID:25343275   PMID:25350849   PMID:25367124   PMID:25371366   PMID:25392491  
PMID:25410658   PMID:25411333   PMID:25433207   PMID:25450620   PMID:25467979   PMID:25468937   PMID:25482987   PMID:25519242   PMID:25521757   PMID:25524439   PMID:25530182   PMID:25543457  
PMID:25556712   PMID:25599390   PMID:25623957   PMID:25631876   PMID:25654255   PMID:25661788   PMID:25668206   PMID:25670795   PMID:25673830   PMID:25680202   PMID:25691540   PMID:25721514  
PMID:25752730   PMID:25762221   PMID:25774014   PMID:25775587   PMID:25794677   PMID:25794678   PMID:25820239   PMID:25825735   PMID:25826454   PMID:25840610   PMID:25843547   PMID:25866925  
PMID:25868900   PMID:25877302   PMID:25885041   PMID:25904789   PMID:25907274   PMID:25918232   PMID:25919494   PMID:25936505   PMID:25942625   PMID:25943695   PMID:25953344   PMID:25975898  
PMID:25986147   PMID:25990412   PMID:25990804   PMID:25995483   PMID:26015547   PMID:26068067   PMID:26102480   PMID:26113728   PMID:26138475   PMID:26147758   PMID:26156498   PMID:26164566  
PMID:26187199   PMID:26193633   PMID:26238476   PMID:26253404   PMID:26257176   PMID:26284287   PMID:26295701   PMID:26296153   PMID:26297872   PMID:26303204   PMID:26313368   PMID:26321200  
PMID:26356988   PMID:26387456   PMID:26395479   PMID:26395878   PMID:26411685   PMID:26420484   PMID:26434918   PMID:26438843   PMID:26441343   PMID:26444681   PMID:26447474   PMID:26479710  
PMID:26489465   PMID:26490861   PMID:26495868   PMID:26503042   PMID:26511239   PMID:26545349   PMID:26633881   PMID:26659141   PMID:26680198   PMID:26681395   PMID:26758845   PMID:26765563  
PMID:26795843   PMID:26798014   PMID:26818521   PMID:26843111   PMID:26858598   PMID:26869039   PMID:26876450   PMID:26883626   PMID:26916252   PMID:26949938   PMID:26951213   PMID:26962139  
PMID:26965371   PMID:26965372   PMID:26994512   PMID:26994968   PMID:27076431   PMID:27097562   PMID:27105846   PMID:27161150   PMID:27170656   PMID:27172884   PMID:27210758   PMID:27214687  
PMID:27223328   PMID:27256596   PMID:27292642   PMID:27301906   PMID:27320915   PMID:27329940   PMID:27385012   PMID:27395006   PMID:27396331   PMID:27414999   PMID:27466379   PMID:27476503  
PMID:27477290   PMID:27478017   PMID:27532212   PMID:27568519   PMID:27571008   PMID:27578785   PMID:27621227   PMID:27654891   PMID:27697904   PMID:27740873   PMID:27784329   PMID:27789623  
PMID:27794491   PMID:27806288   PMID:27818139   PMID:27819291   PMID:27847324   PMID:27856909   PMID:27866798   PMID:27917898   PMID:27930333   PMID:27939581   PMID:27941246   PMID:27957530  
PMID:27977000   PMID:27997532   PMID:27998989   PMID:28009286   PMID:28069742   PMID:28071588   PMID:28082864   PMID:28087629   PMID:28128321   PMID:28139974   PMID:28172500   PMID:28174244  
PMID:28176844   PMID:28177282   PMID:28182636   PMID:28193997   PMID:28195173   PMID:28199486   PMID:28213137   PMID:28215559   PMID:28262664   PMID:28287088   PMID:28291807   PMID:28337978  
PMID:28346224   PMID:28356311   PMID:28378742   PMID:28379358   PMID:28402857   PMID:28431046   PMID:28436940   PMID:28437527   PMID:28438183   PMID:28447752   PMID:28451636   PMID:28472858  
PMID:28490013   PMID:28530676   PMID:28560839   PMID:28576773   PMID:28579317   PMID:28583412   PMID:28595615   PMID:28603487   PMID:28650075   PMID:28669819   PMID:28671548   PMID:28673820  
PMID:28684471   PMID:28729440   PMID:28754980   PMID:28760865   PMID:28800946   PMID:28807898   PMID:28811488   PMID:28817564   PMID:28838968   PMID:28891097   PMID:28892058   PMID:28921616  
PMID:28961240   PMID:28986144   PMID:29016745   PMID:29033129   PMID:29043563   PMID:29045838   PMID:29053761   PMID:29106072   PMID:29117290   PMID:29126155   PMID:29137925   PMID:29197504  
PMID:29202929   PMID:29218725   PMID:29220426   PMID:29225067   PMID:29272992   PMID:29282324   PMID:29321139   PMID:29343636   PMID:29343638   PMID:29363583   PMID:29367466   PMID:29374072  
PMID:29379870   PMID:29409032   PMID:29439133   PMID:29444423   PMID:29445148   PMID:29463648   PMID:29513653   PMID:29559301   PMID:29567669   PMID:29569362   PMID:29611808   PMID:29653101  
PMID:29654745   PMID:29679559   PMID:29700121   PMID:29725084   PMID:29761490   PMID:29768404   PMID:29770538   PMID:29784671   PMID:29859889   PMID:29874580   PMID:29891551   PMID:29922981  
PMID:29939162   PMID:29950673   PMID:29956664   PMID:29962937   PMID:29967281   PMID:30063705   PMID:30063881   PMID:30126905   PMID:30127719   PMID:30128894   PMID:30143575   PMID:30146259  
PMID:30149005   PMID:30242109   PMID:30254141   PMID:30254276   PMID:30311912   PMID:30332636   PMID:30333037   PMID:30372748   PMID:30413696   PMID:30451828   PMID:30456369   PMID:30470704  
PMID:30529950   PMID:30532139   PMID:30541910   PMID:30578296   PMID:30587537   PMID:30620636   PMID:30635555   PMID:30655290   PMID:30661738   PMID:30661739   PMID:30685539   PMID:30697732  
PMID:30735127   PMID:30740044   PMID:30796806   PMID:30827920   PMID:30840660   PMID:30843071   PMID:30846445   PMID:30886014   PMID:30889310   PMID:30902550   PMID:30917305   PMID:30917309  
PMID:30940539   PMID:30951706   PMID:30959515   PMID:30995485   PMID:31064784   PMID:31112136   PMID:31112709   PMID:31152445   PMID:31171666   PMID:31175693   PMID:31186351   PMID:31196952  
PMID:31201155   PMID:31201182   PMID:31206334   PMID:31211835   PMID:31221018   PMID:31235634   PMID:31235635   PMID:31249377   PMID:31305241   PMID:31320323   PMID:31341279   PMID:31356769  
PMID:31371378   PMID:31399471   PMID:31412026   PMID:31427287   PMID:31461644   PMID:31488563   PMID:31491374   PMID:31515492   PMID:31526806   PMID:31535973   PMID:31558700   PMID:31578231  
PMID:31597102   PMID:31609468   PMID:31614382   PMID:31655130   PMID:31749685   PMID:31787878   PMID:31811168   PMID:31812516   PMID:31813798   PMID:31822965   PMID:31875546   PMID:31882119  
PMID:31918020   PMID:31944180   PMID:31969659   PMID:31988190   PMID:31995756   PMID:32019948   PMID:32027825   PMID:32060653   PMID:32083082   PMID:32096760   PMID:32105214   PMID:32150249  
PMID:32170006   PMID:32180559   PMID:32215989   PMID:32244588   PMID:32398354   PMID:32414840   PMID:32420617   PMID:32453714   PMID:32471461   PMID:32499648   PMID:32511952   PMID:32521266  
PMID:32546759   PMID:32561725   PMID:32597756   PMID:32692983   PMID:32717817   PMID:32744119   PMID:32778568   PMID:32783938   PMID:32792525   PMID:32804075   PMID:32817515   PMID:32826903  
PMID:32857951   PMID:32880858   PMID:32901292   PMID:32937136   PMID:32938678   PMID:32943498   PMID:32986815   PMID:33044128   PMID:33096050   PMID:33187539   PMID:33192618   PMID:33238113  
PMID:33414188   PMID:33431871   PMID:33443158   PMID:33510480   PMID:33547135   PMID:33567267   PMID:33575260   PMID:33585465   PMID:33674582   PMID:33711282   PMID:33712461   PMID:33712552  
PMID:33727334   PMID:33775695   PMID:33787491   PMID:33789102   PMID:33833454   PMID:33869166   PMID:33887179   PMID:33892704   PMID:33899511   PMID:34003106   PMID:34169071   PMID:34171285  
PMID:34201511   PMID:34228108   PMID:34248495   PMID:34329593   PMID:34374463   PMID:34423345   PMID:34494344   PMID:34518365   PMID:34547456   PMID:34564702   PMID:34571841   PMID:34615475  
PMID:34672258   PMID:34687812   PMID:34713362   PMID:34782793   PMID:34789765   PMID:34851821   PMID:34906895   PMID:34974536   PMID:34994686   PMID:35100965   PMID:35105870   PMID:35156680  
PMID:35177643   PMID:35210288   PMID:35237793   PMID:35252209   PMID:35315772   PMID:35358427   PMID:35377797   PMID:35401124   PMID:35690356  


Genomics

Comparative Map Data
Isl1
(Mus musculus - house mouse)
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm3913116,434,806 - 116,446,224 (-)NCBIGRCm39mm39
GRCm39 Ensembl13116,434,817 - 116,446,225 (-)Ensembl
GRCm3813116,298,270 - 116,309,688 (-)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl13116,298,281 - 116,309,689 (-)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv3713117,088,478 - 117,099,896 (-)NCBIGRCm37mm9NCBIm37
MGSCv3613117,418,963 - 117,430,370 (-)NCBImm8
Celera13120,696,034 - 120,707,388 (-)NCBICelera
Cytogenetic Map13D2.2NCBI
ISL1
(Homo sapiens - human)
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCh38551,383,448 - 51,394,730 (+)NCBIGRCh38GRCh38hg38GRCh38
GRCh38.p13 Ensembl551,383,448 - 51,394,730 (+)EnsemblGRCh38hg38GRCh38
GRCh37550,679,282 - 50,690,564 (+)NCBIGRCh37GRCh37hg19GRCh37
Build 36550,714,715 - 50,726,321 (+)NCBINCBI36hg18NCBI36
Build 34550,715,025 - 50,726,310NCBI
Celera547,625,609 - 47,637,216 (+)NCBI
Cytogenetic Map5q11.1NCBI
HuRef547,642,569 - 47,654,183 (+)NCBIHuRef
CHM1_1550,681,961 - 50,693,557 (+)NCBICHM1_1
T2T-CHM13v2.0552,202,628 - 52,213,920 (+)NCBI
Isl1
(Rattus norvegicus - Norway rat)
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
mRatBN7.2248,079,412 - 48,090,704 (-)NCBImRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl248,080,522 - 48,095,584 (-)Ensembl
Rnor_6.0248,488,911 - 48,501,217 (-)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl248,487,736 - 48,501,436 (-)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.0266,871,790 - 66,883,936 (-)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.4248,050,124 - 48,060,394 (-)NCBIRGSC3.4rn4RGSC3.4
RGSC_v3.1247,978,356 - 47,988,627 (-)NCBI
Celera243,808,350 - 43,818,250 (-)NCBICelera
Cytogenetic Map2q14NCBI
Isl1
(Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla)
Chinchilla AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChiLan1.0 EnsemblNW_00495544615,824,035 - 15,835,046 (-)EnsemblChiLan1.0
ChiLan1.0NW_00495544615,824,956 - 15,835,000 (-)NCBIChiLan1.0ChiLan1.0
ISL1
(Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee)
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
PanPan1.1564,253,037 - 64,264,674 (-)NCBIpanpan1.1PanPan1.1panPan2
PanPan1.1 Ensembl564,252,715 - 64,264,674 (-)Ensemblpanpan1.1panPan2
Mhudiblu_PPA_v0562,635,095 - 62,650,141 (-)NCBIMhudiblu_PPA_v0panPan3
ISL1
(Canis lupus familiaris - dog)
Dog AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
CanFam3.1463,638,009 - 63,648,492 (-)NCBICanFam3.1CanFam3.1canFam3CanFam3.1
CanFam3.1 Ensembl463,637,443 - 63,648,183 (-)EnsemblCanFam3.1canFam3CanFam3.1
Dog10K_Boxer_Tasha463,397,586 - 63,408,606 (-)NCBI
ROS_Cfam_1.0464,141,344 - 64,152,383 (-)NCBI
ROS_Cfam_1.0 Ensembl464,141,331 - 64,152,087 (-)Ensembl
UMICH_Zoey_3.1463,906,232 - 63,917,266 (-)NCBI
UNSW_CanFamBas_1.0464,028,384 - 64,039,422 (-)NCBI
UU_Cfam_GSD_1.0464,567,747 - 64,578,778 (-)NCBI
Isl1
(Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel)
Squirrel AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HiC_Itri_2NW_024407213206,869,998 - 206,881,359 (-)NCBI
SpeTri2.0NW_00493648015,805,259 - 15,817,854 (-)NCBISpeTri2.0SpeTri2.0SpeTri2.0
ISL1
(Sus scrofa - pig)
Pig AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
Sscrofa11.1 Ensembl1630,963,000 - 30,973,907 (+)EnsemblSscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa11.11630,962,994 - 30,974,201 (+)NCBISscrofa11.1Sscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa10.21632,548,015 - 32,559,227 (-)NCBISscrofa10.2Sscrofa10.2susScr3
ISL1
(Chlorocebus sabaeus - green monkey)
Green Monkey AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChlSab1.1447,665,861 - 47,678,631 (+)NCBIChlSab1.1chlSab2
ChlSab1.1 Ensembl447,666,536 - 47,677,552 (+)EnsemblChlSab1.1chlSab2
Vero_WHO_p1.0NW_0236660823,504,978 - 3,526,896 (-)NCBIVero_WHO_p1.0
Isl1
(Heterocephalus glaber - naked mole-rat)
Naked Mole-rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HetGla_female_1.0 EnsemblNW_0046247597,994,242 - 8,006,311 (-)EnsemblHetGla_female_1.0hetGla2
HetGla 1.0NW_0046247597,996,177 - 8,006,281 (-)NCBIHetGla_female_1.0hetGla2

Position Markers
Isl1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
MGSCv3713117,088,780 - 117,088,847UniSTSGRCm37
MGSCv3713117,089,527 - 117,089,720UniSTSGRCm37
MGSCv3713117,091,928 - 117,093,348UniSTSGRCm37
Celera13120,696,338 - 120,696,405UniSTS
Celera13120,699,469 - 120,700,888UniSTS
Celera13120,697,085 - 120,697,278UniSTS
Cytogenetic Map13D2.3UniSTS
cM Map13 UniSTS
PMC186328P1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm3813116,305,251 - 116,305,437UniSTSGRCm38
MGSCv3713117,095,459 - 117,095,645UniSTSGRCm37
Celera13120,702,951 - 120,703,137UniSTS
Cytogenetic Map13D2.3UniSTS
Isl1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm3813116,298,572 - 116,298,639UniSTSGRCm38
MGSCv3713117,088,780 - 117,088,847UniSTSGRCm37
Celera13120,696,338 - 120,696,405UniSTS
Cytogenetic Map13D2.3UniSTS
Isl1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm3813116,299,319 - 116,299,512UniSTSGRCm38
MGSCv3713117,089,527 - 117,089,720UniSTSGRCm37
Celera13120,697,085 - 120,697,278UniSTS
Cytogenetic Map13D2.3UniSTS
Isl1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm3813116,301,720 - 116,303,140UniSTSGRCm38
MGSCv3713117,091,928 - 117,093,348UniSTSGRCm37
Celera13120,699,469 - 120,700,888UniSTS
Cytogenetic Map13D2.3UniSTS
Isl1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map13D2.3UniSTS
Isl1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map13D2.3UniSTS


QTLs in Region (GRCm39)
The following QTLs overlap with this region.    Full Report CSV TAB Printer Gviewer
RGD IDSymbolNameLODP ValueTraitSub TraitChrStartStopSpecies
1558741Ses10_msalmonella enteritidis susceptibility 10 (mouse)Not determined1382739968116740106Mouse
4142465Pbwg17_mpostnatal body weight growth 17 (mouse)Not determined1383876060117876256Mouse
14700691Cisaq1_mcoxsackieviral infection serum ALT QTL 1 (mouse)1386148119120461536Mouse
4140995Fbtq6_mfemoral bone trait QTL 6 (mouse)Not determined1386341617120341758Mouse
1300939Hrtfm6_mheart failure modifier 6 (mouse)Not determined1391383692120883175Mouse
1300876Tanidd2_mtally ho associated non-insulin dependednt diabetes mellitus 2 (mouse)Not determined1391965303120883175Mouse
1301142Heal2_mwound healing/regeneration 2 (mouse)Not determined1393875267120883175Mouse
4142338Skmw18_mskeletal muscle weight 18 (mouse)Not determined1394528399120883175Mouse
1558763Gct9_mgranulosa cell tumorigenesis 9 (mouse)Not determined1395036824120883175Mouse
1357468Rplag_mreduced platelet aggregation (mouse)Not determined1395502130120883175Mouse
14746974Manh75_mmandible shape 75 (mouse)1399386647120883175Mouse
12879496Fexq2_mfear expression QTL 2 (mouse)13100741519120883175Mouse
4142400Tgq24_mtriglyceride QTL 24 (mouse)Not determined102602630120883175Mouse
4141826Tbqt5_mtibia bone quality traits 5 (mouse)Not determined13103341617117043216Mouse
4142334Svtms_msurvival time modifier of Sod2 (mouse)Not determined13107613580119476372Mouse
4141704Hipq1_mhyperinsulin production QTL 1 (mouse)Not determined110409487119476372Mouse

miRNA Target Status

Predicted Target Of
Summary Value
Count of predictions:636
Count of miRNA genes:438
Interacting mature miRNAs:484
Transcripts:ENSMUST00000036060, ENSMUST00000176044, ENSMUST00000176444, ENSMUST00000176812, ENSMUST00000177469
Prediction methods:Miranda, Rnahybrid
Result types:miRGate_prediction

The detailed report is available here: Full Report CSV TAB Printer

miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/).
For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here.


Expression


Sequence


Reference Sequences
RefSeq Acc Id: ENSMUST00000036060   ⟹   ENSMUSP00000044879
RefSeq Status:
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl13116,434,817 - 116,446,225 (-)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl13116,298,281 - 116,309,689 (-)Ensembl
RefSeq Acc Id: ENSMUST00000176044   ⟹   ENSMUSP00000135567
RefSeq Status:
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl13116,435,799 - 116,445,958 (-)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl13116,299,263 - 116,309,422 (-)Ensembl
RefSeq Acc Id: ENSMUST00000176444
RefSeq Status:
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl13116,435,931 - 116,439,887 (-)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl13116,299,395 - 116,303,351 (-)Ensembl
RefSeq Acc Id: ENSMUST00000176812
RefSeq Status:
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl13116,439,582 - 116,442,933 (-)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl13116,303,046 - 116,306,397 (-)Ensembl
RefSeq Acc Id: ENSMUST00000177469
RefSeq Status:
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl13116,443,427 - 116,446,221 (-)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl13116,306,891 - 116,309,685 (-)Ensembl
RefSeq Acc Id: NM_021459   ⟹   NP_067434
RefSeq Status: VALIDATED
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm3913116,434,806 - 116,446,224 (-)NCBI
GRCm3813116,298,270 - 116,309,688 (-)NCBI
MGSCv3713117,088,478 - 117,099,896 (-)RGD
Celera13120,696,034 - 120,707,388 (-)RGD
cM Map13 ENTREZGENE
Sequence:
Reference Sequences
RefSeq Acc Id: NP_067434   ⟸   NM_021459
- UniProtKB: P61372 (UniProtKB/Swiss-Prot),   A2RSV5 (UniProtKB/TrEMBL),   Q8BTH7 (UniProtKB/TrEMBL)
- Sequence:
RefSeq Acc Id: ENSMUSP00000044879   ⟸   ENSMUST00000036060
RefSeq Acc Id: ENSMUSP00000135567   ⟸   ENSMUST00000176044
Protein Domains
Homeobox   LIM zinc-binding

Protein Structures
Name Modeler Protein Id AA Range Protein Structure
AF-P61372-F1-model_v2 AlphaFold P61372 1-349 view protein structure

Promoters
RGD ID:8681362
Promoter ID:EPDNEW_M18712
Type:initiation region
Name:Isl1_1
Description:Mus musculus ISL1 transcription factor, LIM/homeodomain , mRNA.
SO ACC ID:SO:0000170
Source:EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/)
Experiment Methods:Single-end sequencing.
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm3813116,309,647 - 116,309,707EPDNEW

Additional Information

Database Acc Id Source(s)
AGR Gene MGI:101791 AgrOrtholog
Ensembl Genes ENSMUSG00000042258 Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot
Ensembl Protein ENSMUSP00000044879 ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot
  ENSMUSP00000135567 UniProtKB/Swiss-Prot
Ensembl Transcript ENSMUST00000036060 ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot
  ENSMUST00000176044 UniProtKB/Swiss-Prot
InterPro Homeobox-like_sf UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Homeobox_CS UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Homeobox_dom UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Znf_LIM UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
KEGG Report mmu:16392 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
MGD MGI:101791 ENTREZGENE
NCBI Gene 16392 ENTREZGENE
Pfam Homeodomain UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  LIM UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
PhenoGen Isl1 PhenoGen
PROSITE HOMEOBOX_1 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  HOMEOBOX_2 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  LIM_DOMAIN_1 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  LIM_DOMAIN_2 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
SMART HOX UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  LIM UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
Superfamily-SCOP SSF46689 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
UniProt A2RSV5 ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL
  B2ZUN4_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  ISL1_MOUSE UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE
  Q8BTH7 ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL
UniProt Secondary P20663 UniProtKB/Swiss-Prot
  P47894 UniProtKB/Swiss-Prot
  Q812D8 UniProtKB/Swiss-Prot