Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Med14 | Rat | endometriosis | | ISO | MED14 (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:22138541 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Med14 | Rat | endometriosis | | ISO | MED14 (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:22138541 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | Novel glucocorticoid receptor coactivator effector mechanisms. | Jenkins BD, etal., Trends Endocrinol Metab. 2001 Apr;12(3):122-6. |
| 3. | The Mediator complex and transcription regulation. | Poss ZC, etal., Crit Rev Biochem Mol Biol. 2013 Nov-Dec;48(6):575-608. doi: 10.3109/10409238.2013.840259. Epub 2013 Oct 3. |
| 4. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 5. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 6. | Comprehensive gene review and curation | RGD comprehensive gene curation |
| PMID:10198638 | PMID:10235267 | PMID:11867769 | PMID:12037571 | PMID:12218053 | PMID:15340084 | PMID:15632090 | PMID:19946888 | PMID:20508642 | PMID:20720539 |
| Med14 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| MED14 (Homo sapiens - human) |
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| Med14 (Mus musculus - house mouse) |
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| Med14 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| MED14 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| MED14 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Med14 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| MED14 (Sus scrofa - pig) |
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| MED14 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Med14 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Med14 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Med14
738 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| DXS7582 |
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| RH127471 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 165 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 144 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001191727 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_017602059 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017602060 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_039099757 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | CH474009 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| FQ214390 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000021 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000066480 ⟹ ENSRNOP00000063505 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000093176 ⟹ ENSRNOP00000076161 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000093181 ⟹ ENSRNOP00000076132 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000093346 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000093450 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000093665 ⟹ ENSRNOP00000076292 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001191727 ⟹ NP_001178656 | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039099757 ⟹ XP_038955685 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| Protein RefSeqs | NP_001178656 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_038955685 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | EDL97637 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDL97638 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000063505 | ||
| ENSRNOP00000063505.1 | |||
| ENSRNOP00000076132 | |||
| ENSRNOP00000076132.2 | |||
| ENSRNOP00000080139.1 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001178656 ⟸ NM_001191727 |
| - UniProtKB: | D4A020 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000076292 ⟸ ENSRNOT00000093665 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000063505 ⟸ ENSRNOT00000066480 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000076132 ⟸ ENSRNOT00000093181 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000076161 ⟸ ENSRNOT00000093176 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038955685 ⟸ XM_039099757 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A0A1W2Q643 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-D4A020-F1-model_v2 | AlphaFold | D4A020 | 1-1459 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13701719 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R12234 | ||||||||
| Type: | multiple initiation site | ||||||||
| Name: | Med14_2 | ||||||||
| Description: | mediator complex subunit 14 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Alternative Promoters: | null; see alsoEPDNEW_R12235 | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| RGD ID: | 13701712 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R12235 | ||||||||
| Type: | initiation region | ||||||||
| Name: | Med14_1 | ||||||||
| Description: | mediator complex subunit 14 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Alternative Promoters: | null; see alsoEPDNEW_R12234 | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1560170 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-3066 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000003792 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000066480 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000066480.4 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000093181 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000093181.3 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000093346.3 | UniProtKB/TrEMBL | |
| InterPro | Med14_C | UniProtKB/TrEMBL |
| Med14_N | UniProtKB/TrEMBL | |
| Med14_RM2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Med14_RM6 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Med14_RM8 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Mediator_Med14 | UniProtKB/TrEMBL | |
| RM3_Med14 | UniProtKB/TrEMBL | |
| RM5_Med14 | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:317343 | UniProtKB/TrEMBL |
| NCBI Gene | 317343 | ENTREZGENE |
| PANTHER | MEDIATOR OF RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION SUBUNIT 14 | UniProtKB/TrEMBL |
| PTHR12809 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | MED14 | UniProtKB/TrEMBL |
| Med14_C | UniProtKB/TrEMBL | |
| Med14_RM2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Med14_RM6 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Med14_RM8 | UniProtKB/TrEMBL | |
| RM3_Med14 | UniProtKB/TrEMBL | |
| RM5_Med14 | UniProtKB/TrEMBL | |
| PhenoGen | Med14 | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000003792 | RatGTEx |
| UniProt | A0A1W2Q643 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0A8I5ZQ17_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| D4A020 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| W8C3Y3_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-02-28 | Med14 | mediator complex subunit 14 | RGD1560170_predicted | similar to cofactor required for Sp1 transcriptional activation, subunit 2, 150kDa (predicted) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2006-03-07 | RGD1560170_predicted | similar to cofactor required for Sp1 transcriptional activation, subunit 2, 150kDa (predicted) | LOC317343 | similar to cofactor required for Sp1 transcriptional activation, subunit 2, 150kDa | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
| 2006-02-09 | LOC317343 | similar to cofactor required for Sp1 transcriptional activation, subunit 2, 150kDa | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |