Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 363,599 (bp)   Positions: 443
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.115
.01
.0
.0
.006
.005
.002
.0
.003
.001
.009
.001
.012
.001
.001
.314
.061
.001
.0
.024
.032
.066
.003
.065
.811
.019
.004
.126
.004
.007
.831
.001
.024
.032
.001
.01
.051
.001
.015
.813
.029
.017
.09
.026
--
--
--
--
.001
.0
.0
.0
.001
.045
.167
.003
.298
.0
.01
.006
.997
.013
.588
.005
.172
.0
.126
.021
.537
.0
.995
1.0
.0
.0
.522
--
.734
.038
.335
.289
.997
.055
.028
--
.0
.003
--
--
.22
--
.002
.001
.002
.001
--
.058
.382
.111
.002
.0
.0
.006
.022
.009
.004
.008
.002
.001
.076
.188
.218
.219
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.005
.048
.064
.076
.072
.017
.005
.005
.22
.335
.903
.597
.783
1.0
1.0
.954
.258
.26
.272
.282
.204
.019
.001
.001
.0
.471
.0
.998
.955
.996
.001
.003
.001
.022
.035
.238
.0
1.0
1.0
.996
.983
.01
.0
.002
.027
.006
.132
.386
.0
.004
.028
.007
.01
.026
.575
.063
.06
.011
--
--
.3
.194
.009
.021
.027
.122
.125
.11
.008
.003
.002
.049
.005
.005
.394
.076
.002
.548
.094
.003
.31
.502
--
.007
--
--
--
.0
.788
.009
.008
.001
.074
--
--
--
.007
.012
.077
.076
.011
.002
.086
.01
.012
.222
.339
.303
.029
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.04
.034
.0
.031
.111
.004
.022
.003
.0
.001
.008
.003
.01
.136
.009
.096
.0
.001
.0
.002
.243
--
.062
.0
--
.0
.017
.261
.036
.008
.534
.026
.111
.003
.015
.056
.116
.95
.004
.006
.001
.001
.856
.0
.016
.108
.0
.0
.033
.0
.001
.008
.005
.008
.021
.029
.143
.338
.406
.105
.041
.01
.005
.002
.001
.02
.004
.003
.001
.001
.025
.002
.004
.171
.113
.012
.036
.045
.001
.002
.024
.046
.017
.007
.021
.034
.056
.061
.037
.035
.009
.0
.005
.002
.001
.199
.052
.001
.002
.006
.0
.011
.016
.003
.001
.046
.036
.006
.0
.006
.002
.0
.0
.001
.024
.027
.138
.172
.115
.001
.001
.002
.018
.034
.037
.037
.082
.171
.165
.078
.3
.346
.334
.193
.135
.144
.009
.366
.424
.381
.033
.126
.031
.001
.003
.0
--
.338
.129
.021
.001
.001
.073
1.0
.998
.0
.0
.001
.001
.052
.008
.002
.01
.015
.0
.0
.005
.52
.006
.316
.03
.011
.004
.006
.005
.005
.032
.047
.055
.021
.02
.076
.028
.002
.012
.008
.12
.102
.281
.022
.016
.024
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
A
G
T
T
G
G
C
A
C
T
G
T
A
T
G
G
C
A
C
T
C
-
G
A
-
T
T
C
G
G
A
T
C
T
T
2
T
T
C
G
G
-
12
-
-
A
T
A
A
4
A
C
-
G
T
T
9
-
C
T
A
A
C
-
T
C
C
C
12
T
T
-
C
T
T
-
T
T
T
C
T
T
A
T
G
T
C
-
A
4
C
T
A
A
3
8
-
-
C
C
2
A
-
G
T
C
C
2
T
C
T
A
C
C
C
T
A
T
C
C
C
-
G
-
T
T
T
A
A
C
C
C
A
A
2
G
C
-
A
A
T
C
2
4
8
A
2
T
G
-
C
A
A
G
G
T
G
T
A
T
C
G
-
C
T
G
3
-
G
A
A
T
C
-
A
T
-
C
C
C
C
A
A
G
C
A
G
A
G
G
2
2
-
-
-
-
-
T
C
G
C
T
A
C
-
T
T
C
4
T
T
G
A
G
C
C
-
8
C
A
7
G
-
G
-
G
G
A
C
-
G
2
-
C
C
2
-
G
C
G
A
T
T
T
G
5
-
2
2
T
8
G
G
C
T
C
A
A
A
G
A
-
T
T
T
T
C
T
C
T
2
T
T
A
-
T
T
C
C
T
2
C
117
A
G
T
T
A
4
G
C
C
A
T
T
-
G
C
C
A
C
G
A
T
-
-
G
-
A
T
A
-
4
T
-
-
C
T
-
G
C
T
-
A
-
-
A
C
-
A
T
-
G
-
-
T
4
C
A
-
G
T
-
2
T
C
-
T
C
A
T
C
C
G
-
C
G
G
2
-
A
G
C
A
-
A
-
C
T
A
T
-
C
T
A
T
-
A
A
G
-
T
A
A
-
-
T
A
G
G
C
-
G
A
T
G
T
G
C
T
A
C
G
T
G
T
G
-
G
G
-
-
C
A
T
-
T
G
-
7
A
4
A
A
A
2
A
G
A
A
T
A
A
A
A
G
A
G
-
A
-
C
  57,103,446
  57,104,038
  57,108,588
  57,108,589
  57,109,520
  57,110,494
  57,111,011
  57,112,288
  57,113,323
  57,115,388
  57,116,106
  57,116,294
  57,119,972
  57,120,554
  57,120,653
  57,124,110
  57,124,456
  57,125,229
  57,126,780
  57,126,898
  57,126,900
  57,126,924
  57,127,783
  57,128,081
  57,128,148
  57,128,313
  57,128,504
  57,129,347
  57,130,620
  57,130,794
  57,134,248
  57,134,270
  57,134,352
  57,134,360
  57,135,344
  57,135,393
  57,135,565
  57,135,703
  57,135,806
  57,136,665
  57,136,676
  57,137,422
  57,137,760
  57,138,351
  57,138,600
  57,138,608
  57,138,640
  57,138,642
  57,138,818
  57,138,846
  57,139,302
  57,139,353
  57,139,651
  57,139,702
  57,139,949
  57,140,885
  57,140,989
  57,141,512
  57,141,662
  57,141,746
  57,142,440
  57,143,921
  57,144,441
  57,145,378
  57,146,045
  57,146,356
  57,147,796
  57,147,812
  57,148,062
  57,148,437
  57,151,148
  57,151,672
  57,152,307
  57,152,797
  57,154,514
  57,155,447
  57,157,144
  57,158,062
  57,158,670
  57,158,972
  57,161,159
  57,162,183
  57,162,236
  57,162,984
  57,164,188
  57,164,212
  57,164,511
  57,164,526
  57,164,611
  57,164,711
  57,165,197
  57,166,117
  57,166,699
  57,167,785
  57,169,036
  57,169,837
  57,169,848
  57,169,867
  57,169,884
  57,169,893
  57,169,897
  57,169,919
  57,170,036
  57,170,833
  57,172,357
  57,172,477
  57,173,515
  57,173,516
  57,174,114
  57,174,163
  57,174,289
  57,174,290
  57,174,807
  57,174,902
  57,176,327
  57,176,348
  57,176,352
  57,176,359
  57,176,364
  57,176,377
  57,176,380
  57,176,389
  57,176,837
  57,176,838
  57,177,228
  57,177,520
  57,177,576
  57,179,279
  57,179,624
  57,179,649
  57,179,939
  57,180,334
  57,180,390
  57,180,727
  57,180,805
  57,181,143
  57,181,613
  57,181,869
  57,182,004
  57,182,062
  57,182,067
  57,182,209
  57,182,270
  57,182,416
  57,182,435
  57,182,459
  57,182,473
  57,182,477
  57,182,517
  57,183,119
  57,183,693
  57,183,718
  57,184,090
  57,185,626
  57,185,795
  57,186,099
  57,186,223
  57,186,242
  57,187,328
  57,187,673
  57,188,213
  57,188,539
  57,188,581
  57,189,215
  57,189,603
  57,191,853
  57,192,029
  57,192,136
  57,192,141
  57,192,489
  57,193,132
  57,193,177
  57,193,480
  57,193,519
  57,194,095
  57,195,118
  57,195,657
  57,196,667
  57,197,663
  57,197,886
  57,198,044
  57,198,578
  57,198,773
  57,199,056
  57,199,193
  57,200,480
  57,200,529
  57,201,355
  57,202,086
  57,205,300
  57,205,971
  57,205,976
  57,205,980
  57,205,995
  57,205,999
  57,206,014
  57,206,050
  57,206,052
  57,206,055
  57,206,078
  57,206,102
  57,206,107
  57,206,816
  57,206,980
  57,207,424
  57,208,044
  57,209,199
  57,213,787
  57,215,058
  57,215,338
  57,215,611
  57,217,174
  57,217,511
  57,217,551
  57,217,569
  57,219,469
  57,219,798
  57,220,278
  57,222,031
  57,222,394
  57,222,665
  57,223,169
  57,223,187
  57,223,193
  57,223,211
  57,223,217
  57,223,233
  57,223,238
  57,223,245
  57,223,249
  57,223,263
  57,223,287
  57,223,300
  57,223,323
  57,223,344
  57,223,351
  57,223,379
  57,223,384
  57,223,393
  57,223,397
  57,223,404
  57,223,410
  57,223,425
  57,223,456
  57,223,463
  57,223,474
  57,223,477
  57,223,488
  57,223,502
  57,223,511
  57,226,041
  57,226,368
  57,226,743
  57,226,901
  57,227,738
  57,228,764
  57,229,846
  57,230,159
  57,231,121
  57,231,291
  57,231,600
  57,231,794
  57,235,310
  57,235,909
  57,235,953
  57,236,312
  57,236,356
  57,236,689
  57,236,797
  57,240,103
  57,240,545
  57,241,260
  57,247,249
  57,247,546
  57,247,652
  57,248,298
  57,248,743
  57,249,011
  57,250,377
  57,251,090
  57,251,115
  57,251,233
  57,251,300
  57,252,082
  57,253,047
  57,253,094
  57,253,288
  57,253,334
  57,253,414
  57,253,992
  57,254,001
  57,254,251
  57,254,253
  57,254,742
  57,255,148
  57,255,220
  57,256,003
  57,256,433
  57,256,435
  57,256,846
  57,258,973
  57,260,452
  57,260,464
  57,260,467
  57,260,470
  57,260,472
  57,260,474
  57,260,482
  57,260,486
  57,260,488
  57,260,503
  57,260,504
  57,260,510
  57,260,513
  57,260,522
  57,260,532
  57,260,544
  57,260,554
  57,260,555
  57,260,562
  57,260,570
  57,260,587
  57,260,594
  57,260,599
  57,260,628
  57,260,637
  57,260,640
  57,260,659
  57,260,680
  57,260,707
  57,260,708
  57,260,713
  57,260,723
  57,260,729
  57,260,732
  57,260,738
  57,260,748
  57,260,752
  57,260,757
  57,260,788
  57,260,790
  57,260,800
  57,260,807
  57,260,819
  57,260,827
  57,260,837
  57,262,716
  57,262,725
  57,262,732
  57,262,742
  57,262,744
  57,262,748
  57,262,761
  57,262,773
  57,262,776
  57,262,808
  57,262,814
  57,262,821
  57,262,836
  57,262,856
  57,262,859
  57,262,873
  57,262,891
  57,262,903
  57,262,907
  57,262,913
  57,262,918
  57,262,927
  57,262,928
  57,262,953
  57,262,970
  57,262,981
  57,262,986
  57,263,006
  57,263,017
  57,263,030
  57,263,038
  57,263,052
  57,263,066
  57,263,088
  57,263,124
  57,263,132
  57,263,136
  57,263,147
  57,263,157
  57,263,164
  57,263,166
  57,263,177
  57,263,200
  57,263,217
  57,263,236
  57,263,238
  57,263,245
  57,263,263
  57,263,272
  57,263,273
  57,263,278
  57,263,858
  57,264,087
  57,264,124
  57,264,572
  57,265,082
  57,265,434
  57,265,722
  57,267,100
  57,267,263
  57,267,623
  57,267,864
  57,268,422
  57,268,492
  57,268,557
  57,268,560
  57,268,564
  57,269,255
  57,269,911
  57,270,048
  57,270,191
  57,270,245
  57,270,526
  57,271,149
  57,271,224
  57,271,234
  57,271,237
  57,271,245
  57,271,250
  57,271,256
  57,271,258
  57,271,264
  57,271,271
  57,271,273
  57,272,623
  57,272,624
  57,272,633
  57,272,664
  57,272,683
  57,272,690
  57,272,705
  57,272,737
  57,272,759
  57,272,772
  57,272,788
  57,272,797
  57,371,609
A
G
A
C
G
T
A
T
T
T
C
A
C
C
C
A
A
T
G
T
C
-
T
A
G
T
C
A
A
A
C
C
G
T
C
A
2/-
-
C
T
A
A
A
-
2
2
T
A
G
G
-
G
T
C
A
G
C
-
A
T
C
G
T
A
A/A
G
T
T
T
-
G
C
2
A
C
C
T
C
A
C
-
C
A
G
C
A
G
T
T
G
-
A
C
G
C
-
-
C
G
-
-
2/-
G
3
A
A
T
T
-
G
A
C
G
T
-
A
-
-
C
A
A
A
A
A
G
G
C
C
C
G
T
T
T
-
G
-
A
T
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
T
A
C
G
C
A
C
A
G
T
-
T
A
A
T
C
-
-
2
A
G
T
C
T
A
G
C
2
T
T
T
T
-
T
-
T
G
A
G
C
T
-
-
3
C
2
A
C
-
-
-
-
C
G
T
T
G
C
T
-
-
C
C
-
A
T
T
14
-
T
G
-
-
T
T
T
-
-
-
G
T
-
-
T
-
G
-
T
-
-
A
C
-
-
G
-
-
T
-
-
C
-
A
T
-
C
T
T
G
-
A
G
C
A
G
A
G
G
C
T
G
-
-
G
G
12
C
G
T
G
C
-
T
-
G
A
A
C
G
-
A
G
T
C
A
C
63
-
T
T
G
T/G
A
-
G
A
G
T
2
-
A
C
3
-
G/G
G
T
G
C
A
-
-
-
A
-
C
C
-
-
T
T
-
A
-
G
C
-
-
G
-
2
C
-
C
-
-
-
A
-
A
G
-
A
A
-
C
-
-
-
-
3
-
A
-
-
T
G
T
T
-
-
-
A
-
G
-
-
A
-
-
-
T
-
-
-
T
A
-
-
-
-
A
G
-
T
C
T
A
A
A
C
T
T
A
G
A
C
A
T
-
T
2
G
T
G
G
G
C
A
15
-
-
-
G
-
-
-
-
A
-
T
C
-
-
C
-
-
-
C
3
-
C
T