Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 106,099 (bp)   Positions: 405
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
--
.01
.033
.998
.074
.411
.0
.002
.012
.046
.997
.075
.001
.005
.13
.001
.002
.051
--
--
--
.001
.097
.441
.0
.0
.997
.076
.023
.002
.017
.038
.045
.001
.001
.006
.01
.501
.117
.008
.001
.04
.989
.413
.946
.018
.013
.001
.0
.0
.002
.002
.001
--
.0
.001
.004
--
--
.001
.01
.063
.007
.011
.004
.002
.001
.063
.258
.055
.001
.003
.009
.159
--
.047
.082
.015
.04
.13
.001
.005
.002
.001
.846
1.0
.012
.009
.003
.016
.0
.017
.0
.0
.001
.004
.009
.006
.0
.0
.016
.0
.065
.045
.009
.001
.0
.0
.001
.003
.013
.003
.002
.006
.001
.004
--
--
.0
.005
.048
.002
.004
.006
.039
.014
.677
.001
.0
.0
.342
.023
.008
--
--
--
.026
.152
.345
.046
.382
.548
.357
.317
.8
.905
.946
.536
.519
.526
.583
.003
.002
.004
.026
.011
.003
.014
.039
.0
.001
.111
.011
.0
.005
.018
--
.005
.008
.079
.011
.011
.002
.003
.494
.001
.002
.213
.059
.007
.548
.235
.011
.011
.137
.107
.059
.022
.051
.071
.048
.189
.038
.065
.001
.001
.01
.107
.015
--
--
.971
.062
.06
.057
.054
.067
.989
.001
.013
.0
.162
.002
.002
.003
.022
.001
.003
.008
.0
.021
.0
.005
.019
.044
.04
.014
.001
.002
.0
.0
.001
.027
.068
.002
.013
.155
.01
.012
--
.015
.003
.793
.763
.931
.191
.688
.007
.026
.02
.055
.006
.001
.007
.01
.022
.037
.05
.023
.915
.0
.003
.025
.048
.008
.017
.002
.029
.002
.001
.005
.272
.006
.002
.196
.094
.496
.029
.109
--
--
--
--
.015
.012
.014
.003
.019
.104
.714
.0
.195
.001
--
--
--
--
--
.003
.045
.534
.003
.0
.001
.056
.0
.002
.214
.003
.001
.002
.006
.0
.026
.002
.079
.002
.001
.001
.0
.094
.0
.002
.444
.001
.003
.03
.11
.003
.008
.0
.022
.012
.0
.025
.021
.012
.017
.05
.104
.059
.003
.002
.004
.106
.031
.0
.0
.0
.202
.065
--
--
.003
.087
.147
.0
.002
.001
.013
.001
.0
.001
.001
.036
.0
.003
.988
.0
.0
.0
.0
1.0
.001
.004
.003
.061
.175
.008
.03
.118
.683
.861
.499
.151
.142
.222
.003
.002
.055
.028
.004
.006
.125
.041
.005
.092
--
.002
.001
.001
.007
.006
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
2
T
T
C
T
G
G
T
2
T
C
C
T
A
C
G
G
C
T
18
5
4
G
G
T
T
A
G
A
C
C
T
A
C
T
A
A
A
T
T
T
C
G
T
C
G
2
C
A
A
G
C
2
A
G
C
G
C
A
A
A
T
12
C
6
T
G
T
C
C
C
C
G
T
T
C
G
15
C
G
C
G
T
13
G
T
G
T
C
A
T
A
T
C
A
G
C
A
T
A
C
A
G
T
G
G
C
G
T
C
C
T
C
C
T
C
T
T
C
2
T
C
G
A
G
G
T
A
C
A
C
A
T
G
9
C
T
A
G
C
T
G
T
G
T
T
G
T
T
C
G
T
G
A
G
G
T
C
T
A
C
C
T
A
C
C
C
T
2
T
G
C
C
G
G
T
G
A
A
C
T
T
A
A
G
T
C
G
A
G
C
C
C
T
C
C
T
T
T
A
T
T
T
9
3
T
2
T
C
G
C
A
2
C
T
G
G
G
C
G
T
A
G
G
C
G
G
C
T
G
C
G
C
A
G
C
2
T
C
T
T
T
C
G
T
T
T
G
T
G
G
A
6
A
T
G
A
G
T
A
T
G
G
A
C
A
C
A
4
T
C
T
T
C
A
G
G
C
A
A
C
T
2
A
C
2
11
G
C
C
A
T
T
A
A
A
C
2
A
A
A
4
T
A
T
2
G
T
T
G
T
T
T
A
G
C
G
A
C
A
C
A
C
A
C
2
T
A
2
A
G
C
T
G
A
A
C
G
G
G
21
18
T
G
T
G
G
T
C
G
2
A
C
C
T
G
C
T
C
T
C
T
G
G
G
A
A
G
A
T
4
T
A
C
T
A
A
G
14
T
G
A
4
T
A
A
G
A
T
T
G
T
T
T
C
A
T
T
2
C
G
C
G
G
T
  49,774,101
  49,774,102
  49,775,385
  49,775,569
  49,775,947
  49,777,463
  49,777,571
  49,778,821
  49,779,305
  49,779,309
  49,779,371
  49,779,870
  49,780,168
  49,782,752
  49,782,861
  49,782,926
  49,784,035
  49,785,485
  49,785,919
  49,786,248
  49,786,258
  49,786,259
  49,786,663
  49,787,558
  49,788,238
  49,789,609
  49,791,362
  49,791,679
  49,791,918
  49,792,110
  49,792,165
  49,792,532
  49,792,748
  49,792,932
  49,792,973
  49,793,122
  49,793,142
  49,793,488
  49,793,740
  49,794,999
  49,795,297
  49,795,851
  49,796,158
  49,796,419
  49,796,520
  49,796,673
  49,796,736
  49,796,737
  49,797,036
  49,797,352
  49,800,420
  49,800,423
  49,800,429
  49,800,442
  49,800,449
  49,802,910
  49,803,041
  49,805,317
  49,809,521
  49,809,524
  49,811,699
  49,811,778
  49,812,576
  49,813,125
  49,813,982
  49,814,391
  49,814,454
  49,814,615
  49,815,414
  49,815,441
  49,815,455
  49,815,463
  49,816,295
  49,816,435
  49,817,919
  49,818,225
  49,818,546
  49,818,786
  49,819,383
  49,819,586
  49,819,774
  49,819,807
  49,819,879
  49,820,570
  49,820,825
  49,821,976
  49,822,015
  49,822,222
  49,822,276
  49,822,411
  49,822,420
  49,822,484
  49,822,562
  49,822,573
  49,822,624
  49,822,781
  49,823,187
  49,823,226
  49,824,911
  49,827,987
  49,828,340
  49,828,782
  49,829,516
  49,829,548
  49,829,552
  49,829,556
  49,829,558
  49,829,563
  49,829,566
  49,829,573
  49,829,575
  49,829,854
  49,829,866
  49,829,872
  49,830,249
  49,830,625
  49,832,878
  49,834,334
  49,834,399
  49,834,731
  49,835,159
  49,835,410
  49,836,040
  49,837,723
  49,837,820
  49,838,149
  49,838,939
  49,841,429
  49,841,544
  49,841,681
  49,842,932
  49,843,371
  49,844,455
  49,844,516
  49,844,576
  49,844,582
  49,844,583
  49,844,892
  49,844,928
  49,845,029
  49,845,045
  49,845,051
  49,845,088
  49,845,092
  49,845,094
  49,845,163
  49,845,167
  49,845,177
  49,845,183
  49,845,184
  49,845,186
  49,845,191
  49,845,360
  49,845,367
  49,845,375
  49,845,388
  49,845,398
  49,845,403
  49,845,406
  49,845,415
  49,845,421
  49,845,464
  49,846,061
  49,846,128
  49,846,232
  49,847,006
  49,847,250
  49,848,355
  49,849,150
  49,849,389
  49,849,455
  49,849,590
  49,849,591
  49,850,271
  49,942,818
  49,947,685
  49,948,191
  49,948,196
  49,948,563
  49,949,020
  49,949,026
  49,949,139
  49,949,193
  49,950,316
  49,950,641
  49,951,104
  49,951,866
  49,952,321
  49,952,655
  49,953,099
  49,954,038
  49,954,097
  49,955,092
  49,955,334
  49,955,377
  49,955,449
  49,955,560
  49,956,214
  49,956,376
  49,958,502
  49,958,835
  49,958,847
  49,959,419
  49,960,925
  49,960,931
  49,960,933
  49,961,212
  49,961,228
  49,961,339
  49,962,146
  49,965,400
  49,965,512
  49,966,387
  49,967,344
  49,968,066
  49,968,746
  49,969,021
  49,971,241
  49,971,265
  49,971,307
  49,971,602
  49,972,725
  49,973,579
  49,973,587
  49,973,598
  49,973,607
  49,973,610
  49,973,618
  49,973,626
  49,973,633
  49,973,641
  49,973,646
  49,973,652
  49,973,661
  49,973,668
  49,973,681
  49,974,037
  49,974,210
  49,975,566
  49,975,593
  49,975,698
  49,980,601
  49,980,644
  49,982,332
  49,982,357
  49,982,364
  49,982,393
  49,982,410
  49,984,685
  49,984,845
  49,984,850
  49,985,237
  49,985,284
  49,985,425
  49,985,564
  49,986,237
  49,986,257
  49,986,560
  49,986,583
  49,987,300
  49,987,874
  49,988,158
  49,988,374
  49,988,420
  49,988,673
  49,988,680
  49,988,795
  49,988,924
  49,989,029
  49,989,109
  49,989,453
  49,989,989
  49,990,048
  49,990,114
  49,990,581
  49,990,601
  49,991,124
  49,991,223
  49,991,434
  49,991,496
  49,991,912
  49,992,379
  49,993,231
  49,993,232
  49,993,572
  49,993,824
  49,995,241
  49,998,967
  49,999,114
  49,999,802
  50,001,964
  50,002,072
  50,002,293
  50,002,555
  50,003,452
  50,005,113
  50,005,182
  50,005,195
  50,006,524
  50,007,157
  50,007,276
  50,007,326
  50,008,815
  50,009,365
  50,011,102
  50,012,071
  50,013,569
  50,022,011
  50,023,390
  50,023,432
  50,023,648
  50,023,741
  50,024,085
  50,024,190
  50,024,951
  50,025,302
  50,025,524
  50,025,649
  50,025,899
  50,026,022
  50,026,038
  50,026,653
  50,026,684
  50,026,699
  50,027,507
  50,027,737
  50,027,738
  50,027,975
  50,028,223
  50,028,539
  50,028,710
  50,029,231
  50,029,246
  50,029,254
  50,029,348
  50,029,772
  50,029,831
  50,029,849
  50,029,851
  50,029,856
  50,029,874
  50,029,877
  50,029,938
  50,029,965
  50,030,079
  50,030,235
  50,030,489
  50,030,628
  50,030,835
  50,031,151
  50,031,634
  50,031,885
  50,032,062
  50,032,071
  50,033,014
  50,033,079
  50,033,434
  50,033,525
  50,033,883
  50,033,887
  50,033,901
  50,033,926
  50,034,171
  50,034,257
  50,034,608
  50,034,896
  50,035,165
  50,035,312
  50,035,843
  50,036,301
  50,036,323
  50,036,758
  50,036,821
  50,037,150
  50,037,296
  50,037,384
  50,037,543
  50,038,169
  50,038,564
  50,038,588
  50,038,609
  50,038,628
  50,038,741
  50,038,770
  50,038,920
  50,038,981
  50,038,983
  50,039,276
  50,039,476
  50,039,516
  50,039,563
  50,039,611
  50,039,677
  50,039,695
  50,039,736
  50,039,879
  50,039,888
  50,040,150
  50,041,259
  50,041,393
  50,041,398
  50,041,399
  50,041,486
  50,041,490
  50,041,559
2/-
T/-
-
T
G
T
G/3
G
-
-
T
T
C
G
T
A
A
T
C
-
5/-
4/-
2
T
A
2
G
A
G
T
T
G
2
T
C
13/9
A/G
2
C
C
C
T
C
C
T
T
-
-
G
G
2
-
-
-
C
A
G/4
T
C
C
G
8
12/-
5
-
4
A
C
8/-
C/T
-
C/T
T
-
-
T
T
-
G
-
2
-
C
-
2
C
A
A
T
G
C
C
C
T
G
C
A
-
C
T
T
C
A
-
T
T
T
2
-
T
T
T/C
C/T
C/T
C
T
C
-
C/-
-
C
T
2
G
A
A
-
G
T
C
T
C
C
A
-
C/3
-
G
5
A
A
A
G
A
A
A
A
-
A
A
A
A
2
-
T
-
-
T
-
-
-
2
C
G
A
5/3
T
G
2/-
C
G/A
A
A
T
A
-
C
G
A/5
A
18
-
T
2
A
C
A
A
C
A
2
T
T
-
G
G
C
2
C
2
-
G
C
9/-
-
-
2/-
T/-
C/2
A
T
2
-
6
A
A
C
A
T
A
2
C
-
-
T
2
3
2
2
2
A
A
A
2
2
2
2/-
C
-
-
-
C
T
-
-
-
A
A
-
T
T
G
-
G
G
A
G
A
G
G
-
A
A
T
T
G
T
T
-
C
T
A
C
T
G
A
T
2
2
-
T
5
2/-
-
A/CA
-
-
15
T
2
-
-
4
G
-
-
T
-
G
G
T
4/-
-
T
-
-
2
A
C
A
C
C
C
G
A
T
C
T
G
-
T
C
T
G
T
2/-
T/-
G
-
C
A
A
C
A
G
G
A
G/A
G/A
C
-
-
A
A
C
C
C
2
T
A
-
G
C/T
C/T
A
2
T
C
C/T
T/C
C/T
C
3
T
A
G
G
A
G
C
4/-
C
C
T
C
G
G
6
-
T/2
G/2
G
-
T/2
G
G
3
G
C
C
C
A
A
A
A
-
C
A
-
C/T
G/2
C/2
A
A
C