Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Cript | Rat | Desbuquois dysplasia | | ISO | CRIPT (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Cript | Rat | Desbuquois dysplasia | | ISO | CRIPT (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | Electronic Transfer of LocusLink and RefSeq Data | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
| 3. | CRIPT, a novel postsynaptic protein that binds to the third PDZ domain of PSD-95/SAP90. | Niethammer M, etal., Neuron 1998 Apr;20(4):693-707. |
| 4. | Microtubule binding by CRIPT and its potential role in the synaptic clustering of PSD-95. | Passafaro M, etal., Nat Neurosci. 1999 Dec;2(12):1063-9. |
| 5. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 6. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 7. | Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. | Strausberg RL, etal., Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Dec 24;99(26):16899-903. Epub 2002 Dec 11. |
| 8. | Laminar organization of the NMDA receptor complex within the postsynaptic density. | Valtschanoff JG and Weinberg RJ, J Neurosci. 2001 Feb 15;21(4):1211-7. |
| Cript (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| CRIPT (Homo sapiens - human) |
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| Cript (Mus musculus - house mouse) |
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| Cript (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| CRIPT (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| CRIPT (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Cript (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| CRIPT (Sus scrofa - pig) |
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| CRIPT (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Cript (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Cript (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Cript
128 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| RH141427 |
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| RH132997 |
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| RH138667 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
|
mesoderm
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musculoskeletal system
|
nervous system
|
renal system
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reproductive system
|
respiratory system
|
sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 165 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 144 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_019907 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| GenBank Nucleotide | AF047384 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| BC058146 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473947 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ212096 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ213014 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ213525 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ216273 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ222669 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ227582 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ230603 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ232078 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000006 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000020534 ⟹ ENSRNOP00000020534 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000113445 ⟹ ENSRNOP00000097693 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_019907 ⟹ NP_063972 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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| Sequence: |
| Protein RefSeqs | NP_063972 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| GenBank Protein | AAC40102 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDM02654 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM02655 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000020534.5 | ||
| ENSRNOP00000097693 | |||
| GenBank Protein | Q792Q4 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_063972 ⟸ NM_019907 |
| - UniProtKB: | Q792Q4 (UniProtKB/Swiss-Prot), A6H9E9 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8I6AVC2 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000020534 ⟸ ENSRNOT00000020534 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000097693 ⟸ ENSRNOT00000113445 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-Q792Q4-F1-model_v2 | AlphaFold | Q792Q4 | 1-101 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13694389 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R4914 | ||||||||
| Type: | initiation region | ||||||||
| Name: | Cript_1 | ||||||||
| Description: | CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:621545 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-38711 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000015215 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000020534.7 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| ENSRNOT00000113445 | ENTREZGENE | |
| InterPro | PDZ-binding_CRIPT | UniProtKB/Swiss-Prot |
| KEGG Report | rno:56725 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| NCBI Gene | 56725 | ENTREZGENE |
| PANTHER | CYSTEINE-RICH PDZ-BINDING PROTEIN | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PTHR11805 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | Cript | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Cript | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000015215 | RatGTEx |
| UniProt | A0A8I6AVC2 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A6H9E9 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| A6H9F0_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| CRIPT_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2016-02-03 | Cript | CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain | Cript | cysteine-rich PDZ-binding protein | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-02-25 | Cript | cysteine-rich PDZ-binding protein | Cript | postsynaptic protein Cript | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2005-01-20 | Cript | postsynaptic protein Cript | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED | ||
| 2002-08-07 | Cript | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |
| Note Type | Note | Reference |
|---|---|---|
| gene_cellular_localization | localized to the postsynaptic density | 632510 |
| gene_physical_interaction | binds to the third PDZ domain of PSD-95 via its C terminus | 632510 |