Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 155,320 (bp)   Positions: 388
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.019
.006
.034
.001
.381
.012
.033
.011
.493
.011
.032
.007
.001
.0
.1
.076
.017
.018
.01
.356
.005
.047
.132
.119
.083
.0
.0
.002
.001
.001
--
.199
.019
.001
.0
.121
.0
.001
.301
.0
.0
.0
.04
.02
.427
.554
.593
.027
.395
.048
.452
.001
.0
.013
.006
.016
.003
.011
.074
.179
--
--
--
.0
.059
.005
.078
.27
.015
.014
.144
.051
.567
.099
.026
.001
.069
.061
.032
.048
.0
.011
.003
.003
--
--
.003
.001
.14
.006
--
--
.009
.017
.003
.033
.011
.0
.062
.012
.002
.0
.05
.909
.17
.461
.329
.026
.001
.226
.001
.0
.001
.0
.021
.04
--
--
--
.322
.008
.0
.01
.0
.926
.004
.011
--
.004
.005
.008
--
.319
.011
.021
.061
.018
--
--
.018
.008
.019
.014
.008
.014
--
.043
.047
.008
--
.043
.002
.0
.019
.0
.604
.0
.003
.021
.0
.13
.073
.004
--
.081
--
--
.024
.053
.088
.011
--
--
.202
.008
.002
.104
.229
.038
.002
.36
.241
.045
--
--
.126
.142
.007
.298
.04
.003
.0
.0
.247
.263
.0
.011
.996
.193
--
.005
.004
.005
.076
.029
.001
.097
.196
.0
.074
.093
.042
.008
.0
.299
.02
.195
.0
.001
.0
.047
.0
.06
.065
.44
.003
.006
.065
.106
.008
--
.032
.064
.002
.016
.062
.009
--
--
--
.018
.007
.001
.038
.026
.113
.023
.046
.005
.089
.022
.263
.009
.038
.015
.0
.001
--
--
--
.03
.006
.003
.003
.009
1.0
.152
.143
.121
.01
--
.208
.498
.021
.073
.053
.039
.06
.103
--
--
.202
.093
.017
.001
.001
.077
--
.259
.746
.002
.024
.052
.159
.07
.157
.116
.135
.0
.001
.044
.0
.084
.091
.115
.116
.247
.0
.009
.434
.049
.0
--
.005
.06
.028
.333
.152
.026
.146
.001
.002
.003
.001
.0
.0
.0
.005
.0
.002
.006
.004
.107
.12
.0
.041
.638
.0
.001
.316
.006
.005
.047
--
.032
.595
.023
.0
.033
.04
.012
.081
.441
.003
.001
.099
.019
.0
.937
.011
.0
.016
.0
.024
.167
.0
.026
.0
.001
.002
.001
.031
.004
.0
.007
.005
.336
.151
.0
.025
.002
.0
.004
.005
.007
.0
.0
.043
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
T
T
C
T
G
C
T
G
2
A
T
T
G
T
C
A
4
T
G
C
A
C
G
C
T
T
T
A
T
G
G
A
T
20
G
A
G
C
G
T
A
T
A
C
C
C
G
T
A
C
C
G
T
G
G
T
T
T
T
G
A
A
C
T
2
A
A
T
T
G
C
C
T
G
C
A
G
T
G
G
C
C
12
C
T
G
T
3
G
A
A
A
G
7
14
A
4
G
3
A
T
C
G
C
A
C
T
16
G
T
G
A
T
A
C
10
8
T
4
G
2
C
G
A
G
A
G
A
A
T
A
G
A
T
T
6
2
T
T
T
T
12
G
C
C
C
T
G
G
T
T
T
T
A
A
G
C
2
T
T
C
2
A
G
A
6
G
6
G
2
4
G
A
4
T
G
G
T
G
G
A
C
G
A
A
T
T
G
T
A
T
C
G
C
A
G
20
T
A
2
T
C
C
G
A
12
G
4
2
2
A
G
G
G
T
T
C
G
T
C
C
C
A
10
A
T
A
T
146
T
T
G
A
T
T
2
22
C
8
T
A
A
T
C
C
T
T
T
C
G
G
T
C
A
2
C
C
C
G
A
T
A
G
C
C
A
A
G
T
G
G
A
18
16
14
G
T
T
G
G
T
G
A
A
T
C
T
T
C
A
T
G
T
2
2
A
T
A
A
A
A
T
G
C
4
A
T
C
G
C
A
T
T
C
A
T
A
20
2
C
T
2
C
3
A
T
A
G
12
10
T
A
C
A
C
A
G
T
T
G
G
13
C
C
T
C
G
T
G
2
G
C
C
6
C
8
A
C
C
T
G
A
A
G
2
A
G
2
C
G
T
T
3
G
A
G
C
A
C
T
G
G
G
G
A
C
  184,228,371
  184,228,586
  184,228,750
  184,229,867
  184,230,668
  184,230,911
  184,231,731
  184,231,884
  184,231,964
  184,233,077
  184,234,810
  184,235,037
  184,235,150
  184,235,155
  184,235,524
  184,235,525
  184,235,631
  184,235,690
  184,236,176
  184,237,316
  184,237,936
  184,238,359
  184,238,475
  184,238,489
  184,238,504
  184,238,904
  184,239,312
  184,239,322
  184,239,362
  184,239,406
  184,239,618
  184,239,747
  184,239,838
  184,240,173
  184,240,401
  184,240,752
  184,241,326
  184,241,548
  184,242,113
  184,242,319
  184,242,328
  184,242,438
  184,242,513
  184,242,540
  184,242,794
  184,242,833
  184,242,912
  184,243,691
  184,243,799
  184,243,870
  184,243,924
  184,243,981
  184,244,409
  184,244,643
  184,245,295
  184,245,679
  184,245,706
  184,245,800
  184,246,057
  184,246,093
  184,246,193
  184,246,283
  184,246,305
  184,246,641
  184,247,149
  184,247,567
  184,248,342
  184,248,558
  184,248,674
  184,248,952
  184,249,033
  184,249,213
  184,249,301
  184,249,435
  184,250,969
  184,251,074
  184,251,899
  184,251,904
  184,252,256
  184,252,439
  184,252,959
  184,253,325
  184,253,373
  184,253,479
  184,253,970
  184,253,993
  184,254,171
  184,254,672
  184,255,208
  184,255,244
  184,255,585
  184,256,234
  184,257,645
  184,257,677
  184,257,732
  184,258,079
  184,258,088
  184,258,213
  184,259,059
  184,259,300
  184,259,535
  184,259,664
  184,259,982
  184,260,396
  184,260,587
  184,261,306
  184,261,446
  184,262,994
  184,263,310
  184,263,899
  184,264,849
  184,264,927
  184,265,020
  184,265,196
  184,265,864
  184,266,056
  184,266,485
  184,266,486
  184,266,488
  184,267,024
  184,267,812
  184,268,783
  184,268,830
  184,269,287
  184,269,610
  184,269,700
  184,270,226
  184,270,567
  184,270,839
  184,270,914
  184,270,937
  184,271,803
  184,272,495
  184,274,122
  184,274,227
  184,274,414
  184,274,624
  184,274,853
  184,274,877
  184,274,962
  184,274,964
  184,274,974
  184,274,980
  184,274,983
  184,276,584
  184,278,209
  184,278,838
  184,278,869
  184,279,805
  184,282,641
  184,286,030
  184,286,951
  184,287,086
  184,287,898
  184,287,954
  184,288,281
  184,289,080
  184,289,183
  184,289,301
  184,289,360
  184,292,669
  184,293,058
  184,293,857
  184,295,888
  184,296,089
  184,296,629
  184,296,642
  184,298,007
  184,298,143
  184,299,474
  184,300,354
  184,300,643
  184,300,664
  184,302,196
  184,302,779
  184,302,895
  184,303,032
  184,303,056
  184,303,180
  184,303,831
  184,304,106
  184,304,433
  184,304,471
  184,304,629
  184,304,646
  184,305,012
  184,305,372
  184,309,616
  184,309,867
  184,309,917
  184,311,211
  184,311,345
  184,311,983
  184,312,241
  184,313,049
  184,314,044
  184,315,575
  184,315,879
  184,317,280
  184,317,372
  184,317,549
  184,317,612
  184,318,056
  184,318,147
  184,318,196
  184,318,457
  184,318,485
  184,318,511
  184,318,815
  184,318,872
  184,318,883
  184,318,890
  184,318,982
  184,319,102
  184,319,265
  184,319,340
  184,319,547
  184,319,693
  184,319,853
  184,319,921
  184,320,050
  184,320,159
  184,320,424
  184,320,428
  184,320,563
  184,320,977
  184,320,988
  184,321,005
  184,321,204
  184,321,232
  184,321,268
  184,322,279
  184,323,097
  184,323,526
  184,323,950
  184,324,129
  184,324,140
  184,324,360
  184,324,371
  184,324,398
  184,325,031
  184,325,334
  184,325,837
  184,326,157
  184,326,537
  184,326,705
  184,327,394
  184,327,802
  184,327,885
  184,328,278
  184,328,375
  184,329,003
  184,329,198
  184,329,326
  184,329,850
  184,330,219
  184,330,896
  184,330,928
  184,330,984
  184,331,438
  184,331,913
  184,332,016
  184,332,024
  184,332,039
  184,332,151
  184,332,436
  184,333,680
  184,333,691
  184,333,857
  184,334,255
  184,334,871
  184,335,331
  184,335,394
  184,336,313
  184,336,799
  184,336,801
  184,336,803
  184,337,320
  184,337,435
  184,340,287
  184,340,906
  184,341,661
  184,341,673
  184,343,257
  184,348,091
  184,348,480
  184,348,722
  184,348,804
  184,349,995
  184,350,268
  184,350,625
  184,351,336
  184,352,502
  184,353,236
  184,353,319
  184,353,475
  184,353,481
  184,353,589
  184,353,779
  184,354,071
  184,354,265
  184,355,648
  184,356,282
  184,357,213
  184,357,218
  184,357,267
  184,357,291
  184,358,001
  184,358,267
  184,358,516
  184,358,610
  184,359,051
  184,359,140
  184,359,178
  184,359,245
  184,359,362
  184,359,759
  184,360,424
  184,360,918
  184,360,957
  184,360,995
  184,361,383
  184,361,588
  184,361,646
  184,361,649
  184,361,652
  184,362,162
  184,362,208
  184,362,219
  184,362,490
  184,362,573
  184,362,575
  184,363,222
  184,363,223
  184,363,440
  184,363,744
  184,364,016
  184,364,385
  184,364,430
  184,364,986
  184,365,049
  184,365,696
  184,366,207
  184,366,651
  184,367,502
  184,367,849
  184,368,007
  184,368,150
  184,368,244
  184,369,294
  184,370,009
  184,370,115
  184,370,170
  184,370,251
  184,370,331
  184,370,392
  184,370,401
  184,370,433
  184,371,165
  184,371,843
  184,371,863
  184,372,350
  184,372,776
  184,372,866
  184,373,152
  184,373,520
  184,374,662
  184,375,928
  184,375,985
  184,375,986
  184,376,982
  184,378,062
  184,378,455
  184,378,760
  184,380,130
  184,380,233
  184,381,229
  184,381,548
  184,381,763
  184,381,840
  184,382,370
  184,382,431
  184,382,524
  184,382,560
  184,382,649
  184,382,838
  184,382,839
  184,382,853
T
A
C
G
A
C
A
T
A
A
-
G
14/TG
8
T
C
T
G
-
2
-
2
G
4
9
T
C
-
C
C
C
T
A
C
G
-
A
G
2
T
A
2
G
A
G
14
T
T
A
5/3
G
-
T
A
C
A
A
G
C
C
C
A
G
G
T
C
-
2
G
C
C
4
A
9
C
C
T
G
A
-
A
A
T
2
12/-
T
15
A
C
-
A
G
2
T
A
-
-
G
-
A
-
G
C
T
A
A
G
G
C
-
2
C
A
G
C
C
C/3
10/-
-
C
-
A
-
T
A
C
9
19
A
G
T
-
8
A
-
23
A
-
-
A
C
C
A
-
A
3/4
5
7
19
C
A
C
C
C
G
2
G
A
C/6
-
C
A
T
-
11/7
2
T
-
5/3
6/-
G/3
-
-
C
G
-
2
2
A
C
A
A
T
T
G/3
2
G
G
?
A
C
4/3
C
G
T
T
T
A
20/-
-
G
-
C
T
G
A
-
-
A
-
-
-
G
A
A
A
A
C
G
A
C
T
2
19
G
-
G
-
T
C
-
G
13
2
G
G
A
2/-
22/-
3
-
G
G
G
C
T
T
C
C
2
T
A
A
C
T
C
-
C/2
A
5
A
17
C
G
T
G
T
-
G
C
2
A
A
C
18/-
16/-
14/-
A
9
C
T
2
C
?
G
G
5
C/3
C
C
6
G
C
A
C
-
-
-
C
C
T
G
C
C
5/3
T
-
G
C
T
T
5
G
C
C
T
T
-
4
-
-
T
8
-
G
-
T
C
G
A
12/-
10/-
A
G
T
G
T
G
A
C
C
A
A
-
G
C/-
C
T
A
C
C
-
T
5
9
-
G
-
G
T
T
A
A
G
G
A
-
3
G/13
2/-
T
4
G
C
-
A
G
C
G
G
T
C
T
A
A
T
C
T