Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 126,131 (bp)   Positions: 359
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.042
.001
.005
.0
.011
.002
.015
--
.02
.186
.003
.079
.0
.023
.278
.002
.006
.001
.0
.001
.007
.001
.0
.233
.004
.001
.016
.005
.031
.037
.003
.033
--
--
.059
.073
.001
.001
.009
.005
.019
.003
.011
.001
.008
.026
.0
.013
.0
.0
.954
--
--
.135
.34
.001
.274
.045
.002
.001
.0
.023
.038
.007
.0
.009
.003
.002
.001
.002
.011
.001
.008
.001
.002
.0
.001
.001
.0
.002
.003
.011
.012
.0
.97
.002
.025
.01
.273
.047
.292
.002
.006
.0
.0
.001
.0
.01
.004
.004
.003
.023
.0
.015
.001
.006
.0
.083
.054
.39
.011
.001
.184
.118
.905
.0
.0
.064
.005
.001
.001
.178
.637
.123
.001
.0
.002
.076
.018
.001
.009
.022
.008
.0
.003
.0
.915
.018
.001
.0
.0
.002
.031
.002
.001
.0
.001
.998
1.0
.75
.002
.0
.952
.991
.821
.002
.001
.004
.0
.003
.001
.886
--
.002
.001
.004
.014
.027
.037
.0
.0
.012
.033
.004
.956
.0
.023
.001
.005
.0
.002
.192
.0
.029
--
--
.001
.0
.005
.001
.021
.021
.006
.0
.002
.0
.03
.0
.0
.001
.003
.008
.162
.007
.001
.001
.007
.002
.003
.0
.0
.023
.012
.83
.931
.002
.0
.0
.017
.0
.0
.0
.004
.001
.0
.019
--
.001
.001
.0
.974
.001
.52
.0
.001
.0
.888
.003
.002
.115
.0
.0
.003
.001
.011
.014
.0
.005
.0
.0
.0
.001
.014
.002
.004
.043
.002
.0
.0
.001
.944
.0
.005
.0
.0
.0
.016
.001
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.056
.004
.037
.009
.03
.0
.0
.003
.001
.0
.009
.0
.0
.348
.0
.103
.0
.03
.0
.002
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.015
.005
.0
.0
.0
.0
.003
.001
.0
.001
.01
.001
.012
.026
.054
.006
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.002
.001
.0
.001
.001
.116
.0
.001
.001
.793
.0
.0
.0
.971
.003
.009
.117
.0
.0
.006
--
--
.001
.001
.007
.049
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
Itsn1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
A
-
G
A
C
C
C
C
C
A
A
A
T
T
C
A
T
A
C
-
A
T
T
G
A
G
A
G
7
G
T
G
T
T
A
T
8
G
G
C
G
C
G
G
G
T
A
G
G
-
G
T
G
C
T
A
C
A
G
T
T
C
G
A
-
G
T
A
T
G
A
C
G
T
T
C
A
A
A
C
T
C
-
-
G
T
-
C
G
-
T
T
C
-
T
G
A
A
T
A
T
A
-
A
A
A
C
A
T
A
G
T
G
T
A
A
T
T
A
G
G
T
A
A
G
C
A
C
A
-
8
A
T
A
G
A
4
4
T
A
T
8
A
A
C
A
A
G
C
A
G
T
C
-
T
A
-
T
C
A
C
121
8
G
C
G
C
C
A
A
T
G
G
-
-
-
C
G
A
C
G
G
T
-
-
G
-
A
T
A
A
C
A
C
G
T
A
C
G
A
C
C
T
G
A
G
A
A
A
G
G
T
4
T
T
A
G
C
A
C
A
A
A
T
T
-
T
T
T
A
A
T
C
A
C
G
T
G
A
C
T
T
T
C
C
C
G
A
C
C
A
G
A
14
-
2
A
C
C
A
11
T
T
C
G
G
C
A
T
C
T
C
T
G
C
T
A
G
A
C
A
T
G
A
A
5
23
G
A
C
A
C
T
A
-
T
T
A
T
G
A
C
A
A
A
G
T
A
T
T
G
T
T
A
G
T
T
G
G
A
G
A
A
3
3
C
C
2
2
17
C
C
C
5
T
G
A
C
T
G
G
G
C
T
T
T
C
G
T
A
4
C
G
-
2
-
C
G
  31,944,902
  31,945,087
  31,945,478
  31,945,528
  31,946,215
  31,947,151
  31,948,117
  31,950,118
  31,950,921
  31,951,047
  31,951,568
  31,951,597
  31,952,860
  31,953,336
  31,953,385
  31,953,767
  31,953,881
  31,954,492
  31,954,971
  31,955,399
  31,955,487
  31,956,354
  31,956,460
  31,956,637
  31,956,839
  31,957,571
  31,957,747
  31,958,040
  31,958,405
  31,958,778
  31,958,792
  31,959,278
  31,959,331
  31,959,493
  31,959,608
  31,959,705
  31,959,764
  31,959,767
  31,960,043
  31,960,114
  31,960,132
  31,960,227
  31,961,441
  31,961,908
  31,961,979
  31,962,248
  31,962,694
  31,963,026
  31,963,695
  31,963,818
  31,964,052
  31,964,076
  31,964,094
  31,964,241
  31,964,337
  31,964,755
  31,964,778
  31,964,991
  31,965,274
  31,966,046
  31,966,108
  31,966,179
  31,966,194
  31,966,304
  31,966,809
  31,966,915
  31,966,970
  31,966,997
  31,967,467
  31,967,612
  31,967,660
  31,968,077
  31,968,173
  31,969,400
  31,969,413
  31,969,624
  31,969,948
  31,970,003
  31,970,292
  31,970,370
  31,970,581
  31,970,714
  31,970,860
  31,970,897
  31,971,098
  31,971,154
  31,971,698
  31,971,707
  31,971,934
  31,972,381
  31,972,436
  31,973,069
  31,974,298
  31,974,838
  31,974,905
  31,974,944
  31,974,967
  31,975,081
  31,975,146
  31,975,307
  31,975,317
  31,975,486
  31,975,502
  31,975,855
  31,976,795
  31,977,278
  31,977,736
  31,978,065
  31,978,674
  31,978,782
  31,978,995
  31,979,065
  31,979,100
  31,979,563
  31,979,727
  31,979,953
  31,980,709
  31,980,809
  31,980,990
  31,981,199
  31,981,347
  31,981,364
  31,981,924
  31,982,889
  31,983,010
  31,983,200
  31,983,352
  31,983,782
  31,983,806
  31,984,191
  31,984,505
  31,984,788
  31,984,889
  31,985,509
  31,985,639
  31,985,725
  31,986,283
  31,986,609
  31,987,656
  31,987,853
  31,987,887
  31,988,611
  31,988,830
  31,989,047
  31,989,123
  31,989,369
  31,989,770
  31,990,267
  31,990,290
  31,990,331
  31,990,549
  31,990,713
  31,990,850
  31,990,856
  31,990,893
  31,991,066
  31,991,195
  31,991,348
  31,991,664
  31,991,676
  31,991,751
  31,991,888
  31,992,087
  31,992,326
  31,992,479
  31,992,706
  31,993,174
  31,994,315
  31,994,426
  31,994,489
  31,994,662
  31,994,968
  31,995,218
  31,995,496
  31,995,568
  31,996,357
  31,996,439
  31,996,537
  31,996,670
  31,997,306
  31,997,727
  31,998,178
  31,998,240
  31,998,249
  31,998,342
  31,998,352
  31,999,957
  31,999,990
  32,000,184
  32,000,252
  32,000,305
  32,000,306
  32,000,449
  32,001,319
  32,001,743
  32,002,116
  32,002,965
  32,003,607
  32,003,645
  32,003,650
  32,004,595
  32,004,780
  32,005,157
  32,005,758
  32,006,098
  32,006,269
  32,006,480
  32,006,491
  32,007,176
  32,007,571
  32,008,600
  32,009,964
  32,010,314
  32,010,933
  32,010,980
  32,011,887
  32,011,911
  32,012,240
  32,012,588
  32,012,729
  32,013,455
  32,013,617
  32,014,447
  32,014,896
  32,015,171
  32,015,291
  32,016,395
  32,016,802
  32,017,027
  32,017,302
  32,017,455
  32,017,747
  32,019,091
  32,020,494
  32,020,813
  32,021,135
  32,021,481
  32,021,926
  32,022,137
  32,023,772
  32,035,708
  32,036,274
  32,036,465
  32,036,565
  32,036,571
  32,039,610
  32,039,845
  32,040,772
  32,040,876
  32,041,632
  32,043,697
  32,045,637
  32,045,844
  32,046,771
  32,046,998
  32,047,222
  32,047,231
  32,048,592
  32,049,430
  32,049,499
  32,049,753
  32,050,260
  32,050,467
  32,050,647
  32,050,730
  32,050,747
  32,050,832
  32,050,956
  32,050,962
  32,051,377
  32,051,516
  32,051,525
  32,051,527
  32,051,575
  32,051,576
  32,051,822
  32,051,833
  32,052,175
  32,052,462
  32,052,600
  32,052,663
  32,053,026
  32,053,043
  32,053,642
  32,053,805
  32,053,837
  32,054,032
  32,054,038
  32,054,426
  32,054,625
  32,054,964
  32,055,265
  32,055,460
  32,056,075
  32,056,228
  32,056,300
  32,056,361
  32,056,376
  32,056,423
  32,056,428
  32,056,583
  32,056,637
  32,056,642
  32,056,657
  32,056,708
  32,056,737
  32,056,784
  32,056,798
  32,056,850
  32,056,858
  32,057,003
  32,057,007
  32,057,084
  32,057,103
  32,057,279
  32,057,316
  32,058,223
  32,058,547
  32,058,847
  32,059,037
  32,059,129
  32,060,044
  32,060,860
  32,060,949
  32,061,214
  32,061,225
  32,061,242
  32,061,246
  32,061,251
  32,061,254
  32,061,257
  32,061,276
  32,061,278
  32,061,290
  32,061,551
  32,061,574
  32,061,697
  32,062,093
  32,062,105
  32,063,020
  32,063,282
  32,063,500
  32,064,306
  32,064,502
  32,064,752
  32,064,860
  32,065,101
  32,066,032
  32,066,053
  32,066,201
  32,066,214
  32,066,597
  32,067,066
  32,067,954
  32,068,243
  32,068,760
  32,068,836
  32,068,860
  32,068,900
T
G
-/T
T
G
G
G
T
T
T
G
G
G
-
C
T
G
C
G
T
20
G
C
C
A
G
A
G
T
7/-
A
G
A
C
C
C
C
-
A
-
T
A
T
A
A
A
G
-
A
T
8
T
-
A
T
C
G
A
T
C
C
A
T
-
C
4
A
C
T
C
A
T
T
A
C
C
T
G
G
C
T
C
A
8
3
A
C
2
T
T
T
C
G
T
28
A
A
C
T
G
G
G
G
3
-
G
C
T
G
-
T
A
C
A
A
G
G
G
C
G
C
A
A
G
-
A
T
G
T
G
25
-
G
C
G
A
G
-
-
G
T
C
-
G
G
T
T
T
A
G
T
A
C
T
A
C
G
T
C
T
G
T
121/-
-
A
A
-
T
T
G
G
A
C
A
G
C/C
T
T
A
G
T
A
A
C
G
3
A
2
-
C
G
T
G
G
T
A
G
T
T
A
G
T
T
C
A
G
A
G
G
G
A
A
C
-
G
G
G
A
T
G
T
G
G
G
A
C
3
C
C
C
G
G
G
T
G
T
C
C
C
G
A
G
C
-
T
T
T
A
G
T
T
G
A
G
-
A
-
T
T
T
G
-
C
C
T
A
C
T
C
C
T
C
T
C
A
T
C
G
A
G
T
G
C
A
G
T
-
-
A
G
A
G
T
G
G
G
A
C
G
A
A
G
T
G
T
G
A
C
T
C
C
A
A
C
G
A
G
C
A
A
G
T
G
T
-
-
T
T
-
-
-
T
T
T
-
G
T
G
T
C
A
A
A
A
A
G
C
T
T
C
G
-
T
A
2
-
2
A
A