Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Iqce | Rat | Postaxial Polydactyly, Type A7 | | ISO | IQCE (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Iqce | Rat | Postaxial Polydactyly, Type A7 | | ISO | IQCE (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 2. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| Iqce (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| IQCE (Homo sapiens - human) |
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| Iqce (Mus musculus - house mouse) |
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| Iqce (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| IQCE (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| IQCE (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Iqce (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| IQCE (Sus scrofa - pig) |
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| IQCE (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Iqce (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Iqce (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Iqce
255 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
|
renal system
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reproductive system
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respiratory system
|
sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 161 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 140 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
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| - UniProtKB: | D4ADQ3 (UniProtKB/TrEMBL) |
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| - Sequence: |
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| - Peptide Label: | isoform X15 |
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| - Peptide Label: | isoform X16 |
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| - Peptide Label: | isoform X20 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000103562 ⟸ ENSRNOT00000146516 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000111353 ⟸ ENSRNOT00000130050 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-D4ADQ3-F1-model_v2 | AlphaFold | D4ADQ3 | 1-786 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13698460 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R8977 | ||||||||
| Type: | initiation region | ||||||||
| Name: | Iqce_1 | ||||||||
| Description: | IQ motif containing E | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
|
| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1311349 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-19931 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000001241 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000001667 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000001667.8 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000051565 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000051565.8 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000117335 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000117335.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000130050 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000130050.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000146516.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 1.20.5.190 | UniProtKB/TrEMBL |
| InterPro | CellDiv_DevSignal_Domain | UniProtKB/TrEMBL |
| IQ_CaM-bd_region | UniProtKB/TrEMBL | |
| NCBI Gene | 304318 | ENTREZGENE |
| PANTHER | IQ DOMAIN-CONTAINING PROTEIN E | UniProtKB/TrEMBL |
| MYOSIN MOTOR DOMAIN-CONTAINING PROTEIN | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | PF00612 | UniProtKB/TrEMBL |
| PhenoGen | Iqce | PhenoGen |
| PROSITE | PS50096 | UniProtKB/TrEMBL |
| RatGTEx | ENSRNOG00000001241 | RatGTEx |
| SMART | SM00015 | UniProtKB/TrEMBL |
| UniProt | A0A8I6B1N9 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0ABK0LDM6_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A0ABK0M2F5_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A6K1R7 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| D3ZUL9 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| D4ADQ3 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-04-30 | Iqce | IQ motif containing E | Iqce_predicted | IQ motif containing E (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2006-03-30 | Iqce_predicted | IQ motif containing E (predicted) | RGD1311349_predicted | similar to RIKEN cDNA 1700028P05 (predicted) | Symbol and Name updated | 1299863 | APPROVED |
| 2005-01-20 | RGD1311349_predicted | similar to RIKEN cDNA 1700028P05 (predicted) | LOC304318_predicted | Symbol and Name status set to approved | 1331353 | APPROVED | |
| 2005-01-12 | LOC304318_predicted | similar to RIKEN cDNA 1700028P05 (predicted) | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |