Nbn (nibrin) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: Nbn (nibrin) Rattus norvegicus
Analyze
Symbol: Nbn
Name: nibrin
RGD ID: 621420
Description: Predicted to enable several functions, including histone binding activity; phosphorylation-dependent protein binding activity; and protein serine/threonine kinase activator activity. Involved in several processes, including host-mediated suppression of symbiont invasion; negative regulation of neuron differentiation; and regulation of fibroblast proliferation. Predicted to be located in Golgi apparatus; nucleus; and replication fork. Predicted to be part of BRCA1-C complex and Mre11 complex. Predicted to be active in chromosome, telomeric region and site of double-strand break. Human ortholog(s) of this gene implicated in several diseases, including Nijmegen breakage syndrome; acute lymphoblastic leukemia; aplastic anemia; rectum cancer; and reproductive organ cancer (multiple). Orthologous to human NBN (nibrin); PARTICIPATES IN ataxia telangiectasia-mutated (ATM) signaling pathway; homologous recombination pathway of double-strand break repair; INTERACTS WITH (S)-colchicine; 2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine; 2,4-dinitrotoluene.
Type: protein-coding
RefSeq Status: PROVISIONAL
Previously known as: MGC93174; Nbs1; nijmegen breakage syndrome protein 1 homolog
RGD Orthologs
Human
Mouse
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Orthologs
More Info more info ...
Latest Assembly: GRCr8 - GRCr8 Assembly
Position:
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCr8534,256,678 - 34,291,163 (+)NCBIGRCr8
mRatBN7.2529,459,574 - 29,494,152 (+)NCBImRatBN7.2mRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl529,459,457 - 29,494,150 (+)EnsemblmRatBN7.2 Ensembl
UTH_Rnor_SHR_Utx531,615,796 - 31,650,590 (+)NCBIRnor_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0533,208,466 - 33,243,256 (+)NCBIRnor_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0533,168,642 - 33,203,436 (+)NCBIRnor_WKYUTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0
Rnor_6.0529,622,347 - 29,656,877 (+)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl529,622,281 - 29,656,864 (+)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.0534,300,932 - 34,335,393 (+)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.4530,541,610 - 30,576,168 (+)NCBIRGSC3.4RGSC_v3.4rn4RGSC3.4
RGSC_v3.1530,541,609 - 30,576,168 (+)NCBI
Celera528,665,088 - 28,699,404 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map5q13NCBI
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


1 to 9 of 9 rows

  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRatAlzheimer's disease  ISORGD:13486112317734 RGD 
NbnRatbreast cancer disease_progressionISORGD:13486112298993protein:decreased expression:breastRGD 
NbnRatbreast cancer susceptibilityISORGD:13486112298991DNA:SNPRGD 
NbnRatbreast cancer susceptibilityISORGD:13486112298992DNA:missense mutation:exon:p.I171VRGD 
NbnRatCOVID-19  ISORGD:13486119068941mRNA:increased expression:bronchoalveolar lavage (human)RGDPMID:32407669|REF_RGD_ID:30296672
NbnRatdisease of metabolism  ISORGD:13486111600219Nijmegen breakage syndrome, OMIM:251260, DNA:deletion:exon:nt657del5RGD 
NbnRatovarian cancer  ISORGD:13486112298994 RGD 
NbnRatprostate cancer susceptibilityISORGD:13486112298995DNA:deletion, loss of heterozygosityRGD 
NbnRatrectum cancer susceptibilityISORGD:1348611151361212DNA:SNP:3'utr: (rs14448) (human)RGD 
1 to 9 of 9 rows
1 to 20 of 56 rows
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRatacute lymphoblastic leukemia  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Acute lymphoblastic leukemia | ClinVar Annotator: match by term: Acute more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12505263|PMID:12621246|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14559852|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15338273|PMID:15474156|PMID:16033915|PMID:16415040|PMID:16474176|PMID:16544999|PMID:16770759|PMID:16810201|PMID:17001621|PMID:17103455|PMID:17496786|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18023021|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:18593981|PMID:18606567|PMID:18612309|PMID:18638378|PMID:18940477|PMID:19393249|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19804756|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:20805886|PMID:21212067|PMID:21302341|PMID:21698754|PMID:22006311|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22841127|PMID:22864661|PMID:22941933|PMID:22995991|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24396275|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24830725|PMID:24894818|PMID:25117502|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25485873|PMID:25503501|PMID:25619955|PMID:25677497|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26270727|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26534844|PMID:26564480|PMID:26681312|PMID:26689913|PMID:26722329|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26898890|PMID:27148588|PMID:27150568|PMID:27153395|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:27978560|PMID:28076423|PMID:28135145|PMID:28152038|PMID:28261280|PMID:28374160|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28591191|PMID:28726808|PMID:28873162|PMID:28888541|PMID:29335925|PMID:29368341|PMID:29371908|PMID:29419426|PMID:29522266|PMID:29596542|PMID:29615459|PMID:29659569|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:29915322|PMID:29922827|PMID:29961768|PMID:30043523|PMID:30256826|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30322717|PMID:30426508|PMID:30441849|PMID:30590007|PMID:30651582|PMID:30982232|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31206626|PMID:31415627|PMID:31666926|PMID:31780696|PMID:31874108|PMID:32068069|PMID:32295079|PMID:32427313|PMID:32566746|PMID:32668560|PMID:32832836|PMID:32936981|PMID:32980694|PMID:33050356|PMID:33309985|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33800431|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34284872|PMID:34544220|PMID:35245693|PMID:35264596|PMID:35309086|PMID:35654374|PMID:36003761|PMID:36243179|PMID:36346689|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRatadenosine deaminase deficiency  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Severe combined immunodeficiency due to adenosine deaminase deficiencyClinVarPMID:25326637|PMID:26467025|PMID:28492532|PMID:30287823
NbnRataplastic anemia  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Aplastic anemiaClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11288710|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12433983|PMID:12447395|PMID:12505263|PMID:12508248|PMID:12621246|PMID:12708449|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14559852|PMID:14973119|PMID:15048089|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15338273|PMID:15451479|PMID:15474156|PMID:15593232|PMID:15964794|PMID:16033915|PMID:16199547|PMID:16415040|PMID:16474176|PMID:16544999|PMID:16770759|PMID:16810201|PMID:17103455|PMID:17496786|PMID:17576681|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:18281469|PMID:18575580|PMID:18593981|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19105185|PMID:19393249|PMID:19409520|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19629396|PMID:19635536|PMID:19804756|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:20805886|PMID:21035407|PMID:21212067|PMID:21698754|PMID:22006311|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22864661|PMID:22941933|PMID:23149842|PMID:23265383|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24396275|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24763289|PMID:24830725|PMID:24894818|PMID:25186627|PMID:25485873|PMID:25503501|PMID:25619955|PMID:25677497|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26270727|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26534844|PMID:26564480|PMID:26580448|PMID:26681312|PMID:26689913|PMID:26722329|PMID:26786923|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26898890|PMID:26976419|PMID:27109316|PMID:27148588|PMID:27149842|PMID:27150568|PMID:27153395|PMID:27433846|PMID:27443514|PMID:27498913|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:27978560|PMID:28076423|PMID:28135145|PMID:28152038|PMID:28202063|PMID:28261280|PMID:28374160|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28591191|PMID:28726808|PMID:28727877|PMID:28801450|PMID:28873162|PMID:28888541|PMID:29093764|PMID:29335925|PMID:29338072|PMID:29368341|PMID:29371908|PMID:29419426|PMID:29470806|PMID:29484706|PMID:29506128|PMID:2952226|PMID:29522266|PMID:29535844|PMID:29596542|PMID:29615459|PMID:29625052|PMID:29641532|PMID:29659569|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:29915322|PMID:29922827|PMID:29961768|PMID:30043523|PMID:30130155|PMID:30256826|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30322717|PMID:30426508|PMID:30441849|PMID:30541756|PMID:30590007|PMID:30612635|PMID:30613976|PMID:30651582|PMID:30980208|PMID:30982232|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31206626|PMID:31214711|PMID:31278556|PMID:31422574|PMID:31666926|PMID:31742824|PMID:31780696|PMID:31874108|PMID:31911633|PMID:32068069|PMID:32191290|PMID:32212377|PMID:32268276|PMID:32295079|PMID:32318955|PMID:32338768|PMID:32427313|PMID:32501622|PMID:32566746|PMID:32658311|PMID:32668560|PMID:32782288|PMID:32832836|PMID:32866190|PMID:32885271|PMID:32906206|PMID:32936981|PMID:32980694|PMID:33050356|PMID:33095795|PMID:33309985|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33558524|PMID:33606809|PMID:33630411|PMID:33646313|PMID:33652732|PMID:33800431|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34204722|PMID:34251444|PMID:34284872|PMID:34326862|PMID:34544220|PMID:34964003|PMID:34994648|PMID:35186721|PMID:35245693|PMID:35264596|PMID:35309086|PMID:35467778|PMID:35534704|PMID:35654374|PMID:35739269|PMID:35884425|PMID:36003761|PMID:36243179|PMID:36346689|PMID:36451132|PMID:36497135|PMID:36964972|PMID:36988593|PMID:38446568|PMID:9536098|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRatbreast cancer  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Malignant tumor of breastClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10839544|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12376507|PMID:12427538|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:12861053|PMID:14559852|PMID:14684699|PMID:14707289|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15474156|PMID:16033915|PMID:16415040|PMID:16544999|PMID:16770759|PMID:16810201|PMID:17103455|PMID:17496786|PMID:18003706|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19452044|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19804756|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:20805886|PMID:21302341|PMID:21664921|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22941933|PMID:23317186|PMID:23525077|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24396275|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24894818|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25485873|PMID:25637381|PMID:25677497|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26512707|PMID:26534844|PMID:26564480|PMID:26580448|PMID:26659599|PMID:26681312|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26976419|PMID:26979391|PMID:27150568|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27978560|PMID:28135145|PMID:28152038|PMID:28374160|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28717660|PMID:28726808|PMID:28873162|PMID:29300386|PMID:29368341|PMID:29371908|PMID:29419426|PMID:29458332|PMID:29522266|PMID:29596542|PMID:29758565|PMID:29929473|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30374176|PMID:30426508|PMID:30942098|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31206626|PMID:31278556|PMID:31422574|PMID:31780696|PMID:31874108|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32668560|PMID:32885271|PMID:33050356|PMID:33095795|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34544220|PMID:34646395|PMID:35309086|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRatbreast cancer  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Malignant tumor of breastClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10839544|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12376507|PMID:12427538|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:12861053|PMID:14559852|PMID:14684699|PMID:14707289|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15474156|PMID:16033915|PMID:16415040|PMID:16544999|PMID:16770759|PMID:16810201|PMID:17103455|PMID:17496786|PMID:18003706|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19452044|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19804756|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:20805886|PMID:21302341|PMID:21664921|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22941933|PMID:23317186|PMID:23525077|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24396275|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24894818|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25485873|PMID:25637381|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26512707|PMID:26534844|PMID:26564480|PMID:26580448|PMID:26659599|PMID:26681312|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26976419|PMID:26979391|PMID:27150568|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27978560|PMID:28135145|PMID:28152038|PMID:28374160|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28717660|PMID:28726808|PMID:28873162|PMID:29300386|PMID:29368341|PMID:29371908|PMID:29419426|PMID:29458332|PMID:29522266|PMID:29596542|PMID:29758565|PMID:29929473|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30374176|PMID:30426508|PMID:30942098|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31206626|PMID:31278556|PMID:31422574|PMID:31780696|PMID:31874108|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32668560|PMID:33050356|PMID:33095795|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34544220|PMID:35309086|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRatbreast cancer  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Malignant breast neoplasm | ClinVar Annotator: match by term: Malignant more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10839544|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12376507|PMID:12427538|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12861053|PMID:14559852|PMID:14684699|PMID:14707289|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15474156|PMID:16033915|PMID:16415040|PMID:16544999|PMID:16770759|PMID:16810201|PMID:17103455|PMID:17496786|PMID:18003706|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19452044|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19804756|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:20805886|PMID:21302341|PMID:21664921|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22941933|PMID:23317186|PMID:23525077|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24396275|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24894818|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25637381|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26512707|PMID:26534844|PMID:26564480|PMID:26580448|PMID:26659599|PMID:26681312|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26976419|PMID:26979391|PMID:27150568|PMID:27443514|PMID:27978560|PMID:28135145|PMID:28152038|PMID:28374160|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28717660|PMID:28726808|PMID:28873162|PMID:29300386|PMID:29368341|PMID:29371908|PMID:29458332|PMID:29522266|PMID:29596542|PMID:29758565|PMID:29929473|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30374176|PMID:30426508|PMID:30942098|PMID:31159747|PMID:31206626|PMID:31278556|PMID:31422574|PMID:31780696|PMID:31874108|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32668560|PMID:33095795|PMID:33471991|PMID:9590180|PMID:9620777
NbnRatbreast cancer  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Malignant tumor of breastClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10839544|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12376507|PMID:12427538|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:12861053|PMID:14559852|PMID:14684699|PMID:14707289|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15474156|PMID:16033915|PMID:16415040|PMID:16544999|PMID:16770759|PMID:16810201|PMID:17103455|PMID:17496786|PMID:18003706|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19452044|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19804756|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:20805886|PMID:21302341|PMID:21664921|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22941933|PMID:23317186|PMID:23525077|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24396275|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24894818|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25485873|PMID:25637381|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26512707|PMID:26534844|PMID:26564480|PMID:26580448|PMID:26659599|PMID:26681312|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26976419|PMID:26979391|PMID:27150568|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27978560|PMID:28135145|PMID:28152038|PMID:28374160|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28717660|PMID:28726808|PMID:28873162|PMID:29300386|PMID:29368341|PMID:29371908|PMID:29419426|PMID:29458332|PMID:29522266|PMID:29596542|PMID:29758565|PMID:29929473|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30374176|PMID:30426508|PMID:30942098|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31206626|PMID:31278556|PMID:31422574|PMID:31780696|PMID:31874108|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32668560|PMID:33050356|PMID:33095795|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34544220|PMID:34646395|PMID:35309086|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRatbreast cancer  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Breast cancer, susceptibility to | ClinVar Annotator: match by term: more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10839544|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12376507|PMID:12427538|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:12861053|PMID:14559852|PMID:14684699|PMID:14707289|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15474156|PMID:16033915|PMID:16415040|PMID:16544999|PMID:16770759|PMID:16810201|PMID:17103455|PMID:17496786|PMID:17894553|PMID:18003706|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19452044|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19804756|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:20805886|PMID:21302341|PMID:21664921|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22864661|PMID:22941933|PMID:23149842|PMID:23317186|PMID:23525077|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24396275|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24894818|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25485873|PMID:25637381|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26512707|PMID:26534844|PMID:26564480|PMID:26580448|PMID:26659599|PMID:26681312|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26976419|PMID:26979391|PMID:27150568|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:27978560|PMID:28135145|PMID:28152038|PMID:28374160|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28717660|PMID:28726808|PMID:28873162|PMID:28888541|PMID:29300386|PMID:29368341|PMID:29371908|PMID:29419426|PMID:29458332|PMID:29522266|PMID:29596542|PMID:29625052|PMID:29641532|PMID:29758565|PMID:29915322|PMID:29922827|PMID:29929473|PMID:29961768|PMID:30043523|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30374176|PMID:30426508|PMID:30541756|PMID:30942098|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31206626|PMID:31278556|PMID:31422574|PMID:31780696|PMID:31874108|PMID:31911633|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32658311|PMID:32668560|PMID:32832836|PMID:32885271|PMID:33050356|PMID:33095795|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34250417|PMID:34326862|PMID:34544220|PMID:34646395|PMID:34964003|PMID:35264596|PMID:35309086|PMID:35534704|PMID:35739269|PMID:36155879|PMID:36243179|PMID:36346689|PMID:36568162|PMID:37306523|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRatBreast Cancer, Familial  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Familial cancer of breastClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:16033915|PMID:16415040|PMID:16544999|PMID:17103455|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19635536|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:20805886|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22941933|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24113799|PMID:25186627|PMID:25485873|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:27150568|PMID:27616075|PMID:28135145|PMID:28492532|PMID:28726808|PMID:28873162|PMID:29300386|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:30374176|PMID:30426508|PMID:31173646|PMID:32295079|PMID:33050356|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33558524|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34326862|PMID:34544220|PMID:35309086|PMID:35534704|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRatbreast carcinoma  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Breast carcinoma | ClinVar Annotator: match by term: Carcinoma of more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14559852|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15338273|PMID:16033915|PMID:16415040|PMID:16474176|PMID:16544999|PMID:16810201|PMID:17103455|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19393249|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19635536|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:21212067|PMID:21698754|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22941933|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24728327|PMID:24830725|PMID:25485873|PMID:25619955|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26722329|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:27150568|PMID:27153395|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:28076423|PMID:28261280|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28591191|PMID:28873162|PMID:29335925|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:30287823|PMID:30426508|PMID:30441849|PMID:30590007|PMID:30651582|PMID:30980208|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32658311|PMID:33050356|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34284872|PMID:34544220|PMID:35264596|PMID:35309086|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRatcolon carcinoma  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Colonic carcinomaClinVarPMID:11325820|PMID:14559852|PMID:15338273|PMID:16474176|PMID:16810201|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:19393249|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:21212067|PMID:21698754|PMID:22131123|PMID:22373003|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24728327|PMID:24830725|PMID:25619955|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26722329|PMID:27153395|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:28076423|PMID:28261280|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28591191|PMID:29335925|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:30287823|PMID:30441849|PMID:30590007|PMID:30651582|PMID:31159747|PMID:32566746|PMID:34284872|PMID:35264596
NbnRatdiffuse large B-cell lymphoma  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Diffuse large B cell lymphomaClinVarPMID:16415040|PMID:28492532|PMID:9590180
NbnRatFamilial Prostate Cancer  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Hereditary Prostate CancerClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:16033915|PMID:16544999|PMID:17103455|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19635536|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22941933|PMID:23317186|PMID:24033266|PMID:24113799|PMID:25485873|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26467025|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:27150568|PMID:27616075|PMID:28492532|PMID:28873162|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:30426508|PMID:31173646|PMID:32295079|PMID:33050356|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34544220|PMID:35309086|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRathepatocellular carcinoma  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Hepatocellular cancerClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:16033915|PMID:16544999|PMID:17103455|PMID:18606567|PMID:18940477|PMID:19635536|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22941933|PMID:23317186|PMID:24033266|PMID:24113799|PMID:25485873|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26467025|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:27150568|PMID:27616075|PMID:28492532|PMID:28873162|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:30426508|PMID:31173646|PMID:32295079|PMID:33050356|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34544220|PMID:35309086|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRathereditary breast ovarian cancer syndrome  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Breast and/or ovarian cancer | ClinVar Annotator: match by term: more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14559852|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15338273|PMID:16033915|PMID:16199547|PMID:16415040|PMID:16474176|PMID:16544999|PMID:16810201|PMID:17001621|PMID:17103455|PMID:17576681|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18023021|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:18281469|PMID:18606567|PMID:18612309|PMID:18638378|PMID:18940477|PMID:19393249|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:21212067|PMID:21302341|PMID:21698754|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22841127|PMID:22864661|PMID:22941933|PMID:22995991|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24830725|PMID:25117502|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25485873|PMID:25503501|PMID:25619955|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26580448|PMID:26722329|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26898890|PMID:26976419|PMID:27150568|PMID:27153395|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:27978560|PMID:28076423|PMID:28135145|PMID:28261280|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28591191|PMID:28873162|PMID:29335925|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:29522266|PMID:29625052|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30426508|PMID:30441849|PMID:30564542|PMID:30590007|PMID:30651582|PMID:30942098|PMID:30982232|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31415627|PMID:31666926|PMID:32068069|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32906206|PMID:32980694|PMID:33050356|PMID:33309985|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33800431|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34284872|PMID:34544220|PMID:34994648|PMID:35309086|PMID:36451132|PMID:9536098|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRathereditary breast ovarian cancer syndrome  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Breast and/or ovarian cancer | ClinVar Annotator: match by term: more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14559852|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15338273|PMID:16033915|PMID:16199547|PMID:16415040|PMID:16474176|PMID:16544999|PMID:16810201|PMID:17001621|PMID:17103455|PMID:17576681|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18023021|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:18281469|PMID:18606567|PMID:18612309|PMID:18638378|PMID:18940477|PMID:19393249|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:21212067|PMID:21302341|PMID:21698754|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22841127|PMID:22864661|PMID:22941933|PMID:22995991|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24830725|PMID:25117502|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25485873|PMID:25503501|PMID:25619955|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26580448|PMID:26722329|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26898890|PMID:26976419|PMID:27150568|PMID:27153395|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:27978560|PMID:28076423|PMID:28135145|PMID:28261280|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28591191|PMID:28873162|PMID:29335925|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:29522266|PMID:29625052|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30426508|PMID:30441849|PMID:30564542|PMID:30590007|PMID:30651582|PMID:30942098|PMID:30982232|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31415627|PMID:31666926|PMID:32068069|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32906206|PMID:32959997|PMID:32980694|PMID:33050356|PMID:33309985|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33800431|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34250417|PMID:34284872|PMID:34439939|PMID:34544220|PMID:34994648|PMID:35264596|PMID:35309086|PMID:35534704|PMID:36346689|PMID:36451132|PMID:36568162|PMID:9536098|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRathereditary breast ovarian cancer syndrome  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Breast and/or ovarian cancer | ClinVar Annotator: match by term: more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14559852|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15338273|PMID:16033915|PMID:16199547|PMID:16415040|PMID:16474176|PMID:16544999|PMID:16810201|PMID:17001621|PMID:17103455|PMID:17576681|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18023021|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:18281469|PMID:18606567|PMID:18612309|PMID:18638378|PMID:18940477|PMID:19393249|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:21212067|PMID:21302341|PMID:21698754|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22841127|PMID:22864661|PMID:22941933|PMID:22995991|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24830725|PMID:25117502|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25326637|PMID:25485873|PMID:25503501|PMID:25619955|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26580448|PMID:26722329|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26898890|PMID:26976419|PMID:27150568|PMID:27153395|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:27978560|PMID:28076423|PMID:28135145|PMID:28261280|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28591191|PMID:28873162|PMID:29335925|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:29522266|PMID:29625052|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30426508|PMID:30441849|PMID:30564542|PMID:30590007|PMID:30651582|PMID:30942098|PMID:30982232|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31415627|PMID:31666926|PMID:32068069|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32906206|PMID:32959997|PMID:32980694|PMID:33050356|PMID:33309985|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33800431|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34250417|PMID:34284872|PMID:34439939|PMID:34544220|PMID:34994648|PMID:35264596|PMID:35309086|PMID:35534704|PMID:36346689|PMID:36451132|PMID:36568162|PMID:38446568|PMID:9536098|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRathereditary breast ovarian cancer syndrome  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Breast and/or ovarian cancer | ClinVar Annotator: match by term: more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14559852|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15338273|PMID:16033915|PMID:16199547|PMID:16415040|PMID:16474176|PMID:16544999|PMID:16810201|PMID:17001621|PMID:17103455|PMID:17576681|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18023021|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:18281469|PMID:18606567|PMID:18612309|PMID:18638378|PMID:18940477|PMID:19393249|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:21212067|PMID:21302341|PMID:21698754|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22841127|PMID:22864661|PMID:22941933|PMID:22995991|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24830725|PMID:25117502|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25485873|PMID:25503501|PMID:25619955|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26580448|PMID:26722329|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26898890|PMID:26976419|PMID:27150568|PMID:27153395|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:27978560|PMID:28076423|PMID:28135145|PMID:28261280|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28591191|PMID:28873162|PMID:29335925|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:29522266|PMID:29625052|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30426508|PMID:30441849|PMID:30564542|PMID:30590007|PMID:30651582|PMID:30942098|PMID:30982232|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31415627|PMID:31666926|PMID:32068069|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32906206|PMID:32959997|PMID:32980694|PMID:33050356|PMID:33309985|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33800431|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34250417|PMID:34284872|PMID:34439939|PMID:34544220|PMID:34994648|PMID:35264596|PMID:35309086|PMID:36346689|PMID:36451132|PMID:36568162|PMID:9536098|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRathereditary breast ovarian cancer syndrome  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Breast and/or ovarian cancer | ClinVar Annotator: match by term: more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14559852|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15338273|PMID:16033915|PMID:16199547|PMID:16415040|PMID:16474176|PMID:16544999|PMID:16810201|PMID:17001621|PMID:17103455|PMID:17576681|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18023021|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:18281469|PMID:18606567|PMID:18612309|PMID:18638378|PMID:18940477|PMID:19393249|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:21212067|PMID:21302341|PMID:21698754|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22841127|PMID:22864661|PMID:22941933|PMID:22995991|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24830725|PMID:25117502|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25326637|PMID:25485873|PMID:25503501|PMID:25619955|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26580448|PMID:26722329|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26898890|PMID:26976419|PMID:27150568|PMID:27153395|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:27978560|PMID:28076423|PMID:28135145|PMID:28261280|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28591191|PMID:28873162|PMID:29335925|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:29522266|PMID:29625052|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30426508|PMID:30441849|PMID:30564542|PMID:30590007|PMID:30651582|PMID:30942098|PMID:30982232|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31415627|PMID:31666926|PMID:32068069|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32906206|PMID:32959997|PMID:32980694|PMID:33050356|PMID:33309985|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33800431|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34250417|PMID:34284872|PMID:34439939|PMID:34544220|PMID:34994648|PMID:35264596|PMID:35309086|PMID:36346689|PMID:36451132|PMID:36568162|PMID:9536098|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
NbnRathereditary breast ovarian cancer syndrome  ISORGD:13486118554872ClinVar Annotator: match by term: Breast and/or ovarian cancer | ClinVar Annotator: match by term: more ...ClinVarPMID:10398434|PMID:10799436|PMID:10848790|PMID:10852373|PMID:11093281|PMID:11279524|PMID:11325820|PMID:11953735|PMID:12123493|PMID:12353271|PMID:12505263|PMID:12833396|PMID:12845677|PMID:14559852|PMID:14973119|PMID:15185344|PMID:15279809|PMID:15338273|PMID:16033915|PMID:16199547|PMID:16415040|PMID:16474176|PMID:16544999|PMID:16810201|PMID:17001621|PMID:17103455|PMID:17576681|PMID:17695489|PMID:17894553|PMID:17899368|PMID:18023021|PMID:18049891|PMID:18280732|PMID:18281469|PMID:18606567|PMID:18612309|PMID:18638378|PMID:18940477|PMID:19393249|PMID:19452044|PMID:19523210|PMID:19584272|PMID:19635536|PMID:19813148|PMID:19908051|PMID:20444919|PMID:21212067|PMID:21302341|PMID:21698754|PMID:22131123|PMID:22293976|PMID:22373003|PMID:22491912|PMID:22841127|PMID:22864661|PMID:22941933|PMID:22995991|PMID:23317186|PMID:23555315|PMID:24033266|PMID:24093751|PMID:24113799|PMID:24349281|PMID:24549055|PMID:24728327|PMID:24830725|PMID:25117502|PMID:25186627|PMID:25318351|PMID:25326637|PMID:25485873|PMID:25503501|PMID:25619955|PMID:25712764|PMID:25741868|PMID:25980754|PMID:26083025|PMID:26315354|PMID:26467025|PMID:26580448|PMID:26722329|PMID:26787654|PMID:26822949|PMID:26845104|PMID:26898890|PMID:26976419|PMID:27150568|PMID:27153395|PMID:27443514|PMID:27616075|PMID:27621404|PMID:27978560|PMID:28076423|PMID:28135145|PMID:28261280|PMID:28376765|PMID:28492532|PMID:28528518|PMID:28591191|PMID:28873162|PMID:29335925|PMID:29368341|PMID:29419426|PMID:29522266|PMID:29625052|PMID:29678143|PMID:29785153|PMID:30287823|PMID:30306255|PMID:30426508|PMID:30441849|PMID:30564542|PMID:30590007|PMID:30651582|PMID:30942098|PMID:30982232|PMID:31159747|PMID:31173646|PMID:31415627|PMID:31666926|PMID:32068069|PMID:32295079|PMID:32566746|PMID:32906206|PMID:32959997|PMID:32980694|PMID:33050356|PMID:33309985|PMID:33471974|PMID:33471991|PMID:33800431|PMID:33840814|PMID:34072463|PMID:34072659|PMID:34284872|PMID:34439939|PMID:34544220|PMID:34994648|PMID:35264596|PMID:35309086|PMID:36346689|PMID:36451132|PMID:9536098|PMID:9590180|PMID:9590181|PMID:9620777
1 to 20 of 56 rows
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRatacute lymphoblastic leukemia  ISORGD:134861111554173CTD Direct Evidence: marker/mechanismCTD 
NbnRataplastic anemia  ISORGD:134861111554173CTD Direct Evidence: marker/mechanismCTD 
NbnRatNeoplasm Recurrence, Local  ISORGD:134861111554173CTD Direct Evidence: marker/mechanismCTDPMID:25415046
NbnRatNijmegen breakage syndrome  ISORGD:134861111554173CTD Direct Evidence: marker/mechanismCTDPMID:16521404|PMID:17395558|PMID:18186968
NbnRatProstatic Neoplasms  ISORGD:134861111554173CTD Direct Evidence: marker/mechanismCTDPMID:14973119|PMID:25415046
NbnRatstomatitis  ISORGD:134861111554173CTD Direct Evidence: marker/mechanismCTDPMID:24594932
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRatNijmegen breakage syndrome  ISSRGD:73272313592920OMIM:251260MouseDO 
NbnRatT-cell acute lymphoblastic leukemia  ISSRGD:73272313592920 MouseDO 
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRatacute lymphoblastic leukemia  ISORGD:13486117240710 OMIM 
NbnRataplastic anemia  ISORGD:13486117240710 OMIM 
NbnRatNijmegen breakage syndrome  ISORGD:13486117240710 OMIM 

1 to 20 of 122 rows

  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRat(-)-epigallocatechin 3-gallate multiple interactionsISORGD:13486116480464[potassium chromate(VI) co-treated with epigallocatechin gallate] results in decreased expression of NBN mRNACTDPMID:22079256
NbnRat(S)-colchicine increases expressionEXP 6480464Colchicine results in increased expression of NBN mRNACTDPMID:20624997
NbnRat1,2-dimethylhydrazine affects expressionISORGD:73272364804641,2-Dimethylhydrazine affects the expression of NBN mRNACTDPMID:22206623
NbnRat17alpha-ethynylestradiol multiple interactionsISORGD:7327236480464[Tetrachlorodibenzodioxin co-treated with Ethinyl Estradiol] results in decreased expression of NBN mRNACTDPMID:17942748
NbnRat17beta-estradiol increases expressionISORGD:13486116480464Estradiol results in increased expression of NBN mRNACTDPMID:36581016
NbnRat2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine multiple interactionsISORGD:7327236480464[Tetrachlorodibenzodioxin co-treated with Ethinyl Estradiol] results in decreased expression of NBN mRNACTDPMID:17942748
NbnRat2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine increases expressionEXP 6480464Tetrachlorodibenzodioxin results in increased expression of NBN mRNACTDPMID:33387578
NbnRat2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine decreases expressionEXP 6480464Tetrachlorodibenzodioxin results in decreased expression of NBN mRNACTDPMID:21215274
NbnRat2,4-dinitrotoluene affects expressionEXP 64804642,4-dinitrotoluene affects the expression of NBN mRNACTDPMID:21346803
NbnRat2-methoxyethanol decreases expressionEXP 6480464methyl cellosolve results in decreased expression of NBN mRNACTDPMID:19643169
NbnRat2-palmitoylglycerol increases expressionISORGD:134861164804642-palmitoylglycerol results in increased expression of NBN mRNACTDPMID:37199045
NbnRat4-hydroxynon-2-enal decreases expressionISORGD:73272364804644-hydroxy-2-nonenal results in decreased expression of NBN mRNACTDPMID:19191707
NbnRat4-hydroxynon-2-enal decreases expressionISORGD:134861164804644-hydroxy-2-nonenal results in decreased expression of NBN mRNACTDPMID:12419474
NbnRat5-aza-2'-deoxycytidine affects localizationISORGD:13486116480464Decitabine affects the localization of NBN protein modified formCTDPMID:17991895
NbnRat5-fluorouracil multiple interactionsISORGD:13486116480464TP53 protein affects the reaction [Fluorouracil results in decreased expression of NBN mRNA]CTDPMID:15016801
NbnRatacrolein multiple interactionsISORGD:13486116480464[Acrolein co-treated with methacrylaldehyde co-treated with alpha-pinene co-treated with Ozone] results in increased oxidation of more ...CTDPMID:32699268
NbnRataflatoxin M1 decreases expressionISORGD:13486116480464Aflatoxin M1 results in decreased expression of NBN mRNACTDPMID:30928695
NbnRatall-trans-retinoic acid increases expressionISORGD:13486116480464Tretinoin results in increased expression of NBN mRNACTDPMID:33167477
NbnRatalpha-pinene multiple interactionsISORGD:13486116480464[Acrolein co-treated with methacrylaldehyde co-treated with alpha-pinene co-treated with Ozone] results in increased oxidation of more ...CTDPMID:32699268
NbnRatammonium chloride affects expressionEXP 6480464Ammonium Chloride affects the expression of NBN mRNACTDPMID:16483693

1 to 20 of 122 rows

Biological Process
1 to 20 of 82 rows

  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRatblastocyst growth involved_inIEAUniProtKB:Q9R207|ensembl:ENSMUSP000000298791600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatblastocyst growth involved_inISORGD:7327231624291 PMID:14612522RGDPMID:14612522
NbnRatblastocyst growth involved_inISSUniProtKB:Q9R2071600115GO_REF:0000024UniProtGO_REF:0000024
NbnRatDNA damage checkpoint signaling acts_upstream_of_or_withinISORGD:13486111624291 PMID:12529385RGDPMID:12529385
NbnRatDNA damage checkpoint signaling acts_upstream_of_or_withinIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatDNA damage response involved_inIEAInterPro:IPR0165921600115GO_REF:0000002InterProGO_REF:0000002
NbnRatDNA damage response involved_inIEAUniProtKB-KW:KW-02271600115GO_REF:0000043UniProtGO_REF:0000043
NbnRatDNA double-strand break processing involved_inIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatDNA double-strand break processing involved_inISSUniProtKB:O609341600115GO_REF:0000024UniProtGO_REF:0000024
NbnRatDNA double-strand break processing involved_inISORGD:13486111624291 PMID:16622404RGDPMID:16622404
NbnRatDNA repair involved_inIEAInterPro:IPR0165921600115GO_REF:0000002InterProGO_REF:0000002
NbnRatDNA repair involved_inIEAUniProtKB-KW:KW-02341600115GO_REF:0000043UniProtGO_REF:0000043
NbnRatDNA strand resection involved in replication fork processing involved_inIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatDNA strand resection involved in replication fork processing involved_inISORGD:13486111624291 PMID:27814491, PMID:27889449, PMID:30787182RGDPMID:27814491|PMID:27889449|PMID:30787182
NbnRatdouble-strand break repair involved_inIEAInterPro:IPR0402271600115GO_REF:0000002InterProGO_REF:0000002
NbnRatdouble-strand break repair involved_inIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatdouble-strand break repair involved_inISORGD:13486111624291 PMID:9590181RGDPMID:9590181
NbnRatdouble-strand break repair involved_inISSUniProtKB:O609341600115GO_REF:0000024UniProtGO_REF:0000024
NbnRatdouble-strand break repair via alternative nonhomologous end joining involved_inIEAUniProtKB:Q9R207|ensembl:ENSMUSP000000298791600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatdouble-strand break repair via alternative nonhomologous end joining involved_inISORGD:7327231624291 PMID:28216226RGDPMID:28216226
1 to 20 of 82 rows

Cellular Component
1 to 20 of 47 rows

  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRatBRCA1-C complex part_ofISORGD:13486111624291 PMID:16391231RGDPMID:16391231
NbnRatBRCA1-C complex part_ofIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatchromosome located_inIEAUniProtKB-SubCell:SL-04681600115GO_REF:0000044UniProtGO_REF:0000044
NbnRatchromosome located_inIEAUniProtKB-KW:KW-01581600115GO_REF:0000043UniProtGO_REF:0000043
NbnRatchromosome, telomeric region is_active_inISORGD:7327231624291 PMID:28216226RGDPMID:28216226
NbnRatchromosome, telomeric region located_inIEAUniProtKB-KW:KW-07791600115GO_REF:0000043UniProtGO_REF:0000043
NbnRatchromosome, telomeric region is_active_inISORGD:13486111624291 PMID:28216226RGDPMID:28216226
NbnRatchromosome, telomeric region is_active_inISSUniProtKB:O609341600115GO_REF:0000024UniProtGO_REF:0000024
NbnRatchromosome, telomeric region located_inIEAUniProtKB:Q9R207|ensembl:ENSMUSP000000298791600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatchromosome, telomeric region located_inIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatchromosome, telomeric region located_inISORGD:13486111624291 PMID:10888888RGDPMID:10888888
NbnRatchromosome, telomeric region located_inIEAUniProtKB-SubCell:SL-02761600115GO_REF:0000044UniProtGO_REF:0000044
NbnRatchromosome, telomeric region located_inISORGD:7327231624291 PMID:10811102, PMID:23444137RGDPMID:10811102|PMID:23444137
NbnRatGolgi apparatus located_inISORGD:13486111624291 RGDGO_REF:0000052
NbnRatGolgi apparatus located_inIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatMre11 complex part_ofISSUniProtKB:O609341600115GO_REF:0000024UniProtGO_REF:0000024
NbnRatMre11 complex part_ofIEAUniProtKB:Q9R207|ensembl:ENSMUSP000000298791600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatMre11 complex part_ofIBAFB:FBgn0261530|MGI:1351625|PANTHER:PTN000255549|PomBase:SPBC6B1.09c|UniProtKB:O60934|UniProtKB:Q6XV801600115GO_REF:0000033GO_CentralGO_REF:0000033
NbnRatMre11 complex part_ofISORGD:7327231624291 PMID:18854157RGDPMID:18854157
NbnRatMre11 complex part_ofISORGD:13486111624291 PMID:10888888, PMID:19151086, PMID:27889449, PMID:28867292, PMID:30787182, PMID:31147924, PMID:38961290, PMID:9590181RGDPMID:10888888|PMID:19151086|PMID:27889449|PMID:28867292|PMID:30787182|PMID:31147924|PMID:38961290|PMID:9590181
1 to 20 of 47 rows

Molecular Function
1 to 20 of 22 rows

  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRatchromatin-protein adaptor activity enablesISORGD:7327231624291 PMID:28216226RGDPMID:28216226
NbnRatchromatin-protein adaptor activity enablesIEAUniProtKB:Q9R207|ensembl:ENSMUSP000000298791600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatchromatin-protein adaptor activity enablesISSUniProtKB:O609341600115GO_REF:0000024UniProtGO_REF:0000024
NbnRatchromatin-protein adaptor activity enablesIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatchromatin-protein adaptor activity enablesISORGD:13486111624291 PMID:18411307, PMID:18583988, PMID:19804756, PMID:24534091, PMID:27814491, PMID:27889449, PMID:28216226, PMID:30787182, PMID:38961290RGDPMID:18411307|PMID:18583988|PMID:19804756|PMID:24534091|PMID:27814491|PMID:27889449|PMID:28216226|PMID:30787182|PMID:38961290
NbnRatdamaged DNA binding enablesIEAUniProtKB:Q9R207|ensembl:ENSMUSP000000298791600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatdamaged DNA binding enablesIBAMGI:1351625|PANTHER:PTN0002555491600115GO_REF:0000033GO_CentralGO_REF:0000033
NbnRatdamaged DNA binding enablesISORGD:7327231624291 PMID:11934988RGDPMID:11934988
NbnRatDNA-binding transcription factor binding enablesISSUniProtKB:O609341600115GO_REF:0000024UniProtGO_REF:0000024
NbnRatDNA-binding transcription factor binding enablesISORGD:13486111624291UniProtKB:Q01094 PMID:11486038RGDPMID:11486038
NbnRatDNA-binding transcription factor binding enablesIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRathistone binding enablesIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRathistone binding enablesISORGD:13486111624291UniProtKB:P16104 PMID:19338747RGDPMID:19338747
NbnRatphosphorylation-dependent protein binding enablesIEAUniProtKB:O60934|ensembl:ENSP000002654331600115GO_REF:0000107EnsemblGO_REF:0000107
NbnRatphosphorylation-dependent protein binding enablesISSUniProtKB:O609341600115GO_REF:0000024UniProtGO_REF:0000024
NbnRatphosphorylation-dependent protein binding enablesISORGD:13486111624291 PMID:18411307, PMID:18582474, PMID:18583988, PMID:18678890, PMID:19804756, PMID:24534091, PMID:27814491, PMID:30787182RGDPMID:18411307|PMID:18582474|PMID:18583988|PMID:18678890|PMID:19804756|PMID:24534091|PMID:27814491|PMID:30787182
NbnRatprotein binding enablesISORGD:7327231624291UniProtKB:Q61216|UniProtKB:Q8BHZ5 PMID:17429352, PMID:18854157, PMID:30017584RGDPMID:17429352|PMID:18854157|PMID:30017584
NbnRatprotein binding enablesISORGD:13486111624291UniProtKB:O75943|UniProtKB:P15336|UniProtKB:P16104|UniProtKB:P23497|UniProtKB:P49959|UniProtKB:Q09472|UniProtKB:Q13315|UniProtKB:Q13428|UniProtKB:Q14676|UniProtKB:Q61687|UniProtKB:Q68E01|UniProtKB:Q6NTE8|UniProtKB:Q96EB6|UniProtKB:Q99708|UniProtKB:Q99986|UniProtKB:Q9BXW9 PMID:12419185, PMID:12470659, PMID:12607005, PMID:15916964, PMID:16377563, PMID:17500065, PMID:17612497, PMID:18001824, PMID:18001825, PMID:18583988, PMID:18678890, PMID:19609304, PMID:19683501, more ...RGDPMID:12419185|PMID:12470659|PMID:12607005|PMID:15916964|PMID:16377563|PMID:17500065|PMID:17612497|PMID:18001824|PMID:18001825|PMID:18583988|PMID:18678890|PMID:19609304|PMID:19683501|PMID:19759395|PMID:19804756|PMID:20224574|PMID:21108945|PMID:22078559|PMID:22157895|PMID:22565321|PMID:24534091|PMID:24651726|PMID:24981860|PMID:25064736|PMID:25558984|PMID:25895060|PMID:26869104|PMID:27568553|PMID:29656893|PMID:9590181
NbnRatprotein binding enablesISSUniProtKB:O609341600115GO_REF:0000024UniProtGO_REF:0000024
NbnRatprotein serine/threonine kinase activator activity enablesISORGD:13486111624291 PMID:16622404RGDPMID:16622404
1 to 20 of 22 rows

RGD Manual Annotations


  
Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRatataxia telangiectasia-mutated (ATM) signaling pathway   ISORGD:13486118661232 RGD 
NbnRathomologous recombination pathway of double-strand break repair   ISS 1578504 RGD 
NbnRathomologous recombination pathway of double-strand break repair   ISORGD:13486118662366 RGD 

Imported Annotations - KEGG (archival)

Object Symbol
Species
Term
Qualifier
Evidence
With
Reference
Notes
Source
Original Reference(s)
NbnRathomologous recombination pathway of double-strand break repair   IEA 6907045 KEGGrno:03440

1 to 20 of 26 rows
#
Reference Title
Reference Citation
1. ATM protein kinase: the linchpin of cellular defenses to stress. Bhatti S, etal., Cell Mol Life Sci. 2011 Sep;68(18):2977-3006. doi: 10.1007/s00018-011-0683-9. Epub 2011 May 2.
2. Diagnostic markers of ovarian cancer by high-throughput antigen cloning and detection on arrays. Chatterjee M, etal., Cancer Res. 2006 Jan 15;66(2):1181-90.
3. c-Myc directly regulates the transcription of the NBS1 gene involved in DNA double-strand break repair. Chiang YC, etal., J Biol Chem. 2003 May 23;278(21):19286-91. Epub 2003 Mar 13.
4. NBS1 is a prostate cancer susceptibility gene. Cybulski C, etal., Cancer Res. 2004 Feb 15;64(4):1215-9.
5. A Rad50-dependent pathway of DNA repair is deficient in Fanconi anemia fibroblasts. Donahue SL and Campbell C, Nucleic Acids Res 2004 Jun 15;32(10):3248-57. Print 2004.
6. Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27.
7. Regulation of homologous recombination in eukaryotes. Heyer WD, etal., Annu Rev Genet. 2010;44:113-39. doi: 10.1146/annurev-genet-051710-150955.
8. Breast cancer risk is associated with the genes encoding the DNA double-strand break repair Mre11/Rad50/Nbs1 complex. Hsu HM, etal., Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2007 Oct;16(10):2024-32.
9. Deficiency of the Mre11 DNA repair complex in Alzheimer's disease brains. Jacobsen E, etal., Brain Res Mol Brain Res. 2004 Sep 10;128(1):1-7.
10. The MRE11-NBS1-RAD50 pathway is perturbed in SV40 large T antigen-immortalized AT-1, AT-2 and HL-1 cardiomyocytes. Lanson NA Jr, etal., Nucleic Acids Res 2000 Aug 1;28(15):2882-92.
11. NBS1, the Nijmegen breakage syndrome gene product, regulates neuronal proliferation and differentiation. Lee WT, etal., J Neurochem. 2007 Jul;102(1):141-52. Epub 2007 Apr 17.
12. Terminal differentiation of cardiac and skeletal myocytes induces permissivity to AAV transduction by relieving inhibition imposed by DNA damage response proteins. Lovric J, etal., Mol Ther. 2012 Nov;20(11):2087-97. doi: 10.1038/mt.2012.144. Epub 2012 Jul 31.
13. Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 MGD data from the GO Consortium
14. Double-strand break repair and colorectal cancer: gene variants within 3' UTRs and microRNAs binding as modulators of cancer risk and clinical outcome. Naccarati A, etal., Oncotarget. 2016 Apr 26;7(17):23156-69. doi: 10.18632/oncotarget.6804.
15. Electronic Transfer of LocusLink and RefSeq Data NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002
16. Possible involvement of oxidative stress in fenofibrate-induced hepatocarcinogenesis in rats. Nishimura J, etal., Arch Toxicol. 2008 Feb 6.
17. OMIM Disease Annotation Pipeline OMIM Disease Annotation Pipeline
18. KEGG Annotation Import Pipeline Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD
19. GOA pipeline RGD automated data pipeline
20. ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations
1 to 20 of 26 rows
PMID:9590181   PMID:10766245   PMID:10811102   PMID:10888888   PMID:11438675   PMID:11448772   PMID:11486038   PMID:11555636   PMID:11934988   PMID:12447371   PMID:12470659   PMID:12477932  
PMID:12529385   PMID:14612522   PMID:15489334   PMID:15668383   PMID:15790808   PMID:15821748   PMID:15916964   PMID:16374507   PMID:17694070   PMID:18614044   PMID:19135898   PMID:19151086  
PMID:23444137   PMID:27918544   PMID:38372104  



Nbn
(Rattus norvegicus - Norway rat)
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCr8534,256,678 - 34,291,163 (+)NCBIGRCr8
mRatBN7.2529,459,574 - 29,494,152 (+)NCBImRatBN7.2mRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl529,459,457 - 29,494,150 (+)EnsemblmRatBN7.2 Ensembl
UTH_Rnor_SHR_Utx531,615,796 - 31,650,590 (+)NCBIRnor_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0533,208,466 - 33,243,256 (+)NCBIRnor_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0533,168,642 - 33,203,436 (+)NCBIRnor_WKYUTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0
Rnor_6.0529,622,347 - 29,656,877 (+)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl529,622,281 - 29,656,864 (+)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.0534,300,932 - 34,335,393 (+)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.4530,541,610 - 30,576,168 (+)NCBIRGSC3.4RGSC_v3.4rn4RGSC3.4
RGSC_v3.1530,541,609 - 30,576,168 (+)NCBI
Celera528,665,088 - 28,699,404 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map5q13NCBI
NBN
(Homo sapiens - human)
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCh38889,933,331 - 89,984,667 (-)NCBIGRCh38GRCh38hg38GRCh38
GRCh38.p14 Ensembl889,924,515 - 90,003,228 (-)EnsemblGRCh38hg38GRCh38
GRCh37890,945,559 - 90,996,895 (-)NCBIGRCh37GRCh37hg19GRCh37
Build 36891,014,740 - 91,066,075 (-)NCBINCBI36Build 36hg18NCBI36
Build 34891,014,888 - 91,066,072NCBI
Celera887,140,375 - 87,191,710 (-)NCBICelera
Cytogenetic Map8q21.3NCBI
HuRef886,155,741 - 86,207,078 (-)NCBIHuRef
CHM1_1890,986,489 - 91,037,825 (-)NCBICHM1_1
T2T-CHM13v2.0891,056,512 - 91,107,848 (-)NCBIT2T-CHM13v2.0
Nbn
(Mus musculus - house mouse)
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm39415,955,388 - 15,992,589 (+)NCBIGRCm39GRCm39mm39
GRCm39 Ensembl415,957,925 - 15,992,589 (+)EnsemblGRCm39 Ensembl
GRCm38415,957,587 - 15,992,589 (+)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl415,957,925 - 15,992,589 (+)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv37415,885,114 - 15,919,736 (+)NCBIGRCm37MGSCv37mm9NCBIm37
MGSCv36415,885,115 - 15,919,736 (+)NCBIMGSCv36mm8
Celera415,761,229 - 15,795,887 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map4A2NCBI
cM Map46.66NCBI
Nbn
(Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla)
Chinchilla AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChiLan1.0 EnsemblNW_0049554176,839,312 - 6,880,133 (-)EnsemblChiLan1.0
ChiLan1.0NW_0049554176,840,916 - 6,880,479 (-)NCBIChiLan1.0ChiLan1.0
NBN
(Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee)
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
NHGRI_mPanPan1-v27107,329,160 - 107,380,523 (-)NCBINHGRI_mPanPan1-v2
NHGRI_mPanPan1882,868,830 - 82,938,522 (-)NCBINHGRI_mPanPan1
Mhudiblu_PPA_v0886,622,797 - 86,674,202 (-)NCBIMhudiblu_PPA_v0Mhudiblu_PPA_v0panPan3
PanPan1.1888,575,198 - 88,626,200 (-)NCBIpanpan1.1PanPan1.1panPan2
PanPan1.1 Ensembl888,575,198 - 88,626,307 (-)Ensemblpanpan1.1panPan2
NBN
(Canis lupus familiaris - dog)
Dog AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
CanFam3.12935,416,093 - 35,477,569 (-)NCBICanFam3.1CanFam3.1canFam3CanFam3.1
CanFam3.1 Ensembl2935,416,093 - 35,477,563 (-)EnsemblCanFam3.1canFam3CanFam3.1
Dog10K_Boxer_Tasha2935,567,773 - 35,628,935 (-)NCBIDog10K_Boxer_Tasha
ROS_Cfam_1.02935,612,774 - 35,674,851 (-)NCBIROS_Cfam_1.0
ROS_Cfam_1.0 Ensembl2935,612,774 - 35,692,878 (-)EnsemblROS_Cfam_1.0 Ensembl
UMICH_Zoey_3.12935,604,159 - 35,665,432 (-)NCBIUMICH_Zoey_3.1
UNSW_CanFamBas_1.02935,624,597 - 35,685,889 (-)NCBIUNSW_CanFamBas_1.0
UU_Cfam_GSD_1.02936,059,084 - 36,120,657 (-)NCBIUU_Cfam_GSD_1.0
Nbn
(Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel)
Squirrel AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HiC_Itri_2NW_02440530343,980,776 - 44,018,864 (+)NCBIHiC_Itri_2
SpeTri2.0 EnsemblNW_0049365443,775,220 - 3,808,837 (-)EnsemblSpeTri2.0SpeTri2.0 Ensembl
SpeTri2.0NW_0049365443,773,828 - 3,812,673 (-)NCBISpeTri2.0SpeTri2.0SpeTri2.0
NBN
(Sus scrofa - pig)
Pig AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
Sscrofa11.1 Ensembl446,787,691 - 46,874,603 (+)EnsemblSscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa11.1446,787,664 - 46,854,331 (+)NCBISscrofa11.1Sscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa10.2451,264,106 - 51,288,533 (+)NCBISscrofa10.2Sscrofa10.2susScr3
NBN
(Chlorocebus sabaeus - green monkey)
Green Monkey AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChlSab1.1885,017,807 - 85,069,219 (-)NCBIChlSab1.1ChlSab1.1chlSab2
ChlSab1.1 Ensembl885,015,752 - 85,069,028 (-)EnsemblChlSab1.1ChlSab1.1 EnsemblchlSab2
Vero_WHO_p1.0NW_02366603955,810,092 - 55,861,864 (+)NCBIVero_WHO_p1.0Vero_WHO_p1.0
Nbn
(Heterocephalus glaber - naked mole-rat)
Naked Mole-Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HetGla_female_1.0 EnsemblNW_0046247442,013,922 - 2,061,708 (+)EnsemblHetGla_female_1.0HetGla_female_1.0 EnsemblhetGla2
HetGla 1.0NW_0046247442,013,936 - 2,061,726 (+)NCBIHetGla_female_1.0HetGla 1.0hetGla2

.

.
Variants in Nbn
442 total Variants

Predicted Target Of
Summary Value
Count of predictions:196
Count of miRNA genes:148
Interacting mature miRNAs:159
Transcripts:ENSRNOT00000012377
Prediction methods:Microtar, Miranda, Targetscan
Result types:miRGate_prediction

The detailed report is available here: Full Report CSV TAB Printer

miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/).
For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here.


1 to 10 of 20 rows
The following QTLs overlap with this region.    Full Report CSV TAB Printer Gviewer
RGD ID
Symbol
Name
LOD
P Value
Trait
Sub Trait
Chr
Start
Stop
Species
2293666Bmd38Bone mineral density QTL 384.4femur size trait (VT:1000369)femoral neck cortical cross-sectional area (CMO:0001702)5894822853948228Rat
1578776Stresp18Stress response QTL 182.9thymus mass (VT:0004954)thymus wet weight (CMO:0000855)52795544072955440Rat
1576314Eutr1Estrogen induced uterine response QTL 1uterus integrity trait (VT:0010575)pyometritis severity score (CMO:0002009)52138965166875058Rat
6903306Scl35Serum cholesterol QTL 352.60.0073blood cholesterol amount (VT:0000180)plasma total cholesterol level (CMO:0000585)52851548973515489Rat
70212Niddm25Non-insulin dependent diabetes mellitus QTL 253.54blood glucose amount (VT:0000188)blood glucose level (CMO:0000046)51131345958Rat
1358353Srcrtb2Stress Responsive Cort Basal QTL 23.480.003blood corticosterone amount (VT:0005345)plasma corticosterone level (CMO:0001173)51887394774251464Rat
1300117Hrtrt8Heart rate QTL 83.49heart pumping trait (VT:2000009)heart rate (CMO:0000002)5384401847869213Rat
7394712Emca13Estrogen-induced mammary cancer QTL 13mammary gland integrity trait (VT:0010552)mammary tumor number (CMO:0000343)5982326699753708Rat
634305Mamtr1Mammary tumor resistance QTL 10.0001mammary gland integrity trait (VT:0010552)mammary tumor number (CMO:0000343)512789751113558310Rat
1331771Rf35Renal function QTL 354.36965kidney blood vessel physiology trait (VT:0100012)absolute change in renal blood flow rate (CMO:0001168)572947086724018Rat

1 to 10 of 20 rows
AW530937  
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
mRatBN7.2529,486,006 - 29,486,190 (+)MAPPERmRatBN7.2
Rnor_6.0529,648,732 - 29,648,915NCBIRnor6.0
Rnor_5.0534,327,248 - 34,327,431UniSTSRnor5.0
RGSC_v3.4530,568,048 - 30,568,231UniSTSRGSC3.4
Celera528,691,328 - 28,691,511UniSTS
RH 3.4 Map5162.33UniSTS
Cytogenetic Map5q13UniSTS




alimentary part of gastrointestinal system
appendage
circulatory system
ectoderm
endocrine system
endoderm
exocrine system
hemolymphoid system
hepatobiliary system
integumental system
mesenchyme
mesoderm
nervous system
renal system
reproductive system
respiratory system
9 11 49 113 91 90 59 25 59 6 218 97 93 45 60 31



Ensembl Acc Id: ENSRNOT00000012377   ⟹   ENSRNOP00000012377
Type: CODING
Position:
Rat AssemblyChrPosition (strand)Source
mRatBN7.2 Ensembl529,459,457 - 29,494,150 (+)Ensembl
Rnor_6.0 Ensembl529,622,281 - 29,656,864 (+)Ensembl
Ensembl Acc Id: ENSRNOT00000111074   ⟹   ENSRNOP00000091774
Type: CODING
Position:
Rat AssemblyChrPosition (strand)Source
mRatBN7.2 Ensembl529,464,003 - 29,491,605 (+)Ensembl
RefSeq Acc Id: NM_138873   ⟹   NP_620228
RefSeq Status: PROVISIONAL
Type: CODING
Position:
Rat AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCr8534,256,678 - 34,291,138 (+)NCBI
mRatBN7.2529,459,663 - 29,494,127 (+)NCBI
Rnor_6.0529,622,347 - 29,656,852 (+)NCBI
Rnor_5.0534,300,932 - 34,335,393 (+)NCBI
RGSC_v3.4530,541,610 - 30,576,168 (+)RGD
Celera528,665,088 - 28,699,404 (+)RGD
Sequence:
RefSeq Acc Id: XM_006237916   ⟹   XP_006237978
Type: CODING
Position:
Rat AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCr8534,256,835 - 34,291,163 (+)NCBI
mRatBN7.2529,459,796 - 29,494,152 (+)NCBI
Rnor_6.0529,622,515 - 29,656,877 (+)NCBI
Rnor_5.0534,300,932 - 34,335,393 (+)NCBI
Sequence:
RefSeq Acc Id: XM_039110890   ⟹   XP_038966818
Type: CODING
Position:
Rat AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCr8534,262,722 - 34,291,163 (+)NCBI
mRatBN7.2529,459,574 - 29,493,983 (+)NCBI
1 to 9 of 9 rows
Protein RefSeqs NP_620228 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer  
  XP_006237978 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer  
  XP_038966818 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer  
GenBank Protein AAF91228 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer  
  AAH85700 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer  
  EDL98480 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer  
Ensembl Protein ENSRNOP00000012377
  ENSRNOP00000091774
GenBank Protein Q9JIL9 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer  
1 to 9 of 9 rows
RefSeq Acc Id: NP_620228   ⟸   NM_138873
- UniProtKB: Q5RKL2 (UniProtKB/Swiss-Prot),   Q9JIL9 (UniProtKB/Swiss-Prot)
- Sequence:
RefSeq Acc Id: XP_006237978   ⟸   XM_006237916
- Peptide Label: isoform X1
- UniProtKB: A6IIB0 (UniProtKB/TrEMBL)
- Sequence:
Ensembl Acc Id: ENSRNOP00000012377   ⟸   ENSRNOT00000012377
RefSeq Acc Id: XP_038966818   ⟸   XM_039110890
- Peptide Label: isoform X2
Ensembl Acc Id: ENSRNOP00000091774   ⟸   ENSRNOT00000111074
BRCT   FHA

Name Modeler Protein Id AA Range Protein Structure
AF-Q9JIL9-F1-model_v2 AlphaFold Q9JIL9 1-750 view protein structure


eQTL   View at Phenogen
WGCNA   View at Phenogen
Tissue/Strain Expression   View at Phenogen

RGD ID:13693580
Promoter ID:EPDNEW_R4105
Type:initiation region
Name:Nbn_1
Description:nibrin
SO ACC ID:SO:0000170
Source:EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/)
Experiment Methods:Single-end sequencing.
Position:
Rat AssemblyChrPosition (strand)Source
Rnor_6.0529,622,259 - 29,622,319EPDNEW


1 to 40 of 41 rows
Database
Acc Id
Source(s)
BioCyc Gene G2FUF-41861 BioCyc
Ensembl Genes ENSRNOG00000008580 Ensembl, ENTREZGENE
Ensembl Transcript ENSRNOT00000012377 ENTREZGENE
  ENSRNOT00000111074 ENTREZGENE
Gene3D-CATH 2.60.200.20 UniProtKB/Swiss-Prot
  3.40.50.10190 UniProtKB/Swiss-Prot
  3.40.50.10980 UniProtKB/Swiss-Prot
IMAGE_CLONE IMAGE:7130978 IMAGE-MGC_LOAD
InterPro BRCT_dom UniProtKB/Swiss-Prot
  BRCT_dom_sf UniProtKB/Swiss-Prot
  DNA-repair_Nbs1_C UniProtKB/Swiss-Prot
  FHA_dom UniProtKB/Swiss-Prot
  Nibrin-rel UniProtKB/Swiss-Prot
  Nibrin_BRCT2 UniProtKB/Swiss-Prot
  Nibrin_BRCT2_sf UniProtKB/Swiss-Prot
  Nibrin_met UniProtKB/Swiss-Prot
  SMAD_FHA_dom_sf UniProtKB/Swiss-Prot
KEGG Report rno:85482 UniProtKB/Swiss-Prot
MGC_CLONE MGC:93174 IMAGE-MGC_LOAD
NCBI Gene 85482 ENTREZGENE
PANTHER NIBRIN UniProtKB/Swiss-Prot
  PTHR12162 UniProtKB/Swiss-Prot
Pfam BRCT UniProtKB/Swiss-Prot
  FHA UniProtKB/Swiss-Prot
  Nbs1_C UniProtKB/Swiss-Prot
  NIBRIN_BRCT_II UniProtKB/Swiss-Prot
PhenoGen Nbn PhenoGen
PIRSF Nibrin_animal UniProtKB/Swiss-Prot
PROSITE FHA_DOMAIN UniProtKB/Swiss-Prot
RatGTEx ENSRNOG00000008580 RatGTEx
SMART FHA UniProtKB/Swiss-Prot
  Nbs1_C UniProtKB/Swiss-Prot
Superfamily-SCOP SSF49879 UniProtKB/Swiss-Prot
  SSF52113 UniProtKB/Swiss-Prot
UniProt A0A8I6AGS6_RAT UniProtKB/TrEMBL
  A6IIB0 ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL
  G3V766_RAT UniProtKB/TrEMBL
  NBN_RAT UniProtKB/Swiss-Prot
  Q5RKL2 ENTREZGENE
  Q9JIL9 ENTREZGENE
1 to 40 of 41 rows


Date Current Symbol Current Name Previous Symbol Previous Name Description Reference Status
2005-01-20 Nbn  nibrin      Symbol and Name status set to approved 1299863 APPROVED
2002-08-07 Nbn  nibrin      Symbol and Name status set to provisional 70820 PROVISIONAL

Note Type Note Reference
gene_expression expressed in heart, peak expression at postnatal day 10 68816