Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,162,114 (bp)   Positions: 275
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.237
--
--
--
.436
--
--
--
--
--
--
.018
.003
.001
.0
.001
.006
.003
--
.02
.011
.002
.051
.632
--
.002
.008
.001
.002
.039
.005
--
--
.616
--
--
--
--
--
--
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.029
.032
.039
.028
.026
.419
.629
.762
.793
.001
.007
.079
.116
.049
.003
.003
.002
.105
.004
.001
.112
.018
.005
.0
.006
.025
.014
.006
.001
.0
.007
.0
.0
.012
--
.147
.132
.01
.0
.005
.001
.001
.004
.827
.048
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.011
.003
.406
.796
.874
.026
.007
.477
.001
.004
.002
.0
.001
.007
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.004
.002
.031
.001
.072
.026
.006
.004
.064
.007
.006
.038
.04
.006
.001
.002
.066
.088
.068
.032
.004
--
--
--
--
.146
.0
.001
.004
.013
.042
.003
.001
.0
.0
.002
.006
.023
.156
.15
.167
.261
.073
.069
.071
.019
.023
.042
.027
.001
.001
.006
.008
.004
.0
.007
.0
.001
.0
.002
.004
.001
.003
.003
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.0
.0
.001
.001
.005
.001
.001
.003
.003
.044
.029
.012
.007
.002
.008
.004
.005
.002
.006
.002
.051
--
--
--
--
--
--
.511
.967
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.052
--
--
--
.003
.01
.0
--
--
--
--
--
--
--
.198
.003
.106
.07
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
Ctnna2
-
T
A
G
8
A
T
-
C
G
A
T
T
T
T
T
T
A
C
G
C
G
T
2
T
-
-
T
T
-
C
C
G
G
T
-
C
-
-
C
G
G
-
C
T
C
T
-
-
G
G
T
C
-
-
T
-
A
4
G
G
C
G
C
C
G
C
A
-
G
G
-
A
T
G
-
T
-
T
-
C
T
G
-
T
A
2
C
C
-
-
2
-
C
C
C
-
C
T
G
A
C
G
-
2
G
C
A
3
C
C
A
T
G
G
T
G
G
C
C
G
C
C
T
A
A
-
-
C
C
C
-
A
A
C
-
C
G
G
G
-
C
-
-
-
G
-
-
-
G
G
T
-
G
-
-
-
G
T
A
-
A
A
A
T
A
3
T
G
G
2
4
4
-
C
G
T
T
-
2
A
T
G
2
2
G
2
C
4
2
A
G
C
C
2
3
2
-
-
A
3
C
A
A
C
C
-
G
G
-
-
-
A
G
T
A
-
-
-
T
G
C
A
G
-
G
C
G
-
-
2
-
-
-
A
C
T
T
T
G
T
A
G
G
2
T
G
C
A
T
T
C
G
G
G
G
C
A
G
C
A
7
6
G
C
T
C
C
C
T
T
T
A
G
T
  107,923,682
  107,949,589
  107,949,654
  107,949,661
  107,953,955
  107,954,046
  107,954,290
  107,954,331
  107,985,015
  107,985,017
  107,985,027
  108,029,299
  108,029,305
  108,029,314
  108,029,317
  108,029,320
  108,029,323
  108,056,752
  108,068,623
  108,140,209
  108,140,211
  108,140,215
  108,189,195
  108,232,460
  108,247,191
  108,263,458
  108,400,832
  108,400,836
  108,400,839
  108,419,816
  108,431,578
  108,438,379
  108,438,592
  108,462,671
  108,464,250
  108,464,270
  108,464,295
  108,464,323
  108,464,344
  108,464,348
  108,493,149
  108,519,610
  108,519,616
  108,519,637
  108,519,669
  108,519,692
  108,519,703
  108,519,724
  108,519,739
  108,519,759
  108,519,760
  108,519,800
  108,519,815
  108,519,820
  108,519,995
  108,519,997
  108,520,002
  108,520,006
  108,534,128
  108,534,134
  108,534,140
  108,534,145
  108,534,147
  108,534,163
  108,534,170
  108,534,175
  108,534,176
  108,537,813
  108,537,846
  108,537,864
  108,537,869
  108,542,246
  108,544,929
  108,544,930
  108,544,935
  108,545,072
  108,545,079
  108,545,217
  108,550,678
  108,571,053
  108,573,335
  108,573,397
  108,574,397
  108,574,402
  108,574,452
  108,583,019
  108,583,032
  108,594,454
  108,594,461
  108,594,548
  108,594,571
  108,594,577
  108,618,206
  108,628,990
  108,628,994
  108,629,001
  108,629,006
  108,629,009
  108,629,013
  108,629,014
  108,629,039
  108,642,097
  108,642,106
  108,642,111
  108,642,112
  108,642,119
  108,642,133
  108,642,134
  108,642,140
  108,642,148
  108,642,151
  108,647,571
  108,647,583
  108,647,617
  108,647,622
  108,647,625
  108,647,637
  108,647,641
  108,647,661
  108,647,675
  108,647,677
  108,647,680
  108,647,683
  108,647,690
  108,647,699
  108,647,700
  108,672,356
  108,672,543
  108,672,545
  108,672,611
  108,672,738
  108,672,750
  108,672,948
  108,673,019
  108,673,024
  108,678,796
  108,678,805
  108,678,806
  108,678,931
  108,678,945
  108,678,963
  108,678,969
  108,678,985
  108,679,279
  108,679,293
  108,679,315
  108,679,318
  108,679,326
  108,679,331
  108,679,342
  108,679,347
  108,679,367
  108,679,391
  108,679,402
  108,679,406
  108,679,412
  108,679,430
  108,679,451
  108,679,452
  108,679,465
  108,679,486
  108,685,882
  108,694,736
  108,694,740
  108,694,743
  108,694,746
  108,694,753
  108,694,761
  108,694,763
  108,694,776
  108,694,778
  108,694,783
  108,694,791
  108,694,800
  108,694,809
  108,694,817
  108,694,825
  108,694,831
  108,694,841
  108,694,845
  108,694,856
  108,694,869
  108,694,870
  108,694,885
  108,694,889
  108,694,897
  108,694,902
  108,694,910
  108,694,914
  108,694,921
  108,694,925
  108,694,931
  108,695,302
  108,695,312
  108,695,316
  108,695,320
  108,695,326
  108,695,340
  108,695,359
  108,695,632
  108,695,645
  108,702,819
  108,702,820
  108,702,844
  108,707,189
  108,707,194
  108,707,198
  108,707,201
  108,707,207
  108,707,214
  108,707,221
  108,707,228
  108,739,884
  108,739,888
  108,739,893
  108,739,894
  108,739,900
  108,739,901
  108,739,908
  108,739,916
  108,739,936
  108,739,941
  108,739,942
  108,739,959
  108,739,969
  108,739,973
  108,739,975
  108,739,980
  108,739,987
  108,742,312
  108,758,541
  108,762,938
  108,762,940
  108,763,025
  108,792,042
  108,803,997
  108,804,007
  108,805,619
  108,806,887
  108,806,941
  108,808,193
  108,814,225
  108,818,495
  108,824,757
  108,858,426
  108,880,193
  108,881,574
  108,881,942
  108,882,204
  108,883,393
  108,883,936
  108,884,900
  108,884,906
  108,884,912
  108,884,921
  108,884,922
  108,885,313
  108,888,425
  108,891,823
  108,891,826
  108,898,098
  108,907,472
  108,907,482
  108,927,619
  108,933,755
  108,936,971
  108,937,134
  108,937,841
  108,938,264
  108,938,284
  108,962,932
  108,980,925
  108,984,298
  109,041,328
  109,041,447
A
T/A
A/C
G/A
-
-
-
T
C/T
G/T
A/T
G
G
G
G
G
G
C
C/T
-
-
-
-
2/-
G
-/A
C
-
-
202
-
G
-
T
C
2
T
3
T
T
T
-
T
A
-
-
-
T
G
-
T
-
-
T
A
A
A
-
-
-
T
-
-
-
T
-
T
G
T
-
-
2
T
A
T
5
-
85
-
-/A
-
-
A
T
A
G
-
-
A
C
A
-
A
C/T
C/A
C/T
-/6
C/T
T/C
G/C
A/T
C/T
G/T
-/2
2/-
G/A
C/T
A/G
3/-
C/A
C/G
A/G
T/A
G/T
G/T
T/G
G/T
G/A
C/T
C/T
G/A
C/T
C/T
T/G
A/G
A/G
G
2
-
-
-
A
-
G
-
C
G
A
-
-
A
A
A
T
2
-
A
C
A
-
-
-
G
C
G
A
A
A
G
-
A
-
-
-
-
-
-
G
-
T
-
-
-
A
-
-
A
-
G
-
-
A
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
G
T
-
-
-
G
G
-
-
T
-
A
A
A
A
C
-
A
G
T
T
G
-
-
-
T
A
C
T
T
-
T
2
-
A
A
A
-
A
C
T/A
T/A
G/T
T/C
G
C
T
-
T/C
G/A
C/T
A/C
T/C
T/C
C/T
G/A
G/A
G/C
G/A
C/T
A/C
G/A
C/T
A/C
-
-
C
C/A
T/G
C/G
T
C/T
T/C
C
C
-
-
A