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Variants
miRNA Target Status
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 461 | Count of miRNA genes: | 407 | Interacting mature miRNAs: | 435 | Transcripts: | ENST00000425159, ENST00000572695, ENST00000573318, ENST00000575291 | Prediction methods: | Miranda, Rnahybrid | Result types: | miRGate_prediction | |
The detailed report is available here: | Full Report | CSV | TAB | Printer | ||||
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
Markers in Region
RH41838 |
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D17S2098 |
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D8S2279 |
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Expression
RNA-SEQ Expression
High: > 1000 TPM value
Medium: Between 11 and 1000 TPMLow: Between 0.5 and 10 TPM Below Cutoff: < 0.5 TPM
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | sensory system | adipose tissue | appendage | entire extraembryonic component | |
High | ||||||||||||||||
Medium | 4 | 1 | 11 | 4 | 35 | 6 | 15 | 8 | 21 | 2 | 63 | 20 | 13 | |||
Low | 2425 | 2317 | 1701 | 607 | 1407 | 447 | 4280 | 1957 | 3305 | 413 | 1385 | 1587 | 170 | 1203 | 2715 | 4 |
Below cutoff | 3 | 662 | 11 | 11 | 500 | 11 | 60 | 226 | 382 | 3 | 1 | 1 | 60 |
Sequence
Nucleotide Sequences
RefSeq Acc Id: | ENST00000425159 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000572695 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000573318 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENST00000575291 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENST00000688561 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENST00000691039 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENST00000701693 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENST00000702305 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | NR_033934 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||
Type: | NON-CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
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Sequence: |
Additional Information
External Database Links
Database | Acc Id | Source(s) |
COSMIC | MRPL45P2 | COSMIC |
Ensembl Genes | ENSG00000228782 | Ensembl |
GTEx | ENSG00000228782 | GTEx |
HGNC ID | HGNC:29716 | ENTREZGENE |
Human Proteome Map | MRPL45P2 | Human Proteome Map |
NCBI Gene | 653479 | ENTREZGENE |