Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 133,888 (bp)   Positions: 269
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.999
.111
.141
.006
.03
.006
.0
.0
.0
.009
.011
.021
.003
.0
.031
.002
.007
.004
.039
.002
.614
--
.001
.0
.0
.039
.017
.018
.0
.021
.027
.052
.012
.003
--
.001
--
--
.002
.001
.01
.002
.062
.01
.001
.003
.759
.002
.944
.482
.634
.931
.933
.642
.499
.595
.505
.008
.183
.003
.066
.659
.326
.037
.422
.373
.057
.001
--
--
--
--
.231
--
--
.006
.027
.06
.0
.006
.005
.09
.99
.0
.005
.016
.894
.965
.997
.995
.027
.001
.128
.111
.002
.075
.11
.05
.004
.026
.006
.307
.002
.406
--
.049
.084
.044
.019
--
.078
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.022
.05
.156
.004
.001
1.0
.057
.086
.009
.045
.697
.033
.005
.051
.073
--
--
--
--
--
.02
.045
.198
.01
.233
.023
.007
.001
.208
.009
.01
.005
.003
--
.0
.008
.023
.402
.002
.028
.202
.782
.005
.011
.001
.022
.001
.028
.013
.009
.005
.003
.018
.11
.848
.081
.007
.005
.012
.017
.024
.332
.005
.127
.349
.141
.002
.021
.156
.159
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.442
.001
.169
.002
.001
.167
.064
.989
.038
.921
.856
.308
.068
.008
.02
.569
.984
.979
.423
.08
.019
.04
.068
.003
.028
.004
.0
.005
.098
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
6
-
C
T
C
A
A
C
C
G
T
T
G
2
C
C
A
T
A
T
-
A
C
4
G
G
G
-
C
A
-
A
G
2
6
C
C
8
A
A
G
C
C
G
G
A
T
G
2
4
8
7
19
16
15
7
18
T
-
C
C
C
A
G
G
8
-
A
A
T
C
G
C
T
2
A
C
A
T
A
A
G
G
C
A
T
C
T
A
T
C
T
A
G
C
A
C
G
T
C
-
18
C
8
-
A
A
G
G
G
-
-
G
C
-
T
2
-
T
T
C
C
G
T
T
C
-
-
T
-
-
G
A
4
A
A
A
-
2
T
C
A
G
T
2
C
T
G
T
2
T
8
2
G
T
G
T
T
G
G
A
C
C
A
-
-
T
G
-
A
A
C
G
-
A
G
A
G
C
-
T
A
-
A
A
C
G
G
G
-
-
G
A
A
C
G
C
G
A
-
A
4
T
G
T
G
G
T
C
G
T
G
T
A
A
C
A
A
A
C
A
-
-
T
A
G
-
C
A
G
G
C
G
A
G
C
A
A
C
-
A
-
A
C
G
C
G
3
T
-
C
G
C
C
G
-
-
G
T
T
A
T
A
-
-
C
-
3
C
  1,689,068
  1,690,158
  1,690,177
  1,690,565
  1,692,009
  1,692,224
  1,693,184
  1,693,234
  1,693,323
  1,693,354
  1,693,963
  1,694,338
  1,694,634
  1,694,648
  1,694,773
  1,695,131
  1,695,246
  1,697,810
  1,697,958
  1,698,607
  1,699,377
  1,700,266
  1,700,443
  1,702,296
  1,702,975
  1,703,729
  1,704,457
  1,704,612
  1,705,686
  1,706,048
  1,706,053
  1,706,058
  1,706,071
  1,706,088
  1,706,091
  1,706,448
  1,706,710
  1,706,723
  1,707,369
  1,708,310
  1,709,607
  1,709,946
  1,709,986
  1,710,168
  1,710,802
  1,710,865
  1,711,022
  1,711,899
  1,711,956
  1,712,133
  1,712,140
  1,712,150
  1,712,158
  1,712,180
  1,712,199
  1,712,216
  1,712,225
  1,712,279
  1,712,479
  1,712,601
  1,712,730
  1,713,050
  1,713,655
  1,713,852
  1,714,561
  1,714,566
  1,714,695
  1,714,718
  1,714,721
  1,714,736
  1,714,738
  1,714,757
  1,714,878
  1,715,025
  1,715,071
  1,715,281
  1,715,302
  1,715,438
  1,715,662
  1,716,351
  1,716,590
  1,716,769
  1,716,909
  1,717,243
  1,717,827
  1,718,120
  1,718,986
  1,719,046
  1,719,367
  1,719,713
  1,720,032
  1,720,077
  1,721,284
  1,721,448
  1,721,487
  1,721,500
  1,721,521
  1,721,571
  1,721,726
  1,722,057
  1,724,741
  1,726,250
  1,728,716
  1,729,711
  1,732,050
  1,732,355
  1,732,526
  1,732,905
  1,733,033
  1,733,253
  1,734,437
  1,734,858
  1,734,883
  1,736,442
  1,736,585
  1,736,647
  1,736,660
  1,736,675
  1,736,722
  1,736,830
  1,736,836
  1,736,872
  1,736,890
  1,736,922
  1,737,020
  1,737,050
  1,737,064
  1,737,065
  1,737,078
  1,737,082
  1,737,148
  1,737,861
  1,737,896
  1,737,899
  1,737,947
  1,738,678
  1,739,340
  1,739,950
  1,740,408
  1,740,708
  1,741,049
  1,743,556
  1,743,801
  1,744,322
  1,744,458
  1,744,633
  1,744,898
  1,745,108
  1,747,711
  1,748,428
  1,748,658
  1,749,342
  1,749,492
  1,749,517
  1,749,520
  1,749,521
  1,749,899
  1,751,087
  1,751,127
  1,751,211
  1,751,745
  1,754,425
  1,757,100
  1,757,279
  1,758,563
  1,758,613
  1,758,629
  1,758,830
  1,758,995
  1,759,613
  1,760,746
  1,761,533
  1,762,526
  1,762,751
  1,762,834
  1,763,256
  1,763,333
  1,764,330
  1,765,037
  1,765,069
  1,767,232
  1,767,316
  1,768,110
  1,768,246
  1,768,500
  1,768,504
  1,770,080
  1,770,165
  1,770,649
  1,770,833
  1,771,025
  1,771,747
  1,772,053
  1,772,457
  1,772,465
  1,773,508
  1,774,417
  1,774,517
  1,774,659
  1,774,997
  1,775,240
  1,775,319
  1,775,581
  1,775,980
  1,776,425
  1,776,882
  1,776,956
  1,779,063
  1,779,066
  1,779,115
  1,779,140
  1,779,141
  1,779,144
  1,779,151
  1,779,152
  1,779,161
  1,779,162
  1,779,168
  1,779,169
  1,779,173
  1,779,174
  1,782,593
  1,782,600
  1,782,612
  1,782,656
  1,782,674
  1,782,682
  1,782,744
  1,783,019
  1,783,045
  1,783,070
  1,783,099
  1,783,114
  1,783,125
  1,783,136
  1,783,139
  1,783,166
  1,784,892
  1,785,004
  1,792,291
  1,792,488
  1,796,635
  1,796,779
  1,796,915
  1,797,437
  1,797,886
  1,798,535
  1,799,270
  1,799,351
  1,800,093
  1,800,235
  1,800,369
  1,800,791
  1,801,254
  1,802,351
  1,802,414
  1,802,435
  1,802,773
  1,805,463
  1,806,028
  1,809,630
  1,809,657
  1,810,256
  1,810,341
  1,811,370
  1,812,986
  1,813,484
  1,814,832
  1,814,924
6/-
C
T
C
G
G
G
T
T
A
G
C
T
-
-
T
G
C
G
C
26
G
T
-
A
A
A
72
A
-
4
G
A
-
-
A
T
-
G
T
A
G
T
C
C
G
C
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
5
T
T
T
T
C
A
-
A
-
-
C
-
T
T
C
-
G
T
G
C
-
T
A
A
T
T
C
T
-
G
A
T
C
G
A
T
G
T
A
C
T
A
-
A
-
2
G
G
A
T
A
2
2
A
T
A
A
-
A
-
-
-
-
-
-
-
A
G
C
-
C
A
C
G
-
G
T
C
10
-
G
A
G
A
C
-
T
C
C
C
-
-
-
-
T
C
A
T/A
A
A
T
G
T
T
G
G
A
C
A
36
G
G
T
A
3
G
A
-
C
A
2
C
-
T
G
G
A
A
A
A
A
A
A
G
G
G
C
T
A
G
4
G
-
G
A
C
A
C
T/G
C/A
G/A
T/C
G/A
T/G
A/G
A/G
C/T
A/T
A/G
A/G
C/G
A/G
-/A
-/C
T/A
A/T
G/A
-/2
C/G
A/C
G/A
G/T
C/T
G/C
A/T
G/A
C/T
A/C
G
T
4
C
15
G
T
A
A
C
-
A
C
-
A
A
-
-
3
3
-
A
G
T
C
T
T
17
T
3
-
T