Imported Disease Annotations - ClinVarTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | cholangiocarcinoma | | ISO | CXCL8 (Homo sapiens) | 8554872 | ClinVar Annotator: match by term: Cholangiocarcinoma | ClinVar | PMID:18550579 | |
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Imported Disease Annotations - ClinVarTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | cholangiocarcinoma | | ISO | CXCL8 (Homo sapiens) | 8554872 | ClinVar Annotator: match by term: Cholangiocarcinoma | ClinVar | PMID:18550579 | |
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CXCL8 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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CXCL8 (Homo sapiens - human) |
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Cxcl15 (Mus musculus - house mouse) |
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Cxcl8 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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CXCL8 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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CXCL8 (Canis lupus familiaris - dog) |
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LOC101964975 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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CXCL8 (Sus scrofa - pig) |
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Cxcl8 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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endocrine system | hemolymphoid system | nervous system | |
High | |||
Medium | 2 | 10 | |
Low | 28 | 10 | 14 |
Below cutoff | 6 | 13 |
RefSeq Transcripts | NM_001292081 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_007998871 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | FJ194488 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
JACDXN010000052 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSCSAT00000002814 ⟹ ENSCSAP00000001109 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | NM_001292081 ⟹ NP_001279010 | ||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Protein RefSeqs | NP_001279010 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
GenBank Protein | ACI28915 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
Ensembl Protein | ENSCSAP00000001109.1 |
RefSeq Acc Id: | ENSCSAP00000001109 ⟸ ENSCSAT00000002814 |
RefSeq Acc Id: | NP_001279010 ⟸ NM_001292081 |
- Peptide Label: | precursor |
- UniProtKB: | B6E125 (UniProtKB/TrEMBL), A0A0D9QXM0 (UniProtKB/TrEMBL) |
Database | Acc Id | Source(s) |
Ensembl Genes | ENSCSAG00000004781 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Transcript | ENSCSAT00000002814.1 | UniProtKB/TrEMBL |
Gene3D-CATH | 2.40.50.40 | UniProtKB/TrEMBL |
InterPro | Chemokine_b/g/d | UniProtKB/TrEMBL |
Chemokine_CXC | UniProtKB/TrEMBL | |
Chemokine_CXC_CS | UniProtKB/TrEMBL | |
Chemokine_IL8-like_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
CXC_Chemokine_domain | UniProtKB/TrEMBL | |
Interleukin_8-like_sf | UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | csab:103235786 | UniProtKB/TrEMBL |
NCBI Gene | CXCL8 | ENTREZGENE |
PANTHER | INTERLEUKIN-8 | UniProtKB/TrEMBL |
SMALL INDUCIBLE CYTOKINE A | UniProtKB/TrEMBL | |
Pfam | IL8 | UniProtKB/TrEMBL |
PRINTS | INTERLEUKIN8 | UniProtKB/TrEMBL |
SMALLCYTKCXC | UniProtKB/TrEMBL | |
PROSITE | SMALL_CYTOKINES_CXC | UniProtKB/TrEMBL |
SMART | SCY | UniProtKB/TrEMBL |
Superfamily-SCOP | SSF54117 | UniProtKB/TrEMBL |
UniProt | A0A0D9QXM0 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
B6E125 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |