Gene-Chemical Interaction Annotations
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Genomics
Comparative Map Data
Variants
miRNA Target Status (No longer updated)
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 199 | Count of miRNA genes: | 154 | Interacting mature miRNAs: | 167 | Transcripts: | ENSRNOT00000052130 | Prediction methods: | Microtar, Miranda, Rnahybrid | Result types: | miRGate_prediction | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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QTLs in Region (GRCr8)
| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
Markers in Region
| BE097379 |
|
Expression
RNA-SEQ Expression
|
alimentary part of gastrointestinal system
|
appendage
|
circulatory system
|
ectoderm
|
endocrine system
|
endoderm
|
exocrine system
|
hemolymphoid system
|
hepatobiliary system
|
integumental system
|
mesenchyme
|
mesoderm
|
musculoskeletal system
|
nervous system
|
renal system
|
reproductive system
|
respiratory system
|
sensory system
|
visual system
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13 | 4 | 35 | 111 | 49 | 51 | 31 | 69 | 31 | 5 | 231 | 115 | 6 | 107 | 69 | 79 | 20 | 5 | 5 |
Sequence
Nucleotide Sequences
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000052130 ⟹ ENSRNOP00000047785 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001109262 ⟹ NP_001102732 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
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| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039110581 ⟹ XP_038966509 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
Protein Sequences
| Protein RefSeqs | NP_001102732 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_038966509 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAI60900 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| B1H283 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL90470 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000047785 | ||
| ENSRNOP00000047785.3 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001102732 ⟸ NM_001109262 |
| - UniProtKB: | B1H283 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000047785 ⟸ ENSRNOT00000052130 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038966509 ⟸ XM_039110581 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |






















