Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 179,025 (bp)   Positions: 362
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.153
.001
.0
.001
.016
.031
.006
.006
.042
.002
.026
.021
.002
.0
.046
.001
.042
.254
.149
.002
.016
.002
.003
.002
.008
.159
.001
.013
.226
.028
.025
.561
.583
.304
.025
.003
.115
.307
.01
.011
.028
.002
.008
.011
.0
.008
.348
.001
.111
.007
.049
.001
.0
.369
--
.144
.077
.077
.098
.045
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.005
.017
.037
.053
.179
.023
.058
.032
.031
.371
.182
--
.001
.087
.006
.01
--
--
--
--
--
.222
.012
.773
.103
.218
.146
.035
--
.102
.0
.0
.0
.146
.0
.042
.011
.004
.388
.274
.018
.001
.0
.002
.001
.001
.004
.002
.966
.001
.255
.021
.001
.0
.0
.0
.001
.002
.004
--
--
--
--
--
--
--
.003
.046
.03
.013
.01
.013
.0
.002
.0
.002
.02
.005
.127
.013
.444
.048
.0
.0
.002
.0
.99
.014
.344
.051
.998
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.078
.035
.219
.0
.004
.012
.016
.002
.003
.003
.002
.0
.073
.014
.955
.151
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
--
.005
.002
.001
.005
.01
.138
.0
.002
.001
.013
.238
.002
.341
.623
.006
.029
.003
--
.581
.055
.118
.005
.013
.002
.013
.017
.017
--
--
--
.153
.039
--
--
--
--
--
--
--
--
.123
.473
.079
.368
.035
.002
.0
.049
.007
.712
.001
.053
.023
.005
.006
.002
.02
.033
.025
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.086
.001
1.0
--
.996
.0
.284
.044
.001
.013
.0
.017
.005
.08
.061
.012
--
--
--
--
--
--
--
.011
.017
.997
.995
.002
.003
--
--
.62
.519
.002
.002
.237
.952
.0
.004
.003
.075
.99
.078
--
.254
.017
.002
.0
.002
.0
.002
.001
.004
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
Stk33
C
G
T
C
A
C
C
C
C
7
C
C
C
C
A
C
C
A
T
-
G
G
2
C
C
A
C
T
C
G
2
-
A
T
-
G
C
A
A
A
G
A
T
G
G
C
C
A
T
A
T
G
T
G
A
C
C
T
C
T
C
A
A
C
C
A
T
T
-
T
C
G
3
G
A
C
A
C
C
G
C
C
A
G
A
C
C
G
-
A
-
T
T
-
C
G
A
C
G
C
G
G
G
G
-
G
C
A
A
T
T
A
C
G
A
G
C
T
-
A
A
G
C
G
C
G
G
C
A
4
-
T
A
-
G
C
T
C
C
C
C
-
A
G
-
C
-
C
-
-
G
-
A
C
C
T
G
G
T
A
A
-
T
A
-
-
G
T
C
G
G
T
T
G
A
C
-
T
A
-
G
C
C
G
A
4
A
G
A
C
T
C
A
C
G
A
A
A
A
A
-
-
A
-
A
4
A
A
A
A
C
A
C
-
G
C
A
C
A
G
T
C
-
A
T
T
G
A
T
G
G
C
G
G
-
A
C
C
A
-
-
C
A
G
A
G
G
2
G
A
G
A
2
A
C
C
A
A
C
6
G
A
A
G
T
C
-
T
A
T
A
G
T
T
C
T
G
G
C
C
G
T
A
A
T
A
G
G
C
G
G
G
C
A
G
A
A
A
G
G
G
G
-
C
G
C
T
C
T
G
-
C
A
C
2
T
C
G
A
2
G
G
-
C
G
A
C
G
T
T
C
T
G
T
G
A
G
16
-
-
A
T
A
G
A
G
A
A
T
A
C
T
C
A
T
G
-
T
G
G
-
C
  173,873,096
  173,873,417
  173,874,074
  173,874,190
  173,874,267
  173,874,420
  173,874,423
  173,874,592
  173,874,938
  173,874,962
  173,875,098
  173,875,615
  173,875,683
  173,875,770
  173,875,890
  173,876,374
  173,876,391
  173,878,621
  173,879,254
  173,879,510
  173,879,602
  173,880,202
  173,880,220
  173,880,252
  173,880,258
  173,880,268
  173,880,328
  173,880,428
  173,880,858
  173,881,150
  173,881,279
  173,881,326
  173,881,699
  173,881,700
  173,881,948
  173,882,136
  173,882,235
  173,882,368
  173,882,684
  173,882,849
  173,883,235
  173,883,338
  173,883,392
  173,883,411
  173,883,414
  173,883,455
  173,883,541
  173,883,820
  173,883,829
  173,885,420
  173,885,621
  173,885,684
  173,885,771
  173,885,875
  173,886,677
  173,887,271
  173,888,437
  173,889,318
  173,890,769
  173,891,067
  173,891,666
  173,891,726
  173,892,879
  173,892,887
  173,892,888
  173,893,059
  173,893,435
  173,893,480
  173,893,517
  173,893,529
  173,893,573
  173,893,585
  173,893,887
  173,893,895
  173,894,065
  173,894,467
  173,894,663
  173,894,664
  173,894,683
  173,894,735
  173,894,746
  173,895,881
  173,895,889
  173,896,896
  173,896,952
  173,897,653
  173,899,199
  173,899,563
  173,900,536
  173,901,087
  173,901,106
  173,901,152
  173,902,712
  173,902,994
  173,903,005
  173,906,691
  173,906,722
  173,907,796
  173,911,682
  173,913,425
  173,913,666
  173,913,669
  173,913,673
  173,913,685
  173,913,691
  173,914,082
  173,914,132
  173,914,705
  173,915,990
  173,916,030
  173,916,969
  173,918,176
  173,920,680
  173,927,989
  173,928,688
  173,931,938
  173,932,362
  173,932,602
  173,932,888
  173,933,346
  173,933,449
  173,933,660
  173,933,799
  173,934,096
  173,934,362
  173,934,522
  173,934,633
  173,934,753
  173,935,239
  173,935,279
  173,935,989
  173,936,040
  173,936,216
  173,936,459
  173,937,059
  173,937,421
  173,937,732
  173,938,158
  173,938,273
  173,938,364
  173,938,434
  173,938,616
  173,938,681
  173,946,749
  173,946,761
  173,946,801
  173,946,876
  173,946,881
  173,946,907
  173,946,925
  173,946,966
  173,946,990
  173,947,116
  173,947,412
  173,947,505
  173,947,538
  173,947,698
  173,947,718
  173,948,024
  173,948,336
  173,948,347
  173,948,485
  173,949,075
  173,949,269
  173,949,580
  173,949,764
  173,951,302
  173,951,324
  173,951,351
  173,951,651
  173,951,799
  173,951,877
  173,952,245
  173,952,484
  173,952,678
  173,953,475
  173,953,848
  173,954,279
  173,954,436
  173,955,116
  173,955,202
  173,955,203
  173,955,665
  173,955,880
  173,955,901
  173,956,112
  173,956,220
  173,956,583
  173,956,614
  173,956,628
  173,956,775
  173,956,809
  173,956,915
  173,956,995
  173,957,200
  173,957,502
  173,957,580
  173,957,765
  173,958,147
  173,958,507
  173,959,232
  173,959,648
  173,959,954
  173,960,043
  173,960,165
  173,960,557
  173,960,678
  173,960,791
  173,961,366
  173,961,620
  173,961,673
  173,961,783
  173,962,851
  173,962,872
  173,963,161
  173,963,168
  173,964,922
  173,965,234
  173,965,521
  173,965,531
  173,965,580
  173,965,905
  173,966,428
  173,966,506
  173,966,727
  173,971,370
  173,972,268
  173,972,788
  173,972,885
  173,973,345
  173,973,801
  173,974,238
  173,974,931
  173,976,343
  173,977,525
  173,977,548
  173,977,581
  173,977,589
  173,977,593
  173,978,534
  173,978,654
  173,978,823
  173,980,171
  173,980,629
  173,982,292
  173,982,855
  173,983,342
  173,983,344
  173,983,377
  173,983,961
  173,983,962
  173,984,000
  173,988,318
  173,989,499
  173,989,844
  173,991,283
  173,991,753
  173,994,441
  173,995,846
  173,995,953
  173,996,098
  173,998,176
  173,998,429
  173,998,702
  173,998,822
  173,999,900
  173,999,914
  173,999,921
  173,999,991
  173,999,998
  174,000,171
  174,000,277
  174,000,292
  174,000,296
  174,000,548
  174,000,746
  174,001,008
  174,001,069
  174,001,083
  174,001,100
  174,001,375
  174,001,520
  174,001,864
  174,001,959
  174,002,008
  174,002,302
  174,002,308
  174,002,317
  174,002,325
  174,002,326
  174,002,874
  174,002,875
  174,002,929
  174,002,960
  174,002,984
  174,002,993
  174,003,155
  174,003,378
  174,003,391
  174,003,414
  174,003,531
  174,003,561
  174,003,564
  174,003,675
  174,004,080
  174,004,241
  174,005,410
  174,006,021
  174,007,065
  174,009,369
  174,010,434
  174,010,546
  174,016,805
  174,017,674
  174,018,201
  174,019,617
  174,021,160
  174,021,524
  174,022,629
  174,023,006
  174,023,488
  174,024,497
  174,024,522
  174,025,385
  174,029,933
  174,029,938
  174,029,949
  174,029,993
  174,030,106
  174,030,157
  174,030,587
  174,032,871
  174,033,423
  174,034,386
  174,034,886
  174,035,981
  174,037,025
  174,037,614
  174,037,868
  174,038,875
  174,038,876
  174,041,005
  174,041,094
  174,042,403
  174,042,437
  174,042,966
  174,043,864
  174,043,865
  174,043,991
  174,045,569
  174,045,830
  174,047,026
  174,047,823
  174,047,881
  174,049,443
  174,049,655
  174,049,853
  174,050,232
  174,050,555
  174,050,889
  174,051,014
  174,051,450
A
C
C
T
G
T
A
T
T
-
T
T
G
T
G
G
T
G
C
3
A
C
-
T
T
C
T
C
T
A
-
T
-
G
T
T
T
C
-
-
-
G
G
A
C
A
T
T
C
T
C
T
C
A
G
A
A
C
T
C
T
T
C
T
T
G
T/C
T/C
-/2
T/C
C/T
G/A
3/-
C
A/T
C/G
A/C
C/A
C/T
G/A
C/T
G
G
A
T
T
A
C
G
T
6
C
-
C
-
A
G
T
T
T
C
C
T
T
2
A
T
G
T
-
A
G
T
A
G
T
T
C
A
G
T
A
T
A
T
A
A
T
G
-
2
G
G
A
T
T
C
T
T
T
G
A
-
-
C
-
C
T
T
G
A
T
C
A
T
A
-
T
C
C
G
5
C
G
T
70
A
C
A
A
A
C
C
A
G
T
6
C
G
A
C
T
T
A
T
-
G
A
G
T
C
T
T
T
C
G
T
G
G
G
T
C
-
10
-
-
-
G
G
G
T
G
T
8
A/4
T
G
T
G
C
C
G
5
G
C
G
C
G
C
C
A
G
C
A
T
G
-
G
G
G
A
T
G
A
T
G/C
G/A
2/-
G/A
C
C
G
2/-
C
T
T
G
G
T
6/-
T
G
C
A
G
T
G
C
T
G
A/T
T
C
A
C/T
T/G
G/C
G/A
C/T
C/G
T
T/C
A/G
A/T
T/C
A/T
G/A
G/A
C/A
G/A
G/T
G/A
C/T
A/T
G/-
A/G
A/G
T
T
G/A
G/C
G/C
C/A
T
A
A
-
T
C
A
T
-
-
T
-
C
T
A
G
-
A
C
C
T
A
G
A
A
G
C
-
C
A
C
A
G
A
-
22
G
G
A
G
A
C
T
T
C
-
G
T
C
G
G
C
A
C
C
A
A
T
T