Variant Visualizer (Variants)

Submit Data | Help | Video Tutorials | News | Publications | Download | REST API | Citing RGD | Contact

Sequence Annotation

Assembly Rnor_6.0

Conservation

Genes ( + )

Genes ( + )

Genes ( - )

Rnor 6.0

ACI/EurMcwi (MCW)

.005	.191	.0	.025	.0	.0	.032	.009	.069	.003	.002	.006	.001	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.008	.003	.047	.006	.001	.001	.014	.004	.0	.0	.775	.001	.119	.039	.021	.001	.0	.007	.0	.001	.007	--	.062	.001	.018	.002	.0	.001	.666	.001	.08	.038	.077	.134	.0	.001	.0	.784	.995	.013	.081	.995	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.439	.328	.015	.275	.268	.001	.214	.07	.035	.818	.984	.651	.054	.083	.025	.026	.0	.01	.001	.0	.002	.529	.055	.002	.577	.01	.007	.023	.255	.0	.035	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.044	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.002	.013	.001	.017	.004	.154	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.055	.477	--	--	--	--	--	--	.053	.009	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.866	1.0	.992	.991	.989	1.0	.997	.989	.415	.031	.92	.998	.001	.004	.001	.48	.501	.749	.004	.444	--	--	--	--	--	--	--	.014	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.014	.004	.039	.056	.0	.045	.027	.0	.016	.127	.498	.181	.622	.043	.304	.037	.05	.008	.692	.008	.035	.003	.031	.013	.017	.04	.103	.06	.249	.0	.003	--	--	--	--	--	.844	1.0	.022	.245	.162	.017	--	.086	.0	.0	.01	.0	.002	.012	.025	.006	.249	.0	.0	.034	.0	.03	.001	.159	.0	.0	.001	.003	.054	.013	.206	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.002	.001	.709	.026	.018	.002	.008	.001	.052	.007	.013	.001	.005	.0	.056	.014	.147	.0	.01	.014	.009	.876	.015	.022	.016	.01	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.017	.142	--	.008	.005	.885	.001	.001	.459	.01	.002	.002	.006	.0	.132	.03	.103	.204	.767	.002	.032	.01	.021	--	.007	.01	.144	.0	.003	.002	.0	.0	.0	.02	.125	.003	.001	.001	.002	.157	.001	.0	.013	.062	.176	.001	.007	.046	.007	.003	.006	.014	.2	.003	.002	--	--	--	--	--	--	--	.002	.004	.882	.786	.046	.01	.771	.0	.018	1.0	.0	.002	.075	.001	.002	.0	.004	.0	.008	.002	.013	.0
Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl										Nubpl
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
T	C	A	G	G	T	T	G	G	G	T	A	T	C	C	T	G	C	C	A	G	A	T	A	T	C	A	A	T	G	A	C	G	T	A	T	T	G	G	C	A	T	A	T	C	T	T	C	G	A	C	T	C	T	T	G	A	G	A	T	T	C	G	G	C	A	A	C	G	C	T	G	T	T	C	C	T	A	G	G	C	C	G	A	G	T	T	C	C	G	A	A	A	C	G	G	T	C	A	C	A	G	A	T	G	A	C	A	T	G	G	G	C	A	A	T	A	C	C	A	T	A	A	G	C	C	A	C	C	C	T	C	T	T	C	C	T	A	T	T	G	G	G	T	C	T	C	T	C	T	G	T	C	T	T	A	A	A	G	C	G	G	C	C	G	T	T	A	T	A	T	T	C	G	T	T	C	G	A	A	C	A	A	A	G	G	C	A	T	G	C	G	T	C	C	C	T	G	G	A	C	C	G	T	A	C	G	T	C	T	G	C	A	A	T	G	A	G	T	T	G	T	G	G	G	C	G	G	A	A	G	G	G	A	A	G	G	A	G	G	G	C	G	T	A	C	A	T	A	G	C	C	G	G	A	A	G	G	G	C	T	T	C	G	G	T	T	A	C	C	T	T	C	T	T	C	C	A	C	G	G	T	C	G	A	T	T	A	C	A	T	T	A	T	G	C	G	T	C	C	C	G	T	T	G	G	G	T	A	C	C	G	G	T	G	C	G	G	C	A	G	A	G	T	C	A	C	G	G	A	T	A	A	A	A	T	A	T	T	T	G	T	G	A	A	T	T	G	T	T	A	T	T	G	G	G	T	T	A	T	A	T	A	T	C	C	C	C	T	A	A	A	C	C	C	A	A	T	G	G	G	A	T	C	G	G	C	C	T	C	G	C	T	C	A	A	G	G	A	A	A	C	C	G	G	C	A	T	A	T	G	G	A	A	G	G	A	A	C	A	C	A	A	A	G	G	T	G	G	A	C	G	G	A	G	G	C	G	T	T	A	G	A	T	A	T	A	G	T	G	A	C	C	T	C	A	G	C	G	T	T	C	G	A	G	T	A	C	G	G	T	A	G	C
72,892,741	72,893,780	72,893,943	72,894,551	72,894,655	72,894,735	72,895,142	72,895,194	72,895,585	72,896,295	72,897,071	72,897,330	72,897,629	72,897,854	72,898,076	72,898,128	72,898,129	72,898,134	72,898,220	72,898,221	72,898,302	72,898,363	72,898,446	72,898,646	72,898,789	72,898,875	72,898,969	72,899,315	72,899,480	72,899,543	72,900,284	72,900,349	72,900,437	72,901,167	72,902,400	72,902,515	72,902,982	72,903,259	72,903,796	72,904,044	72,904,783	72,905,235	72,905,725	72,906,940	72,907,446	72,908,359	72,909,755	72,910,362	72,910,396	72,910,710	72,910,728	72,911,037	72,912,085	72,912,486	72,916,545	72,917,442	72,918,551	72,922,485	72,922,686	72,922,996	72,924,390	72,929,655	72,929,687	72,930,369	72,930,395	72,931,939	72,937,443	72,937,864	72,937,930	72,939,133	72,940,159	72,940,517	72,940,652	72,940,660	72,940,722	72,940,753	72,940,756	72,940,780	72,940,837	72,940,905	72,941,027	72,941,031	72,941,047	72,941,062	72,941,064	72,941,080	72,941,142	72,941,195	72,941,288	72,941,307	72,941,316	72,941,370	72,941,396	72,941,483	72,941,540	72,941,654	72,941,660	72,941,685	72,941,702	72,941,710	72,941,731	72,941,737	72,941,748	72,941,896	72,941,902	72,942,081	72,943,044	72,944,657	72,944,844	72,945,324	72,945,382	72,945,563	72,946,514	72,947,765	72,947,999	72,949,205	72,950,619	72,953,402	72,953,403	72,953,631	72,953,659	72,953,713	72,953,786	72,953,983	72,953,992	72,954,006	72,954,093	72,954,194	72,954,303	72,954,333	72,954,565	72,954,600	72,954,635	72,954,663	72,955,009	72,955,080	72,955,176	72,955,464	72,955,467	72,955,472	72,955,473	72,955,541	72,955,542	72,955,544	72,956,537	72,956,908	72,957,182	72,957,223	72,957,441	72,957,493	72,957,559	72,957,582	72,957,666	72,957,816	72,958,020	72,958,094	72,958,111	72,958,173	72,958,220	72,958,243	72,958,293	72,958,311	72,958,539	72,958,542	72,958,546	72,959,317	72,959,611	72,959,807	72,959,847	72,959,883	72,959,898	72,959,900	72,960,041	72,960,567	72,960,725	72,961,182	72,961,479	72,961,496	72,961,696	72,961,708	72,961,818	72,961,825	72,962,144	72,962,699	72,962,945	72,963,566	72,963,649	72,963,719	72,963,782	72,963,901	72,963,964	72,963,965	72,965,568	72,965,671	72,965,673	72,965,731	72,965,749	72,965,755	72,965,775	72,966,094	72,966,226	72,966,311	72,966,314	72,966,342	72,966,393	72,966,422	72,966,425	72,966,453	72,966,518	72,966,530	72,966,659	72,966,669	72,966,918	72,967,190	72,967,996	72,968,158	72,968,184	72,968,955	72,969,144	72,969,673	72,969,871	72,970,219	72,970,289	72,970,293	72,970,297	72,970,323	72,970,391	72,970,545	72,970,633	72,970,671	72,970,705	72,970,719	72,970,726	72,970,778	72,970,779	72,971,080	72,971,182	72,971,188	72,971,197	72,971,212	72,971,234	72,971,242	72,971,243	72,971,257	72,971,277	72,971,304	72,971,319	72,971,362	72,971,409	72,971,419	72,971,480	72,981,396	72,981,419	72,981,562	72,981,643	72,981,649	72,981,765	72,981,771	72,982,951	72,983,972	72,984,104	72,984,264	72,984,312	72,984,416	72,985,273	72,986,755	72,986,916	72,987,248	72,987,291	72,987,848	72,988,051	72,988,490	72,989,490	72,990,466	72,991,270	72,992,401	72,992,408	72,992,766	72,993,225	72,993,674	72,994,199	72,994,218	72,994,246	72,994,410	72,994,420	72,994,539	72,994,805	72,996,538	72,996,774	72,997,726	72,997,795	72,997,799	72,997,828	72,998,447	72,998,752	72,999,050	72,999,055	72,999,062	72,999,131	72,999,140	72,999,158	72,999,511	73,002,040	73,002,293	73,004,139	73,004,828	73,005,239	73,005,926	73,006,218	73,010,131	73,011,672	73,019,103	73,020,056	73,020,274	73,020,492	73,020,842	73,021,318	73,024,175	73,024,204	73,028,146	73,028,662	73,028,834	73,028,935	73,029,472	73,029,835	73,034,627	73,035,570	73,036,613	73,036,620	73,037,045	73,037,501	73,037,616	73,037,855	73,038,440	73,047,510	73,047,789	73,047,852	73,048,227	73,048,787	73,048,828	73,048,927	73,050,498	73,050,540	73,051,519	73,052,795	73,053,856	73,055,514	73,055,552	73,056,007	73,056,038	73,056,724	73,057,141	73,057,216	73,057,743	73,057,801	73,057,892	73,058,207	73,060,288	73,060,396	73,060,537	73,060,670	73,060,886	73,061,339	73,061,954	73,062,134	73,062,647	73,063,384	73,066,264	73,066,818	73,067,160	73,067,183	73,068,011	73,068,239	73,070,011	73,070,431	73,071,256	73,071,425	73,072,728	73,074,221	73,074,582	73,074,608	73,074,954	73,075,440	73,075,451	73,075,456	73,075,467	73,075,471	73,075,534	73,075,802	73,076,006	73,076,399	73,077,134	73,078,117	73,078,685	73,079,129	73,081,140	73,081,189	73,081,300	73,090,263	73,090,612	73,090,655	73,090,656	73,090,762	73,090,810	73,090,945	73,090,961	73,091,541	73,092,857	73,094,395	73,096,455	73,098,515	73,098,733	73,098,783	73,099,533	73,100,670	73,100,745	73,100,913	73,101,779	73,102,101	73,103,107	73,105,238	73,107,625	73,107,789	73,108,253	73,108,295	73,109,744	73,109,786	73,110,695	73,110,711	73,111,219	73,111,514	73,112,410	73,112,437	73,112,698	73,115,232	73,115,525	73,115,703	73,116,778	73,118,057	73,119,959	73,120,732	73,120,738	73,120,769	73,120,789	73,121,016	73,124,945	73,125,220	73,125,244	73,125,587	73,126,033	73,126,337	73,126,598	73,127,404	73,127,416	73,129,323	73,129,531	73,129,541	73,131,486	73,131,773	73,131,936	73,132,961	73,137,984	73,138,246	73,138,461	73,139,313	73,140,953	73,144,118	73,144,290	73,144,577	73,145,517	73,145,690	73,147,059	73,147,367	73,147,448
C	T	C	A	C	G	G	A	A	C	C	C	C	T	C/T	T/C	G/A	C/A	C/T	A/G	A	T	C	G	C	A	G	G	C	C	T	G	T	C	G	C	C	C	T	G	T	C	G	C	A	C	C	A	A	G	T	C	A	C	T/C	T	C	A	G	C	C	T	A	A	T	G	G	T	A	C/T	T/C	G/A	T/C	T/C	C/T	C/A	T/C	A/C	G/A	G/A	C/G	C/T	G/A	A/C	G/T	T/C	T/A	C/T	C/G	G/A	A/G	A/G	A/T	C/T	G/A	G/A	T/A	C/A	A/T	C/A	A/C	G/A	A/C	T/A	G/A	T	G	C	G	T	A	C	A	G	C	A	G	T	T	G	C	T	G	G/C	C/G	C/T	A/G	A	T	T	A	T	C	C	T	G	T/C	G	A	C	A	C	A	C	T	G	T	C	T	C	A	C	T	C	C	T	C	G	A	T	A	A	T	G	A	A	C	G	C	C	C	A	T	A	C	A	T	A	G	G	G	C	G	G	A	A	A	C	T/C	T	T	T	C	C/G	C/T	C/G	T/A	G/A	G/C	G	A	C/T	G/A	T/C	G	C/T	G/A	C	T	C	A	A	G	G	C	C	G	A	G	C	T	C	G/A	G/A	A	C/G	T	A	G	G	A	A	C	G	G	A	G/A	A/G	G/A	G/A	G/A	C/T	G/T	T/G	A/C	C/A	A/G	C	G	A	T	C/G	G/C	G/T	A/G	A/G	G/C	G/C	T	T	C	C	C/G	T	T	C	G	C	T	T	C	C	A	A	C	T	T	G	T	A	A	C	G	C	T	A	A	G	A	A/C	T/C	T/C	C	C	A	C/A	G/A	T/C	C/A	C/A	C/A	A	G	C	A	A	A	C	G	G	T	T	A	C	A	A	T	A	T	G	A	G	T	C	T	T	T	G/A	G/A	A/G	C	A/T	T	C	G	C	G	A	C	G	A	C	A	C	G	C	C	A	C	C	G	C	C	A	A	A	A	A	G	A	G	C	G	A	A	A	T	A	G	G	G	C	A	G	G	G	C	C	G/A	A	T	G	T/G	C/T	G/C	G/A	C/T	T	C	T	C	G	C	T	G	G	A	A	C	G	G	T	G	A	A	T	T	C	G	G	C	T	G	G	T	T	A/T	G	A	G	G	G	G	C	A	A	C	G/A	A	G	T	C	A	G	A	A	T	A	C	C	G	C	T	G	C	C	T	A	A	A	G	G	T	C	A	G	A	T	A	C	A	T	A	G	A	G	G	T	C	A	A	G	A	A