Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Uba2 | Rat | ACCES Syndrome | | ISO | UBA2 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Uba2 | Rat | ACCES Syndrome | | ISO | UBA2 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
| 3. | KEGG Annotation Import Pipeline | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
| 4. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
| 5. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| PMID:10187858 | PMID:12477932 | PMID:15660128 | PMID:15767674 | PMID:20164921 | PMID:21554500 | PMID:21968017 | PMID:22082260 | PMID:31505169 |
| Uba2 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| UBA2 (Homo sapiens - human) |
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| Uba2 (Mus musculus - house mouse) |
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| Uba2 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| UBA2 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| UBA2 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Uba2 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| UBA2 (Sus scrofa - pig) |
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| UBA2 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Uba2 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Uba2 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Uba2
57 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| RH128380 |
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| BE116537 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
|
sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 165 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 144 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001100579 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_039111601 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_063261617 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_063261621 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XR_010052057 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | BC098845 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| BC161985 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473979 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000001 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000028672 ⟹ ENSRNOP00000028672 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000101711 ⟹ ENSRNOP00000087889 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000130156 ⟹ ENSRNOP00000109327 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001100579 ⟹ NP_001094049 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039111601 ⟹ XP_038967529 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XM_063261617 ⟹ XP_063117687 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XM_063261621 ⟹ XP_063117691 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XR_010052057 | ||||||||
| Type: | NON-CODING | ||||||||
| Position: |
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| Protein RefSeqs | NP_001094049 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_038967529 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_063117687 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_063117691 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAH98845 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| AAI61985 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM07648 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000028672 | ||
| ENSRNOP00000028672.9 | |||
| ENSRNOP00000087889 | |||
| ENSRNOP00000087889.1 | |||
| ENSRNOP00000109327 | |||
| ENSRNOP00000109327.1 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001094049 ⟸ NM_001100579 |
| - UniProtKB: | B1WC32 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8I6A3Z5 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000028672 ⟸ ENSRNOT00000028672 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038967529 ⟸ XM_039111601 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | F1LS72 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000087889 ⟸ ENSRNOT00000101711 |
| RefSeq Acc Id: | XP_063117687 ⟸ XM_063261617 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| - UniProtKB: | A0A8I6A3Z5 (UniProtKB/TrEMBL) |
| RefSeq Acc Id: | XP_063117691 ⟸ XM_063261621 |
| - Peptide Label: | isoform X3 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000109327 ⟸ ENSRNOT00000130156 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-F1LS72-F1-model_v2 | AlphaFold | F1LS72 | 1-595 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1312023 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-60022 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000021113 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000028672 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000028672.9 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000101711 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000101711.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000130156 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000130156.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 1.10.10.520 | UniProtKB/TrEMBL |
| 3.50.50.80 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Ubiquitin-like 2 activating enzyme e1b. Chain: B, domain 3 | UniProtKB/TrEMBL | |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:7379417 | IMAGE-MGC_LOAD |
| IMAGE:9030809 | IMAGE-MGC_LOAD | |
| InterPro | SAE2/Uba2 | UniProtKB/TrEMBL |
| ThiF/MoeB/HesA | UniProtKB/TrEMBL | |
| ThiF_NAD_FAD-bd | UniProtKB/TrEMBL | |
| UAE_UbL_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
| Ub-E1_IAD_1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Ub_act_enz_dom_a_sf | UniProtKB/TrEMBL | |
| UBA2_C | UniProtKB/TrEMBL | |
| Ubiquitin-activating_enz | UniProtKB/TrEMBL | |
| UBQ-activ_enz_E1_AS | UniProtKB/TrEMBL | |
| UBQ-activ_enz_E1_Cys_AS | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:308508 | UniProtKB/TrEMBL |
| MGC_CLONE | MGC:112901 | IMAGE-MGC_LOAD |
| MGC:187804 | IMAGE-MGC_LOAD | |
| NCBI Gene | 308508 | ENTREZGENE |
| PANTHER | PTHR10953 | UniProtKB/TrEMBL |
| PTHR10953:SF5 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | ThiF | UniProtKB/TrEMBL |
| UAE_UbL | UniProtKB/TrEMBL | |
| UBA2_C | UniProtKB/TrEMBL | |
| PhenoGen | Uba2 | PhenoGen |
| PIRSF | SUMO_E1B | UniProtKB/TrEMBL |
| PROSITE | PROKAR_LIPOPROTEIN | UniProtKB/TrEMBL |
| UBIQUITIN_ACTIVAT_1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| UBIQUITIN_ACTIVAT_2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| RatGTEx | ENSRNOG00000021113 | RatGTEx |
| Superfamily-SCOP | MoeB | UniProtKB/TrEMBL |
| UniProt | A0A8I6A3Z5 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0ABK0M3G2_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| B1WC32 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| F1LS72 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| Q4G010_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-06-13 | Uba2 | ubiquitin-like modifier activating enzyme 2 | Sae2 | SUMO1 activating enzyme subunit 2 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-03-07 | Sae2 | SUMO1 activating enzyme subunit 2 | Uble1b | ubiquitin-like 1 (sentrin) activating enzyme E1B | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2005-12-06 | Uble1b | ubiquitin-like 1 (sentrin) activating enzyme E1B | Uble1b_predicted | ubiquitin-like 1 (sentrin) activating enzyme E1B (predicted) | Symbol and Name updated | 1559027 | APPROVED |
| 2005-01-12 | Uble1b_predicted | ubiquitin-like 1 (sentrin) activating enzyme E1B (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |