Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 93,080 (bp)   Positions: 289
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.077
.052
.002
.149
.028
.131
.0
.0
.0
.009
.009
.997
.002
.0
.001
.054
1.0
.01
.0
.002
.006
.858
.116
.074
.995
.015
.155
.003
.049
.087
.092
.129
.037
.079
.02
.001
.0
.002
.0
.001
.004
.469
.001
.004
.031
.002
.002
.0
.0
.058
.005
.005
.001
.001
.004
.0
.001
.0
.0
.218
--
--
--
--
--
.002
.124
.002
.002
.014
.286
.086
.087
.011
.01
.045
.001
.023
.223
--
--
--
--
.011
.662
.69
.911
.756
.001
.018
.012
.025
.024
.085
.023
.018
.024
.002
.0
.103
.002
.004
.536
.857
.016
.009
.003
.01
.0
.095
.0
.003
.002
.993
.003
.034
.001
.008
.997
.0
.0
.001
.0
.002
.001
.009
.001
.005
.008
.002
.017
.163
.9
.985
.303
.001
.0
.001
.001
.0
.001
.015
.992
.927
.253
.209
.013
.001
.006
.0
.0
.0
.001
.002
.002
.0
.0
.019
.0
.003
.021
.002
.014
.125
.212
.048
.0
.004
.001
.0
.001
.073
.399
.012
.0
.0
.634
.03
.047
.034
.0
.022
.0
.0
.001
.001
.011
.001
.012
.002
.021
.003
.172
.001
.003
.001
.012
.031
.0
.055
.464
.001
.001
.261
.0
.002
.019
.0
.004
.022
.002
.0
.001
.0
.0
.004
.0
.001
.002
.0
.848
.096
.113
.0
.0
.001
.004
.001
.004
.0
.002
.009
.506
.008
.001
.01
.0
.08
.088
.0
.003
--
.007
.0
.002
.003
.001
.011
1.0
.997
.956
.004
.002
.004
--
.0
.008
.0
--
--
--
--
.228
.023
.003
.562
.106
.045
.056
.947
--
--
--
.02
.027
.251
.249
.006
.168
.021
.018
.284
.243
.175
.205
.549
--
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
G
2
T
T
A
A
C
3
2
A
2
T
A
G
C
C
T
C
G
A
G
G
A
A
C
A
C
A
A
C
4
2
A
T
C
G
T
A
G
A
T
8
G
C
G
G
G
G
G
G
G
A
C
G
A
G
G
A
G
T
T
C
2
2
2
3
A
G
T
G
C
15
T
G
C
C
A
A
C
A
C
3
G
C
G
3
2
2
C
G
T
C
T
T
A
T
3
T
T
G
C
G
A
G
G
T
A
A
C
A
A
A
T
T
G
G
A
A
G
C
C
A
7
A
A
A
A
G
T
C
C
A
G
A
3
A
G
A
C
C
G
G
T
T
G
G
G
T
G
A
G
T
G
C
C
A
G
T
T
T
C
G
G
T
C
T
2
G
A
A
A
A
T
G
T
A
T
T
A
4
C
C
C
C
8
8
T
A
G
T
T
A
C
T
A
A
A
G
G
T
T
5
A
A
C
G
C
T
T
A
2
C
G
G
C
T
G
A
A
G
T
G
3
G
C
G
G
A
G
G
T
T
G
C
C
14
T
A
9
6
2
G
C
T
C
C
C
C
A
8
A
A
A
G
4
T
G
A
A
G
G
5
2
C
A
3
T
A
3
2
C
C
A
4
G
C
2
A
C
C
A
A
C
A
A
G
C
T
A
  114,856,429
  114,856,981
  114,856,987
  114,857,093
  114,857,279
  114,857,472
  114,858,010
  114,858,243
  114,858,244
  114,858,245
  114,858,251
  114,858,252
  114,859,023
  114,859,271
  114,860,017
  114,860,025
  114,860,055
  114,860,420
  114,860,495
  114,860,523
  114,861,581
  114,862,708
  114,863,272
  114,863,665
  114,864,274
  114,865,052
  114,865,835
  114,866,278
  114,866,627
  114,867,114
  114,867,123
  114,867,125
  114,867,693
  114,868,755
  114,869,400
  114,869,411
  114,869,590
  114,869,760
  114,871,109
  114,871,476
  114,872,316
  114,872,319
  114,873,222
  114,874,083
  114,875,369
  114,875,431
  114,875,486
  114,875,498
  114,875,507
  114,875,513
  114,875,517
  114,875,594
  114,876,915
  114,879,165
  114,879,778
  114,880,475
  114,881,047
  114,881,150
  114,881,378
  114,881,764
  114,882,101
  114,882,563
  114,882,644
  114,882,651
  114,882,652
  114,882,659
  114,882,779
  114,882,898
  114,883,359
  114,883,762
  114,883,806
  114,884,049
  114,884,064
  114,884,065
  114,885,228
  114,888,159
  114,888,409
  114,888,657
  114,889,417
  114,889,522
  114,890,097
  114,890,230
  114,890,249
  114,890,256
  114,890,273
  114,890,414
  114,890,415
  114,890,429
  114,890,440
  114,890,487
  114,891,107
  114,891,568
  114,891,714
  114,892,009
  114,892,046
  114,892,277
  114,892,280
  114,892,298
  114,892,363
  114,892,457
  114,892,521
  114,892,776
  114,892,808
  114,893,146
  114,893,173
  114,893,381
  114,893,635
  114,893,683
  114,893,697
  114,893,738
  114,893,805
  114,893,896
  114,893,955
  114,894,354
  114,894,588
  114,894,672
  114,894,898
  114,894,924
  114,894,931
  114,895,210
  114,895,501
  114,895,505
  114,895,656
  114,895,679
  114,895,784
  114,895,847
  114,895,892
  114,895,948
  114,895,954
  114,896,015
  114,896,100
  114,896,237
  114,896,336
  114,896,374
  114,896,379
  114,896,439
  114,896,458
  114,896,477
  114,896,494
  114,896,506
  114,896,535
  114,896,684
  114,896,879
  114,896,898
  114,896,917
  114,896,956
  114,896,964
  114,897,068
  114,897,070
  114,897,079
  114,897,104
  114,897,142
  114,897,206
  114,897,381
  114,897,388
  114,897,392
  114,897,396
  114,897,487
  114,897,498
  114,897,534
  114,897,638
  114,897,653
  114,897,749
  114,897,842
  114,897,946
  114,897,966
  114,898,159
  114,898,405
  114,899,087
  114,899,551
  114,900,173
  114,900,365
  114,900,590
  114,900,904
  114,902,021
  114,902,654
  114,902,744
  114,902,906
  114,902,920
  114,902,978
  114,902,981
  114,903,223
  114,903,262
  114,903,620
  114,903,798
  114,903,803
  114,904,102
  114,904,121
  114,904,322
  114,904,687
  114,904,807
  114,905,026
  114,905,240
  114,905,359
  114,905,620
  114,905,831
  114,905,955
  114,906,063
  114,906,075
  114,906,237
  114,906,772
  114,906,817
  114,907,061
  114,907,395
  114,907,666
  114,908,308
  114,908,322
  114,909,131
  114,909,252
  114,909,306
  114,909,779
  114,909,887
  114,910,049
  114,910,584
  114,910,704
  114,910,891
  114,911,215
  114,911,271
  114,911,275
  114,911,536
  114,911,592
  114,911,966
  114,911,994
  114,912,000
  114,912,234
  114,912,455
  114,912,774
  114,912,800
  114,912,833
  114,913,235
  114,913,567
  114,913,577
  114,913,682
  114,913,850
  114,914,410
  114,914,724
  114,915,213
  114,915,541
  114,915,575
  114,915,578
  114,915,626
  114,915,790
  114,915,909
  114,916,004
  114,916,042
  114,916,531
  114,917,104
  114,917,392
  114,917,489
  114,918,749
  114,918,760
  114,918,768
  114,919,338
  114,919,720
  114,920,065
  114,920,111
  114,922,416
  114,925,139
  114,925,282
  114,926,338
  114,927,892
  114,927,934
  114,927,959
  114,929,145
  114,934,539
  114,934,968
  114,936,457
  114,937,806
  114,938,270
  114,938,271
  114,938,484
  114,939,156
  114,939,160
  114,939,178
  114,940,860
  114,942,670
  114,943,839
  114,943,840
  114,944,822
  114,945,086
  114,945,413
  114,945,819
  114,946,322
  114,946,436
  114,946,860
  114,947,763
  114,947,806
  114,948,059
  114,948,714
A
2/-
T/-
A
G
-
T
-
-
-
2/-
T/-
C
A
T
T
3
T
A
T
C
A
-
4
A
T
T
G
G
T
4/-
2/-
G
C
T
T
C
G
A
G
C
-
A
2
3
2
-
-
A
-
-
G
G
G/C
G
A
A
G
A
C
C
T
-
2/-
-
3/-
G
A
C
A
-
-
T/C
G/A
T
T
C
G
T
G
-
-
C
7
G/-
3/-
2/-
-
6
C
A
T
5
C
G
2
3/-
T/-
C
C
T
C
G
C
A
C
G
G
4
C
G
G
-
C
A
A
G
C
A
T
A
G
-
C
-
G
C
T
-
T
T
G
C
G
-
T
A
T
T
T
A
A
C
C
A
T
A
C
A
C
A
C
A
T
T
2
A
C
A
C
T
A
G/A
G
T
C
-
A
A/G
G
G
T
3
A
-/6
2
G
C
G
-
-
T
T
T
-
-
C
G
A
C
C
T
T
C
G
G
G
2
A
C
C
-
G
C
T
A
T
C
C
G
-
A
A
A
T
C
A
A/G
A/G
T
G
A
-
7/6
T
A
A
G
A
A
C
C
A
T
T
-
C
G
9/-
-
-
A
T
T/C
G
T
T
T
C
-
A/G
A/G
G
A
-
2
A
G
G
A
3
5/-
2/-
-
G
-
T/2
G
3/-
-
T
C/A
A/C
-
T
T
2/-
A/-
7
T
G
3
T
C
5
A
T
A
T