Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 101,386 (bp)   Positions: 298
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.003
.001
.004
.0
.004
.0
.0
.0
.0
.028
.059
.024
.0
.009
.02
.136
.0
.001
.0
.0
.001
.002
.0
.001
.001
.001
.001
.005
.0
.115
.003
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.005
.0
.002
.0
.0
.003
.001
.031
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.111
.009
.028
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.652
.002
.855
.066
.0
.004
.032
.001
.218
.0
.99
.945
.683
.001
.0
.001
.0
.0
.996
.016
.012
.01
.005
.002
.067
.073
.01
.122
.319
.085
.122
.003
.008
.001
.007
.054
.005
.053
.073
.0
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.998
.001
.021
.001
.003
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.093
.002
.009
.002
.05
.048
.001
.001
.023
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.24
.001
.001
.0
.0
.033
.16
.158
.146
.003
.033
.006
.007
.001
.096
.442
.004
.699
.071
.066
.115
.009
.004
.108
.041
.0
.044
.011
.007
.01
--
--
.909
.003
.284
.0
.002
.0
.001
.002
.002
.103
.0
.002
.0
.0
.0
.003
.0
.006
.012
--
.005
.287
.085
--
--
.05
.001
.0
.065
--
--
.017
.066
.408
.47
.134
.045
.009
.069
.019
.019
.001
.218
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
Cfh
A
G
A
A
A
G
T
T
C
T
C
G
A
C
G
A
T
C
C
T
A
G
T
A
C
T
C
G
T
A
T
A
T
A
A
T
T
T
G
T
T
C
C
G
G
C
A
G
G
T
A
G
A
A
A
A
A
A
T
T
T
G
C
C
T
G
G
T
G
A
C
A
G
A
A
A
C
G
G
A
C
C
T
G
A
G
G
A
G
G
T
G
C
T
C
G
G
G
G
C
C
C
G
G
C
C
T
A
A
C
G
T
T
G
T
A
T
T
G
T
C
C
G
G
G
C
A
G
C
C
G
A
A
G
T
C
A
A
T
C
T
G
C
C
G
A
G
C
G
A
T
G
C
C
T
G
A
C
T
C
G
A
C
T
A
C
G
A
C
G
T
T
G
A
G
A
A
G
A
T
G
A
A
A
A
G
T
T
A
A
C
C
C
T
C
A
G
G
T
T
C
T
C
G
T
A
G
C
A
A
A
A
C
C
T
C
G
G
A
A
T
G
A
T
G
G
G
T
A
A
A
C
G
T
C
A
C
C
T
C
G
C
A
G
A
A
A
T
A
A
A
T
C
C
G
T
G
A
C
T
T
T
A
C
C
T
T
T
A
G
A
A
C
G
G
G
A
C
T
A
G
G
G
C
A
G
A
T
A
T
A
C
A
T
T
A
G
A
  56,979,284
  56,979,291
  56,979,404
  56,979,476
  56,979,588
  56,979,592
  56,979,673
  56,979,763
  56,980,070
  56,980,152
  56,980,309
  56,980,328
  56,980,546
  56,980,570
  56,980,586
  56,980,587
  56,980,611
  56,980,695
  56,981,012
  56,981,071
  56,981,134
  56,981,144
  56,981,152
  56,981,158
  56,981,226
  56,981,229
  56,981,244
  56,981,390
  56,981,901
  56,982,296
  56,982,397
  56,982,504
  56,982,658
  56,982,706
  56,982,866
  56,982,921
  56,983,195
  56,983,229
  56,983,290
  56,983,355
  56,983,386
  56,983,411
  56,983,605
  56,983,612
  56,983,796
  56,983,859
  56,983,924
  56,984,251
  56,984,278
  56,984,287
  56,984,331
  56,984,517
  56,984,525
  56,984,609
  56,984,770
  56,984,867
  56,984,963
  56,985,104
  56,985,146
  56,985,342
  56,985,700
  56,985,798
  56,985,976
  56,986,302
  56,986,402
  56,986,421
  56,986,468
  56,986,473
  56,986,547
  56,986,587
  56,986,860
  56,987,048
  56,987,146
  56,987,186
  56,987,301
  56,987,505
  56,987,910
  56,987,968
  56,988,340
  56,988,608
  56,989,359
  56,989,405
  56,989,655
  56,990,062
  56,990,444
  56,990,515
  56,990,648
  56,990,777
  56,990,856
  56,991,663
  56,993,916
  56,993,941
  56,994,354
  56,994,435
  56,994,842
  56,995,160
  56,995,269
  56,995,670
  56,995,835
  56,996,181
  56,996,688
  56,997,516
  56,997,713
  56,997,794
  56,998,058
  56,998,469
  56,999,596
  56,999,597
  56,999,631
  56,999,723
  57,000,269
  57,001,128
  57,002,178
  57,002,368
  57,003,273
  57,003,365
  57,003,413
  57,005,306
  57,007,216
  57,007,589
  57,008,470
  57,008,493
  57,008,518
  57,008,521
  57,008,564
  57,009,002
  57,009,069
  57,009,268
  57,009,396
  57,009,515
  57,009,617
  57,010,949
  57,011,121
  57,011,199
  57,011,473
  57,011,478
  57,011,499
  57,012,309
  57,012,461
  57,012,544
  57,012,843
  57,012,964
  57,013,010
  57,013,057
  57,013,118
  57,013,715
  57,013,805
  57,013,824
  57,014,055
  57,014,123
  57,014,162
  57,017,615
  57,017,884
  57,019,670
  57,019,806
  57,019,917
  57,020,197
  57,020,272
  57,024,069
  57,024,261
  57,025,311
  57,025,510
  57,026,322
  57,026,385
  57,026,866
  57,027,730
  57,028,145
  57,028,222
  57,028,277
  57,029,475
  57,030,238
  57,030,951
  57,031,540
  57,031,958
  57,031,981
  57,032,346
  57,032,662
  57,032,803
  57,032,908
  57,032,944
  57,032,988
  57,032,999
  57,033,053
  57,033,246
  57,033,487
  57,033,543
  57,033,567
  57,033,568
  57,033,640
  57,033,931
  57,034,053
  57,034,551
  57,034,713
  57,034,846
  57,034,957
  57,035,410
  57,035,708
  57,035,797
  57,035,801
  57,035,849
  57,035,896
  57,035,921
  57,036,281
  57,036,354
  57,036,388
  57,036,467
  57,036,583
  57,036,627
  57,036,656
  57,036,664
  57,037,128
  57,037,325
  57,039,097
  57,039,118
  57,039,825
  57,039,883
  57,040,685
  57,040,913
  57,040,972
  57,041,309
  57,042,141
  57,042,183
  57,042,184
  57,043,995
  57,044,009
  57,044,249
  57,044,341
  57,044,414
  57,045,470
  57,045,652
  57,045,775
  57,045,779
  57,046,310
  57,046,420
  57,046,799
  57,046,999
  57,047,049
  57,047,063
  57,047,179
  57,047,809
  57,047,996
  57,048,395
  57,048,396
  57,048,437
  57,048,713
  57,048,864
  57,049,052
  57,049,181
  57,057,382
  57,057,457
  57,059,209
  57,060,342
  57,060,573
  57,060,730
  57,060,813
  57,061,009
  57,061,196
  57,061,509
  57,061,696
  57,061,763
  57,061,867
  57,062,398
  57,062,846
  57,063,463
  57,063,659
  57,063,820
  57,063,896
  57,064,054
  57,064,077
  57,064,234
  57,064,364
  57,064,371
  57,064,424
  57,064,828
  57,065,221
  57,066,041
  57,066,156
  57,066,493
  57,066,836
  57,066,988
  57,068,626
  57,069,806
  57,070,583
  57,071,738
  57,072,593
  57,072,676
  57,072,926
  57,073,161
  57,073,167
  57,073,174
  57,073,684
  57,074,836
  57,075,892
  57,076,099
  57,078,921
  57,079,150
  57,079,859
  57,080,374
A/G
G/T
A/G
A/G
A/G
G/A
T/A
T/G
C/T
T/C
C/T
T
G
C/A
G/A
A/G
T/A
C/T
A
A
C
A
C
C
A
C
T
A
A
G
C
C
C
G
G
G
C
G
T
C
C
C/T
T
T
T
G
G
A
A
C
T
A
G
G
G
G
G
G
C
G
C
A
T
T
G
A
A
C
A
G
T
G
A
T
G
C
A
C
T
G
A
T
G
A
T
A
A
C
G/C
T
C
A
A
C
T
T
A
C
A
C/T
T
T
A
G/A
C/T
C/A
C
T
G
T
T
G
A
A
T/C
G
T/G
C
C
G
T
T
A
A
T
T
G
A
T
T
A
G
G
A
C
A
G
G
A
T
T/A
T
G
T
T
C
T
T
C
G
A
A
T
G
C
G/C
G
C/T
C
T
G/A
T
T
T/A
T
T
A
G
T
A
T/C
C
A
C
A
C
G
A
G
G
A
G
T
A/G
G
T
G
A
G
C
G
T
A
C
C/T
C
A
T
G
A
T
C
G
A
C
G
A
T
C
C
G
G
A
G
T/G
T
C
A
A/T
G
G
C
T
G
C
A
A
A
G
G
G
T
A
C
T
G
T
T
C
T
A
T
G
A
G
G
C
A
G
T
G
G
T
T
A
C
A
G
G
C
C
C
C
T
A
C
A
G
G
C
C
G
A
A
C
C
C
T
G
G
A
C
A
T
G
A
G
C
C
C
T
A
C
G
C
T
A
T