Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
Advanced Search (OLGA)

GENE - TERM ANNOTATION REPORT

5 Annotations Found.

An association has been curated linking Scn5a and Brugada syndrome 1 in Rattus norvegicus.        

  • The association was inferred from sequence orthology (ISO)
    		•  
  • The annotation was made from OMIM Disease Annotation Pipeline
  • The annotation has been inferred from sequence orthology with SCN5A (Homo sapiens) [(IAGP) inferred by association of genotype and phenotype]
  • 11 RGD objects have been annotated to Brugada syndrome 1  (DOID:0110218)
  • 32 papers in RGD have been used to annotate Scn5a


    • An association has been curated linking Scn5a and Brugada syndrome 1 in Rattus norvegicus.        

  • The association was inferred from sequence or structural similarity (ISS)
    		•  
  • The annotation was made from RGD automated import pipeline for MGI gene-to-disease annotations
  • The annotation has been inferred from sequence or structural similarity with Scn5a (Mus musculus) [(IAGP) inferred by association of genotype and phenotype]
  • 11 RGD objects have been annotated to Brugada syndrome 1  (DOID:0110218)
  • 32 papers in RGD have been used to annotate Scn5a
  • Curation Notes: OMIM:601144


    • An association has been curated linking Scn5a and Brugada syndrome 1 in Rattus norvegicus.        

  • The association was inferred from sequence orthology (ISO)
    		•  
  • The annotation was made from RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations
  • The annotation has been inferred from sequence orthology with SCN5A (Homo sapiens) [(IAGP) inferred by association of genotype and phenotype]
  • 11 RGD objects have been annotated to Brugada syndrome 1  (DOID:0110218)
  • 32 papers in RGD have been used to annotate Scn5a
  • Curation Notes: ClinVar Annotator: match by term: Brugada syndrome 1 | ClinVar Annotator: match by term: RIGHT BUNDLE BRANCH BLOCK, ST SEGMENT ELEVATION, AND SUDDEN DEATH SYNDROME | ClinVar Annotator: match by term: Right bundle branch block, ST segment elevation, and sudden death syndrome
  • Original References(s): PMID:10377081 PMID:10508990 PMID:10532948 PMID:10590249 PMID:10618304 PMID:10662748 PMID:10690282 PMID:10711933 PMID:10727653 PMID:10807545 PMID:10807547 PMID:10940383 PMID:10961955 PMID:10966831 PMID:10973849 PMID:11013131 PMID:11029409 PMID:11076825 PMID:11123251 PMID:11150514 PMID:11222472 PMID:11410597 PMID:11417215 PMID:11463728 PMID:11562792 PMID:11710892 PMID:11748104 PMID:11786529 PMID:11804990 PMID:11807557 PMID:11823453 PMID:11827685 PMID:11889015 PMID:11901046 PMID:11960580 PMID:11997281 PMID:12051963 PMID:12106943 PMID:12193783 PMID:12354768 PMID:12471205 PMID:12566525 PMID:12569159 PMID:12574143 PMID:12639704 PMID:12673799 PMID:12820704 PMID:12877697 PMID:1309946 PMID:14500339 PMID:14523039 PMID:14607451 PMID:14687250 PMID:14753626 PMID:14760488 PMID:14961552 PMID:14967853 PMID:14985827 PMID:14998624 PMID:15023552 PMID:15028074 PMID:15121794 PMID:15161528 PMID:15176425 PMID:15178757 PMID:15266024 PMID:15277732 PMID:15338453 PMID:15466642 PMID:15520322 PMID:15556047 PMID:15579534 PMID:15599693 PMID:15671429 PMID:15689442 PMID:15828879 PMID:15840476 PMID:15840483 PMID:15851227 PMID:15851228 PMID:15851440 PMID:15910881 PMID:15992732 PMID:15996170 PMID:16061744 PMID:16132053 PMID:16155735 PMID:16199547 PMID:16239976 PMID:16266370 PMID:16267250 PMID:16267253 PMID:16325048 PMID:16344400 PMID:16379539 PMID:16414944 PMID:16453014 PMID:16453024 PMID:16505387 PMID:16540748 PMID:16568155 PMID:16611632 PMID:16632547 PMID:16686678 PMID:16707561 PMID:16712702 PMID:16731473 PMID:16764707 PMID:16798729 PMID:16864729 PMID:16922724 PMID:16945804 PMID:17081365 PMID:17088455 PMID:17141278 PMID:17161064 PMID:17185997 PMID:17198989 PMID:17210839 PMID:17210841 PMID:17227473 PMID:17275750 PMID:17331104 PMID:17438607 PMID:17438610 PMID:17442746 PMID:17504259 PMID:17510181 PMID:17512504 PMID:17576681 PMID:17587741 PMID:17605181 PMID:17646591 PMID:17675083 PMID:17697823 PMID:17854786 PMID:17892895 PMID:17897635 PMID:17905336 PMID:17908752 PMID:17967976 PMID:17993325 PMID:18048769 PMID:18071069 PMID:18088563 PMID:18093912 PMID:18156160 PMID:18180363 PMID:18245395 PMID:18304999 PMID:18361072 PMID:18362431 PMID:18368697 PMID:18378609 PMID:18426444 PMID:18451998 PMID:18452873 PMID:18452875 PMID:18456723 PMID:18503232 PMID:18508782 PMID:18596570 PMID:18599870 PMID:18708744 PMID:18752142 PMID:18752973 PMID:18809926 PMID:18849657 PMID:18976777 PMID:19017345 PMID:19026623 PMID:19027780 PMID:19056759 PMID:19083750 PMID:19167345 PMID:19214780 PMID:19251209 PMID:19272188 PMID:19302788 PMID:19305408 PMID:19305409 PMID:19322600 PMID:19406494 PMID:19412328 PMID:19561025 PMID:19597050 PMID:19606473 PMID:19632629 PMID:19666841 PMID:19706159 PMID:19716085 PMID:19799913 PMID:19808398 PMID:19808477 PMID:19841298 PMID:19841300 PMID:19843921 PMID:19862833 PMID:19996378 PMID:20031634 PMID:20102864 PMID:20102920 PMID:20110800 PMID:20123697 PMID:20129283 PMID:20137763 PMID:2030070 PMID:20301690 PMID:20384651 PMID:20395683 PMID:20403459 PMID:20448214 PMID:20458009 PMID:20470418 PMID:20486126 PMID:20539757 PMID:20541041 PMID:20566482 PMID:20609320 PMID:20625312 PMID:20636320 PMID:20646679 PMID:20875080 PMID:20877689 PMID:20981092 PMID:21051419 PMID:2107088 PMID:21070882 PMID:21109022 PMID:21126620 PMID:21143119 PMID:21167004 PMID:21167176 PMID:21185501 PMID:21273195 PMID:21306642 PMID:21321465 PMID:21325150 PMID:21385947 PMID:21410720 PMID:21483645 PMID:21498565 PMID:21596231 PMID:21621375 PMID:21622575 PMID:21705349 PMID:21726068 PMID:21840964 PMID:21908450 PMID:22028457 PMID:22090166 PMID:22247482 PMID:22277643 PMID:22331908 PMID:22337857 PMID:22338672 PMID:22360817 PMID:22370247 PMID:22373669 PMID:22378279 PMID:22407026 PMID:22426227 PMID:2247482 PMID:22490985 PMID:22519808 PMID:22557970 PMID:22581653 PMID:22675453 PMID:22677073 PMID:22682427 PMID:22685113 PMID:22710484 PMID:22739120 PMID:22766342 PMID:22789973 PMID:22795782 PMID:22840528 PMID:22885917 PMID:22899775 PMID:22956155 PMID:22984773 PMID:22995991 PMID:22999724 PMID:23008441 PMID:23085483 PMID:23091201


    • An association has been curated linking Scn5a and Brugada syndrome 1 in Rattus norvegicus.        

  • The association was inferred from sequence orthology (ISO)
    		•  
  • The annotation was made from RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations
  • The annotation has been inferred from sequence orthology with SCN5A (Homo sapiens) [(IAGP) inferred by association of genotype and phenotype]
  • 11 RGD objects have been annotated to Brugada syndrome 1  (DOID:0110218)
  • 32 papers in RGD have been used to annotate Scn5a
  • Curation Notes: ClinVar Annotator: match by term: Brugada syndrome 1 | ClinVar Annotator: match by term: RIGHT BUNDLE BRANCH BLOCK, ST SEGMENT ELEVATION, AND SUDDEN DEATH SYNDROME | ClinVar Annotator: match by term: Right bundle branch block, ST segment elevation, and sudden death syndrome
  • Original References(s): PMID:29884292 PMID:29892087 PMID:29895855 PMID:29907873 PMID:29907895 PMID:29915097 PMID:29953624 PMID:29961767 PMID:29997009 PMID:29998127 PMID:30050137 PMID:30059973 PMID:30079003 PMID:30086531 PMID:30122538 PMID:30143662 PMID:30146492 PMID:30153324 PMID:30165862 PMID:30193851 PMID:30203441 PMID:30232268 PMID:30244407 PMID:30246897 PMID:30279931 PMID:30364184 PMID:30369311 PMID:30371189 PMID:30371277 PMID:30385166 PMID:30419068 PMID:30476647 PMID:30532816 PMID:30609406 PMID:30615648 PMID:30662450 PMID:30670673 PMID:30690642 PMID:30700137 PMID:30828344 PMID:30828412 PMID:30847665 PMID:30847666 PMID:30860130 PMID:30868116 PMID:30891416 PMID:30955239 PMID:30972196 PMID:30975432 PMID:31019283 PMID:31020160 PMID:31032819 PMID:31043699 PMID:31069529 PMID:31125670 PMID:31191357 PMID:31333075 PMID:31337358 PMID:31371804 PMID:31395126 PMID:31397097 PMID:31447099 PMID:31453232 PMID:31470130 PMID:31477192 PMID:31514951 PMID:31521807 PMID:31534214 PMID:31535183 PMID:31564432 PMID:31568572 PMID:31610692 PMID:31638414 PMID:31657683 PMID:31696929 PMID:31709321 PMID:31713545 PMID:31737537 PMID:31847883 PMID:31865383 PMID:31866066 PMID:31901299 PMID:31918855 PMID:31928070 PMID:31928344 PMID:31935801 PMID:31981491 PMID:31983221 PMID:32009526 PMID:32048431 PMID:32091595 PMID:32096284 PMID:32145446 PMID:32153684 PMID:32161207 PMID:32233023 PMID:32268277 PMID:32323320 PMID:32371921 PMID:32383558 PMID:32389048 PMID:32431610 PMID:32449611 PMID:32470535 PMID:32508047 PMID:32533187 PMID:32533946 PMID:32553838 PMID:32600061 PMID:32619740 PMID:32652122 PMID:32659924 PMID:32746448 PMID:32789579 PMID:32815768 PMID:32826072 PMID:32850980 PMID:32880476 PMID:32893267 PMID:32917565 PMID:32931854 PMID:33029862 PMID:33071830 PMID:33083013 PMID:33087929 PMID:33131149 PMID:33164571 PMID:33213388 PMID:33221895 PMID:33232181 PMID:33258288 PMID:33338828 PMID:33500567 PMID:33535892 PMID:33552729 PMID:33641026 PMID:33662488 PMID:33712541 PMID:33764691 PMID:33797273 PMID:33874732 PMID:33906374 PMID:33919104 PMID:33996946 PMID:34019817 PMID:34021086 PMID:34034907 PMID:34076677 PMID:34092119 PMID:34122134 PMID:34135346 PMID:34147702 PMID:34194985 PMID:34219138 PMID:34298581 PMID:34317510 PMID:34348284 PMID:34379075 PMID:34426522 PMID:34461752 PMID:34486814 PMID:34495297 PMID:34539730 PMID:34546463 PMID:34555931 PMID:34620408 PMID:34621001 PMID:34628405 PMID:34628415 PMID:34645491 PMID:34649698 PMID:34678660 PMID:34843967 PMID:34856468 PMID:34930020 PMID:34935411 PMID:34957250 PMID:35027292 PMID:35052356 PMID:35113648 PMID:35124229 PMID:35284542 PMID:35305865 PMID:35331424 PMID:35394010 PMID:35397174 PMID:35538921 PMID:35617207 PMID:35650162 PMID:35663620 PMID:35701104 PMID:35703482 PMID:35727495 PMID:35932045 PMID:36007526 PMID:36091819 PMID:36129056 PMID:36143288 PMID:36147716 PMID:36197721 PMID:36220970 PMID:36291626 PMID:36303204 PMID:36354768 PMID:36516610 PMID:36578016 PMID:36588553 PMID:36724992 PMID:36881552 PMID:36927930 PMID:36964972 PMID:36973604 PMID:37061847 PMID:37351150 PMID:37432518 PMID:37449562 PMID:37461109 PMID:37547970 PMID:37614113 PMID:37732247 PMID:37746560 PMID:37795979 PMID:37894777 PMID:37904629 PMID:38068978 PMID:38241367 PMID:38352122 PMID:38473809 PMID:38489124 PMID:38534782 PMID:38731905 PMID:39481677 PMID:461398 PMID:545017 PMID:748006 PMID:8661019 PMID:8972392 PMID:9521325 PMID:9536098 PMID:9686753 PMID:9716085


    • An association has been curated linking Scn5a and Brugada syndrome 1 in Rattus norvegicus.        

  • The association was inferred from sequence orthology (ISO)
    		•  
  • The annotation was made from RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations
  • The annotation has been inferred from sequence orthology with SCN5A (Homo sapiens) [(IAGP) inferred by association of genotype and phenotype]
  • 11 RGD objects have been annotated to Brugada syndrome 1  (DOID:0110218)
  • 32 papers in RGD have been used to annotate Scn5a
  • Curation Notes: ClinVar Annotator: match by term: Brugada syndrome 1 | ClinVar Annotator: match by term: RIGHT BUNDLE BRANCH BLOCK, ST SEGMENT ELEVATION, AND SUDDEN DEATH SYNDROME | ClinVar Annotator: match by term: Right bundle branch block, ST segment elevation, and sudden death syndrome
  • Original References(s): PMID:23098067 PMID:23104914 PMID:23139254 PMID:23168001 PMID:23174487 PMID:23200271 PMID:23237912 PMID:23293604 PMID:23299917 PMID:23321620 PMID:23382499 PMID:23396983 PMID:23414114 PMID:23420830 PMID:23424222 PMID:23425522 PMID:23465283 PMID:23503384 PMID:23538271 PMID:235469 PMID:235504 PMID:23571586 PMID:23631430 PMID:23671135 PMID:23692053 PMID:23714088 PMID:23785128 PMID:23805106 PMID:23838598 PMID:23840796 PMID:23853484 PMID:23861362 PMID:23874304 PMID:23936059 PMID:23963187 PMID:24033266 PMID:24055113 PMID:24136861 PMID:24144883 PMID:24190697 PMID:24227891 PMID:24295898 PMID:24317018 PMID:24332150 PMID:24349418 PMID:24363352 PMID:24388587 PMID:24400668 PMID:24439875 PMID:24463578 PMID:24524602 PMID:24529773 PMID:24573164 PMID:24573764 PMID:24606995 PMID:24613995 PMID:24631775 PMID:24653702 PMID:24667783 PMID:24721456 PMID:24721642 PMID:24736382 PMID:24762593 PMID:24762805 PMID:24768612 PMID:24784157 PMID:24795344 PMID:24815523 PMID:24871449 PMID:24892747 PMID:24895455 PMID:24915601 PMID:24948852 PMID:24951569 PMID:24951663 PMID:24963427 PMID:24981977 PMID:25051102 PMID:25065297 PMID:25102755 PMID:25172307 PMID:25175087 PMID:25179549 PMID:25194972 PMID:25210054 PMID:25210526 PMID:25261036 PMID:25326637 PMID:25344691 PMID:25348405 PMID:25351510 PMID:25410959 PMID:25467552 PMID:25554238 PMID:25585270 PMID:25624448 PMID:25626866 PMID:25637381 PMID:25649125 PMID:25650408 PMID:256650 PMID:25741286 PMID:25741868 PMID:25741911 PMID:25741912 PMID:25748040 PMID:25757662 PMID:25815641 PMID:25829473 PMID:25856671 PMID:25904541 PMID:25923670 PMID:26022185 PMID:26031372 PMID:26071830 PMID:26111534 PMID:26125038 PMID:26129877 PMID:26131924 PMID:26136871 PMID:26159999 PMID:26164358 PMID:26173111 PMID:26187847 PMID:26189708 PMID:26209461 PMID:26213684 PMID:26214305 PMID:26220391 PMID:26220970 PMID:26281194 PMID:26282245 PMID:26283144 PMID:26304136 PMID:26304620 PMID:26332594 PMID:26383259 PMID:26406308 PMID:26412604 PMID:26467025 PMID:26467377 PMID:26538325 PMID:26632536 PMID:26633542 PMID:26669661 PMID:26680202 PMID:26713557 PMID:26733869 PMID:26743238 PMID:26746457 PMID:26749013 PMID:26771585 PMID:26798387 PMID:26801742 PMID:26822237 PMID:26828384 PMID:26916278 PMID:26921764 PMID:27000522 PMID:27026747 PMID:27077130 PMID:27082542 PMID:27108952 PMID:27153395 PMID:27207958 PMID:27232914 PMID:27281089 PMID:27287068 PMID:27332903 PMID:27381756 PMID:27435932 PMID:27485560 PMID:27529593 PMID:27532257 PMID:27554632 PMID:27566755 PMID:27635072 PMID:27650965 PMID:27668095 PMID:27707468 PMID:27711072 PMID:27810048 PMID:27816319 PMID:27834932 PMID:27871843 PMID:27896284 PMID:27930701 PMID:28018021 PMID:28069705 PMID:28074886 PMID:28086167 PMID:28087566 PMID:28087622 PMID:28104484 PMID:28150151 PMID:28152038 PMID:28183570 PMID:28202948 PMID:28265756 PMID:28301460 PMID:28323875 PMID:28341588 PMID:28341781 PMID:28344931 PMID:28359509 PMID:28370132 PMID:28391114 PMID:28412158 PMID:28416588 PMID:28438721 PMID:28449774 PMID:28472724 PMID:28491738 PMID:28491758 PMID:28492532 PMID:28493952 PMID:28494446 PMID:28498465 PMID:28518168 PMID:28521022 PMID:28549997 PMID:28567303 PMID:28573431 PMID:28589536 PMID:28600387 PMID:28611029 PMID:28638671 PMID:28704380 PMID:28725320 PMID:28779003 PMID:28781330 PMID:28781849 PMID:28790152 PMID:28794082 PMID:28798025 PMID:28807990 PMID:28831623 PMID:28834665 PMID:28837624 PMID:28878402 PMID:28988457 PMID:28991257 PMID:29016939 PMID:29032884 PMID:29033053 PMID:29038103 PMID:29062695 PMID:29095814 PMID:29121719 PMID:29132927 PMID:29167113 PMID:291807 PMID:29192238 PMID:29202755 PMID:29247119 PMID:29255176 PMID:29306897 PMID:29325976 PMID:29349559 PMID:29396286 PMID:29396561 PMID:29420653 PMID:29431662 PMID:29447731 PMID:29449639 PMID:29449963 PMID:29517769 PMID:29531232 PMID:29540472 PMID:29540853 PMID:29544605 PMID:29574140 PMID:29579189 PMID:29672598 PMID:29709101 PMID:29709244 PMID:29728395 PMID:29748316 PMID:29759522 PMID:29759671 PMID:29766885 PMID:29773157 PMID:29791480 PMID:29798782 PMID:29806494 PMID:29871609


    • Go Back to source page   Continue to Ontology report