Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 466,530 (bp)   Positions: 357
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.049
.0
.0
.065
.003
.004
.514
.176
.0
.003
.0
.061
.073
.002
.199
.016
--
--
.061
.001
.007
--
.021
.014
.024
.027
.081
.038
.047
.523
--
--
--
--
--
--
--
--
.345
.0
.0
.0
.012
.036
.0
.024
.002
.0
.003
.995
.028
.118
.24
.265
--
--
--
--
.001
.0
.002
.003
.124
.308
--
--
--
--
--
.012
.253
.087
--
.051
.208
.093
.515
.001
.063
--
--
--
.064
.052
.174
.019
.257
.025
--
--
.989
.997
--
.204
--
.004
.061
.459
.065
.036
.002
.522
.021
.037
.425
.014
.668
.676
.549
.159
.038
.044
--
.03
.012
.013
.013
.205
.209
.004
.033
.007
.006
.992
.974
.002
.002
.026
.03
.0
.0
.012
.0
.005
.034
.052
.0
.095
.959
.001
.002
.005
.137
.002
.041
.002
.191
.052
.032
.009
.998
.998
.998
.055
--
.005
.013
.003
.956
.002
.114
.947
.001
.207
--
.001
.983
.039
--
--
--
.64
.862
.015
.014
.015
.001
.476
--
.108
.088
.016
.143
--
--
--
.007
.44
.048
.002
.0
.013
.987
1.0
--
.039
.183
.996
.069
.041
.08
.008
.09
.002
.002
.003
.306
.1
--
--
--
.406
.294
--
.046
.0
.032
.09
.034
.008
.254
.121
.104
--
.004
.001
.0
.004
.018
.002
.007
--
--
--
--
--
.46
.0
.0
.113
.001
.014
.018
.002
.035
.062
--
--
--
--
--
--
.167
.062
.002
.005
.199
.005
.001
.001
.056
.124
.047
.051
--
.08
--
--
--
--
--
.0
.18
.105
.015
.08
.011
.048
.011
.039
.0
.0
.001
--
--
--
--
.248
.036
.225
.011
.006
.06
.697
.38
--
.135
.996
.0
.0
.005
.002
.014
.359
.012
.56
.317
.006
.005
.001
.028
.005
.002
--
--
--
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.001
.017
.157
.001
.0
.102
.0
.005
.002
.004
.814
.021
.094
.034
.004
.001
.001
--
.897
.549
.054
.061
.063
.002
.098
.064
.0
.018
.101
.012
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
T
G
C
C
C
C
C
G
T
T
G
A
A
T
T
C
T
A
T
G
G
T
C
T
A
C
G
G
T
A
A
A
G
G
C
C
G
C
C
C
A
G
T
T
A
A
T
T
G
T
C
G
C
G
A
C
C
A
C
C
G
T
A
C
G
T
C
T
T
T
A
G
G
C
C
G
C
A
T
G
G
C
A
A
G
T
T
G
A
A
C
A
T
A
C
G
G
C
C
C
A
G
A
T
A
A
T
C
C
C
T
C
T
T
T
C
C
C
C
C
G
T
G
G
C
T
A
T
A
A
A
C
A
G
A
A
G
C
T
C
G
G
G
G
C
G
G
A
C
A
T
G
A
C
C
A
C
A
T
T
G
A
A
C
T
A
C
T
A
A
A
A
T
G
T
G
G
C
C
A
G
G
G
A
T
T
C
A
C
C
T
C
T
C
C
G
A
A
A
A
T
A
T
A
C
C
T
C
A
A
C
C
C
A
G
A
T
A
G
A
G
A
C
T
T
C
T
T
C
G
G
T
C
G
C
T
A
G
A
A
C
T
A
G
G
A
G
T
C
T
G
A
T
T
G
T
C
T
A
T
C
G
G
G
A
C
A
G
A
A
C
T
G
A
T
C
A
C
G
A
G
A
A
T
T
A
C
T
G
A
T
C
C
G
C
C
A
C
G
T
T
C
T
C
C
A
A
G
G
A
T
G
T
G
G
G
C
A
T
T
C
A
T
T
A
G
C
C
A
C
C
G
G
A
A
C
C
T
G
A
G
T
T
G
T
C
T
A
C
T
G
T
A
C
T
  60,127,203
  60,132,078
  60,143,515
  60,143,768
  60,149,270
  60,149,317
  60,157,966
  60,162,056
  60,164,585
  60,165,406
  60,170,736
  60,174,188
  60,184,027
  60,186,357
  60,188,294
  60,188,758
  60,192,620
  60,195,095
  60,198,233
  60,202,801
  60,203,934
  60,205,558
  60,210,147
  60,213,591
  60,216,909
  60,216,912
  60,217,093
  60,217,098
  60,217,336
  60,217,440
  60,226,270
  60,226,309
  60,228,282
  60,228,322
  60,229,353
  60,248,152
  60,248,172
  60,248,332
  60,250,139
  60,250,307
  60,250,308
  60,250,309
  60,250,362
  60,255,858
  60,256,431
  60,257,050
  60,258,083
  60,258,240
  60,259,894
  60,260,222
  60,261,156
  60,262,508
  60,262,574
  60,262,973
  60,263,674
  60,264,221
  60,265,268
  60,266,874
  60,268,698
  60,270,092
  60,270,410
  60,272,224
  60,275,356
  60,276,610
  60,277,450
  60,278,291
  60,278,346
  60,278,394
  60,278,742
  60,280,115
  60,283,784
  60,284,301
  60,284,810
  60,286,065
  60,291,212
  60,291,362
  60,293,343
  60,294,137
  60,294,467
  60,295,314
  60,295,316
  60,295,338
  60,297,826
  60,301,720
  60,303,477
  60,303,997
  60,304,207
  60,304,226
  60,304,461
  60,304,462
  60,307,577
  60,308,413
  60,309,214
  60,309,701
  60,312,617
  60,313,341
  60,315,231
  60,315,297
  60,315,952
  60,316,151
  60,316,466
  60,316,973
  60,317,090
  60,317,213
  60,317,828
  60,318,197
  60,319,234
  60,319,287
  60,320,027
  60,320,272
  60,320,392
  60,322,273
  60,324,685
  60,326,916
  60,329,738
  60,330,455
  60,331,119
  60,331,930
  60,331,931
  60,333,555
  60,333,624
  60,333,666
  60,333,694
  60,335,037
  60,335,135
  60,335,502
  60,335,504
  60,335,530
  60,335,867
  60,336,679
  60,336,680
  60,336,889
  60,337,771
  60,338,889
  60,338,918
  60,339,205
  60,339,247
  60,339,919
  60,339,968
  60,340,118
  60,340,784
  60,341,926
  60,342,190
  60,342,955
  60,350,105
  60,351,527
  60,366,448
  60,367,775
  60,368,051
  60,370,421
  60,370,863
  60,371,135
  60,371,363
  60,373,212
  60,375,635
  60,375,936
  60,377,549
  60,385,947
  60,386,868
  60,388,834
  60,388,917
  60,390,485
  60,390,683
  60,390,870
  60,391,185
  60,391,273
  60,392,709
  60,395,694
  60,398,389
  60,398,970
  60,400,495
  60,402,214
  60,402,245
  60,403,240
  60,403,943
  60,403,952
  60,404,052
  60,404,558
  60,406,911
  60,410,532
  60,410,867
  60,413,691
  60,415,060
  60,424,763
  60,425,366
  60,425,594
  60,430,427
  60,431,148
  60,431,177
  60,431,354
  60,432,355
  60,432,562
  60,433,537
  60,433,625
  60,434,905
  60,435,111
  60,435,715
  60,435,817
  60,438,214
  60,438,215
  60,438,216
  60,438,490
  60,438,507
  60,440,687
  60,441,413
  60,442,787
  60,442,921
  60,444,474
  60,445,361
  60,445,586
  60,447,408
  60,449,565
  60,449,927
  60,450,310
  60,450,862
  60,451,724
  60,452,443
  60,452,572
  60,452,784
  60,454,317
  60,455,127
  60,456,370
  60,456,415
  60,456,929
  60,457,529
  60,458,982
  60,461,726
  60,463,582
  60,463,674
  60,464,372
  60,464,502
  60,464,876
  60,467,265
  60,467,473
  60,467,519
  60,467,891
  60,468,015
  60,468,667
  60,468,668
  60,468,975
  60,472,007
  60,472,277
  60,472,825
  60,473,133
  60,473,206
  60,473,669
  60,476,153
  60,476,196
  60,476,267
  60,476,903
  60,477,184
  60,478,581
  60,479,124
  60,479,453
  60,480,564
  60,481,032
  60,482,103
  60,483,628
  60,483,632
  60,483,768
  60,483,793
  60,483,815
  60,484,586
  60,485,269
  60,485,522
  60,486,616
  60,488,264
  60,488,699
  60,490,424
  60,491,592
  60,492,854
  60,496,689
  60,497,014
  60,498,174
  60,498,361
  60,498,742
  60,499,179
  60,499,404
  60,499,540
  60,500,234
  60,500,409
  60,500,410
  60,500,842
  60,501,014
  60,507,186
  60,508,262
  60,512,546
  60,512,994
  60,513,128
  60,513,410
  60,513,457
  60,513,474
  60,514,051
  60,514,306
  60,514,384
  60,517,698
  60,518,202
  60,518,553
  60,518,740
  60,518,878
  60,520,033
  60,520,637
  60,520,696
  60,520,944
  60,521,430
  60,526,923
  60,527,462
  60,527,582
  60,527,877
  60,528,476
  60,528,579
  60,530,623
  60,531,227
  60,532,068
  60,532,611
  60,537,428
  60,541,512
  60,542,298
  60,542,347
  60,544,686
  60,544,784
  60,544,891
  60,545,072
  60,545,167
  60,545,234
  60,553,148
  60,553,551
  60,560,617
  60,561,632
  60,563,711
  60,563,713
  60,564,139
  60,564,293
  60,564,935
  60,565,906
  60,568,914
  60,578,869
  60,579,857
  60,581,410
  60,582,585
  60,583,646
  60,583,650
  60,583,651
  60,584,930
  60,586,834
  60,587,603
  60,587,651
  60,588,493
  60,588,715
  60,589,395
  60,590,691
  60,591,002
  60,591,022
  60,591,568
  60,591,701
  60,592,064
  60,592,065
C
A
C
T
T
T
G
T
T
A
C
G
G/A
G
A/G
C
A
T
C
C
C
T
T
G
G
A
A/T
T
A
A
A
C
G
G
C
G/C
C/A
C/T
T
T
G
T
G
T
T/G
C
T
C
C
A
A
C
C/A
C
T
G/T
G
C/A
T
C
T
T
T
C
G
A
A
C
T
G
C
G
G
A
A
C/T
A
A
T
C
C
A
A
T
C
G
C
A
C
C
G
A/G
T
A/T
C
G
T
T
A
T
G
T
G
T
T
C
G
G
T/A
T
T
T
C
T
C
C
C
A
G
G
T
T
A
C
A
A
T
C
C
A
C
G
G
T
G
A
T
A/G
G/A
T
G
T
A
A
A
A
A
A
T
C
T
C
C
C
A/T
T
A
G
T
G
C
C
C
T
G
T
G
G
G
C
G
G
C
G
G
A
C
A
A
A
T
T
A
A
A
T
C
A
A
G
A
T
C
T
C
T
G
T
A/T
T
C
G
C
T
C
G
T
T
C
T
G
T
G
T
C/T
G
A
C
C
C
T
G
A
G
G
C
C
G
C
G
T
T
T
T/G
T
G/A
A
A
A/T
A
T
A/G
T
C
C
G/A
A
G
A
A
T
C
T
C
C
C
G/A
C
A
C
A/T
T/C
T
A
C
A
G
T
G
A
G
A/C
G
C
A
C
G
A
T
A
C
C
C
A/G
T
G
C
C
A
C
G/A
G
C
T
T
G/A
A
T
C
A
A
C
C
T
C
T
T
G
G
A
A
A/G
A
A
C
T
A
A
T
G
C
G
T
A/C
A
G
T
T
T
A
G
T
T
A
C
G
T
T
T
C
A
G
A
C
C
A
C
T
C
A/T
T
C
C
A
G
G
A