Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 159,310 (bp)   Positions: 298
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
--
--
--
--
--
--
--
.01
--
--
.085
--
--
--
.032
.456
.0
.002
.003
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.15
.179
.146
.005
.002
--
.004
.005
.016
.0
.044
.021
.017
.162
--
.0
.003
.018
.064
.034
.043
.031
--
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.06
.105
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.091
.023
.002
--
--
.712
--
.472
--
--
--
--
--
.001
--
--
.944
.003
.521
.011
.136
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.136
.004
.004
.015
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
.484
--
--
--
--
--
.087
.068
.148
.137
.731
.048
.128
.002
.047
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.998
1.0
.991
.997
1.0
.111
.002
--
--
--
--
--
--
--
.439
.576
.001
.053
.019
.002
.002
.0
.008
--
.045
.405
.104
.782
.804
--
--
--
--
.999
1.0
--
.001
--
--
--
--
.556
.004
.012
.017
.01
.002
.0
.001
.0
.002
.009
.034
.001
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
Bmerb1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
4
-
A
C
A
-
-
-
A
G
G
T
C
C
G
2
G
T
-
T
T
A
-
T
G
C
A
2
A
-
C
-
G
-
6
T
A
T
-
G
T
T
C
G
2
C
G
G
A
T
-
3
T
A
C
C
T
A
A
A
C
A
G
G
C
G
G
-
C
T
2
C
G
C
G
G
G
C
A
A
G
C
C
G
G
C
G
C
C
A
A
T
G
C
C
T
G
C
A
T
C
A
C
G
A
A
A
C
C
G
G
G
C
A
T
G
C
C
C
A
A
-
A
-
-
C
C
2
5
A
C
T
A
G
G
T
T
T
-
A
T
A
C
G
A
G
G
G
C
G
A
G
T
T
G
T
22
C
G
C
C
C
A
G
-
C
T
T
T
4
T
G
A
T
C
G
A
C
A
T
-
T
C
T
T
C
G
T
-
-
8
-
T
-
T
G
T
C
T
C
C
C
G
C
-
T
G
A
A
C
-
G
T
T
G
G
C
C
T
A
G
-
A
-
T
C
G
C
G
A
C
C
G
A
T
C
C
C
-
-
G
G
T
T
-
A
C
C
T
G
C
C
T
-
-
3
-
-
G
G
A
C
C
G
G
C
G
T
T
-
G
T
T
T
C
A
C
G
A
A
A
-
-
-
-
50
G
-
C
T
G
-
A
C
C
A
C
C
  3,436,217
  3,437,356
  3,437,358
  3,437,365
  3,437,372
  3,437,480
  3,437,490
  3,437,497
  3,437,763
  3,441,730
  3,441,733
  3,444,464
  3,447,412
  3,450,760
  3,451,221
  3,457,954
  3,458,206
  3,460,866
  3,461,932
  3,461,948
  3,461,953
  3,464,913
  3,465,053
  3,465,102
  3,465,115
  3,465,143
  3,465,178
  3,465,224
  3,465,226
  3,465,242
  3,465,287
  3,465,297
  3,465,308
  3,465,323
  3,465,521
  3,466,342
  3,467,261
  3,469,232
  3,469,352
  3,469,639
  3,469,926
  3,470,750
  3,471,453
  3,471,642
  3,472,614
  3,472,873
  3,473,024
  3,473,062
  3,473,466
  3,473,515
  3,474,280
  3,474,570
  3,474,573
  3,474,588
  3,474,607
  3,474,609
  3,474,624
  3,474,880
  3,475,023
  3,475,125
  3,475,197
  3,476,013
  3,476,058
  3,476,079
  3,476,173
  3,476,399
  3,476,454
  3,476,721
  3,477,289
  3,477,459
  3,477,682
  3,477,761
  3,477,823
  3,477,836
  3,477,837
  3,477,844
  3,477,890
  3,477,927
  3,478,006
  3,478,028
  3,478,029
  3,478,031
  3,478,086
  3,478,093
  3,478,110
  3,478,170
  3,478,437
  3,478,455
  3,478,503
  3,478,917
  3,478,935
  3,479,153
  3,479,161
  3,479,185
  3,479,295
  3,479,539
  3,480,041
  3,480,055
  3,480,233
  3,480,451
  3,480,534
  3,480,610
  3,480,722
  3,481,240
  3,481,286
  3,481,384
  3,481,405
  3,481,450
  3,481,459
  3,481,588
  3,481,718
  3,481,779
  3,481,873
  3,481,936
  3,482,096
  3,482,248
  3,482,293
  3,483,189
  3,483,348
  3,483,513
  3,484,326
  3,484,487
  3,484,509
  3,484,514
  3,484,520
  3,484,540
  3,485,109
  3,485,141
  3,485,521
  3,485,961
  3,486,054
  3,486,261
  3,486,422
  3,486,713
  3,487,009
  3,487,214
  3,487,336
  3,487,357
  3,487,454
  3,487,461
  3,487,735
  3,487,863
  3,487,989
  3,488,076
  3,488,095
  3,488,600
  3,489,559
  3,499,766
  3,500,142
  3,500,533
  3,500,657
  3,500,773
  3,501,019
  3,501,055
  3,501,164
  3,501,304
  3,501,506
  3,507,271
  3,507,665
  3,507,697
  3,508,877
  3,509,933
  3,510,390
  3,510,619
  3,510,823
  3,510,883
  3,510,891
  3,511,187
  3,511,202
  3,511,325
  3,511,550
  3,511,645
  3,511,897
  3,512,058
  3,512,206
  3,512,321
  3,512,329
  3,512,347
  3,512,352
  3,512,433
  3,512,454
  3,512,658
  3,512,767
  3,512,770
  3,512,959
  3,512,981
  3,512,987
  3,513,162
  3,513,337
  3,513,391
  3,513,396
  3,513,481
  3,514,062
  3,514,582
  3,514,583
  3,514,686
  3,514,696
  3,514,913
  3,515,142
  3,515,543
  3,515,616
  3,515,651
  3,515,924
  3,515,982
  3,516,054
  3,516,065
  3,516,093
  3,516,135
  3,516,465
  3,516,799
  3,517,100
  3,517,146
  3,517,310
  3,517,502
  3,517,978
  3,517,990
  3,517,995
  3,518,209
  3,518,615
  3,518,641
  3,518,667
  3,518,713
  3,518,726
  3,518,766
  3,518,774
  3,518,797
  3,518,845
  3,518,847
  3,518,857
  3,518,871
  3,518,885
  3,518,945
  3,518,959
  3,518,979
  3,518,987
  3,519,038
  3,519,054
  3,519,082
  3,519,093
  3,519,096
  3,519,129
  3,519,139
  3,553,521
  3,557,113
  3,557,465
  3,557,777
  3,557,890
  3,557,894
  3,558,389
  3,558,910
  3,559,941
  3,560,560
  3,560,569
  3,560,577
  3,560,615
  3,560,676
  3,560,709
  3,560,731
  3,561,209
  3,561,689
  3,562,814
  3,562,908
  3,563,773
  3,563,973
  3,564,443
  3,564,616
  3,565,375
  3,565,920
  3,565,998
  3,566,134
  3,566,205
  3,566,566
  3,566,578
  3,566,749
  3,566,773
  3,567,065
  3,567,077
  3,567,295
  3,567,498
  3,567,703
  3,567,730
  3,567,750
  3,567,752
  3,567,767
  3,567,771
  3,567,978
  3,568,192
  3,568,311
  3,568,312
  3,568,506
  3,568,558
  3,568,822
  3,568,827
  3,568,830
  3,568,832
  3,569,009
  3,570,027
  3,570,101
-
2
-
-
-
T
A
T
T
A
A
C
-
T
T
-
G/T
C
2
-
-
-
G
-
-
-
-
-
T
A
-
A
-
T
-
A/G
G
G
T
A
C
C
T
T
-
A
G/C
A
T
C
T
-
A
G
T
T
C
C
G
G
T
G
T
A
T
A
A
8
C/T
T/C
-
C/T
G/A
C/T
G/A
G/A
G/A
C/T
A/C
A/T
G/T
C/T
C/T
G/A
G/A
C/T
G/A
C/T
C/T
G
G
C
A
G
T
C
A
T
G
G
C/T
A/G
G
C
G
C
G
C/T
C/T
G/A
C
A
T
G
C
C
T
A
A
C
G
G
C
T
G
-
T
-
-
C
G
C
G
A
T
C
C
G
A
G
G
G
T
A
T
A
A
A
T
A
G
T
G
A
T
C
-
T
A
T
T
T
G
T
6
T
G
A
-
-
C
A
G
C
T
A
G
T
G
A
A
G
G
G
-
G
T
C
3
A
-
3
A
C
A
T
G
A
C
T
A
T
-
T
C
C
A
G
-
T
20
T
C
C
A
A
T
T
-
-
-
A
-
C
-
-
C
A
-
-
A
-
-
-
C
-
T
-
A
A
-
-
C
G
2
G
-
T
C
A
T
T
C
2
2
-
3
3
A
A
G
G
T
A
A
T
A
C
C
8
A
G
-
C
T
-
A
A
T
-
G
G
18
3
G
-
A
T
A
C
A
2
G
T
T
G
T
T