Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 286,209 (bp)   Positions: 512
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.004
.537
.026
.026
.0
.649
.194
.825
.0
.001
.005
.007
.001
.008
.002
.041
.906
.0
.003
.023
.012
.034
.108
.002
.0
.001
.049
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.017
.015
.003
.0
.0
.002
.006
.001
.0
.124
.0
.013
.013
.005
.004
.003
.002
.014
.002
.15
.171
.015
.002
--
.013
.001
--
--
.152
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.003
.004
.074
.0
.0
.001
.03
.0
.001
.001
.004
.001
.438
.001
.0
.0
.002
.001
.0
.014
.529
.094
.083
.452
.001
.0
.005
.0
.008
.001
.047
.0
.0
.007
--
.001
.007
.104
.005
.0
.005
.004
.016
--
--
.019
--
--
--
--
.0
.547
.035
.024
.496
.014
.0
.0
.044
.03
.277
.023
.0
.058
.002
.019
.054
.027
.0
.001
.0
.003
.0
.015
.001
.03
.006
.005
.001
.002
.0
.007
.001
.0
.001
.005
.0
.001
.002
.0
.002
.052
.0
.0
.0
.0
.0
.067
.008
.006
.0
.983
.227
.023
.034
.002
.073
.0
.002
.611
.001
.044
.011
--
--
.008
.0
.001
.08
.18
--
.0
.013
.113
.009
.319
.1
.008
.0
.002
.003
.003
.003
.002
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.079
.002
.001
.004
.0
.001
.068
.0
.004
.029
.002
.007
.086
.097
.004
.003
.0
.0
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.004
.005
.015
.04
.044
.082
.763
.001
.004
.004
.001
.009
.191
.056
.0
.002
.012
.031
.025
.244
.027
.096
.002
.036
.012
.006
.004
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
.081
.002
.017
.0
.0
.005
--
--
.0
.441
.012
.0
.01
.024
.032
.027
.027
.634
.008
.021
.019
.082
.761
.013
.969
.023
.012
.362
.034
.642
.861
.826
.0
.0
.026
.059
.087
.001
.004
.021
.001
.74
.0
.0
.001
.004
.001
.009
.054
1.0
.0
.0
.011
.004
.0
.002
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.012
.009
.001
.0
.98
.039
.953
.0
.028
.0
.0
.012
.629
.996
.628
.012
.979
.01
.0
.002
.001
--
.005
.008
.002
.004
.0
1.0
.0
.0
.017
.003
.001
.04
.004
.01
.001
.0
.017
.0
.0
.001
.003
.002
.0
.0
.001
.0
.013
.852
.0
.001
.0
.016
.0
.01
.001
.0
.044
.001
.003
.0
.049
.0
.012
.003
.0
.0
.998
.031
--
.0
.0
.0
.008
.0
.017
--
--
--
.006
.3
.916
.0
.003
.992
.007
.007
.014
.006
.13
.001
.008
.412
.001
.0
.012
.0
.004
.122
.086
.0
.008
.01
.0
.0
.009
.013
.001
.0
.002
.016
.082
.016
.008
.011
.001
.001
.002
.052
.004
.002
.004
.012
.967
.411
.005
.0
.0
.006
.0
.001
.013
.088
.001
.011
.0
.016
.023
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.067
.02
.106
.001
.319
.072
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
Ptprr
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Taf7l-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
G
C
T
A
T
T
C
A
G
G
A
A
G
G
A
T
G
T
G
T
T
T
A
G
G
T
T
C
G
T
A
T
C
A
G
G
C
T
T
C
T
G
C
C
A
A
A
T
G
C
C
A
C
A
T
G
G
A
A
T
T
C
G
G
T
T
T
A
T
T
C
A
T
A
T
G
A
A
G
G
A
G
G
T
T
A
G
G
G
G
A
T
G
A
A
A
A
T
G
G
A
C
T
T
C
C
C
G
G
C
G
T
A
A
G
C
T
T
A
C
G
G
C
C
T
A
G
A
A
A
T
T
G
C
C
T
C
G
A
A
G
T
C
G
G
T
C
G
C
A
G
C
G
C
G
C
A
T
G
G
C
C
G
C
C
A
C
A
A
C
C
C
G
T
A
G
A
T
G
T
C
C
C
T
A
T
G
T
C
A
T
T
T
A
G
C
C
C
G
C
T
A
G
A
T
G
G
G
T
C
A
C
G
T
A
C
C
A
C
A
C
T
T
C
C
G
T
T
G
A
C
G
G
G
A
A
A
T
G
T
A
G
T
G
G
G
A
G
A
G
A
G
C
G
G
G
G
G
T
A
A
C
G
C
C
T
A
C
C
C
A
C
T
G
A
C
G
C
T
T
A
A
A
G
A
T
G
C
G
A
T
G
G
T
T
C
A
T
A
A
G
C
A
G
A
G
G
C
A
T
G
G
C
A
G
G
C
G
A
G
A
G
G
T
C
T
C
C
A
G
A
T
C
G
T
C
C
T
T
C
C
T
A
T
C
G
A
T
G
T
G
G
C
G
T
G
A
A
A
G
G
G
A
G
G
A
C
T
A
C
G
C
T
G
G
C
T
T
T
T
G
T
T
G
C
T
G
C
C
C
T
A
G
A
T
G
T
C
G
C
A
A
C
T
C
G
C
A
G
C
T
C
T
G
T
A
A
T
G
A
A
G
T
G
A
A
G
T
C
G
G
A
T
A
G
A
G
A
C
T
C
T
C
C
T
C
C
A
T
G
A
T
G
G
A
G
A
T
A
G
T
A
T
G
T
A
G
T
A
A
T
T
A
A
T
T
T
G
A
C
A
G
A
A
C
A
A
A
A
A
G
G
A
A
G
A
G
G
C
G
G
C
A
C
C
A
C
T
T
A
  59,039,906
  59,040,217
  59,040,568
  59,040,799
  59,040,917
  59,041,594
  59,042,206
  59,042,223
  59,042,975
  59,043,209
  59,043,936
  59,044,021
  59,044,462
  59,044,507
  59,044,995
  59,045,630
  59,045,928
  59,046,187
  59,046,494
  59,046,906
  59,047,311
  59,047,720
  59,047,791
  59,047,841
  59,047,907
  59,047,918
  59,047,951
  59,048,079
  59,048,292
  59,048,377
  59,048,615
  59,048,637
  59,048,715
  59,048,843
  59,048,981
  59,049,261
  59,049,428
  59,049,737
  59,050,001
  59,050,126
  59,050,706
  59,050,740
  59,050,794
  59,050,854
  59,050,925
  59,051,064
  59,051,232
  59,051,509
  59,052,772
  59,052,901
  59,053,506
  59,053,935
  59,054,650
  59,056,276
  59,056,513
  59,056,810
  59,056,875
  59,056,876
  59,056,943
  59,056,958
  59,057,095
  59,057,784
  59,058,089
  59,058,109
  59,058,131
  59,058,524
  59,058,592
  59,059,538
  59,059,993
  59,060,235
  59,060,520
  59,060,575
  59,060,616
  59,061,517
  59,061,538
  59,062,205
  59,062,307
  59,062,354
  59,062,380
  59,062,596
  59,062,910
  59,063,136
  59,063,417
  59,063,488
  59,064,021
  59,064,056
  59,064,442
  59,064,703
  59,064,890
  59,065,462
  59,066,080
  59,066,177
  59,066,291
  59,066,545
  59,066,706
  59,067,103
  59,067,278
  59,067,307
  59,068,025
  59,068,054
  59,068,133
  59,068,471
  59,068,749
  59,069,037
  59,069,639
  59,070,365
  59,070,720
  59,070,781
  59,070,949
  59,071,192
  59,071,212
  59,071,246
  59,071,480
  59,071,718
  59,071,870
  59,071,948
  59,072,180
  59,072,388
  59,072,525
  59,072,774
  59,073,034
  59,073,063
  59,073,784
  59,073,860
  59,073,937
  59,074,058
  59,074,860
  59,074,996
  59,075,056
  59,075,418
  59,075,509
  59,076,295
  59,076,366
  59,076,419
  59,076,622
  59,077,414
  59,077,725
  59,078,548
  59,079,231
  59,079,478
  59,080,042
  59,080,319
  59,080,406
  59,082,475
  59,082,476
  59,082,633
  59,082,726
  59,082,932
  59,082,949
  59,083,061
  59,083,537
  59,083,575
  59,083,687
  59,084,001
  59,084,298
  59,084,329
  59,085,282
  59,085,379
  59,085,721
  59,085,929
  59,086,055
  59,086,557
  59,086,617
  59,086,995
  59,087,367
  59,087,585
  59,087,788
  59,087,923
  59,087,926
  59,087,975
  59,088,007
  59,088,032
  59,088,054
  59,088,098
  59,088,739
  59,088,808
  59,088,843
  59,088,988
  59,089,274
  59,089,275
  59,089,298
  59,089,667
  59,089,688
  59,089,779
  59,089,847
  59,089,993
  59,090,310
  59,091,043
  59,091,161
  59,091,662
  59,091,671
  59,092,206
  59,092,310
  59,092,361
  59,092,670
  59,093,306
  59,093,946
  59,094,023
  59,094,581
  59,095,071
  59,099,728
  59,100,076
  59,102,413
  59,103,094
  59,106,783
  59,108,096
  59,108,471
  59,109,888
  59,110,418
  59,113,384
  59,113,468
  59,113,564
  59,113,648
  59,113,656
  59,114,349
  59,114,473
  59,114,567
  59,114,859
  59,114,864
  59,115,317
  59,115,466
  59,115,974
  59,116,353
  59,116,846
  59,116,870
  59,116,990
  59,117,045
  59,117,163
  59,117,355
  59,117,509
  59,117,569
  59,119,440
  59,120,870
  59,122,273
  59,125,079
  59,125,117
  59,125,122
  59,125,155
  59,125,519
  59,126,262
  59,126,382
  59,126,433
  59,126,444
  59,128,054
  59,129,166
  59,130,674
  59,130,984
  59,131,594
  59,132,440
  59,132,617
  59,132,660
  59,132,770
  59,132,959
  59,133,602
  59,133,629
  59,133,716
  59,134,731
  59,135,251
  59,135,270
  59,135,886
  59,135,942
  59,135,967
  59,136,342
  59,136,668
  59,137,554
  59,139,155
  59,139,607
  59,139,944
  59,140,004
  59,140,213
  59,140,459
  59,140,612
  59,140,974
  59,141,091
  59,141,162
  59,141,547
  59,142,526
  59,142,783
  59,143,075
  59,143,209
  59,143,644
  59,143,686
  59,144,202
  59,144,500
  59,144,668
  59,145,230
  59,145,727
  59,147,065
  59,147,296
  59,149,980
  59,164,242
  59,181,790
  59,182,167
  59,182,279
  59,182,402
  59,182,486
  59,190,480
  59,190,984
  59,192,119
  59,192,165
  59,192,268
  59,193,226
  59,193,556
  59,193,700
  59,195,496
  59,195,575
  59,195,587
  59,195,920
  59,196,291
  59,196,482
  59,196,700
  59,196,701
  59,197,327
  59,197,344
  59,197,672
  59,198,000
  59,198,001
  59,198,109
  59,198,220
  59,198,698
  59,200,973
  59,205,575
  59,209,216
  59,210,195
  59,211,399
  59,211,427
  59,211,480
  59,211,485
  59,211,715
  59,211,850
  59,212,177
  59,212,230
  59,212,699
  59,214,666
  59,214,712
  59,214,870
  59,214,908
  59,215,017
  59,215,951
  59,215,962
  59,215,966
  59,216,131
  59,216,190
  59,216,323
  59,216,732
  59,217,352
  59,217,408
  59,217,522
  59,218,835
  59,218,923
  59,219,029
  59,219,073
  59,219,101
  59,219,231
  59,219,565
  59,220,044
  59,220,198
  59,220,313
  59,220,423
  59,220,448
  59,220,947
  59,221,112
  59,221,288
  59,221,305
  59,221,545
  59,221,876
  59,221,997
  59,222,213
  59,223,238
  59,223,257
  59,223,419
  59,223,585
  59,223,601
  59,224,048
  59,224,059
  59,224,663
  59,224,797
  59,224,883
  59,224,981
  59,225,152
  59,225,510
  59,227,201
  59,228,210
  59,228,698
  59,228,745
  59,228,746
  59,228,972
  59,229,095
  59,229,299
  59,229,764
  59,229,843
  59,229,937
  59,230,150
  59,230,280
  59,235,188
  59,235,969
  59,236,005
  59,236,380
  59,237,645
  59,237,945
  59,238,600
  59,238,601
  59,239,170
  59,239,344
  59,239,574
  59,239,714
  59,240,282
  59,246,965
  59,247,190
  59,247,802
  59,248,118
  59,248,400
  59,248,473
  59,248,500
  59,249,396
  59,250,062
  59,250,876
  59,250,936
  59,252,050
  59,252,957
  59,253,454
  59,253,641
  59,255,939
  59,256,803
  59,257,006
  59,258,290
  59,259,568
  59,260,750
  59,262,877
  59,264,925
  59,266,746
  59,266,866
  59,267,328
  59,267,519
  59,268,033
  59,268,475
  59,269,485
  59,269,580
  59,270,500
  59,270,760
  59,270,820
  59,271,530
  59,272,834
  59,273,439
  59,273,514
  59,273,564
  59,274,041
  59,274,402
  59,274,490
  59,274,746
  59,274,784
  59,274,949
  59,275,457
  59,275,587
  59,276,354
  59,276,554
  59,276,788
  59,276,980
  59,277,120
  59,277,555
  59,277,811
  59,277,820
  59,277,944
  59,277,984
  59,278,125
  59,278,207
  59,278,513
  59,278,677
  59,278,729
  59,278,937
  59,279,408
  59,279,854
  59,284,765
  59,284,773
  59,285,218
  59,285,255
  59,294,951
  59,298,975
  59,314,185
  59,316,736
  59,316,778
  59,317,188
  59,317,513
  59,317,515
  59,317,638
  59,318,056
  59,318,067
  59,318,380
  59,318,589
  59,318,724
  59,318,763
  59,318,868
  59,319,088
  59,319,198
  59,319,201
  59,319,691
  59,320,269
  59,320,548
  59,321,167
  59,321,388
  59,321,464
  59,322,090
  59,322,196
  59,322,282
  59,323,427
  59,323,766
  59,323,909
  59,324,473
  59,325,012
  59,325,317
  59,325,773
  59,325,781
G
C
A
T
G
G
C
C
T
T
T
A
G
G
A
A
G
C
A
G
A
A
C
C
T
A
A
C
G
A
A
C
C
A
T
C
A
A
T
G
G
T
A
A
T
T
G
T
G
G
A
T
G
G
T
C
C
T
C
G
G
C
C
T
A
A
C
A
C
G
C
G
T
G
C
C
C
T
G
G
A
A
G
T
A
C
G
G
A
A
A
T
C
C
T
C
C
G
C
A
A
A
G
T
C
C
T
A
T
A
A
G
T
C
G
G
A
T
C
C
G
G
T
A
G
T
A
T
A
G
C
T
C
T/C
A
T
T
C
G
C
G
G
A
C
T
A
C
C
T
A
T
G
A
T
A
T
A
T
T
C
A
A
A
T
A
T
T
G
T
T
G
A
T
T
A
C
C
C
C
A
A
C
T
T
T
C
C
C
C
T/C
C/G
G
C
C
C
G
A
G
C/T
T
A
T
G
G
A
G
C
A
A
T
C
T
C
T
A
C
G
T
T
G
T
C
T
C
C
T
A
A
C
C
A
G
T
A
A
A
G
G
T
C
A
C
G
A
C
A
C
C
C
A
A/G
C
G
G/A
C/T
G/A
G/A
C
A
T
G
C
G
T
A
T
T
G
G
G
T
G
G
T
C
T
G
T
A
T
C
C
G
G
C
C
A/C
A
A
T
C
G
T/G
C
A
C
C
T
G
G
C
C
A
C/G
G
A
G
A
T
T
T
A
A
A
G
G
A
G/A
T
T
G
T
T
A
A
A
T
C
T
T
C
A
G
G
T
A
C
T
G
C
C
T
T
G
G
C
T
A
G
C
A
G
A
T
T
A
A
A
G
G
G
T
T
A
G
T
A
G
G
C
G
T
A
G
C
T
A
T
G
C
A
A
A
G
C
A
T
C
A
T
T
T
A
G
A
G
C
A
G
A
A
A
G
T
A
C
T
A
T
G
A
T
C
T
C
A
C
G
C
C
A
G
G
T
C
T
G
T
A
C
G
G/A
A
G
C
G
T
C
A
G
T
A
T
G
G
T
C
A
T
C
C
A
G
C
T
A
G
A
G
G
G
C
C
G
C
A
C
G
T
C
G
G
A
C
G
G
T/G
C
C
C
G
T
G
A
G
A/G
C/T
C
G
C
G
G
A
A
G
C
C
C
A
A
A
A
A
A
G
T
A
G
T
A
C
T