Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Mrm2 | Rat | mitochondrial DNA depletion syndrome 17 | | ISO | MRM2 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Mrm2 | Rat | mitochondrial DNA depletion syndrome 17 | | ISO | MRM2 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Identification and characterization of FTSJ2, a novel human nucleolar protein homologous to bacterial ribosomal RNA methyltransferase. | Ching YP, etal., Genomics 2002 Jan;79(1):2-6. |
| 2. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 3. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 4. | Comprehensive gene review and curation | RGD comprehensive gene curation |
| Mrm2 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MRM2 (Homo sapiens - human) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mrm2 (Mus musculus - house mouse) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mrm2 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MRM2 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MRM2 (Canis lupus familiaris - dog) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mrm2 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MRM2 (Sus scrofa - pig) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MRM2 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mrm2 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mrm2 (Rattus rattus - black rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
.
Variants in Mrm2
22 total Variants
|
| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
||||||||
| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
|
alimentary part of gastrointestinal system
|
appendage
|
circulatory system
|
ectoderm
|
endocrine system
|
endoderm
|
exocrine system
|
hemolymphoid system
|
hepatobiliary system
|
integumental system
|
mesenchyme
|
mesoderm
|
musculoskeletal system
|
nervous system
|
renal system
|
reproductive system
|
respiratory system
|
sensory system
|
visual system
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 160 | 91 | 90 | 59 | 87 | 59 | 6 | 351 | 187 | 11 | 139 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000042366 ⟹ ENSRNOP00000050915 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001107125 ⟹ NP_001100595 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039089388 ⟹ XP_038945316 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| Protein RefSeqs | NP_001100595 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_038945316 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | EDL89739 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000050915 | ||
| ENSRNOP00000050915.3 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001100595 ⟸ NM_001107125 |
| - UniProtKB: | D3ZGI8 (UniProtKB/TrEMBL), A6K1T1 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000050915 ⟸ ENSRNOT00000042366 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038945316 ⟸ XM_039089388 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-D3ZGI8-F1-model_v2 | AlphaFold | D3ZGI8 | 1-246 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13698457 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R8982 | ||||||||
| Type: | single initiation site | ||||||||
| Name: | Mrm2_1 | ||||||||
| Description: | mitochondrial rRNA methyltransferase 2 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
|
| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1305944 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-19911 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000043267 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000042366 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000042366.5 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 3.40.50.150 | UniProtKB/TrEMBL |
| InterPro | RNA_methyltr_RlmE | UniProtKB/TrEMBL |
| rRNA-MeTfrase_J | UniProtKB/TrEMBL | |
| rRNA_MeTrfase_RrmJ/FtsJ | UniProtKB/TrEMBL | |
| SAM-dependent_MTases-like | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:304323 | UniProtKB/TrEMBL |
| NCBI Gene | 304323 | ENTREZGENE |
| PANTHER | RIBOSOMAL RNA METHYLTRANSFERASE | UniProtKB/TrEMBL |
| RRNA METHYLTRANSFERASE 2, MITOCHONDRIAL | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | FtsJ | UniProtKB/TrEMBL |
| PhenoGen | Mrm2 | PhenoGen |
| PIRSF | 23S_rRNA_mtase | UniProtKB/TrEMBL |
| RatGTEx | ENSRNOG00000043267 | RatGTEx |
| Superfamily-SCOP | SSF53335 | UniProtKB/TrEMBL |
| UniProt | A6K1T1 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| D3ZGI8 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2016-04-20 | Mrm2 | mitochondrial rRNA methyltransferase 2 | Ftsj2 | FtsJ RNA methyltransferase homolog 2 (E. coli) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2012-07-16 | Ftsj2 | FtsJ RNA methyltransferase homolog 2 (E. coli) | Ftsj2 | FtsJ homolog 2 (E. coli) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-04-30 | Ftsj2 | FtsJ homolog 2 (E. coli) | Ftsj2_predicted | FtsJ homolog 2 (E. coli) (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2005-01-12 | Ftsj2_predicted | FtsJ homolog 2 (E. coli) (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |