Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,086,307 (bp)   Positions: 558
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
--
.007
.001
.001
.117
.045
.015
.027
.021
.123
--
--
--
--
.002
.191
.0
.056
.001
.996
.016
.01
.0
.001
.004
.451
.575
.004
.017
.005
.001
.003
.01
.014
.0
.0
.0
.0
.001
.773
.0
.008
.006
.0
.001
.001
.867
.903
.987
.01
--
.013
.042
.011
.014
--
.01
.176
--
.003
.044
.003
.0
.003
.027
.063
.061
--
.073
.074
.001
.0
.003
.0
.0
.048
.012
.097
.096
.001
.001
.035
.012
.003
--
.008
.0
.228
--
.0
.099
.043
.014
.005
.051
.001
.026
.041
.018
.009
.104
.021
.003
.0
.0
.007
.0
.396
.127
.003
.002
.001
.0
.017
.001
.0
.0
.0
.0
.014
.0
.003
.044
.002
.0
.0
.02
.017
.002
.023
.008
.027
.015
--
--
.037
.001
.061
.416
.015
.016
.006
.002
.001
.001
.003
--
--
.244
.01
.001
--
.006
.001
.0
.039
.008
.014
.026
.001
.034
.056
.309
.0
.104
.002
.045
.004
.235
--
--
.001
.378
.021
.002
.0
.025
.008
.002
.006
.126
.001
.004
.002
.012
.014
.001
.0
.0
.033
.016
.004
.102
.001
.0
.014
.086
.006
.002
.158
.141
.0
.07
.001
.001
.002
.006
.0
.0
.005
.013
.0
.004
.001
.998
.955
.0
.0
.001
.001
.0
.463
.168
.002
.086
.004
.862
.489
.934
.001
.001
.002
.0
.002
.174
.053
.133
.001
.003
.046
.0
.508
.032
.056
.019
.0
.018
.002
.001
.002
.009
.107
.105
.002
.0
.147
.0
.001
.049
.001
.001
.0
.0
.0
.014
.001
.006
.0
.204
.026
.046
.167
.27
.007
.323
.144
.02
.024
.001
.0
.118
.001
.443
.046
.06
.0
.011
--
.294
.064
.696
.0
.113
.001
.007
.132
.454
.0
.0
.002
1.0
1.0
.003
.001
.0
.019
.026
.07
.0
.0
.001
.38
.305
.059
.033
.001
.866
.955
.049
.0
.183
.002
.0
.852
.012
.0
.0
--
.0
.008
.091
.041
.14
.138
.024
.0
.004
.002
.003
.002
.002
.0
.002
.0
.0
.004
.0
.0
.002
.005
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.002
.01
.008
.779
.327
.997
.578
.944
.46
.135
.002
.166
.951
.023
.003
.063
.067
.209
.004
.002
.006
.001
.008
.004
.0
.001
.001
.002
.0
.006
.0
.097
.064
.116
.065
.0
.316
.002
.028
.014
.001
.006
.0
.003
.0
.022
.006
.001
.0
.003
.0
.001
.007
.067
.001
.006
.007
.032
.065
.018
.059
.024
.046
.002
.034
.288
.911
.329
.0
.001
.0
.022
.963
.005
.002
.136
.035
.194
.079
.001
.059
.0
.002
.14
.101
.039
.0
.001
.001
.292
.077
.0
.0
.923
.849
.828
.025
.025
.002
.002
.003
.0
.878
.319
.001
.711
.001
.647
.846
.012
.003
.007
.0
.0
.006
.0
.001
.006
.012
.001
.025
.004
.55
.994
.044
.007
.127
.054
.43
.001
.201
.001
.347
1.0
.648
.0
.031
.007
.003
.045
.001
.015
.0
.002
.0
.004
.005
.098
.001
.0
.002
.046
.037
.997
.971
.94
.851
.003
.003
.0
.005
.0
.0
.0
.011
.042
.313
.002
.0
.001
.016
.0
.0
.006
.645
.007
.001
.055
.001
.003
.0
.143
.0
.999
.001
.008
.084
.001
.001
.003
.004
.012
.961
.014
.017
.998
.264
.997
.273
.062
.131
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
Nrg1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
C
A
A
A
G
G
C
C
T
G
2
G
A
4
C
G
A
T
A
A
2
C
C
G
T
C
G
G
T
A
G
A
A
G
A
A
G
G
G
A
A
T
4
A
G
A
G
A
A
A
T
A
T
G
T
G
C
A
2
2
T
G
T
T
G
G
C
T
C
A
T
A
C
A
C
G
G
T
T
T
C
G
G
T
T
C
A
T
T
G
A
T
C
T
G
G
T
A
A
C
G
G
A
A
2
8
G
T
G
G
C
T
C
T
C
A
C
C
C
G
A
T
C
3
C
G
A
A
T
A
A
G
C
C
A
A
G
T
C
C
G
C
G
C
C
C
C
C
T
G
G
A
G
A
T
G
T
C
G
G
A
4
C
C
G
C
A
T
2
C
A
C
G
C
C
A
A
C
T
C
G
T
A
A
A
2
A
C
C
C
T
A
T
G
A
A
C
G
G
T
T
G
C
A
C
G
T
C
T
A
G
C
C
G
T
A
A
T
A
T
G
A
G
A
A
A
G
A
T
C
T
C
T
C
A
C
A
C
T
C
T
A
T
A
T
T
C
3
T
C
A
A
G
G
A
T
T
C
C
T
C
T
G
G
G
2
T
T
2
G
T
4
A
A
C
G
C
C
G
G
A
G
A
C
T
A
T
A
A
G
A
G
G
G
C
C
T
C
T
A
T
T
T
T
C
C
C
G
T
C
T
G
G
G
G
A
T
A
T
A
A
C
C
C
G
T
C
G
A
T
T
C
A
T
C
C
G
T
T
C
C
A
T
T
G
T
G
C
T
A
T
C
T
C
A
G
T
C
C
T
A
T
A
T
T
A
A
G
A
C
C
C
G
C
C
C
C
T
T
G
T
T
T
G
A
T
C
T
T
G
T
G
G
G
A
C
A
2
T
C
A
G
T
G
A
T
T
G
C
T
T
C
T
G
G
C
T
A
C
C
A
A
A
C
G
A
C
C
C
C
T
A
A
T
C
A
G
C
T
T
T
T
T
T
A
T
T
G
C
G
C
T
A
G
A
G
T
G
T
G
C
G
A
A
C
G
C
2
A
A
A
A
T
T
T
C
T
C
A
G
T
A
G
A
T
C
T
T
C
C
A
T
T
A
A
A
T
A
A
C
C
C
G
T
G
T
T
C
A
C
C
G
T
C
A
T
G
C
A
T
T
G
T
G
T
C
A
C
T
A
2
A
2
G
A
A
G
T
A
A
A
A
C
C
C
C
C
T
G
A
C
A
A
T
T
G
T
  62,652,293
  62,660,389
  62,671,735
  62,685,108
  62,685,109
  62,686,602
  62,690,395
  62,694,407
  62,694,412
  62,694,488
  62,710,372
  62,726,233
  62,726,236
  62,726,238
  62,726,363
  62,734,697
  62,740,283
  62,746,541
  62,769,479
  62,771,505
  62,781,503
  62,802,682
  62,823,964
  62,847,475
  62,899,434
  62,899,439
  62,899,494
  62,899,495
  62,906,361
  62,924,477
  62,931,528
  62,931,537
  62,931,538
  62,931,540
  62,931,699
  62,931,704
  62,931,708
  62,931,887
  62,931,888
  62,931,889
  62,960,945
  63,008,310
  63,014,702
  63,019,012
  63,028,596
  63,051,436
  63,052,478
  63,052,545
  63,052,546
  63,052,583
  63,054,268
  63,060,607
  63,066,945
  63,072,690
  63,096,039
  63,124,353
  63,170,175
  63,178,308
  63,195,739
  63,222,796
  63,248,719
  63,248,725
  63,250,389
  63,250,557
  63,267,479
  63,282,577
  63,282,583
  63,282,593
  63,303,830
  63,314,806
  63,314,808
  63,314,818
  63,324,345
  63,358,825
  63,367,180
  63,367,426
  63,368,562
  63,368,565
  63,368,622
  63,368,623
  63,368,656
  63,368,659
  63,368,759
  63,373,583
  63,374,844
  63,378,032
  63,421,428
  63,422,365
  63,425,505
  63,428,624
  63,432,560
  63,432,590
  63,432,772
  63,436,259
  63,436,554
  63,437,272
  63,437,515
  63,437,652
  63,437,776
  63,438,564
  63,438,616
  63,438,671
  63,438,935
  63,438,988
  63,439,123
  63,439,285
  63,439,306
  63,439,591
  63,439,686
  63,440,315
  63,440,479
  63,440,625
  63,440,939
  63,441,068
  63,441,795
  63,443,372
  63,445,121
  63,445,582
  63,445,593
  63,445,967
  63,446,088
  63,446,700
  63,447,023
  63,447,082
  63,447,118
  63,447,302
  63,447,576
  63,447,943
  63,447,987
  63,448,234
  63,448,921
  63,449,703
  63,449,997
  63,450,107
  63,450,427
  63,450,486
  63,450,989
  63,451,245
  63,451,949
  63,452,857
  63,452,887
  63,454,091
  63,454,164
  63,454,357
  63,454,446
  63,454,533
  63,454,563
  63,454,628
  63,454,670
  63,455,073
  63,455,342
  63,455,662
  63,455,842
  63,456,330
  63,456,864
  63,456,948
  63,457,040
  63,457,989
  63,458,399
  63,460,394
  63,469,233
  63,469,273
  63,472,515
  63,508,839
  63,508,980
  63,509,008
  63,510,615
  63,511,112
  63,511,452
  63,511,556
  63,512,101
  63,513,016
  63,516,725
  63,551,612
  63,551,691
  63,553,326
  63,553,749
  63,554,863
  63,554,884
  63,554,886
  63,554,891
  63,554,906
  63,557,419
  63,561,091
  63,561,111
  63,561,142
  63,561,180
  63,561,338
  63,561,341
  63,561,363
  63,561,394
  63,561,517
  63,563,381
  63,564,003
  63,565,805
  63,565,840
  63,566,104
  63,566,146
  63,566,153
  63,566,411
  63,566,459
  63,566,464
  63,566,977
  63,569,418
  63,569,755
  63,569,795
  63,570,417
  63,570,873
  63,573,629
  63,573,632
  63,573,751
  63,575,168
  63,575,321
  63,575,617
  63,575,739
  63,576,500
  63,576,520
  63,576,608
  63,576,905
  63,577,542
  63,577,595
  63,577,803
  63,578,061
  63,578,294
  63,578,592
  63,579,156
  63,579,523
  63,580,210
  63,580,671
  63,581,157
  63,582,339
  63,582,492
  63,583,170
  63,583,600
  63,584,062
  63,584,180
  63,584,189
  63,586,532
  63,586,589
  63,586,635
  63,587,100
  63,587,841
  63,588,038
  63,588,112
  63,588,907
  63,589,185
  63,589,368
  63,589,414
  63,589,656
  63,589,996
  63,590,519
  63,590,681
  63,590,840
  63,590,860
  63,590,863
  63,591,166
  63,592,048
  63,592,108
  63,592,366
  63,593,300
  63,593,558
  63,593,657
  63,593,779
  63,593,866
  63,593,993
  63,594,016
  63,594,131
  63,594,133
  63,594,332
  63,594,384
  63,594,556
  63,594,670
  63,595,095
  63,595,491
  63,595,848
  63,596,242
  63,597,434
  63,597,789
  63,597,790
  63,599,105
  63,599,131
  63,599,283
  63,599,709
  63,599,775
  63,599,961
  63,600,298
  63,600,836
  63,600,956
  63,601,257
  63,601,297
  63,601,655
  63,601,754
  63,601,852
  63,601,949
  63,601,977
  63,604,833
  63,606,758
  63,607,348
  63,608,444
  63,615,765
  63,617,372
  63,619,589
  63,619,590
  63,620,983
  63,621,492
  63,621,749
  63,622,270
  63,623,145
  63,623,672
  63,624,906
  63,635,717
  63,636,067
  63,637,301
  63,637,321
  63,637,346
  63,637,350
  63,637,365
  63,641,010
  63,641,063
  63,641,256
  63,641,287
  63,641,310
  63,643,085
  63,643,520
  63,643,576
  63,645,581
  63,645,590
  63,645,862
  63,646,086
  63,655,592
  63,656,149
  63,660,302
  63,660,589
  63,660,593
  63,660,594
  63,660,997
  63,661,022
  63,661,202
  63,661,211
  63,661,294
  63,661,295
  63,661,314
  63,661,318
  63,661,325
  63,661,382
  63,661,405
  63,661,415
  63,661,417
  63,661,419
  63,661,444
  63,661,461
  63,661,470
  63,661,518
  63,661,524
  63,661,533
  63,661,534
  63,661,553
  63,661,584
  63,661,588
  63,661,589
  63,661,621
  63,661,648
  63,661,719
  63,661,764
  63,661,778
  63,661,807
  63,661,839
  63,661,980
  63,661,995
  63,662,033
  63,662,164
  63,662,197
  63,662,405
  63,662,407
  63,662,423
  63,662,799
  63,662,863
  63,662,951
  63,662,965
  63,662,990
  63,663,011
  63,663,085
  63,663,093
  63,663,094
  63,663,098
  63,663,148
  63,663,202
  63,663,242
  63,663,301
  63,663,308
  63,664,331
  63,664,587
  63,664,738
  63,665,963
  63,666,543
  63,667,016
  63,667,039
  63,667,101
  63,669,567
  63,669,579
  63,669,878
  63,670,691
  63,671,304
  63,671,499
  63,673,029
  63,673,136
  63,673,385
  63,673,516
  63,673,524
  63,674,030
  63,674,190
  63,674,792
  63,674,866
  63,674,906
  63,674,975
  63,675,423
  63,675,601
  63,675,753
  63,675,777
  63,677,161
  63,677,993
  63,679,076
  63,679,246
  63,679,277
  63,679,381
  63,679,670
  63,679,695
  63,679,740
  63,679,772
  63,679,972
  63,680,111
  63,680,554
  63,680,684
  63,680,716
  63,681,015
  63,681,017
  63,682,903
  63,683,063
  63,683,428
  63,683,741
  63,683,978
  63,684,062
  63,684,141
  63,684,323
  63,684,339
  63,684,748
  63,684,809
  63,685,821
  63,685,870
  63,686,109
  63,686,426
  63,686,462
  63,686,635
  63,687,148
  63,687,307
  63,688,059
  63,688,073
  63,688,197
  63,688,317
  63,688,532
  63,688,674
  63,688,971
  63,689,684
  63,689,880
  63,690,520
  63,691,484
  63,691,582
  63,691,709
  63,691,751
  63,691,761
  63,691,867
  63,691,960
  63,692,105
  63,692,115
  63,692,121
  63,692,156
  63,692,751
  63,692,960
  63,693,106
  63,693,242
  63,693,489
  63,693,815
  63,695,054
  63,695,093
  63,695,584
  63,695,773
  63,696,610
  63,696,890
  63,697,016
  63,698,106
  63,698,125
  63,698,536
  63,699,073
  63,699,081
  63,699,200
  63,699,215
  63,699,297
  63,699,415
  63,699,521
  63,699,670
  63,699,802
  63,699,830
  63,699,845
  63,700,260
  63,700,462
  63,701,086
  63,701,326
  63,701,526
  63,701,784
  63,701,785
  63,701,940
  63,702,000
  63,702,155
  63,702,647
  63,703,132
  63,703,168
  63,703,232
  63,703,416
  63,703,455
  63,703,562
  63,703,565
  63,704,366
  63,704,861
  63,704,888
  63,705,474
  63,706,105
  63,706,122
  63,706,661
  63,707,152
  63,707,201
  63,707,404
  63,707,655
  63,708,445
  63,708,457
  63,708,474
  63,708,610
  63,708,819
  63,709,006
  63,709,750
  63,713,563
  63,714,256
  63,714,504
  63,714,558
  63,714,768
  63,714,954
  63,715,222
  63,715,237
  63,715,528
  63,716,085
  63,716,125
  63,716,321
  63,716,322
  63,717,210
  63,718,127
  63,718,422
  63,718,484
  63,718,614
  63,718,634
G/A
C/G
2
A/2
A/4
C
2
A
A
2
G/9
2/-
G/4
A/-
-
C/T
T
A/2
-
A/-
A/-
2/-
C/-
2
G/-
T/-
-
T
G/A
T/2
2
A
G
T
-
C
T
T
C
T
G
A/G
T/2
-
T
G/A
6
T
G
2
A/3
T/-
A/-
3
G/C
T/2
G/6
-
A/C
-
-
3
T
T/C
C
T
-
-
T/-
G
C
A
A/C
2
2
C/-
C
C
A
C
C
G
T
G/T
C
T/A
T
G
T/C
A
A
A/T
A
C/A
-
A
A
C
G
G
G
A
A
G
G
2/-
-
A
C
T
2
T
A
C/T
C
T
G
T
T
T
A
G
G
6
-
T
A
G
G
A
C
G
A
T
2
G
G
A
2
C/6
A
A
A
A
T
A
7
C/-
2
C
G/A
T
G
2
C
C
C
C
C/T
G/2
3
3
-
2
A
2
T
2
C
2/-
T
A/2
2
A
T
2
G
G
2
G
-
-
C
C
G
C
-
G
G
G
T
T/G
G
C
A
G
G
T
T
T
G
C
A
C/-
G
T
A
C
T/--
A
5
A
T
T
2
C
G
C
C
G
C
A
A/-
2
G
G
G
G/T
G
C
T
-
T
C
A
C
T
G
C/T
-
-
C
G
C
-
C
T/C
T
-
C
A
G
C
A
A
A/C
3
C
C/T
T
C
T
G
G/A
A
A
-
G
C
-
A
C
-
A/4
C
T
A
T
A
A
2
G
A
-
T
C
G
C
G
G
A
G
A
A
A
T
T
C
A
G
A/2
G
C
C
C
T
T
C/-
A
C
T
4
C
T
T
T
G
C
A/C
C
G
2
T
A
C/T
G/A
G
G
G/C
G
T/-
C
T
C
C
A
A
T
C
T/C
C/T
T
G
C
C
A
C
A
G
C
G
C
T
C
T
G
T
C
G
A
G
A/G
G
G
C
C
G
G
C
4
C/G
T
A
T
T
T
T
T
C
C
A
A
T/G
T/G
A
G
C
G
C
C
T
C
A
A
A
2
T
A/G
-
C
3
G
G/A
C
A
G
C
C
A
A
C
C
G
C
2
A
-
C
G
C/A
C/10
G
G
G
G
T
T
G
T
A
-
C
G
G
C
A
G
T
T
G
C
G
C
A
C
G
C
C
A
A
A
T
2
-
2
G
C
G
2
C
A
T
A
G
A/G
T
A
T
-
A/C
T
G
G
-
G
C
C/T
A
T
G
3
C
G
A
8
-
T
C
-
T
T
C
-
C
G
G
G
C
A/G
G
G
T
C/T
A
C
G/C
C
C
C/T
A/G
C/G
T
G/A
T/-
G
G
T/C
A
T
G
C
T/2
T
-
A
C
T
-
T
G
G
-
-
-
A
T
T
A
T/G
G
G
G
G
T
T
2
T
T
C
T
C
T
C
C
T/C
T/A
G/2
T/C