Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 141,433 (bp)   Positions: 426
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.999
--
.334
.007
.128
.211
.015
.003
.001
.005
.795
.002
.94
.0
.894
.008
.001
.011
.133
.006
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.001
.26
.002
.004
.001
.003
.002
.001
.007
.007
.002
.006
.007
.002
.038
.0
.0
.0
.002
--
.003
.004
.002
.0
.0
.556
.805
.003
.002
.002
.001
.555
.065
--
.0
.0
.029
.203
.014
.223
.002
.021
.456
.016
.002
.002
.873
.895
.012
.007
.014
.022
--
--
.007
.004
.004
.001
.003
.008
.014
.0
.0
.0
.026
.72
.986
1.0
.0
.027
.005
.004
.056
.0
.223
.0
.195
.007
--
--
--
--
--
.004
.207
.172
.01
.036
.023
.07
.132
--
--
.003
.975
.003
.355
.448
.959
--
--
.016
.141
.141
.081
.0
.086
.087
.0
.045
.005
.004
.007
.047
.992
.005
.002
.001
.0
.062
.039
.033
.43
.024
.203
.004
.004
.062
.082
.063
.022
.022
.032
.199
.43
.001
.011
.096
.006
.003
.16
.498
.076
.207
.011
.032
.001
.003
.542
.002
.064
.006
.006
.006
.036
.003
.005
.024
.003
.0
.093
.019
.075
.077
.019
.052
.039
.003
.068
.065
.028
.58
.97
.001
.002
.012
1.0
.999
.936
.205
1.0
1.0
.999
.998
.003
.001
.272
.035
.249
.002
.001
.001
.002
.001
.303
.488
.151
.549
.543
.097
.001
.033
.002
.0
.005
.006
.26
.055
.094
.007
.029
.013
.015
.001
.007
.002
.0
.003
.051
.05
--
.015
.002
--
--
--
--
--
--
.016
.006
.034
.046
.004
.075
.158
.297
.001
.098
.039
.0
.02
.046
.029
.007
.003
.143
.0
.094
.136
.001
.0
.004
.198
--
--
.115
.012
.039
.001
.016
--
--
--
--
--
--
.006
.036
.13
.127
.002
.001
.002
.057
.034
.309
.003
.03
.943
.641
.062
.003
.01
.047
--
--
.005
.195
.045
.083
.093
.185
.146
.612
.634
.012
.003
.029
.018
--
.019
--
--
--
.01
.086
.035
.078
.008
.032
.022
.03
.01
.046
.048
.236
.02
.997
.002
.002
.002
.079
.114
--
--
--
.024
.002
.0
.001
.849
.045
.009
.213
.067
.001
.018
.0
.121
.03
.144
.899
.021
.922
.003
.097
.317
.032
.6
.741
.536
.0
.005
.001
.094
.002
.001
.007
.015
.025
.0
.144
.156
.162
.0
.001
.0
.006
.0
.001
.003
.004
--
.079
.003
.012
.03
.001
.0
.032
.98
.985
.983
.067
.008
.001
.009
.0
.052
.001
.015
.008
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
A
G
C
C
C
C
A
T
8
6
G
A
C
T
C
C
A
C
G
G
36
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
G
T
A
A
T
C
G
C
C
10
8
C
T
C
T
A
T
G
A
T
T
C
A
T
A
G
T
G
C
G
T
G
C
A
T
C
T
C
G
A
A
T
C
C
T
C
A
G
2
A
2
G
T
C
C
8
2
C
4
C
10
C
C
C
G
C
C
T
T
A
A
8
A
6
T
T
C
T
T
C
G
C
C
C
C
G
T
C
A
A
T
C
T
T
G
G
G
A
2
T
C
2
T
C
2
G
C
G
2
A
C
C
4
2
A
G
C
C
C
T
C
T
G
22
C
G
C
T
G
4
T
C
T
T
C
T
T
T
C
T
C
G
G
G
G
C
A
C
A
G
A
C
T
2
G
A
C
G
T
T
C
4
G
2
7
T
G
A
G
T
C
G
A
T
A
G
A
C
C
G
G
G
G
G
G
C
10
G
8
C
G
A
T
T
A
12
C
A
A
A
T
C
T
A
G
A
T
T
A
G
A
4
A
A
A
C
G
C
T
C
C
G
T
G
T
T
G
9
A
A
G
G
G
G
G
G
C
G
C
A
G
T
7
A
T
A
C
A
T
A
A
A
C
A
T
A
A
G
A
A
10
A
T
3
16
2
2
37
T
C
C
4
C
G
T
G
G
A
G
G
C
T
G
C
G
T
T
T
G
G
13
2
A
G
C
C
C
C
C
C
31
G
A
C
G
G
T
G
C
A
G
C
G
T
G
G
G
C
G
A
A
G
C
5
T
G
T
G
G
C
T
C
T
A
C
C
C
T
T
C
T
T
G
G
G
C
T
A
6
C
T
A
T
G
A
G
T
A
T
G
32
C
4
T
T
T
T
C
C
C
A
G
G
C
A
T
A
G
A
G
A
A
T
A
C
T
A
C
A
T
C
C
C
G
C
  91,681,982
  91,684,287
  91,684,435
  91,685,881
  91,686,163
  91,686,514
  91,686,558
  91,686,734
  91,686,904
  91,686,906
  91,686,997
  91,688,059
  91,688,412
  91,688,735
  91,688,831
  91,689,001
  91,689,042
  91,690,734
  91,690,789
  91,691,725
  91,691,811
  91,691,848
  91,691,852
  91,691,854
  91,691,856
  91,691,858
  91,691,860
  91,691,862
  91,691,864
  91,691,866
  91,691,868
  91,691,965
  91,692,616
  91,693,597
  91,694,036
  91,694,419
  91,694,546
  91,694,591
  91,694,650
  91,695,354
  91,695,641
  91,695,643
  91,695,915
  91,695,917
  91,696,143
  91,698,067
  91,698,126
  91,699,164
  91,699,874
  91,700,092
  91,700,283
  91,701,256
  91,701,288
  91,701,701
  91,701,770
  91,701,835
  91,702,213
  91,702,378
  91,702,418
  91,702,582
  91,702,639
  91,702,640
  91,702,667
  91,703,328
  91,703,736
  91,704,230
  91,704,425
  91,704,501
  91,706,010
  91,707,624
  91,707,728
  91,707,762
  91,708,903
  91,709,163
  91,709,237
  91,709,310
  91,709,858
  91,709,987
  91,710,178
  91,710,179
  91,710,259
  91,710,356
  91,710,359
  91,710,857
  91,711,001
  91,711,005
  91,711,086
  91,711,104
  91,711,113
  91,711,120
  91,711,129
  91,711,136
  91,711,157
  91,711,913
  91,712,181
  91,712,474
  91,712,557
  91,712,706
  91,712,795
  91,712,850
  91,712,958
  91,713,222
  91,714,052
  91,715,464
  91,715,738
  91,715,772
  91,716,304
  91,716,403
  91,716,442
  91,716,597
  91,716,746
  91,716,747
  91,716,825
  91,716,835
  91,716,844
  91,717,235
  91,718,197
  91,718,211
  91,718,226
  91,718,562
  91,718,571
  91,718,930
  91,719,449
  91,720,824
  91,721,897
  91,722,056
  91,723,727
  91,727,983
  91,729,893
  91,729,900
  91,730,427
  91,732,248
  91,732,249
  91,733,777
  91,734,085
  91,734,086
  91,736,433
  91,738,548
  91,741,242
  91,741,243
  91,742,761
  91,743,368
  91,743,828
  91,743,945
  91,744,431
  91,744,592
  91,744,740
  91,745,765
  91,746,137
  91,746,206
  91,746,228
  91,746,423
  91,746,477
  91,746,715
  91,746,795
  91,747,179
  91,747,436
  91,747,497
  91,747,498
  91,748,095
  91,748,134
  91,748,444
  91,748,866
  91,748,877
  91,748,963
  91,749,088
  91,749,190
  91,749,693
  91,750,085
  91,750,135
  91,750,497
  91,750,707
  91,751,004
  91,751,065
  91,751,100
  91,751,168
  91,752,609
  91,752,768
  91,752,866
  91,753,301
  91,754,623
  91,754,825
  91,754,867
  91,755,174
  91,755,355
  91,757,193
  91,757,246
  91,757,894
  91,758,469
  91,760,068
  91,761,102
  91,761,277
  91,761,917
  91,762,026
  91,762,046
  91,762,201
  91,762,207
  91,762,323
  91,762,395
  91,762,557
  91,762,607
  91,762,684
  91,762,789
  91,763,421
  91,763,433
  91,763,456
  91,763,570
  91,763,895
  91,764,623
  91,764,630
  91,764,666
  91,764,699
  91,764,902
  91,764,928
  91,764,936
  91,764,963
  91,765,051
  91,765,984
  91,766,087
  91,766,731
  91,768,188
  91,768,922
  91,768,942
  91,769,444
  91,769,557
  91,769,893
  91,771,949
  91,772,272
  91,773,786
  91,774,065
  91,774,066
  91,774,110
  91,774,301
  91,774,774
  91,774,828
  91,774,919
  91,775,760
  91,776,086
  91,776,263
  91,776,384
  91,776,561
  91,776,825
  91,777,393
  91,778,400
  91,778,552
  91,779,407
  91,781,268
  91,781,385
  91,781,819
  91,782,197
  91,783,187
  91,783,642
  91,784,311
  91,785,003
  91,785,215
  91,785,762
  91,785,794
  91,785,861
  91,785,941
  91,786,008
  91,786,010
  91,786,191
  91,786,469
  91,786,912
  91,788,320
  91,788,646
  91,789,043
  91,789,098
  91,789,431
  91,789,442
  91,789,619
  91,789,965
  91,790,396
  91,790,947
  91,791,079
  91,791,200
  91,791,701
  91,791,702
  91,791,770
  91,791,868
  91,791,953
  91,792,148
  91,792,503
  91,792,688
  91,792,702
  91,792,994
  91,793,775
  91,793,794
  91,793,966
  91,794,076
  91,794,485
  91,794,547
  91,794,572
  91,794,771
  91,795,626
  91,795,638
  91,795,657
  91,795,662
  91,795,667
  91,795,772
  91,795,810
  91,795,832
  91,795,840
  91,795,883
  91,795,939
  91,796,021
  91,796,099
  91,796,162
  91,796,182
  91,796,300
  91,796,553
  91,796,611
  91,796,781
  91,797,048
  91,797,094
  91,797,367
  91,797,475
  91,797,564
  91,797,572
  91,797,821
  91,798,082
  91,798,114
  91,798,151
  91,798,203
  91,798,359
  91,798,629
  91,798,922
  91,798,961
  91,799,077
  91,799,191
  91,799,237
  91,799,376
  91,799,703
  91,799,751
  91,799,791
  91,799,810
  91,799,825
  91,799,919
  91,799,977
  91,800,133
  91,800,983
  91,801,011
  91,801,032
  91,801,320
  91,801,321
  91,801,336
  91,801,444
  91,801,820
  91,801,994
  91,802,220
  91,802,478
  91,802,646
  91,802,785
  91,803,078
  91,803,165
  91,803,316
  91,803,451
  91,803,461
  91,803,481
  91,803,496
  91,803,798
  91,804,001
  91,804,162
  91,804,355
  91,805,460
  91,805,969
  91,806,221
  91,806,360
  91,806,424
  91,806,599
  91,806,691
  91,806,946
  91,807,007
  91,807,515
  91,807,547
  91,807,955
  91,808,159
  91,808,185
  91,808,372
  91,810,049
  91,810,090
  91,810,454
  91,810,528
  91,810,621
  91,811,030
  91,811,208
  91,811,504
  91,811,659
  91,812,127
  91,812,191
  91,812,927
  91,812,939
  91,813,373
  91,814,262
  91,814,283
  91,814,285
  91,814,287
  91,815,043
  91,815,104
  91,815,455
  91,815,771
  91,816,178
  91,816,327
  91,816,938
  91,817,249
  91,817,346
  91,817,648
  91,818,077
  91,818,950
  91,818,982
  91,819,153
  91,819,610
  91,820,184
  91,820,582
  91,820,601
  91,820,609
  91,820,660
  91,820,716
  91,820,886
  91,820,909
  91,820,917
  91,820,982
  91,821,736
  91,821,975
  91,822,107
  91,822,608
G
7
T
T
3/5
T
G
C
8/-
6/-
T
G
T
C
T
A
G
A
T
C
-
C/G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
A
C
G
G
C
T
A
T
G
10/-
-
T
A
T
A
T
C
A
2
C
2
A
T
C
C
T
C
3
T
T
C
T
A
G
C
T
C
A
A
G
G
C
T
3
C
T
G
G/3
2/-
G
-
C
C
A
11
-
-
G
-
G
-
G
T
T
A
T
T
T/-
C
G
T
8/-
3
6/-
C
C
G
C
C
T
T
G
T
A
T
T
C
G
G
G
5
3
C
A
7
-
C
A/7
2/-
3
C/4
2/-
3
C/2
-
T
26
GA/3
2/-
G
T
T
-
-
G
A
T
T
T
C
T
C
A
-
T
A
G
G
A
4/-
C
7
C
A
T
C
-
C
T
2
T
2
T
T
4
2
T
T
2
T
G
T
-
2/-
2
G
3
C
C
C
4
-
A
-
-
3
A
3
A
C
T
A
G
C
G
A
10
T
T
A
C
T
A
A
T
T
-
A
8/-
T
A
G
C
T/3
C
-
2
G
2
4
C
A
A
G
A
G
C
A
17
T
G
-
G
-
T
G
T
T
C
A
A
3/7
A
A
C
C
-
-
-
T
A
A
A
C
C
A
-
2
T
-
2
C
-
G
A
G
T
-
C
G
-
G
G
C
C
9
G
A
4
G
-
3
13
-
-
-
-
-
2
T
A
-
T
T
A
T
A
-
A
A
T
C
A
T
A
C
-
A
A
T
-
-
G
A
T
T
G
T
T
-
-
2
T
T
2
2
C
T
T
2
6
A
C
10
A
T
C
A
A
G
G
A
T
-
C
G/3
A
2
-
A
C
T
C
A/9
T
A
T
C
A
G
4
C
A
GA/5
?
T
G
9/5
-
3
C
-
C
A
G
C
C
G
A
A
-
T
-
A
A
A
C
T
T
T
G
4
T
10
G
C
2
A
2
C
G
G
3
6
A
C
G
-
C
C
A
T
A
A
T