Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 333,541 (bp)   Positions: 380
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.019
.0
.0
.373
.368
.002
.011
.544
.109
.037
.026
.019
.059
.08
.509
.0
.008
.078
.412
.001
.0
.135
.133
.109
.002
.0
.0
.035
.001
.052
.004
.004
.012
.0
.654
.0
.0
.119
.52
.005
.001
.042
.001
.1
.008
.006
.034
.001
.001
.033
--
.015
.091
.0
.015
.117
--
--
.001
.021
.002
.968
.011
.25
.0
.0
.0
.021
.979
.013
.0
.359
.456
.122
.036
.028
.029
.244
--
.226
.01
.016
.002
.512
.002
.005
.549
.047
.0
.015
.003
.0
--
.047
.001
.001
.001
.003
.0
.044
.007
.006
.009
.0
.084
.073
.037
.002
.429
.982
.0
.002
.004
.0
.023
.0
.175
.004
.035
.164
.183
.181
1.0
.998
.018
.417
.005
.002
.855
.115
.001
.0
.001
.0
.006
.001
.31
.024
.004
.118
.006
.1
.11
.007
.051
.016
.184
.003
.49
.087
.003
.045
.004
.002
.287
.0
.938
--
.002
.226
.003
.0
.002
.0
.113
.056
.23
.016
.268
.003
.001
.0
.787
.0
.0
.004
.002
.003
.0
.001
.001
.003
.0
.391
.038
.002
1.0
1.0
.001
.019
.001
.001
.0
.0
.0
.006
.116
.044
.0
.0
--
--
.992
.935
.496
.0
.001
.997
.083
.189
.002
.086
.0
.938
.006
.029
.0
.011
.004
.0
.0
.057
.003
.001
.0
.002
.001
.007
.003
.181
.007
.017
--
--
.045
.061
.099
.069
.145
.002
.002
.017
.166
.04
.043
.017
.001
.0
.14
.001
.017
.003
.001
.0
.01
.016
.0
.146
.0
.001
.002
.687
.0
.001
.029
.004
.001
.002
.006
.0
.0
.002
.0
.002
.007
.004
.001
.155
.007
.002
.0
.0
.0
.0
.044
.052
.001
.084
.001
.024
.012
.207
.21
.002
.0
.181
.004
.174
.2
.002
.012
.01
.001
.975
.998
1.0
.999
.055
.0
.0
.052
.0
.006
.061
.0
.001
--
.071
.005
.001
.088
.146
.006
.01
.029
.002
.005
.069
.078
.085
.003
.12
.024
.767
.003
.201
.001
.006
.028
.01
.002
.001
.004
.022
.002
.0
.023
.0
.03
.002
.05
.012
.011
.005
.0
.003
--
--
.026
.313
.279
.068
.121
.029
.001
.004
.0
.112
.995
.003
.001
.982
.001
.006
.0
.0
.003
.001
.0
.0
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108351064
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
T
T
A
C
A
A
G
G
T
A
A
T
G
A
C
C
C
G
T
T
G
T
T
A
C
G
A
A
A
A
G
C
A
G
A
T
C
G
G
C
G
A
G
A
T
C
C
C
G
C
A
G
C
G
G
T
A
T
A
C
C
G
C
G
A
A
G
G
A
C
C
T
A
G
A
C
C
C
T
C
A
A
T
T
C
G
G
T
C
C
T
C
C
C
C
G
G
T
C
T
C
C
A
G
G
C
C
G
G
A
A
C
C
A
T
T
G
G
G
A
T
T
A
T
G
G
G
G
G
T
C
G
T
C
T
G
A
G
A
T
C
G
T
C
A
C
A
C
G
G
C
T
A
T
T
A
C
G
C
C
T
C
C
A
C
A
A
T
T
G
A
C
T
T
G
C
G
G
G
C
C
C
A
G
T
G
A
T
T
T
G
C
G
A
T
G
G
T
T
G
G
T
C
A
T
C
G
A
C
G
G
A
A
C
C
C
T
A
A
T
C
T
A
A
G
A
C
G
T
A
A
T
G
A
C
A
T
T
A
T
A
C
G
T
C
G
G
G
C
C
C
T
G
C
C
C
A
A
T
C
G
G
G
G
C
C
C
G
G
T
T
G
G
A
T
G
T
C
T
G
C
G
A
T
G
G
C
C
T
T
T
G
T
T
T
A
T
A
C
A
T
C
G
G
C
G
C
C
A
G
G
A
C
C
C
C
G
T
C
G
G
C
T
G
G
A
G
A
A
A
T
A
C
A
G
C
G
A
G
T
G
T
C
C
G
C
A
G
G
C
G
T
A
G
A
C
A
T
G
G
A
T
T
G
A
C
G
C
C
A
A
T
A
T
T
C
C
A
  167,334,214
  167,334,983
  167,334,984
  167,335,118
  167,336,622
  167,336,754
  167,337,122
  167,337,482
  167,338,524
  167,340,220
  167,341,825
  167,341,827
  167,341,833
  167,341,835
  167,343,634
  167,343,864
  167,345,317
  167,345,564
  167,346,081
  167,346,390
  167,346,577
  167,347,557
  167,347,558
  167,347,562
  167,351,897
  167,351,900
  167,351,901
  167,355,828
  167,355,839
  167,356,259
  167,356,514
  167,357,124
  167,357,700
  167,358,200
  167,358,283
  167,359,036
  167,359,597
  167,360,040
  167,360,090
  167,360,394
  167,361,179
  167,362,351
  167,363,575
  167,365,327
  167,365,528
  167,366,318
  167,366,402
  167,367,428
  167,367,445
  167,368,847
  167,369,336
  167,370,501
  167,371,524
  167,371,592
  167,372,332
  167,373,207
  167,374,529
  167,375,109
  167,377,473
  167,378,322
  167,380,664
  167,381,248
  167,382,754
  167,383,021
  167,383,581
  167,383,656
  167,383,661
  167,385,108
  167,385,616
  167,386,940
  167,386,994
  167,387,487
  167,387,524
  167,388,085
  167,389,379
  167,389,415
  167,390,442
  167,390,790
  167,391,027
  167,392,062
  167,392,271
  167,393,220
  167,393,574
  167,393,978
  167,394,058
  167,394,240
  167,395,694
  167,397,754
  167,398,508
  167,398,953
  167,399,265
  167,399,648
  167,401,133
  167,401,500
  167,402,144
  167,402,518
  167,402,524
  167,402,935
  167,403,400
  167,404,225
  167,404,237
  167,405,899
  167,406,346
  167,406,360
  167,407,140
  167,407,663
  167,408,403
  167,408,510
  167,411,371
  167,411,740
  167,413,287
  167,413,300
  167,414,521
  167,415,659
  167,417,067
  167,417,682
  167,419,246
  167,419,256
  167,419,257
  167,419,299
  167,419,356
  167,419,358
  167,419,628
  167,419,833
  167,420,851
  167,421,342
  167,422,024
  167,422,135
  167,422,588
  167,422,602
  167,422,874
  167,425,000
  167,425,433
  167,425,733
  167,426,432
  167,426,750
  167,428,181
  167,429,182
  167,430,049
  167,432,414
  167,433,659
  167,433,857
  167,434,407
  167,435,290
  167,436,258
  167,436,261
  167,436,400
  167,436,828
  167,436,921
  167,436,929
  167,437,511
  167,437,969
  167,438,672
  167,439,112
  167,440,210
  167,440,539
  167,440,662
  167,441,922
  167,443,172
  167,444,374
  167,445,129
  167,445,644
  167,446,034
  167,447,192
  167,448,052
  167,448,172
  167,448,355
  167,448,473
  167,448,964
  167,449,267
  167,449,288
  167,453,302
  167,453,615
  167,454,313
  167,455,779
  167,456,670
  167,457,101
  167,457,425
  167,457,536
  167,457,550
  167,457,655
  167,459,339
  167,459,479
  167,460,711
  167,460,936
  167,460,976
  167,463,121
  167,463,122
  167,463,323
  167,464,069
  167,464,782
  167,465,205
  167,465,331
  167,465,385
  167,465,530
  167,465,593
  167,465,759
  167,467,543
  167,467,801
  167,469,658
  167,471,706
  167,471,712
  167,473,888
  167,474,872
  167,480,525
  167,481,004
  167,483,810
  167,485,623
  167,490,179
  167,491,598
  167,495,904
  167,499,198
  167,504,063
  167,504,174
  167,505,441
  167,505,915
  167,508,769
  167,512,346
  167,514,327
  167,514,709
  167,515,934
  167,517,855
  167,518,360
  167,518,385
  167,519,632
  167,519,965
  167,521,837
  167,522,751
  167,525,265
  167,525,919
  167,528,386
  167,528,429
  167,529,452
  167,529,688
  167,530,699
  167,530,745
  167,530,748
  167,530,822
  167,530,966
  167,531,762
  167,531,946
  167,533,270
  167,533,764
  167,533,820
  167,534,072
  167,534,729
  167,536,197
  167,537,256
  167,537,781
  167,538,073
  167,538,209
  167,538,362
  167,538,440
  167,538,583
  167,538,711
  167,538,790
  167,538,908
  167,538,973
  167,539,041
  167,539,203
  167,539,971
  167,540,321
  167,541,127
  167,541,263
  167,541,269
  167,541,273
  167,541,356
  167,541,357
  167,541,568
  167,541,701
  167,541,703
  167,541,731
  167,541,853
  167,541,894
  167,542,459
  167,542,472
  167,542,856
  167,542,886
  167,542,905
  167,543,159
  167,543,444
  167,543,569
  167,544,044
  167,544,060
  167,544,744
  167,544,943
  167,545,289
  167,545,554
  167,546,068
  167,547,038
  167,549,103
  167,550,739
  167,550,742
  167,551,190
  167,551,200
  167,551,312
  167,551,634
  167,552,113
  167,552,315
  167,552,355
  167,552,374
  167,552,512
  167,552,933
  167,555,252
  167,555,325
  167,555,450
  167,555,483
  167,555,558
  167,557,609
  167,557,761
  167,559,857
  167,560,835
  167,560,971
  167,565,579
  167,566,024
  167,567,204
  167,571,102
  167,575,164
  167,575,630
  167,575,683
  167,575,763
  167,576,791
  167,578,475
  167,578,931
  167,579,595
  167,580,032
  167,580,153
  167,580,896
  167,583,505
  167,583,594
  167,583,909
  167,586,597
  167,587,172
  167,589,483
  167,590,127
  167,590,225
  167,590,327
  167,595,359
  167,596,456
  167,598,989
  167,600,912
  167,601,003
  167,601,306
  167,603,941
  167,605,106
  167,607,158
  167,608,237
  167,613,396
  167,613,418
  167,619,196
  167,620,004
  167,622,354
  167,624,622
  167,625,677
  167,627,072
  167,627,961
  167,629,022
  167,629,138
  167,629,752
  167,634,124
  167,634,154
  167,636,347
  167,639,842
  167,640,640
  167,641,518
  167,642,221
  167,642,834
  167,646,893
  167,650,026
  167,653,240
  167,653,621
  167,653,717
  167,659,052
  167,659,107
  167,659,140
  167,659,164
  167,659,172
  167,659,354
  167,661,392
  167,663,909
A
G
A
C
C
G
G
G
C
C
A
T
T
G
A
G
T
T
T
A
C
C
A
C
G
G
G
G/T
T
G
G
G
T
T
G
A
G
C
T
A
A
T
C
G
A
G
G
T
T
A
A
T
T
T
T
A
A
C
C
C
G
T
T
A
T
A
G
G
A
C
T
T
T
C
G
A
T
G
A
T
C
G
G
G
C
G
T
A
A
C
G
T
C
T
T
T
G
A
A
G
T
G
T
T
G
A
T
T
T
A
A
G
G
T
T
T
A
G
C
T
A
G
C
C
G
C
T
T
A
A
T
C
T
A
G
T
G
A
G
A
T
C
T
T
C
T
G
A
G
G
A
A
T
G
G
C
C
T
G
T
G
A
C
T
A
G
T
G
G
C
C
A
G
A
C
C
A
T
C
C
A
T
T
T
T
A
C
T
G
A
C
C
C
G
A
G
G
A
A
C
G
T
A
C
T
G
A
T
C
A/C
T
A
A
G
G
T
T
T
G
G
G
A
G
C
G
G
A
G
T
T
A
G
G
C
C
G
T
G
A
G
G
C
G
G
A
C
T
A
T
C
T
T
T
C
A
T
T
T
T
C
G
A
A
A
A
A
T
T
T
T
A
C
C
A
A
G
C
A
C
T
C
T
T
A
C
C
A
A
G
G
C
G
G
T
C
C
C
T
C
T
G
G
G
G
A
A
G
A
A
T
C
A
A
T
T
T
G
T
A
C
T
A
T
T
C
A
A
T
A
G
G
G
C
G
T
C
A
A
C
G
A
C
A
G
T
T
G/T
G
G
A
A
G
A
C
G
A
G
T
T
G
A
A
G
C
C
A
C
T
A
T
T
G
G
C
G
C
C
G
G
C