Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Experimental Liver Cirrhosis | | ISO | GLT8D1 (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:25380136 | |
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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Experimental Liver Cirrhosis | | ISO | GLT8D1 (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:25380136 | |
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# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Functional annotation of a full-length mouse cDNA collection. | Kawai J, etal., Nature. 2001 Feb 8;409(6821):685-90. |
2. | MGDs mouse GO annotations | MGD data from the GO Consortium |
3. | MGD IEA | MGD IEA |
4. | Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60,770 full-length cDNAs. | Okazaki Y, etal., Nature. 2002 Dec 5;420(6915):563-73. |
5. | Mouse MP Annotation Import Pipeline | RGD automated import pipeline |
6. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
PMID:8889548 | PMID:10349636 | PMID:10922068 | PMID:11042159 | PMID:11076861 | PMID:12477932 | PMID:14610273 | PMID:15782199 | PMID:16141072 | PMID:16141073 | PMID:18799693 | PMID:20562862 |
PMID:21267068 | PMID:21873635 | PMID:28378742 | PMID:29483533 |
Glt8d1 (Mus musculus - house mouse) |
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GLT8D1 (Homo sapiens - human) |
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Glt8d1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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Glt8d1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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GLT8D1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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GLT8D1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Glt8d1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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GLT8D1 (Sus scrofa - pig) |
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GLT8D1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Glt8d1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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Variants in Glt8d1
222 total Variants |
The detailed report is available here: | Full Report | CSV | TAB | Printer | ||||
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
The following QTLs overlap with this region. | Full Report | CSV | TAB | Printer | Gviewer |
AI450005 |
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D10Mit157.2 |
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Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-Q6NSU3-F1-model_v2 | AlphaFold | Q6NSU3 | 1-371 | view protein structure |
RGD ID: | 8681796 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_M18929 | ||||||||
Type: | initiation region | ||||||||
Name: | Glt8d1_1 | ||||||||
Description: | Mus musculus glycosyltransferase 8 domain containing 1 , transcriptvariant 1, mRNA. | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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RGD ID: | 6824955 | ||||||||
Promoter ID: | MM_KWN:16079 | ||||||||
Type: | CpG-Island | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | MPROMDB | ||||||||
Tissues & Cell Lines: | 3T3L1_Day0, 3T3L1_Day1, 3T3L1_Day2, 3T3L1_Day4, BoneMarrow_2Hour, BoneMarrow_4Hour, Brain, ES_Cell, Kidney, Lung, MEF_B4, MEF_B6 | ||||||||
Transcripts: | NM_001165930, NM_029626, UC007SWG.1 | ||||||||
Position: |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | MGI:1923735 | AgrOrtholog |
Ensembl Genes | ENSMUSG00000021916 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Transcript | ENSMUST00000022476 | ENTREZGENE |
ENSMUST00000022476.9 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
ENSMUST00000168584 | ENTREZGENE | |
ENSMUST00000168584.9 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
ENSMUST00000226378.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSMUST00000228255 | ENTREZGENE | |
InterPro | Glyco_trans_8 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Nucleotide-diphossugar_trans | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | mmu:76485 | UniProtKB/Swiss-Prot |
MGD | MGI:1923735 | ENTREZGENE |
NCBI Gene | 76485 | ENTREZGENE |
PANTHER | GLYCOSYLTRANSFERASE 8 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
GLYCOSYLTRANSFERASE 8 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Pfam | Glyco_transf_8 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Glt8d1 | PhenoGen |
Superfamily-SCOP | SSF53448 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
UniProt | A0A2I3BRI4_MOUSE | UniProtKB/TrEMBL |
GL8D1_MOUSE | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Q3TV18 | ENTREZGENE | |
Q6NSU3 | ENTREZGENE | |
Q7TNU1_MOUSE | UniProtKB/TrEMBL | |
Q9CWT8 | ENTREZGENE | |
UniProt Secondary | Q3TV18 | UniProtKB/Swiss-Prot |
Q9CWT8 | UniProtKB/Swiss-Prot |