RGD DISEASE ONTOLOGY - ANNOTATIONS
RGD uses the Human Disease Ontology (DO, https://disease-ontology.org/) for disease curation across species. RGD automatically downloads each new release of the ontology on a monthly basis. Some additional terms which are required for RGD's curation purposes but are not currently covered in the official version of DO have been added. As corresponding terms are added to DO, these custom terms are retired and the DO terms substituted in existing annotations and subsequently used for curation.
Term: familial adenomatous polyposis 2
Accession: DOID:0080410
browse the term
Definition: A familial adenomatous polyposis that has_material_basis_in homozygous or compound heterozygous mutation in the MUTYH gene on chromosome 1p34. (DO)
Synonyms: exact_synonym: Colorectal Adenomatous Polyposis, Autosomal Recessive; FAP2; MUTYH-related attenuated FAP; MUTYH-related attenuated familial adenomatous polyposis; MUTYH-related attenuated familial polyposis coli; multiple colorectal adenomas, autosomal recessive; mutyh-associated polyposis
narrow_synonym: COLORECTAL ADENOMATOUS POLYPOSIS, AUTOSOMAL RECESSIVE, WITH PILOMATRICOMAS
primary_id: MESH:C563924
alt_id: OMIM:608456
xref: EFO:0009296 ; ICD10CM:D12.6 ; ORDO:247798
G
Bard1
BRCA1 associated RING domain 1
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2
ClinVar
PMID:25186627 PMID:25741868 PMID:26315354 PMID:26467025 PMID:27443514 PMID:28492532 PMID:29596542 PMID:32268276 PMID:33118316 PMID:33471991 More...
NCBI chr 9:72,616,070...72,694,553
Ensembl chr 9:72,623,155...72,694,265
G
Eif2b3
eukaryotic translation initiation factor 2B subunit gamma
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2
ClinVar
PMID:28492532
NCBI chr 5:130,492,167...130,558,692
Ensembl chr 5:130,492,220...130,563,332
G
Hectd3
HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 3
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2
ClinVar
PMID:28492532
NCBI chr 5:130,469,840...130,479,802
Ensembl chr 5:130,469,840...130,478,561
G
Hpdl
4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2
ClinVar
PMID:16557584 PMID:17949294 PMID:19806110 PMID:25820570 PMID:28492532
NCBI chr 5:130,286,627...130,288,233
Ensembl chr 5:130,286,631...130,288,233
G
Mutyh
mutY DNA glycosylase
ISO
ClinVar Annotator: match by term: MUTYH-related attenuated familial adenomatous polyposis CTD Direct Evidence: marker/mechanism ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2 | ClinVar Annotator: match by term: MUTYH-related attenuated familial adenomatous polyposis
OMIM ClinVar CTD
PMID:166460 PMID:186631 PMID:517270 PMID:545764 PMID:2084865 PMID:9536098 PMID:9846876 PMID:10612827 PMID:11051386 PMID:11092888 PMID:11295288 PMID:11433026 PMID:11801590 PMID:11805113 PMID:11818965 PMID:11864576 PMID:12056405 PMID:12393807 PMID:12606733 PMID:12707038 PMID:12853198 PMID:12917422 PMID:14579148 PMID:14618256 PMID:14633673 PMID:14991577 PMID:14999774 PMID:15034862 PMID:15036665 PMID:15180946 PMID:15188161 PMID:15236166 PMID:15273732 PMID:15326180 PMID:15366000 PMID:15465463 PMID:15635083 PMID:15673720 PMID:15690400 PMID:15761860 PMID:15890374 PMID:15931596 PMID:15943555 PMID:15987719 PMID:16042573 PMID:16134146 PMID:16134147 PMID:16140997 PMID:16199547 PMID:16207212 PMID:16234049 PMID:16287072 PMID:16338133 PMID:16408224 PMID:16455870 PMID:16492921 PMID:16557584 PMID:16616356 PMID:16645203 PMID:16774938 PMID:16890597 PMID:16929514 PMID:16941501 PMID:16996809 PMID:17031395 PMID:17081686 PMID:17122612 PMID:17161978 PMID:17207658 PMID:17219385 PMID:17252231 PMID:17273161 PMID:17368238 PMID:17369389 PMID:17489848 PMID:17524638 PMID:17576681 PMID:17581577 PMID:17674103 PMID:17703316 PMID:17874208 PMID:17931073 PMID:17949294 PMID:17956577 PMID:18091433 PMID:18172263 PMID:18271935 PMID:18294051 PMID:18301448 PMID:18414213 PMID:18422726 PMID:18433509 PMID:18495334 PMID:18506705 PMID:18515411 PMID:18534194 PMID:18564191 PMID:18776649 PMID:18787472 PMID:18811933 PMID:18992148 PMID:19031083 PMID:19032956 PMID:19245865 PMID:19279422 PMID:19300419 PMID:19394335 PMID:19414147 PMID:19443904 PMID:19479711 PMID:19506731 PMID:19527492 PMID:19531215 PMID:19620482 PMID:19725997 PMID:19732775 PMID:19793053 PMID:19806110 PMID:19836313 PMID:19841264 PMID:19953527 PMID:19998059 PMID:20110747 PMID:20149637 PMID:20191381 PMID:20223003 PMID:20418187 PMID:20571908 PMID:20618354 PMID:20628285 PMID:20663686 PMID:20687945 PMID:20725929 PMID:20816984 PMID:20848659 PMID:21061173 PMID:21063410 PMID:21078199 PMID:21153778 PMID:21167187 PMID:21171015 PMID:21178863 PMID:21195604 PMID:21235684 PMID:21287799 PMID:21424714 PMID:21443744 PMID:21520333 PMID:21777424 PMID:21815886 PMID:21901162 PMID:21952991 PMID:21962078 PMID:22158503 PMID:22252118 PMID:22266422 PMID:22297469 PMID:22402879 PMID:22473953 PMID:22538434 PMID:22641385 PMID:22703879 PMID:22722201 PMID:22744763 PMID:22773231 PMID:22865608 PMID:22922830 PMID:22926731 PMID:22976915 PMID:23007840 PMID:23035301 PMID:23108399 PMID:23322991 PMID:23361220 PMID:23383274 PMID:23460355 PMID:23507534 PMID:23561487 PMID:23599153 PMID:23605219 PMID:23621914 PMID:23625202 PMID:23677194 PMID:23729658 PMID:23805267 PMID:23820649 PMID:24033266 PMID:24039736 PMID:24082139 PMID:24278394 PMID:24377541 PMID:24444654 PMID:24470512 PMID:24556621 PMID:24569162 PMID:24691292 PMID:24728327 PMID:24733792 PMID:24763289 PMID:24799981 PMID:24834277 PMID:24953332 PMID:25151137 PMID:25186627 PMID:25197429 PMID:25307848 PMID:25318351 PMID:25326637 PMID:25368107 PMID:25503501 PMID:25525159 PMID:25559809 PMID:25569433 PMID:25590978 PMID:25637381 PMID:25640679 PMID:25741868 PMID:25820570 PMID:25856671 PMID:25892863 PMID:25927356 PMID:25937855 PMID:25938944 PMID:25957691 PMID:25980754 PMID:25995449 PMID:26138249 PMID:26202870 PMID:26269718 PMID:26296696 PMID:26300997 PMID:26332594 PMID:26377631 PMID:26414517 PMID:26436112 PMID:26446593 PMID:26467025 PMID:26511139 PMID:26517685 PMID:26556299 PMID:26580448 PMID:26600934 PMID:26615199 PMID:26632267 PMID:26673696 PMID:26681312 PMID:26684149 PMID:26684191 PMID:26689913 PMID:26694661 PMID:26822237 PMID:26824983 PMID:26832770 PMID:26837502 PMID:26845104 PMID:26900293 PMID:26902849 PMID:26944241 PMID:26947005 PMID:26976419 PMID:27014339 PMID:27077130 PMID:27145315 PMID:27153395 PMID:27194394 PMID:27276934 PMID:27377421 PMID:27443514 PMID:27600092 PMID:27631816 PMID:27696107 PMID:27705013 PMID:27720647 PMID:27732944 PMID:27783336 PMID:27797849 PMID:27799157 PMID:27829682 PMID:27870730 PMID:27878467 PMID:27978560 PMID:28087410 PMID:28127763 PMID:28130451 PMID:28135048 PMID:28135145 PMID:28141798 PMID:28152038 PMID:28166811 PMID:28195393 PMID:28199314 PMID:28202063 PMID:28243543 PMID:28251689 PMID:28332257 PMID:28349240 PMID:28445943 PMID:28491533 PMID:28492532 PMID:28495237 PMID:28502729 PMID:28503720 PMID:28526081 PMID:28533537 PMID:28551381 PMID:28577310 PMID:28608266 PMID:28634180 PMID:28644590 PMID:28687356 PMID:28709830 PMID:28717660 PMID:28726808 PMID:28790112 PMID:28861346 PMID:28873161 PMID:28873162 PMID:28944238 PMID:28961279 PMID:29093764 PMID:29147111 PMID:29192238 PMID:29212164 PMID:29330641 PMID:29360161 PMID:29368341 PMID:29371908 PMID:29406563 PMID:29431110 PMID:29458332 PMID:29478780 PMID:29484706 PMID:29506128 PMID:29557500 PMID:29610499 PMID:29625052 PMID:29641532 PMID:29667044 PMID:29684080 PMID:29700634 PMID:29754767 PMID:29766397 PMID:29785153 PMID:29879026 PMID:29915346 PMID:29954149 PMID:29967336 PMID:29978187 PMID:30067863 PMID:30093976 PMID:30098577 PMID:30122538 PMID:30151275 PMID:30151276 PMID:30256826 PMID:30267214 PMID:30291343 PMID:30306255 PMID:30309722 PMID:30322717 PMID:30333958 PMID:30357411 PMID:30374176 PMID:30487145 PMID:30564557 PMID:30582135 PMID:30604180 PMID:30609409 PMID:30613976 PMID:30620386 PMID:30666091 PMID:30675318 PMID:30676620 PMID:30680046 PMID:30702970 PMID:30716719 PMID:30719162 PMID:30787465 PMID:30833417 PMID:30833958 PMID:30836094 PMID:30850667 PMID:30852976 PMID:30877237 PMID:30886832 PMID:30927264 PMID:30953464 PMID:30982232 PMID:31062380 PMID:31090900 PMID:31104418 PMID:31159747 PMID:31203172 PMID:31214250 PMID:31220976 PMID:31263571 PMID:31273614 PMID:31277343 PMID:31285513 PMID:31350202 PMID:31360874 PMID:31422818 PMID:31447099 PMID:31465090 PMID:31512090 PMID:31575519 PMID:31589614 PMID:31618753 PMID:31666926 PMID:31687339 PMID:31739127 PMID:31742824 PMID:31744909 PMID:31780696 PMID:31829624 PMID:31867841 PMID:31921681 PMID:31942411 PMID:31970404 PMID:31980526 PMID:32029870 PMID:32066632 PMID:32068069 PMID:32072083 PMID:32088803 PMID:32133419 PMID:32231684 PMID:32255556 PMID:32283892 PMID:32338768 PMID:32390558 PMID:32390703 PMID:32522261 PMID:32570879 PMID:32615015 PMID:32658311 PMID:32665031 PMID:32720237 PMID:32761968 PMID:32782288 PMID:32821650 PMID:32830346 PMID:32854451 PMID:32868316 PMID:32885271 PMID:32888815 PMID:32904697 PMID:32906206 PMID:32923874 PMID:32973888 PMID:32980694 PMID:32984025 PMID:33011440 PMID:33024574 PMID:33062672 PMID:33077847 PMID:33087929 PMID:33094510 PMID:33130102 PMID:33134171 PMID:33193653 PMID:33194656 PMID:33223521 PMID:33230973 PMID:33258288 PMID:33309985 PMID:33313162 PMID:33332384 PMID:33343895 PMID:33359728 PMID:33383211 PMID:33384714 PMID:33414168 PMID:33436027 PMID:33442023 PMID:33471974 PMID:33471991 PMID:33504652 PMID:33553733 PMID:33558524 PMID:33563768 PMID:33606809 PMID:33748650 PMID:33785725 PMID:33858029 PMID:33878367 PMID:33901219 PMID:33939675 PMID:33980423 PMID:34026625 PMID:34034685 PMID:34250417 PMID:34259353 PMID:34271781 PMID:34285288 PMID:34308366 PMID:34326862 PMID:34347074 PMID:34371384 PMID:34404389 PMID:34426522 PMID:34428338 PMID:34506673 PMID:34598035 PMID:34621001 PMID:34659905 PMID:34680878 PMID:34687117 PMID:34704405 PMID:34716202 PMID:34775073 PMID:34816434 PMID:34897210 PMID:34981295 PMID:34994648 PMID:35089076 PMID:35098669 PMID:35205332 PMID:35238777 PMID:35264596 PMID:35273153 PMID:35430768 PMID:35534218 PMID:35534704 PMID:35535697 PMID:35545820 PMID:35628513 PMID:35668106 PMID:35712480 PMID:35734982 PMID:35892882 PMID:35980532 PMID:36035419 PMID:36119527 PMID:36135357 PMID:36243179 PMID:36368126 PMID:36672847 PMID:36988593 PMID:37201251 More...
NCBI chr 5:130,274,034...130,286,149
Ensembl chr 5:130,274,122...130,286,146
G
Ptch2
patched 2
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2
ClinVar
PMID:28492532
NCBI chr 5:130,571,956...130,592,506
Ensembl chr 5:130,572,312...130,592,405
G
Stk11
serine/threonine kinase 11
ISO
ClinVar Annotator: match by term: MUTYH-related attenuated familial adenomatous polyposis
ClinVar
PMID:25741868 PMID:26467025 PMID:28135145 PMID:28492532 PMID:33471991
NCBI chr 7:9,574,553...9,591,315
Ensembl chr 7:9,575,269...9,591,315
G
Toe1
target of EGR1, exonuclease
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2 | ClinVar Annotator: match by term: MUTYH-related attenuated familial adenomatous polyposis
ClinVar
PMID:9536098 PMID:12056405 PMID:14618256 PMID:16199547 PMID:16408224 PMID:17576681 PMID:18271935 PMID:18534194 PMID:19725997 PMID:20663686 PMID:20725929 PMID:22473953 PMID:25186627 PMID:25741868 PMID:26467025 PMID:27720647 PMID:28492532 PMID:28644590 PMID:30716719 PMID:32821650 PMID:36988593 More...
NCBI chr 5:130,270,484...130,274,050
Ensembl chr 5:130,262,319...130,274,050
G
Urod
uroporphyrinogen decarboxylase
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2
ClinVar
PMID:28492532
NCBI chr 5:130,464,695...130,468,783
Ensembl chr 5:130,455,217...130,468,808
G
Vdr
vitamin D receptor
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2
ClinVar
PMID:17970811 PMID:25741868
NCBI chr 7:128,987,981...129,037,677
Ensembl chr 7:128,987,981...129,037,677
G
Zswim5
zinc finger, SWIM-type containing 5
ISO
ClinVar Annotator: match by term: Familial adenomatous polyposis 2
ClinVar
PMID:28492532
NCBI chr 5:130,346,733...130,463,791
Ensembl chr 5:130,343,034...130,463,784
Term paths to the root one shortest all shortest one longest all longest one shortest and longest all