Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Gpihbp1 | Rat | familial GPIHBP1 deficiency | | ISO | GPIHBP1 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Gpihbp1 | Rat | familial GPIHBP1 deficiency | | ISO | GPIHBP1 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| PMID:12496272 | PMID:17403372 | PMID:17997385 | PMID:19304573 | PMID:19542565 | PMID:20124439 | PMID:20620994 | PMID:26586663 | PMID:29899144 | PMID:37974401 |
| Gpihbp1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| GPIHBP1 (Homo sapiens - human) |
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| Gpihbp1 (Mus musculus - house mouse) |
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| Gpihbp1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| GPIHBP1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| GPIHBP1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Gpihbp1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| GPIHBP1 (Sus scrofa - pig) |
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| GPIHBP1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Gpihbp1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Gpihbp1 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Gpihbp1
12 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
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visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 51 | 111 | 84 | 83 | 52 | 28 | 52 | 6 | 247 | 112 | 11 | 82 | 59 | 89 | 31 | 1 | 1 |
| RefSeq Transcripts | NM_001130547 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_039078806 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | CH473950 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| JAXUCZ010000007 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000009811 ⟹ ENSRNOP00000009811 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000103232 ⟹ ENSRNOP00000093917 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000128846 ⟹ ENSRNOP00000103492 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001130547 ⟹ NP_001124019 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039078806 ⟹ XP_038934734 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Protein RefSeqs | NP_001124019 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_038934734 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | EDM16060 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDM16061 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM16062 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000093917 | ||
| ENSRNOP00000093917.1 | |||
| ENSRNOP00000103492.1 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001124019 ⟸ NM_001130547 |
| - Peptide Label: | precursor |
| - UniProtKB: | D3ZZL5 (UniProtKB/TrEMBL), A6HS12 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000009811 ⟸ ENSRNOT00000009811 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038934734 ⟸ XM_039078806 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A6HS11 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000093917 ⟸ ENSRNOT00000103232 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000103492 ⟸ ENSRNOT00000128846 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-D3ZZL5-F1-model_v2 | AlphaFold | D3ZZL5 | 1-236 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13695385 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R5910 | ||||||||
| Type: | initiation region | ||||||||
| Name: | Gpihbp1_1 | ||||||||
| Description: | glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoproteinbinding protein 1 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1564237 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-32990 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000007475 | Ensembl |
| ENSRNOG00000064680 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000103232 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000103232.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000128846.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 2.10.60.10 | UniProtKB/TrEMBL |
| InterPro | CD59_antigen_CS | UniProtKB/TrEMBL |
| Ly-6/neurotoxin-like_GPI-ap | UniProtKB/TrEMBL | |
| Snake_toxin-like_sf | UniProtKB/TrEMBL | |
| Toxin/TOLIP | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:300027 | UniProtKB/TrEMBL |
| NCBI Gene | 300027 | ENTREZGENE |
| PANTHER | GLYCOSYLPHOSPHATIDYLINOSITOL-ANCHORED HIGH DENSITY LIPOPROTEIN-BINDING PROTEIN 1 | UniProtKB/TrEMBL |
| UPAR/LY6 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | Toxin_TOLIP | UniProtKB/TrEMBL |
| PhenoGen | Gpihbp1 | PhenoGen |
| PROSITE | LY6_UPAR | UniProtKB/TrEMBL |
| RatGTEx | ENSRNOG00000007475 | RatGTEx |
| ENSRNOG00000064680 | RatGTEx | |
| Superfamily-SCOP | SSF57302 | UniProtKB/TrEMBL |
| UniProt | A0ABK0LQM7_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
| A6HS11 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| A6HS12 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| D3ZZL5 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-09-26 | Gpihbp1 | glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1 | Gpihbp1 | GPI-anchored HDL-binding protein 1 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-03-07 | Gpihbp1 | GPI-anchored HDL-binding protein 1 | RGD1564237_predicted | similar to high density lipoprotein-binding protein (predicted) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2006-03-07 | RGD1564237_predicted | similar to high density lipoprotein-binding protein (predicted) | LOC300027 | similar to high density lipoprotein-binding protein | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
| 2006-02-09 | LOC300027 | similar to high density lipoprotein-binding protein | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |