Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 114,913 (bp)   Positions: 475
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.009
.0
--
.075
.088
--
.002
.003
.009
.011
.0
.035
--
--
.03
.037
.001
.0
.002
.013
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.045
.047
.002
.512
.001
.002
.998
.001
.119
.85
.1
.013
.014
.038
.108
.002
.874
.065
.094
.184
.031
.014
.005
.041
.18
.056
.017
.827
.809
.006
.035
.463
.005
.008
.001
.937
.982
.994
.484
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.012
.045
.151
.031
.023
.016
.143
.006
.0
.013
.001
.004
.0
.009
.004
.006
.012
.043
.004
.034
.002
.023
.013
.007
.008
.006
.013
.001
.007
.006
.026
--
--
--
.023
.014
.001
.074
.185
--
.113
.004
.001
.0
.002
.001
.06
.631
.012
.339
.269
.074
.004
.016
.011
.101
.8
.0
.001
.0
.007
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.205
.002
.0
.001
.001
.001
.001
.001
.001
.002
.485
.876
.004
.343
.141
.013
.119
.001
.001
.086
.001
.268
.262
.001
.003
.132
.008
.007
.004
.007
.004
.002
.009
.002
.078
.035
.02
.02
.013
.114
.723
.001
.002
.0
.026
.041
.028
.016
.015
.091
.088
.093
.013
.026
.026
.012
.025
.017
.019
.001
.007
.008
.012
.001
.0
.006
.005
.001
.007
.002
.005
.024
.034
.271
.004
.002
.008
.005
.066
.004
.027
.009
.016
.005
.002
.0
.007
.0
.007
.0
.029
.019
.018
.0
.02
.012
.008
.086
.021
.003
--
--
--
.013
.002
.005
.537
.101
.001
.001
.0
.004
.019
.0
.022
.045
.0
.003
.077
.001
.001
.053
1.0
.036
.136
.098
.012
.035
.13
.027
.089
.065
.121
.13
.523
.002
.013
.055
.003
.996
.004
.232
.104
.032
.044
.016
.001
.199
1.0
.001
.025
.14
.003
.017
--
--
.022
.017
--
--
.096
.032
.009
.023
.014
.016
.002
.001
.0
.002
.002
.075
.08
.0
.005
.026
.004
.021
.193
.014
.001
.002
.128
.01
.003
.003
.023
.011
.009
.005
.066
.016
.006
.01
.03
.029
.347
.037
.016
.063
.002
.0
.001
.0
.967
.096
.003
.001
.0
.006
.129
.221
.152
.121
.011
.006
.002
.004
.014
.015
.007
.001
.083
.244
.489
.041
.003
.003
.0
.002
.059
.001
.0
.99
.103
.027
.01
.013
.018
.025
.0
.01
.001
.07
.001
.003
.064
.004
.0
.0
.004
.008
.003
.0
.019
.0
.076
.001
.004
.717
.294
.0
.001
.054
.0
.488
.078
.026
.026
.016
.02
.02
--
--
--
--
--
.001
.014
.291
.004
.013
.014
.001
.009
.138
.013
.0
.0
.001
.002
.002
.018
.002
.077
.501
.004
.007
.004
.001
.001
.021
.002
.07
.049
.0
.012
.001
.223
.01
.002
.01
.026
.038
.001
.002
.005
.022
.01
.004
.0
.747
.011
.025
.022
.068
.0
.002
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
Adgrl4
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
C
A
C
C
A
G
G
A
A
C
C
A
T
T
A
T
G
A
T
A
A
C
T
7
2
A
A
T
A
C
A
T
T
G
C
C
T
G
G
G
C
4
T
C
G
C
G
T
G
A
A
A
C
C
T
A
G
G
C
C
T
A
A
T
A
A
A
A
G
T
A
12
G
A
A
2
2
T
G
2
4
A
2
C
G
C
C
A
C
A
A
G
G
T
T
A
T
A
C
A
G
G
T
C
C
T
A
T
T
G
A
T
A
C
C
A
10
6
G
G
T
G
A
T
G
T
C
C
A
T
A
C
T
C
2
T
C
G
T
T
T
C
C
A
C
A
T
A
C
A
A
A
A
A
A
G
A
C
T
G
A
A
A
A
G
A
A
C
A
A
9
T
T
5
C
4
T
T
T
A
A
A
T
T
T
T
A
A
C
A
G
C
T
G
C
G
T
T
T
A
A
G
T
T
T
C
T
C
G
A
G
G
G
C
G
A
G
T
A
T
C
A
C
G
G
T
A
T
A
G
A
G
C
C
T
G
C
G
T
C
T
C
C
A
T
C
T
G
T
T
C
C
C
A
G
T
C
T
T
G
2
A
G
G
A
T
T
G
A
A
A
G
T
C
T
A
G
A
T
G
T
T
G
C
A
T
T
C
C
T
T
A
C
G
A
G
T
C
A
3
T
A
T
C
T
T
A
T
G
C
T
T
C
3
2
A
G
C
T
A
16
A
G
G
T
G
A
A
T
C
T
C
C
C
G
T
T
C
3
A
T
T
C
C
G
A
G
G
G
C
C
T
7
C
G
2
G
C
16
20
T
T
A
T
A
C
A
C
G
C
A
G
C
A
C
A
3
G
C
A
G
C
A
C
T
A
T
T
A
C
T
A
C
C
C
G
A
C
A
A
C
C
T
A
A
C
T
A
G
T
C
A
T
T
C
G
G
G
T
T
T
T
A
G
A
A
C
G
C
T
A
G
T
C
G
A
A
G
G
C
A
A
G
A
C
A
T
G
G
G
T
C
C
A
A
G
T
T
6
T
2
T
A
A
T
C
A
T
A
3
2
G
C
C
  275,294,564
  275,294,710
  275,294,930
  275,300,431
  275,300,433
  275,302,834
  275,306,491
  275,306,492
  275,306,494
  275,306,495
  275,306,517
  275,306,544
  275,308,813
  275,309,230
  275,309,254
  275,309,476
  275,309,494
  275,309,503
  275,309,549
  275,309,657
  275,309,897
  275,309,907
  275,310,378
  275,310,565
  275,310,652
  275,310,660
  275,310,758
  275,310,760
  275,310,836
  275,310,991
  275,311,050
  275,311,051
  275,311,258
  275,311,772
  275,311,903
  275,312,589
  275,313,129
  275,313,320
  275,313,357
  275,313,359
  275,314,336
  275,314,600
  275,315,947
  275,317,979
  275,318,167
  275,318,561
  275,319,199
  275,319,935
  275,319,948
  275,320,080
  275,320,104
  275,320,158
  275,320,371
  275,320,484
  275,320,492
  275,320,802
  275,320,904
  275,320,976
  275,321,072
  275,321,294
  275,321,316
  275,321,448
  275,321,452
  275,321,476
  275,321,495
  275,321,540
  275,321,548
  275,321,556
  275,321,564
  275,321,569
  275,321,583
  275,321,606
  275,321,607
  275,321,618
  275,321,629
  275,321,705
  275,321,796
  275,321,800
  275,321,871
  275,321,881
  275,321,883
  275,321,885
  275,321,888
  275,322,221
  275,322,552
  275,322,762
  275,322,779
  275,322,861
  275,323,097
  275,323,287
  275,323,336
  275,323,343
  275,323,349
  275,323,617
  275,323,619
  275,324,044
  275,324,048
  275,324,104
  275,324,120
  275,324,172
  275,324,362
  275,324,409
  275,324,509
  275,324,793
  275,324,819
  275,325,361
  275,325,369
  275,325,845
  275,326,611
  275,326,613
  275,326,769
  275,326,832
  275,326,840
  275,327,093
  275,327,238
  275,327,264
  275,327,312
  275,327,354
  275,327,358
  275,327,431
  275,327,690
  275,328,195
  275,328,622
  275,328,746
  275,329,005
  275,329,398
  275,329,914
  275,330,194
  275,331,319
  275,331,731
  275,332,049
  275,332,141
  275,332,280
  275,332,293
  275,332,298
  275,332,557
  275,332,748
  275,333,850
  275,333,912
  275,333,976
  275,334,186
  275,334,219
  275,334,358
  275,334,366
  275,334,385
  275,334,438
  275,334,459
  275,334,705
  275,334,798
  275,334,849
  275,335,223
  275,335,224
  275,335,226
  275,335,228
  275,335,231
  275,335,233
  275,335,250
  275,335,513
  275,335,622
  275,336,486
  275,336,544
  275,336,553
  275,336,740
  275,336,779
  275,337,075
  275,337,221
  275,337,367
  275,337,569
  275,337,689
  275,337,690
  275,337,978
  275,338,066
  275,338,242
  275,338,284
  275,338,541
  275,338,599
  275,338,747
  275,338,785
  275,338,789
  275,338,935
  275,339,209
  275,339,338
  275,339,475
  275,339,588
  275,339,930
  275,339,982
  275,340,174
  275,340,582
  275,340,731
  275,340,916
  275,341,024
  275,341,331
  275,341,369
  275,341,398
  275,341,432
  275,341,457
  275,341,470
  275,341,489
  275,341,546
  275,341,555
  275,341,570
  275,341,571
  275,341,574
  275,341,600
  275,341,601
  275,341,659
  275,341,665
  275,341,668
  275,341,684
  275,341,688
  275,341,697
  275,341,741
  275,341,771
  275,341,775
  275,341,778
  275,341,800
  275,341,842
  275,341,861
  275,341,927
  275,341,942
  275,341,972
  275,342,006
  275,342,026
  275,342,055
  275,342,059
  275,342,068
  275,342,087
  275,342,140
  275,342,144
  275,342,168
  275,342,172
  275,342,196
  275,342,200
  275,342,223
  275,342,233
  275,342,252
  275,342,286
  275,342,311
  275,342,315
  275,342,453
  275,342,487
  275,342,511
  275,342,517
  275,342,534
  275,342,549
  275,342,568
  275,342,574
  275,355,376
  275,355,377
  275,355,409
  275,355,465
  275,355,490
  275,355,645
  275,355,991
  275,356,278
  275,356,658
  275,357,007
  275,357,362
  275,357,445
  275,357,606
  275,357,899
  275,358,263
  275,358,460
  275,358,841
  275,359,546
  275,359,597
  275,359,809
  275,360,063
  275,360,282
  275,360,480
  275,360,746
  275,361,487
  275,362,011
  275,362,073
  275,362,190
  275,362,279
  275,362,678
  275,362,764
  275,362,780
  275,363,151
  275,363,245
  275,363,489
  275,363,620
  275,363,676
  275,363,801
  275,363,910
  275,364,302
  275,364,556
  275,364,694
  275,364,882
  275,364,895
  275,365,086
  275,365,094
  275,365,213
  275,365,421
  275,367,231
  275,367,441
  275,368,583
  275,368,592
  275,370,230
  275,370,663
  275,370,705
  275,370,721
  275,370,826
  275,370,829
  275,370,868
  275,370,876
  275,370,990
  275,370,994
  275,371,025
  275,371,091
  275,371,396
  275,371,403
  275,371,902
  275,371,940
  275,371,941
  275,372,030
  275,372,316
  275,372,352
  275,372,379
  275,372,858
  275,372,999
  275,373,014
  275,373,117
  275,373,410
  275,373,444
  275,373,502
  275,373,744
  275,373,746
  275,373,880
  275,373,919
  275,373,925
  275,373,966
  275,373,977
  275,374,157
  275,374,162
  275,374,206
  275,374,282
  275,374,314
  275,374,358
  275,374,432
  275,374,454
  275,374,625
  275,374,926
  275,374,984
  275,375,015
  275,375,397
  275,375,570
  275,375,598
  275,375,700
  275,375,832
  275,376,157
  275,376,433
  275,376,466
  275,376,494
  275,376,537
  275,376,936
  275,376,967
  275,376,980
  275,376,986
  275,376,988
  275,377,007
  275,377,011
  275,377,025
  275,377,038
  275,377,045
  275,377,048
  275,377,163
  275,377,419
  275,378,332
  275,378,346
  275,378,411
  275,378,509
  275,378,549
  275,378,578
  275,378,584
  275,378,721
  275,378,799
  275,378,882
  275,379,049
  275,379,373
  275,379,442
  275,380,050
  275,380,061
  275,380,211
  275,380,231
  275,380,317
  275,380,419
  275,380,431
  275,380,511
  275,380,553
  275,380,686
  275,380,815
  275,380,866
  275,382,625
  275,383,571
  275,383,572
  275,383,606
  275,383,893
  275,384,188
  275,384,464
  275,384,988
  275,385,121
  275,385,151
  275,385,464
  275,385,597
  275,387,787
  275,388,142
  275,388,614
  275,388,665
  275,388,684
  275,388,800
  275,389,663
  275,389,769
  275,389,782
  275,389,787
  275,389,792
  275,389,800
  275,389,830
  275,389,933
  275,389,948
  275,389,953
  275,389,958
  275,389,976
  275,390,242
  275,390,373
  275,391,381
  275,391,619
  275,392,211
  275,392,216
  275,392,223
  275,392,310
  275,392,726
  275,392,737
  275,392,840
  275,392,894
  275,393,121
  275,393,211
  275,394,430
  275,394,933
  275,395,017
  275,395,524
  275,396,586
  275,396,679
  275,397,349
  275,397,431
  275,397,501
  275,397,941
  275,399,059
  275,399,067
  275,399,664
  275,399,671
  275,400,773
  275,400,876
  275,401,186
  275,402,026
  275,402,090
  275,402,267
  275,402,639
  275,402,710
  275,402,715
  275,402,921
  275,402,924
  275,403,506
  275,404,001
  275,404,002
  275,404,007
  275,405,041
  275,405,479
  275,406,117
  275,406,395
  275,406,396
  275,406,451
  275,406,740
  275,408,509
C/A
G
A/G
C/G
G
G
C
C
T
T
G
A
-
3
3
T
-
A
G
C
G
G
3
A
-
-
-
-
C
2
T
G
C
C
2
T
T
C
A/3
A
A
T
4/-
T/2
2
5
T
T
G
A
G
G
G
G
T
G
G
2
T
2
A
T/5
A/T
A/G
T/2
A/-
A/-
A/-
A/G
G/-
T/2
A/2
12/-
G/-
A/-
2
2/-
2/-
5
G/-
2/-
-
A/-
-
T
T
T
T
C
3
G
T
T
A/T
-
A
G
C
G
T
4/5
A
A
C
T
2
3
G
-
-
T
G
C
G
5
T
G
-
6/-
T
A
C
A
T
C
A
C
A
T
G
C
-
T
14
T
-
G
T
A
C
C
2
T
T
C
T
G
C
G
T
2
A/2
A/2
2
A/2
2
A
G
C/2
C
A
-
T
-
G
A
T
G
T
G
G
-
A
G
-
T
-
T/A
T/A
C
G
G
G
-
5
-
C
-
G
G
T
A
C/T
C
G/T
C/A
-
T/G
T/G
T/2
A/G
A/2
G/T
T/G
T/G
T/G
C/G
T/2
C/A
G/T
A/-
G/A
G/-
G/T
C/T
G/-
-
G/T
T/2
A/G
T/2
C/T
A/G
C/A
G/T
G/-
T/G
A/G
T/G
A/G
G/T
A/G
G/T
C/T
C/T
C
G/T
A
G/T
G
C/T
T/G
C/G
C/2
A/-
T/G
C/G
T/C
G/A
T/G
T/G
C/A
G
T
T
T
C
T
A
C
A
-
G
A
A
3
C
C
A
-
G
16
A
C
T
C
T
A
G
-
C
C
C
A
A
T
C
G
T
A
C
2
C
T
A
A/C
T
3
2
G
-
C
C
C
T
A
C
G
A
T
A
C
-
2
3/-
-
G
A
T
A
G
-
-
2
A
C
A
T
G
C
G
-
A
T
T
-
G
G
G
-
T
C
C
A
C/T
A
G
A
A
G/C
T
T
-
-
T
T
-
G/A
C/T
16/-
20/-
T/3
T/A
A/G
T/C
A/5
C/T
5
T
T
T
T
A
T
G
T
-
-
A
T
G
A
A
G
G
2
G
C
C
G
2
G
2
T
G
T
A
G
T
G
-
A
T
-
T
G
T
G
G
G/-
T/3
A
C
G
T/-
A/G
G/A
G/2
G/A
G
G
G
G
G
C
G
G
G
T
T
G
G
A
A
T
T
C
G
C
C
T
G
G
A
G
T
T
C
5/A
A
A
C
T
T
C
-
A
2
3
6/-
4
2/-
C
G
2
4
5
G
T/C
2
-
2/-
A
G
T