Gene-Chemical Interaction Annotations
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Genomics
Clinical Variants
miRNA Target Status
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 708 | Count of miRNA genes: | 339 | Interacting mature miRNAs: | 368 | Transcripts: | ENST00000345111, ENST00000535118, ENST00000535544, ENST00000537374, ENST00000539315, ENST00000540250, ENST00000541359 | Prediction methods: | Miranda, Rnahybrid | Result types: | miRGate_prediction | |
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miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
Markers in Region
D12S307 |
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RH92779 |
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RH92063 |
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D12S307 |
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Expression
RNA-SEQ Expression
High: > 1000 TPM value
Medium: Between 11 and 1000 TPMLow: Between 0.5 and 10 TPM Below Cutoff: < 0.5 TPM
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | sensory system | adipose tissue | appendage | |
High | |||||||||||||||
Medium | 4 | 5 | 342 | ||||||||||||
Low | 111 | 71 | 54 | 10 | 439 | 11 | 29 | 5 | 922 | 30 | 87 | 148 | 5 | 12 | 8 |
Below cutoff | 1836 | 1934 | 1220 | 427 | 1074 | 272 | 2934 | 1448 | 2080 | 190 | 743 | 1214 | 157 | 1057 | 1920 |
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Nucleotide Sequences
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