Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Fbxo31 | Rat | autosomal recessive intellectual developmental disorder 45 | | ISO | FBXO31 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Fbxo31 | Rat | autosomal recessive intellectual developmental disorder 45 | | ISO | FBXO31 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 3. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 4. | The centrosomal E3 ubiquitin ligase FBXO31-SCF regulates neuronal morphogenesis and migration. | Vadhvani M, etal., PLoS One. 2013;8(2):e57530. doi: 10.1371/journal.pone.0057530. Epub 2013 Feb 28. |
| Fbxo31 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| FBXO31 (Homo sapiens - human) |
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| Fbxo31 (Mus musculus - house mouse) |
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| Fbxo31 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| FBXO31 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| FBXO31 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Fbxo31 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| FBXO31 (Sus scrofa - pig) |
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| FBXO31 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Fbxo31 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Fbxo31 (Rattus rattus - black rat) |
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
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visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 161 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 140 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001044259 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| NM_001414926 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006255719 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006255720 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | BC110046 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| BC166840 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473972 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000019 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000068764 ⟹ ENSRNOP00000063581 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000074005 ⟹ ENSRNOP00000067191 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000079651 ⟹ ENSRNOP00000070481 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001044259 ⟹ NP_001037724 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | NM_001414926 ⟹ NP_001401855 | ||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Protein RefSeqs | NP_001037724 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| NP_001401855 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAI10047 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| AAI66840 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| B2RYN2 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL92722 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL92723 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL92724 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000063581 | ||
| ENSRNOP00000063581.2 | |||
| ENSRNOP00000070481 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001037724 ⟸ NM_001044259 |
| - Peptide Label: | isoform 1 |
| - UniProtKB: | B2RYN2 (UniProtKB/Swiss-Prot), A6IZP5 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000070481 ⟸ ENSRNOT00000079651 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000063581 ⟸ ENSRNOT00000068764 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000067191 ⟸ ENSRNOT00000074005 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001401855 ⟸ NM_001414926 |
| - Peptide Label: | isoform 2 |
| - UniProtKB: | A0A8L2R3E7 (UniProtKB/TrEMBL), A6IZP5 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-B2RYN2-F1-model_v2 | AlphaFold | B2RYN2 | 1-507 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13701191 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R11714 | ||||||||
| Type: | initiation region | ||||||||
| Name: | Fbxo31_1 | ||||||||
| Description: | F-box protein 31 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1561069 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-5429 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000042274 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000068764 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000068764.4 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| ENSRNOT00000079651 | ENTREZGENE | |
| Gene3D-CATH | 1.20.1280.50 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:7302542 | IMAGE-MGC_LOAD |
| IMAGE:9027777 | IMAGE-MGC_LOAD | |
| InterPro | F-box-like_dom_sf | UniProtKB/Swiss-Prot |
| F-box_dom | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| FBXO31/39 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | rno:498959 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| MGC_CLONE | MGC:125122 | IMAGE-MGC_LOAD |
| MGC:188731 | IMAGE-MGC_LOAD | |
| NCBI Gene | 498959 | ENTREZGENE |
| PANTHER | F-BOX ONLY PROTEIN 31 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PTHR10706 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | Cyclin_D1_bind | UniProtKB/Swiss-Prot |
| F-box-like | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| PhenoGen | Fbxo31 | PhenoGen |
| PROSITE | FBOX | UniProtKB/Swiss-Prot |
| RatGTEx | ENSRNOG00000042274 | RatGTEx |
| SMART | FBOX | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Superfamily-SCOP | SSF81383 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniProt | A0A8L2R3E7 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A6IZP5 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| B2RYN2 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Q2YDU9_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-12-02 | Fbxo31 | F-box protein 31 | RGD1561069 | similar to F-box only protein 31 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-04-30 | RGD1561069 | similar to F-box only protein 31 | RGD1561069_predicted | similar to F-box only protein 31 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2006-03-07 | RGD1561069_predicted | similar to F-box only protein 31 (predicted) | LOC498959 | similar to F-box only protein 31 | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
| 2006-02-09 | LOC498959 | similar to F-box only protein 31 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |