Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 93,561 (bp)   Positions: 480
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.026
.013
--
.172
.77
--
--
--
--
--
--
--
.063
.004
--
--
.444
.145
.017
.01
.045
.103
.163
.019
.013
--
--
--
--
.002
.019
.0
.423
.0
.007
.025
.023
.073
.015
.062
.021
.001
.001
.263
.084
.016
.002
.008
.027
.093
.025
.037
--
.081
.033
.045
.009
.105
--
--
.032
.001
.004
.004
.002
.002
.013
--
.088
.049
.165
.376
--
.001
--
.014
.016
--
--
.125
--
.005
.107
.933
.504
--
--
--
--
--
.017
--
.012
.106
.108
--
.0
.006
.0
--
.004
.091
.013
.015
.006
.008
.405
.612
.013
--
--
.056
.03
.001
--
.014
--
--
--
--
--
--
.098
.001
.0
.003
.013
.001
.08
.045
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.056
.004
.084
.004
.006
.039
.137
--
--
.005
.023
.027
.01
.043
.02
.019
.009
.0
.965
.012
.011
.018
.011
.0
.003
.001
.02
.001
--
--
--
--
.01
.005
.001
.012
--
.009
.059
.006
.008
.03
.01
.003
.005
.0
.001
.0
.0
.01
.001
.002
.001
.003
.001
.004
.0
.001
.002
.0
.003
.002
.001
.002
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.016
.121
.083
.124
.206
.009
.097
.047
.042
.154
.275
.482
.426
.153
.013
.012
.006
.022
.039
.009
.013
.94
.838
.125
.19
.001
.001
.01
.079
.1
.028
.438
.037
.014
.143
.242
.291
.062
.039
.011
.037
.003
.006
.041
.062
.009
.004
.011
.041
.0
.0
.002
.005
.917
.426
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.04
.264
.132
.226
.006
.008
.078
.076
.022
.014
.013
.589
.537
--
--
--
.067
.137
.081
.043
.022
.015
.004
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.042
.015
.319
.168
.046
.009
.023
--
--
--
--
.017
.493
.001
--
--
--
--
--
--
--
.03
.148
.07
.122
.053
.045
.178
.007
.005
.011
.017
.858
.021
.069
.023
.077
--
--
--
--
.198
.008
.013
.134
.051
.014
.026
.037
.029
.111
.265
.099
.174
.177
.106
.005
.064
.066
.064
.002
.084
.018
.013
.002
.015
.015
.373
.53
.052
.021
.113
.012
.6
.037
.009
.003
--
--
--
.013
.007
.056
.049
.067
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.012
.047
.147
.03
.036
.006
.0
.725
.013
.02
.001
.001
.001
.001
.008
.015
.001
.016
.074
.469
.535
.016
.174
--
.003
.106
.498
.15
.134
.379
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.046
.075
.002
.15
.039
.011
.0
.0
.043
.003
.001
.003
.005
.021
.004
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
A
G
C
A
A
C
G
T
T
G
G
G
T
3
C
A
G
C
G
C
T
C
G
C
T
G
G
G
A
C
A
G
G
G
A
T
A
G
G
G
C
T
C
A
A
C
G
C
T
C
T
G
G
G
C
C
A
G
T
C
C
G
A
T
C
G
A
A
T
T
T
A
C
A
2
3
C
G
C
2
G
C
C
T
A
T
4
4
C
T
A
G
2
C
A
T
C
C
C
G
4
A
C
6
C
A
A
T
A
C
G
A
C
G
T
G
5
T
A
A
A
A
A
C
A
G
C
C
T
T
C
8
8
A
G
T
T
A
T
T
C
T
T
A
4
A
T
C
T
A
G
T
T
T
A
C
T
G
T
T
A
C
T
A
T
A
C
G
A
4
G
G
A
G
G
T
3
G
A
A
G
C
G
C
G
G
G
C
G
C
3
A
T
C
T
G
T
G
T
T
T
C
A
C
G
G
C
C
T
C
T
T
G
A
A
A
C
T
G
C
G
G
A
G
G
11
C
G
2
T
A
C
C
T
12
G
G
C
T
A
C
C
C
T
T
C
T
A
G
G
C
C
G
A
A
G
G
G
A
T
3
T
T
G
G
G
T
G
T
A
T
C
T
C
T
T
T
C
T
C
G
T
C
G
G
T
A
C
C
A
G
G
9
T
T
T
C
C
T
A
G
A
A
11
T
T
A
G
A
2
T
C
C
C
C
T
A
C
C
A
G
T
C
T
G
A
C
G
G
G
C
T
C
A
A
G
G
G
T
T
A
A
T
A
G
T
G
T
T
G
C
C
A
C
A
A
C
C
2
A
G
G
2
C
A
G
G
G
C
A
C
C
G
G
3
C
C
C
G
C
G
A
A
G
A
A
20
A
C
G
A
A
A
A
G
A
C
A
T
2
G
G
G
C
T
G
A
C
T
T
T
T
T
T
4
2
C
G
G
G
C
G
C
G
C
T
G
G
T
G
G
T
C
A
G
A
A
G
6
A
A
C
G
G
T
C
A
4
3
3
3
3
A
5
A
C
G
G
C
G
G
C
C
8
A
A
A
T
A
C
T
T
G
C
4
A
C
T
T
G
  13,447,539
  13,449,076
  13,449,467
  13,450,035
  13,450,579
  13,450,679
  13,451,782
  13,452,829
  13,453,268
  13,455,824
  13,456,585
  13,456,596
  13,456,612
  13,457,131
  13,457,248
  13,457,730
  13,457,739
  13,457,984
  13,459,615
  13,460,043
  13,460,231
  13,460,663
  13,460,906
  13,460,969
  13,461,185
  13,461,735
  13,461,885
  13,462,067
  13,462,444
  13,462,459
  13,462,799
  13,463,161
  13,463,179
  13,463,403
  13,463,549
  13,463,682
  13,463,904
  13,463,912
  13,464,161
  13,464,204
  13,464,229
  13,464,397
  13,464,768
  13,465,000
  13,465,560
  13,465,950
  13,466,711
  13,466,757
  13,467,016
  13,467,515
  13,467,774
  13,467,950
  13,468,090
  13,469,033
  13,469,552
  13,470,806
  13,470,818
  13,470,991
  13,471,105
  13,471,124
  13,471,129
  13,471,284
  13,471,372
  13,471,667
  13,471,762
  13,472,017
  13,472,660
  13,474,329
  13,474,534
  13,475,724
  13,476,688
  13,477,200
  13,477,663
  13,477,870
  13,478,256
  13,479,502
  13,479,832
  13,479,873
  13,481,831
  13,482,152
  13,482,522
  13,483,744
  13,483,911
  13,484,978
  13,486,257
  13,486,841
  13,487,561
  13,487,650
  13,487,658
  13,488,392
  13,488,535
  13,489,099
  13,489,890
  13,490,148
  13,490,652
  13,490,868
  13,491,403
  13,492,057
  13,492,214
  13,492,269
  13,492,962
  13,493,174
  13,493,185
  13,493,589
  13,493,907
  13,494,985
  13,495,486
  13,495,789
  13,496,041
  13,496,175
  13,497,555
  13,497,599
  13,497,883
  13,498,239
  13,498,501
  13,498,502
  13,498,516
  13,498,538
  13,498,594
  13,498,595
  13,498,596
  13,498,690
  13,498,703
  13,499,470
  13,499,944
  13,500,061
  13,500,441
  13,500,858
  13,500,963
  13,502,739
  13,502,752
  13,503,019
  13,503,039
  13,503,163
  13,505,016
  13,505,018
  13,505,072
  13,505,296
  13,505,662
  13,505,711
  13,505,917
  13,505,919
  13,506,300
  13,506,316
  13,506,432
  13,506,820
  13,506,902
  13,507,908
  13,509,067
  13,509,436
  13,509,807
  13,510,014
  13,510,078
  13,511,066
  13,511,095
  13,511,097
  13,511,449
  13,511,600
  13,511,927
  13,511,945
  13,512,042
  13,512,146
  13,512,279
  13,512,326
  13,512,408
  13,512,417
  13,512,621
  13,512,635
  13,512,870
  13,513,126
  13,513,137
  13,513,325
  13,513,537
  13,513,538
  13,513,671
  13,513,710
  13,513,988
  13,513,991
  13,514,276
  13,514,333
  13,514,402
  13,514,706
  13,514,715
  13,514,788
  13,514,789
  13,514,842
  13,514,866
  13,514,916
  13,515,532
  13,515,725
  13,515,793
  13,515,806
  13,515,809
  13,515,882
  13,515,938
  13,515,973
  13,515,988
  13,515,993
  13,516,006
  13,516,019
  13,516,038
  13,516,118
  13,516,127
  13,516,134
  13,516,137
  13,516,166
  13,516,222
  13,516,424
  13,516,468
  13,516,479
  13,516,670
  13,516,678
  13,516,691
  13,516,720
  13,516,761
  13,516,769
  13,516,919
  13,516,975
  13,516,976
  13,516,984
  13,517,024
  13,517,095
  13,517,285
  13,517,303
  13,517,333
  13,517,351
  13,517,372
  13,517,380
  13,517,407
  13,517,508
  13,517,519
  13,517,521
  13,517,608
  13,517,611
  13,517,622
  13,517,674
  13,517,687
  13,517,762
  13,517,763
  13,518,010
  13,518,030
  13,518,040
  13,518,057
  13,518,059
  13,518,128
  13,518,142
  13,518,287
  13,518,350
  13,518,529
  13,518,530
  13,518,550
  13,518,708
  13,518,716
  13,518,805
  13,518,914
  13,518,947
  13,518,953
  13,519,036
  13,519,046
  13,519,086
  13,519,289
  13,519,372
  13,519,602
  13,519,610
  13,519,662
  13,519,666
  13,519,696
  13,519,787
  13,519,889
  13,520,070
  13,520,387
  13,520,398
  13,520,449
  13,520,501
  13,520,546
  13,520,561
  13,520,906
  13,520,923
  13,521,023
  13,521,024
  13,521,181
  13,521,260
  13,521,267
  13,521,270
  13,521,556
  13,521,590
  13,521,603
  13,521,706
  13,521,878
  13,521,912
  13,521,928
  13,521,973
  13,522,151
  13,522,253
  13,522,353
  13,522,455
  13,522,576
  13,522,723
  13,522,750
  13,522,840
  13,522,846
  13,522,847
  13,523,185
  13,523,319
  13,523,340
  13,523,350
  13,523,376
  13,523,379
  13,523,409
  13,523,412
  13,523,643
  13,523,828
  13,523,843
  13,523,846
  13,523,878
  13,523,890
  13,523,917
  13,523,985
  13,524,097
  13,524,224
  13,524,378
  13,524,522
  13,524,546
  13,524,554
  13,524,582
  13,524,645
  13,524,652
  13,524,693
  13,524,811
  13,524,846
  13,524,871
  13,524,989
  13,525,064
  13,525,085
  13,525,136
  13,525,293
  13,525,357
  13,525,372
  13,525,501
  13,525,612
  13,525,639
  13,525,653
  13,525,765
  13,525,947
  13,525,997
  13,526,001
  13,526,053
  13,526,096
  13,526,122
  13,526,139
  13,526,163
  13,526,285
  13,526,442
  13,526,863
  13,526,873
  13,526,887
  13,526,917
  13,526,942
  13,526,988
  13,527,005
  13,527,037
  13,527,114
  13,527,123
  13,527,213
  13,527,269
  13,527,286
  13,527,399
  13,527,424
  13,527,425
  13,527,479
  13,527,543
  13,527,563
  13,527,622
  13,527,692
  13,527,776
  13,527,928
  13,527,981
  13,528,038
  13,528,044
  13,528,102
  13,528,429
  13,528,571
  13,528,572
  13,528,580
  13,528,695
  13,528,726
  13,528,743
  13,528,788
  13,528,876
  13,528,994
  13,529,016
  13,529,145
  13,529,448
  13,530,163
  13,530,203
  13,530,206
  13,530,243
  13,530,254
  13,530,256
  13,530,489
  13,530,950
  13,531,195
  13,531,315
  13,531,378
  13,531,503
  13,531,589
  13,531,591
  13,531,640
  13,531,652
  13,531,667
  13,531,687
  13,531,695
  13,531,862
  13,532,054
  13,532,170
  13,532,172
  13,532,682
  13,533,063
  13,533,112
  13,533,158
  13,533,205
  13,533,322
  13,533,524
  13,533,564
  13,533,580
  13,533,625
  13,533,632
  13,533,840
  13,533,942
  13,534,054
  13,534,261
  13,534,292
  13,534,330
  13,534,334
  13,534,410
  13,534,451
  13,534,535
  13,534,799
  13,535,035
  13,535,316
  13,535,359
  13,535,510
  13,535,581
  13,535,702
  13,535,739
  13,535,771
  13,535,775
  13,535,911
  13,535,924
  13,535,928
  13,535,936
  13,535,940
  13,535,964
  13,536,040
  13,536,225
  13,536,381
  13,536,540
  13,536,547
  13,536,562
  13,536,664
  13,536,770
  13,536,843
  13,536,926
  13,537,079
  13,537,300
  13,537,346
  13,537,395
  13,537,410
  13,537,887
  13,537,972
  13,538,014
  13,538,040
  13,538,050
  13,538,191
  13,538,269
  13,538,273
  13,538,328
  13,538,406
  13,538,710
  13,538,820
G
A
4
G
G
T
C
C
G
A
4
2
9
-
T
T
T
T
C
T
C
T
T
-
C
A
A
29
-
C/2
G
A
A
A
G
T/-
G
A
A
A
T
G
T
G
G
T
A
A
C
-
A
T
A
A
T
T
G
A
C
-
T
3
G
A
T
C
G
G
-
C
3
G
CA/3
G
-
-
T
A
T
-
G/5
7/6
3
-
C
C
-
-
T
C
G
A
-
T
G
3/TA
5
T
G
A
-
T
-
-
T
G
T
C
G
T
A
17
T
T
G
T
-
-
T
T
G
-
-
T
2
C
T
T
T/2
2
T
-
-
G
2
5
T/2
C
C
2
T
C
2
2
-
G
G
2
C
13
T
T/-
C
A
G
T
2
A
C
C
G
T
G
G
3
T
T
C
5
-
A
A
G
A
A
C
-
3
G
G
T
T
A
T
A
T
C
T
A
T
-
T
C
3
G
A
A
A
C
C
C
T
G
T
T
A
T
T
C
T
-
C
A
G
C
G
T
C
A
T
A
A
-
A
A
-
G
A
-
C
-
T
T
A
-
C
A
T
G
G
T
T
T
C
-
A
5
G
A
A
T
A
A
G
G
A
A
A
G
G
-
C
C
A
A
-
7
A
3
G
C
T
C
T
C
A
C
T
G
T
-
C
T
A
A
C
G
T
A
G
A
A
-
C
C
G
T
T
G
C
T
T
C
-
C
G
8
3
G
-
C
T
A
A
T
C
G
T
T
C
C
C
5
A
A
T
G
A
A
2
T
-
A
C
G
A
C
C
72
C
C
G
C
G
A
C
A
C
C
A
T
-
C
T
C
G
T
T
-
17
A
6
-
T
2
T
A
T
T
G
T
T
A
A
-
T
28
T
T
T
A
2
T
A
G
G
-
C
A
A
G
G
G
T
A
-
T
C
C
2/-
A
A
C
T
C
T
G
T
C
C
C
C
G
C
4/-
2/-
A
A
A
T
T
A
G
A
A
2
A
A
C
A
A
C
T
G
4
-
G
A
-
T
G
3
2
A
C
G
G
-
-
-
-
-
G
-
G
T
A
A
A
A
A
T
2
-
G
G
3
C
G
T
C
C
A
T
-
G
A
C
C
T