Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Dpysl5 | Rat | Ritscher-Schinzel Syndrome 4 | | ISO | DPYSL5 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Dpysl5 | Rat | Ritscher-Schinzel Syndrome 4 | | ISO | DPYSL5 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | Rat ISS GO annotations from GOA human gene data--August 2006 | GOA data from the GO Consortium |
| 3. | Ulip6, a novel unc-33 and dihydropyrimidinase related protein highly expressed in developing rat brain. | Horiuchi M, etal., FEBS Lett 2000 Sep 1;480(2-3):283-6. |
| 4. | Identification of CRAM, a novel unc-33 gene family protein that associates with CRMP3 and protein-tyrosine kinase(s) in the developing rat brain. | Inatome R, etal., J Biol Chem 2000 Sep 1;275(35):27291-302. |
| 5. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
| 6. | Electronic Transfer of LocusLink and RefSeq Data | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
| 7. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
| 8. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| PMID:11069615 | PMID:15834957 | PMID:19805073 | PMID:22871113 | PMID:26677106 |
| Dpysl5 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| DPYSL5 (Homo sapiens - human) |
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| Dpysl5 (Mus musculus - house mouse) |
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| Dpysl5 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| DPYSL5 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| DPYSL5 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Dpysl5 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| DPYSL5 (Sus scrofa - pig) |
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| DPYSL5 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Dpysl5 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Dpysl5 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Dpysl5
202 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| IB426 |
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| RH131974 |
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| UniSTS:478904 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 61 | 162 | 89 | 88 | 59 | 87 | 59 | 6 | 340 | 181 | 10 | 141 | 76 | 92 | 29 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_023023 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_017594350 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AB029432 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| AJ131436 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473947 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000006 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000012273 ⟹ ENSRNOP00000012274 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_023023 ⟹ NP_075412 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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| Sequence: |
| Protein RefSeqs | NP_075412 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| GenBank Protein | BAA89475 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| CAB95193 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM02977 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM02978 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM02979 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000012274 | ||
| ENSRNOP00000012274.4 | |||
| GenBank Protein | Q9JHU0 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_075412 ⟸ NM_023023 |
| - UniProtKB: | Q9JHU0 (UniProtKB/Swiss-Prot), A6HAC3 (UniProtKB/TrEMBL), Q9JMG8 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000012274 ⟸ ENSRNOT00000012273 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-Q9JHU0-F1-model_v2 | AlphaFold | Q9JHU0 | 1-564 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13694461 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R4984 | ||||||||
| Type: | single initiation site | ||||||||
| Name: | Dpysl5_1 | ||||||||
| Description: | dihydropyrimidinase-like 5 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:620467 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-38320 | BioCyc |
| BioCyc Pathway | PWY-3982 [uracil degradation I (reductive)] | BioCyc |
| PWY-6430 [thymine degradation] | BioCyc | |
| BioCyc Pathway Image | PWY-3982 | BioCyc |
| PWY-6430 | BioCyc | |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000008996 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000012273 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000012273.5 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Gene3D-CATH | 2.30.40.10 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Metal-dependent hydrolases | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| InterPro | Amidohydro-rel | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Hydantoinase/dihydroPyrase | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Metal-dep_hydrolase_composite | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Metal_Hydrolase | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Metallo-dep_Hydrolases_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | rno:65208 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| NCBI Gene | 65208 | ENTREZGENE |
| PANTHER | HYDRANTOINASE/DIHYDROPYRIMIDINASE FAMILY MEMBER | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PTHR11647:SF58 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | Amidohydro_1 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Dpysl5 | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000008996 | RatGTEx |
| Superfamily-SCOP | SSF51338 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| SSF51556 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| UniProt | A6HAC2_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
| A6HAC3 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| A6HAC4_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| DPYL5_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE | |
| Q9JMG8 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2021-03-09 | Dpysl5 | dihydropyrimidinase-like 5 | LOC100911610 | dihydropyrimidinase-related protein 5-like | Data merged from RGD:6492163 | 737654 | PROVISIONAL |
| 2012-07-05 | LOC100911610 | dihydropyrimidinase-related protein 5-like | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
| 2004-09-10 | Dpysl5 | dihydropyrimidinase-like 5 | Crmp5 | dihydropyrimidinase-related protein | Symbol and Name updated | 1299863 | APPROVED |
| 2002-08-07 | Crmp5 | dihydropyrimidinase-related protein | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |
| Note Type | Note | Reference |
|---|---|---|
| gene_expression | highly expressed in embryonic and early postnatal brain and spinal cord | 632608 |
| gene_function | associated with CRMP3 | 632609 |
| gene_regulation | expression is up-regulated during neuronal differentiation | 632609 |