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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:uridine 5'-monophosphate(2-)
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Accession:CHEBI:57865 term browser browse the term
Definition:A pyrimidine nucleoside 5'-monophosphate(2-) that results from the removal of two protons from the phosphate group of UMP.
Synonyms:exact_synonym: 5'-O-phosphonatouridine
 related_synonym: 5'-uridylate;   Formula=C9H11N2O9P;   InChI=1S/C9H13N2O9P/c12-5-1-2-11(9(15)10-5)8-7(14)6(13)4(20-8)3-19-21(16,17)18/h1-2,4,6-8,13-14H,3H2,(H,10,12,15)(H2,16,17,18)/p-2/t4-,6-,7-,8-/m1/s1;   InChIKey=DJJCXFVJDGTHFX-XVFCMESISA-L;   SMILES=O[C@@H]1[C@@H](COP([O-])([O-])=O)O[C@H]([C@@H]1O)n1ccc(=O)[nH]c1=O;   UMP;   UMP dianion;   UMP(2-);   uridine 5'-phosphate
 xref: Beilstein:3570858;   Gmelin:341500
 cyclic_relationship: is_conjugate_base_of CHEBI:16695



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  CHEBI ontology 19808
    role 19784
      biological role 19782
        biochemical role 19496
          metabolite 19484
            eukaryotic metabolite 19307
              fungal metabolite 17857
                Saccharomyces cerevisiae metabolite 17290
                  uridine 5'-monophosphate(2-) 0
                    5,6-dihydrouridine 5'-monophosphate(2-) 0
                    TMP(2-) 0
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  CHEBI ontology 19808
    subatomic particle 19806
      composite particle 19806
        hadron 19806
          baryon 19806
            nucleon 19806
              atomic nucleus 19806
                atom 19806
                  main group element atom 19756
                    p-block element atom 19756
                      chalcogen 19513
                        oxygen atom 19488
                          oxygen molecular entity 19488
                            hydroxides 19299
                              oxoacid 18736
                                pnictogen oxoacid 13211
                                  phosphorus oxoacid 12414
                                    phosphoric acids 11418
                                      phosphoric acid 11418
                                        phosphoric acid derivative 11227
                                          phosphate 11226
                                            organic phosphate 11226
                                              carbohydrate phosphate 1854
                                                phospho sugar 1699
                                                  aldose phosphate 1696
                                                    aldopentose phosphate 1688
                                                      ribose phosphate 1683
                                                        ribonucleotide 1644
                                                          ribonucleoside 5'-phosphate 643
                                                            ribonucleoside 5'-monophosphate 356
                                                              uridine 5'-monophosphate(2-) 0
                                                                5,6-dihydrouridine 5'-monophosphate(2-) 0
                                                                TMP(2-) 0
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