Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Ankrd17 | Rat | CHOPRA-AMIEL-GORDON SYNDROME | | ISO | ANKRD17 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Ankrd17 | Rat | CHOPRA-AMIEL-GORDON SYNDROME | | ISO | ANKRD17 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
| 3. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 4. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| PMID:19150984 | PMID:19619540 | PMID:19946888 | PMID:22190705 | PMID:22328336 | PMID:22658674 | PMID:23711367 |
| Ankrd17 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| ANKRD17 (Homo sapiens - human) |
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| Ankrd17 (Mus musculus - house mouse) |
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| Ankrd17 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| ANKRD17 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| ANKRD17 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Ankrd17 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| ANKRD17 (Sus scrofa - pig) |
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| ANKRD17 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Ankrd17 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Ankrd17 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Ankrd17
868 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| RH127459 |
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| BI291183 |
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| AI598408 |
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| RH124614 |
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| G34499 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 165 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 144 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001105999 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| NM_001401338 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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| NM_001401343 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006250766 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006250767 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_008770011 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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| XM_063272902 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_063272903 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | CH474060 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| FQ225998 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ226740 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ232027 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ232502 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ233020 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ235158 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000014 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000068682 ⟹ ENSRNOP00000059864 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000112709 ⟹ ENSRNOP00000086651 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000119401 ⟹ ENSRNOP00000095296 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
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| Position: |
|
||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
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| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001401339 ⟹ NP_001388268 | ||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001401343 ⟹ NP_001388272 | ||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_008770011 ⟹ XP_008768233 | ||||||||||||||||
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| Position: |
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||||||||||||||||
| Sequence: |
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| Position: |
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||||||||||||||||
| Sequence: |
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| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XM_063272902 ⟹ XP_063128972 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XM_063272903 ⟹ XP_063128973 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Protein RefSeqs | NP_001099469 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
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| GenBank Protein | EDL88547 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDL88548 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
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| ENSRNOP00000059864.1 | |||
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| ENSRNOP00000095296.1 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001099469 ⟸ NM_001105999 |
| - Peptide Label: | isoform 3 |
| - UniProtKB: | D4A0B4 (UniProtKB/TrEMBL), A6KKG2 (UniProtKB/TrEMBL), A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XP_006250828 ⟸ XM_006250766 |
| - Peptide Label: | isoform X3 |
| - UniProtKB: | A0A0G2JVW3 (UniProtKB/TrEMBL), A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XP_008768233 ⟸ XM_008770011 |
| - Peptide Label: | isoform X4 |
| - UniProtKB: | A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XP_017454587 ⟸ XM_017599098 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000059864 ⟸ ENSRNOT00000068682 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000069642 ⟸ ENSRNOT00000086542 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000095296 ⟸ ENSRNOT00000119401 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000086651 ⟸ ENSRNOT00000112709 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001388267 ⟸ NM_001401338 |
| - Peptide Label: | isoform 1 |
| - UniProtKB: | A0A8I6AAR9 (UniProtKB/TrEMBL), A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| RefSeq Acc Id: | NP_001388268 ⟸ NM_001401339 |
| - Peptide Label: | isoform 2 |
| - UniProtKB: | A0A8I6AL58 (UniProtKB/TrEMBL), A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| RefSeq Acc Id: | NP_001388272 ⟸ NM_001401343 |
| - Peptide Label: | isoform 4 |
| - UniProtKB: | A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| RefSeq Acc Id: | XP_063128971 ⟸ XM_063272901 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| - UniProtKB: | A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| RefSeq Acc Id: | XP_063128972 ⟸ XM_063272902 |
| - Peptide Label: | isoform X5 |
| - UniProtKB: | A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| RefSeq Acc Id: | XP_063128973 ⟸ XM_063272903 |
| - Peptide Label: | isoform X6 |
| - UniProtKB: | A6KKG3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-A0A0G2JVW3-F1-model_v2 | AlphaFold | A0A0G2JVW3 | 1-2524 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1562348 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-16184 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000002940 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000068682 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000068682.4 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000086542 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000086542.3 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000112709 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000112709.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000119401 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000119401.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 1.25.40.20 | UniProtKB/TrEMBL |
| 3.30.1370.10 | UniProtKB/TrEMBL | |
| InterPro | Ankyrin-KH/SAM_domain | UniProtKB/TrEMBL |
| Ankyrin_rpt | UniProtKB/TrEMBL | |
| Ankyrin_rpt-contain_sf | UniProtKB/TrEMBL | |
| KH-I_ANKRD17 | UniProtKB/TrEMBL | |
| KH_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
| KH_dom_type_1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| KH_dom_type_1_sf | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:289521 | UniProtKB/TrEMBL |
| NCBI Gene | 289521 | ENTREZGENE |
| PANTHER | ANKYRIN REPEAT DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 17 | UniProtKB/TrEMBL |
| MASK PROTEIN | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | Ank | UniProtKB/TrEMBL |
| Ank_2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Ank_4 | UniProtKB/TrEMBL | |
| KH_1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| PhenoGen | Ankrd17 | PhenoGen |
| PRINTS | ANKYRIN | UniProtKB/TrEMBL |
| PROSITE | ANK_REP_REGION | UniProtKB/TrEMBL |
| ANK_REPEAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| KH_TYPE_1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| RatGTEx | ENSRNOG00000002940 | RatGTEx |
| SMART | ANK | UniProtKB/TrEMBL |
| SM00322 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Superfamily-SCOP | ANK | UniProtKB/TrEMBL |
| SSF54791 | UniProtKB/TrEMBL | |
| UniProt | A0A0G2JVW3 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0A8I6AAR9 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| A0A8I6AL58 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| A6KKG2 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| A6KKG3 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| D4A0B4 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-02-29 | Ankrd17 | ankyrin repeat domain 17 | RGD1562348_predicted | similar to ankyrin repeat domain protein 17 isoform b (predicted) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2006-03-07 | RGD1562348_predicted | similar to ankyrin repeat domain protein 17 isoform b (predicted) | LOC289521 | similar to ankyrin repeat domain protein 17 isoform b | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
| 2006-02-09 | LOC289521 | similar to ankyrin repeat domain protein 17 isoform b | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |