Gene-Chemical Interaction Annotations
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Variants
miRNA Target Status
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 1347 | Count of miRNA genes: | 709 | Interacting mature miRNAs: | 836 | Transcripts: | ENST00000427863, ENST00000443258, ENST00000467292, ENST00000483000, ENST00000535464, ENST00000607780 | Prediction methods: | Miranda, Rnahybrid | Result types: | miRGate_prediction | |
The detailed report is available here: | Full Report | CSV | TAB | Printer | ||||
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
Markers in Region
RH26381 |
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D2S1603E |
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D2S1692E |
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D2S2136 |
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SHGC-105076 |
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SGC35015 |
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RH35908 |
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RH79204 |
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Expression
RNA-SEQ Expression
High: > 1000 TPM value
Medium: Between 11 and 1000 TPMLow: Between 0.5 and 10 TPM Below Cutoff: < 0.5 TPM
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | sensory system | adipose tissue | appendage | entire extraembryonic component | |
High | ||||||||||||||||
Medium | 126 | 56 | 48 | 18 | 45 | 18 | 591 | 113 | 1913 | 17 | 564 | 32 | 1 | 1 | 514 | |
Low | 2302 | 2570 | 1630 | 578 | 1543 | 420 | 3759 | 2070 | 1792 | 398 | 877 | 1560 | 169 | 1203 | 2273 | 1 |
Below cutoff | 4 | 357 | 42 | 24 | 358 | 24 | 5 | 10 | 2 | 2 | 3 | 14 | 1 | 2 |
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Nucleotide Sequences
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